Journal of the Society of Cosmetic Scientists of Korea
/
v.48
no.1
/
pp.33-38
/
2022
Ultraviolet B (UVB) damages DNA residues in skin keratinocytes. In particular, the formation of cyclobutane pyrimidine dimers (CPD), a pyrimidine residue damage in DNA, is considered a representative indicator of skin photoaging. In this study, we confirmed defensive effect of Glycyrrhiza glabra (G. glabra) extract against UVB induced DNA damage. First of all, we confirmed UVB dependent amount of CPD formation in human keratinocyte cell line. UVB induced CPD was decreased by G. glabra extract by dose dependent manner. In addition, it was confirmed that the expression of mRNA of DNA damage recovery factors was increased by G. glabra extract. Consequently, through this study, it was possible to confirm the DNA protection effect of G. glabra extract in skin keratinocytes.
Several challenges arise in DNA extraction and gene amplification for airborne fungal metagenome analysis from a particulate matter (PM) samples. In this study, various conditions were tested to optimize the DNA extraction method from PM samples and polymerase chain reaction (PCR) conditions with primer set and annealing temperature. As a result of comparative evaluation of DNA extraction under various conditions, chemical cell lysis using buffer and proteinase K for 20 minutes and bead beating treatment were followed by using a commercial DNA extraction kit to efficiently extract DNA from the PM filter samples. To optimize the PCR conditions, PCR was performed using 10 primer sets for amplifying the ITS2 gene region. The concentration of the PCR amplicon was relatively high when the annealing temperature was 58℃ with the ITS3tagmix3/ITS4 primer set. Even under these conditions, when the concentration of the PCR product was low, nested PCR was performed using the primary PCR amplicon as the template DNA to amplify the ITS2 gene at a satisfactory concentration. Using the methods optimized in this study, DNA extraction and PCR were performed on 15 filter samples that collected PM2.5 in Seoul, and the ITS2 gene was successfully amplified in all samples. The optimized methods can be used for research on analyzing and interpreting the fungal metagenome of atmospheric PM samples.
A method is described for the rapid and simple isolation of genomic DNA from 3 mL culture of Lactobacillus crispatus KLB46 The isolated DNA using this method was shown to be an excellent substrate for restriction endonclease digestion and PCR. The method is expected to be used in gentic manipulation of L. crispatus KLB46.
목적 : 이전 연구에서 단삼 추출액이 강력한 항산화 작용이 있음을 확인한 바 있어 단삼 추출액이 신장세뇨관 세포에서 oxidant에 의한 세포사망 및 DNA 손상을 방지하는 지를 조사하고 이러한 효과가 지질의 과산화를 억제하는 효과에 기인하는 지를 시험하였다. 방법 : 신장 근위세뇨관 세포 유래 세포주인 opossum kidney (OK)세포를 이용하여 세포 사망은 frypan blue exclusion방법을 이용하여 평가하였고, DNA손상 정도는 double stranded DNA의 파괴를 측정하여 평가하였다. Oxidant 약물 모델로는 $H_2O_2$를 사용하였다. 결과 : $H_2O_2$는 적용시 간과 농도에 비례하여 세포 사망을 유도하였다. 단삼 추출액은 0.05% 농도에서 $H_2O_2$에 의한 세포사망 및 DNA 손상을 방지하였다. 이러한 방지효과는 $H_2O_2$ 제거 효소인 catalase와 철 착염제인 deferoxamine에 의해서도 나타났다. 그러나 강력한 항산화제인 DPPD는 $H_2O_2$에 의한 세포 사망이나 DNA손상을 방지하지 못하였다. $H_2O_2$는 세포내 ATP 농도를 감소시켰으며. 이러한 감소는 poly (ADP-ribose) polymerase억제제인 3-aminobenzamide에 의해 방지되었으나 단삼 추출액에 의해서는 영향을 받지 않았다. 3-aminobenzamide는 $H_2O_2$에 의한 세포 사망을 방지하였다. $H_2O_2$는 지질의 과산화를 증가시켰으며, 이러한 변화는 단삼 추출액과 DPPD에 의해 방지되었다 결론 : OK 세포에서 $H_2O_2$에 의한 세포사망과 DNA 손상에는 지질의 과산화가 중요한 역할을 하지 않으며, 단삼 추출액의 $H_2O_2$에 의한 세포 사망과 DNA 손상 방지 효과는 항산화 작용이 아닌 다른 기전에 기인하는 것으로 사료된다.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
/
v.33
no.6
/
pp.936-940
/
2004
Doenjang (Korean soy paste) is one of the popular soybean based fermented foods in Korea. This study investigated the growth and DNA synthesis inhibitory effect of doenjang methanol extracts on AGS human gastric adenocarcinoma cells, Hep 3B human hepatocellular carcinoma cells and HT-29 human colon cancer cells. In order to determine an anticancer effect of doenjang methanol extracts, other soybean fermented foods and original materials were compared. The treatment of doenjang methanol extracts (200 $\mu\textrm{g}$/mL) to the AGS, Hep 3B and HT-29 cancer cells inhibited the growth of cancer cells by 80%, 77% and 86%, respectively. Compared to other soybean fermented foods and original materials, doenjang methanol extracts showed the highest growth inhibitory effect on different cancer cells. In addition, doenjang methanol extracts (200 $\mu\textrm{g}$/mL) significantly inhibited DNA synthesis of AGS and Hep 3B cancer cells by 76% and 59%, respectively. These results suggested that this anticancer effect of doenjang may be due to specific active compounds, which will be newly produced during soybean fermented process and not contained in soybean.
