• 생명과학회지
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• 제17권12호
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• pp.1622-1626
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• 2007

4개의 후보 유전자를 분석해본 결과, 돼지의 주요 염색체 부위 및 유전자들이 주요 경제성 요인들과 관계가 있는 것으로 확인됐다. 양돈업계에서 DNA 기술을 이용한 염색체 정보를 활용하기 위해 본 연구에서는 4개의 후보 유전자에서 생성된 중합효소연쇄반응(PCR) 생성물을 비교 재 서열 함으로써 단일염기변이(SNP) 표지들을 개발했다. 또한 이들 4개의 SNP에 대해 PCR 제한효소 절편길이 다형 성(RFLP)분석을 전개한 후, 이를 대한민국 내 버크셔 종 돼지 개체군의 유전자형을 분석하는데 활용했다. 본 연구는 유용한 단일염기변이를 식별하고 돼지개체군 내 경제적으로 중요한 특성들과 SNP의 연관성을 확인하는 데 그 목적이 있다.

• 한국축산식품학회지
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• 제37권6호
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• pp.926-930
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• 2017

High-quality meat is of great economic importance to the pig industry. The 1-acylglycerol-3-phosphate-O-acyltransferase 5 (AGPAT5) enzyme converts lysophosphatidic acid to phosphatidic acid in the mitochondrial membrane. In this study, we found that the porcine AGPAT5 gene was highly expressed in muscle tissue, influencing meat characteristics, and we also identified a non-synonymous single-nucleotide polymorphism (nsSNP) (rs196952262, c.673 A>G) in the gene, associated with a change of isoleucine 225 to valine. The presence of this nsSNP was significantly associated with meat color (lightness), lower cooking loss, and lower carcass temperatures 1, 4, and 12 h after slaughter (items T1, T4, and T12 on the recognized quality scale, respectively), and tended to increase backfat thickness and the water-holding capacity. These results suggest that nsSNP (c.673A>G) of the AGPAT5 gene is a potential genetic marker of high meat quality in pigs.

• 한국축산시설환경학회지
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• 제12권1호
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• pp.13-20
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• 2006

품종과 성 및 체중이 검정돈의 행동특성에 미치는 영향을 분석하기 위하여 공인 종돈능력 검정소에서 검정중인 Duroc, Landrace, Yorkshire 및 Berkshire 등 4개 품종 32두의 행동패턴을 녹화한 자료의 비디오 분석을 실시하였다. 또한 4개 품종 8,477두를 대상으로 돼지의 주요 경제형질인 일당증체량, 90kg 도달일령 및 사료요구율에 영향을 미치는 품종 및 성의 효과를 추정하였다. 검정돈의 품종에 따른 행동특성의 차이는 Berkshire 종이 앞으로 엎드린 자세와 앉은 자세로 보낸 시간의 비율이 상대적으로 낮고 걷는 동작, 물을 마시는 동작 및 사료를 먹는 동작으로 보내는 시간의 비율이 다른 품종에 비하여 상대적으로 높게 나타났다. 성에 따라서는 수퇘지가 서있는 자세로 보낸 시간과 사회성 행동으로 보낸 시간 비율이 높게 나타났다. 체중에 따라서는 60kg 이상의 체중에서 30kg 이하의 돼지에 비하여 앞으로 엎드린 자세로 보낸 시간의 비율이 낮았으며, 서있는 시간의 비율이 높게 나타났다. 그러나 그 외의 행동과 동작으로 보낸 시간의 비율은 차이가 없었다. 검정돈의 모든 형질에서 품종 간에 뚜렷한 차이를 나타내었으며, 일당증체량은 Duroc 종이 가장 우수하였고, 90kg 도달일령은 Berkshire 종이 가장 불량하였다. 사료요구율은 Duroc 종이 가장 우수하였고 Yorkshire 종과 Berkshire 종이 불량하였다. 검정돈의 각 형질에 대한 성별에 따른 차이를 보면 일당증체량은 수퇘지가 양호하였고 90kg 도달일령은 차이가 없었으며, 사료 요구율은 수퇘지가 우수하였다. 결론적으로 각각의 행동이나 동작으로 보낸 시간의 비율이 품종과 성 및 체중에 따라 차이가 있음을 알 수 있는데, 이는 품종과 성 및 성장단계에 따라 돼지가 가지는 특유의 행동패턴을 나타낸 것으로 판단된다. 돼지의 품종과 성 및 성장단계에 따라 나타나는 특유의 행동특성과 생산성, 취급, 관리와의 연계에 대한 진전된 연구가 필요한 것으로 사료된다.