Many important traits have been tagged allowing plant breeders to apply marker assisted selection (MAS) in rice. PCR itself is simple to set up, and requires little hands-on time. However, a crucial limiting step of MAS programs is the reliable and efficient extraction of DNA which can be performed on thousands of individuals. In this study, We describe a modification of the DNA extraction method, in which cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) is used to extract DNA from leaf tissues for suitable MAS in rice. We followed the standard 2% CTAB extraction method in all the procedure. In addition we used the 1.2 ml 8-strip tube instead of 1.5 ml E-tubes to fit the 8-multichannel pipette and employ the 96 well plate to use the swing bucket centrifuge. Our modified CTAB DNA extraction method offers several advantages with respect to traditional and simple methods. 1) adult leaf samples collected in paddy field are applicable. 2) 96 leaf samples can be homogenized only one-time by using tungsten carbonate bead and 96well block. 3) semiautomatic loading method using 8-multichannel pipette from DNA extraction to electrophoresis of PCR products. 4) our system can extract about 400 leaf samples per day by only one technicion. Therefore, this method could be useful for marker assisted breeding in rice.
Reactive oxygen species (ROS) has been played a critical role in damage of DNA. Recently, many effort is focusing to develop the natural antioxidants for controlling ROS. Zelkova serrata, Ulmaceae, is close as plants which are planted in front of Korea villages. Although Zelkova serrata is familiar with Koreans, those of antioxidant activities and protective effects on oxidative DNA damage haven't studied. We demonstrated antioxidant activities and inhibitory effects on oxidative DNA damage of Leaf from Zelkova serrata with ethyl acetate fractions (EA) and hot water extracts (HW). Between the extracts, EA showed higher activities in 1,1-diphenyl-2-picryl-hydrazyl, 2,2'-azino-bis[3-ethylbenzthiazoline-6-sulphonic acid radical scavenging, $Fe^{2+}$ chelating and reducing power than HW. Also, those of total phenolic content are 56.63 and 51.61 mg/g respectively. In addition, ${\phi}X$-174 RF I plasmid DNA cleavage assay for inhibitory effect by oxidative DNA damage was both EA and HW has significant protective effect on oxidative DNA damage. The results suggested that leaf from Zelkova serrata with ethyl acetate fractions and hot water extracts have surpassing potential as natural resources with antioxidant and inhibitory effect on oxidative DNA damage.
Kim, Su-Jung;Seo, Go-Un;Seo, Bo-Young;Park, Eun-Ju;Lee, Seung-Cheol
Korean journal of food and cookery science
/
v.27
no.4
/
pp.99-106
/
2011
The antioxidant properties of Robinia pseudoacacia L. water and 70% ethanol extracts were evaluated by determining total phenolic content (TPC), DPPH radical scavenging activity (RSA), and reducing power (RP). The water extract showed higher TPC (9.07 mg/g gallic acid equivalents) and RP than those of ethanol extract, whereas ethanol extract had greater DPPH RSA. The R. pseudoacacia L. extracts also showed antigenotoxic effects for 200 ${\mu}M$$H_2O_2$-induced DNA damage in human leukocytes. The 200 ${\mu}M$$H_2O_2$-induced DNA damage decreased following treatment with the water extract. Reductions in DNA damage with 50 ${\mu}g/ml$ of the water and ethanol extracts were 46.5 and 32.4%, respectively.
Seo, Yoo-Na;Kim, Jum-Ji;Sung, Kwang-Soo;Lee, Mi-Young
Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
/
v.11
no.12
/
pp.4922-4927
/
2010
In order to investigate whether the ethanol extract of Acanthopanax sp. might inhibit herbicide-induced DNA damage and erythrocyte damage, the suppression of the oxidative DNA damage of lymphocyte and erythrocyte damage in the presence of the extract were evaluated by comet assay and hemolysis assay, respectively. Phenoxy herbicides, named 2,4-D (2,4-dichlorophenoxyacetic acid) and 2,4,5-T (2,4,5-trichlorophenoxyacetic acid) and bipyridyl herbicide paraquat induced oxidative DNA damages of lymphocytes. However, the oxidative DNA damage by 2,4-D, 2,4,5-T or paraquat was inhibited in vitro upon treating Acanthopanax extract. Moreover, the erythrocyte damage was also suppressed in vitro by Acanthopanax extract treatment.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
/
v.39
no.6
/
pp.805-812
/
2010
DNA damage including base modifications, loss of base and breaks in DNA strands can occur by exposure to irradiation, smoking and several components of food. Unrepaired DNA damage is known to lead to cellular dysfunction, cell death, cancer, and other diseases such as arteriosclerosis and diabetes. The protective effect of garlic on oxidative stress induced DNA damage has been reported recently. In this study, we investigated the protective effect of garlic extracts prepared by different processing methods (raw garlic extracts, RGE; grilled garlic extracts, GGE; pickled garlic extracts, PGE) on leukocytic DNA damage using comet assay. Human leukocytes were incubated with ethanol and methanol extract of garlic at various concentrations (1, 5, 10, 50 ${\mu}g$/mL), followed by oxidative stimuli (200 ${\mu}M$$H_2O_2$ or 200 ${\mu}M$ 4-hydroxynonenal (HNE)). The methanol and ethanol extracts of RGE, GGE, and PGE showed inhibitory activities of DNA damage induced by $H_2O_2$ or HNE. Especially methanol extract of RGE ($ED_{50}$; 13.3 ${\mu}g$/mL) had a higher antigenotoxic effect on $H_2O_2$ induced DNA damage than those of GGE (23.5 ${\mu}g$/mL) or PGE (24.5 ${\mu}g$/mL). HNE induced DNA damage tended to be effectively inhibited by the lower concentration of all garlic extracts. Therefore, garlic might have protective effects against oxidative DNA damage regardless of processing methods (raw, grilled, pickled) which are the general consumed forms of garlic in Korea.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.