• 한국축산식품학회지
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• 제38권4호
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• pp.703-710
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• 2018

Bromodomain-containing protein 2 (BRD2) is a nuclear serine/threonine kinase involved in transcriptional regulation. We investigated the expression and association of the BRD2 gene as a candidate gene for meat quality traits in Berkshire pigs. BRD2 mRNA was expressed at relatively high levels in muscle tissue. Statistical analysis revealed that the c.1709G>C polymorphism of the BRD2 gene was significantly associated with carcass weight, meat color ($a^*$, redness), protein content, cooking loss, water-holding capacity, carcass temperatures 4, 12 and 24 h postmortem, and the 24 h postmortem pH in 384 Berkshire pigs. Therefore, this polymorphism in the porcine BRD2 gene may be used as a candidate genetic marker to improve meat quality traits in pigs.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제28권2호
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• pp.151-157
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• 2015

Fatness qualities in pigs measured by the amount of fat deposition and composition of fatty acids (FAs) in pork have considerable effect on current breeding goals. The stearoyl-CoA desaturase (SCD) gene plays a crucial role in the conversion of saturated FAs into monounsaturated FAs (MUFAs), and hence, is among the candidate genes responsible for pig fatness traits. Here, we identified a single nucleotide polymorphism (SNP, $c.^*2041T$ >C) in the 3' untranslated region by direct sequencing focused on coding and regulatory regions of porcine SCD. According to the association analysis using a hundred of Berkshire pigs, the SNP was significantly associated with FA composition (MUFAs and polyunsaturated FAs [PUFAs]), polyunsaturated to saturated (P:S) FA ratio, n-6:n-3 FA ratio, and extent of fat deposition such as intramuscular fat and marbling (p<0.05). In addition, the SNP showed a significant effect on the SCD mRNA expression levels (p = 0.041). Based on our results, we suggest that the SCD $c.^*2041T$ >C SNP plays a role in the gene regulation and affects the fatness qualities in Berkshire pigs.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제32권11호
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• pp.1657-1663
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• 2019

Objective: A genome-based best linear unbiased prediction (GBLUP) method was applied to evaluate accuracies of genomic estimated breeding value (GEBV) of carcass and reproductive traits in Berkshire, Duroc and Yorkshire populations in Korean swine breeding farms. Methods: The data comprised a total of 1,870, 696, and 1,723 genotyped pigs belonging to Berkshire, Duroc and Yorkshire breeds, respectively. Reference populations for carcass traits consisted of 888 Berkshire, 466 Duroc, and 1,208 Yorkshire pigs, and those for reproductive traits comprised 210, 154, and 890 dams for the respective breeds. The carcass traits analyzed were backfat thickness (BFT) and carcass weight (CWT), and the reproductive traits were total number born (TNB) and number born alive (NBA). For each trait, GEBV accuracies were evaluated with a GEBV BLUP model and realized GEBVs. Results: The accuracies under the GBLUP model for BFT and CWT ranged from 0.33-0.72 and 0.33-0.63, respectively. For NBA and TNB, the model accuracies ranged 0.32 to 0.54 and 0.39 to 0.56, respectively. The realized accuracy estimates for BFT and CWT ranged 0.30 to 0.46 and 0.09 to 0.27, respectively, and 0.50 to 0.70 and 0.70 to 0.87 for NBA and TNB, respectively. For the carcass traits, the GEBV accuracies under the GBLUP model were higher than the realized GEBV accuracies across the breed populations, while for reproductive traits the realized accuracies were higher than the model based GEBV accuracies. Conclusion: The genomic prediction accuracy increased with reference population size and heritability of the trait. The GEBV accuracies were also influenced by GEBV estimation method, such that careful selection of animals based on the estimated GEBVs is needed. GEBV accuracy will increase with a larger sized reference population, which would be more beneficial for traits with low heritability such as reproductive traits.

• 생명과학회지
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• 제19권4호
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• pp.467-471
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• 2009

돼지 6품종(Landrace, Duroc, Large White, 한국재래돼지, Berkshire, Hampshire)을 대상으로 기존에 보고된 서열을 바탕으로 제작한 primer를 이용하여 mtDNA D-loop 전체영역을 증폭하였다. 증폭된 PCR product를 cloning 및 DNA sequencing, 다중염기서열비교를 통하여 분석한 결과, mtDNA에서 heteroplasmy가 나타나는 D-loop 내 tandem repeat region 이후에 11-bp 중복이 존재하는 것을 확인하였다. 이런 중복현상은 일본재래돼지와 Duroc에서 보고되었지만, 이를 이용한 돼지 품종별 중복현상의 빈도 및 분포에 관한 연구는 이루어져있지 않다. 품종별 11-bp 중복현상을 분석하기 위해서 6품종을 대상으로 중복지역을 포함한 약 150 bp 절편을 증폭하였으며, PAGE 방법을 통하여 분석하였다. 그 결과 본 연구에서 사용한 품종들 중 모든 Large White에서 중복현상이 발생하는 것을 확인하였으며, Duroc인 경우 11.2% (9/80)에서 중복현상이 확인되었다. 반면에 Landrace, 한국재래돼지, Berkshire 및 Hampshire에서는 전혀 발견되지 않았다. 이런 결과로서, 11-bp 중복현상의 분석은 현재 구별이 불가능한 Landrace와 Large White를 구별할 수 있는 유용한 DNA marker로서 사용이 가능할 것이다.

• 농업생명과학연구
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• 제45권1호
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• pp.79-88
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• 2011

연구는 사일리지 사료를 급여하였을 때 돼지 품종과 사일리지 급여 유무에 따른 등심의 품질 특성에 미치는 영향을 평가하기 위해 실시하였다. 돼지품종은 가고시마 와타나베 흑돼지 (B), 삼원교잡종[$D(Landrace{\times}Yorkshire){\times} Duroc$], 미국산 버크셔종(A) 등에 대해 각각 시험구와 대조구 20두씩 총120두를 공시하였으며, 개시체중은 평균 $69.3{\pm}3kg$, 시험기간은 평균 $66.7{\pm}9.3$일, 출하일령은 200~210일이었다. 사일리지를 급여하지 않은 대조구 (C)에 비해 급여한 처리구 (T)가 조단백질 함량은 많았고, 육색은 밝았으며, 신선육 관능평가 시 외관, 육색, 상강도 및 전체적 기호도에서 높은 점수를 보였고, stearic산과 oleic산은 낮고, linoleic산, arachidonic산, 필수지방산 및 필수지방산/불포화지방산 비율은 높게 나타났다. 사일리지 급여시 단맛 관련 아미노산 함량은 높은 장점을 지닌 반면 육색의 적색도는 낮고, 가열감량과 육즙감량은 많아 다즙성이 낮았으며, 육의 탄력성이 낮고 지방의 밝기는 어둡고 황색도가 높은 단점을 보였다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제49권3호
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• pp.405-414
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• 2007

돼지의 내인성 레트로 바이러스인 PERV의 존재는 돼지의 무균 사육을 통해서도 제거할 수 없으며, 장기 이식 시 인수 공통 감염의 위험성을 내포하고 있으므로, 이종 간 장기 이식 시 면역 거부 반응과 더불어 해결해야 할 가장 큰 문제점 중의 하나이다. 본 연구에서는 국내에서 사육되고 있는 Berkshire, Duroc, Landrace, Yorkshire 종을 비롯하여 국내 미니 돼지 및 제주도 토종 흑돼지에서 PERV의 존재 유무 및 종류에 대하여 확인 및 검출하는 중합효소 연쇄반응(PCR) 기반 기법을 확립하였다. 사용된 모든 공시 돼지의 genomic DNA로부터 PERV- A 및 PERV-B가 모두 검출되었으며, PERV-C의 경우 음성대조구인 PK15 세포에서의 결과와 비교했을 때, Duroc종에서 매우 낮은 양의 PCR 산물이, 국내 미니돼지와 제주 토종 흑돼지에서는 상대적으로 높은 양의 PCR 산물이 검출되었다. 또한 PERV-A와 PERV-B의 경우 특이적 primer와 제한효소 BamHI을 이용한 PCR- RFLP를 통하여 확인할 수 있었다. 본 연구의 PERV 검출법은 이종 간 장기 이식 시 PERV에 대한 안전 검정 및 PERV의 분류 방법으로서 활용가능할 것으로 사료된다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제46권6호
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• pp.903-908
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• 2004

다양한 포유동물의 미토콘드리아 유전자들에서 선택적 개시코돈(AIC)들이 보고되었다. 본 연구는 돼지 5 품종에서 mtDNA ND2 유전자의 AIC 양상을 분석하였다. 두 종류의 AIC 서열들이 발견되었고, 품종 집단간에서 각기 다른 출현빈도를 보였다. ND2의 methionine codon으로 Large White와 Landrace는 각각 전 개체에서 ATA와 ATT 서열로 확인되었다. 다른 3 품종(Berkshire, Duroc, Hampshire)의 경우는 두 서열이 모두 발생하였으며, 91.9, 21.3, 60.0%의 빈도로 ATA를 보였다. 기존의 연구들에 의하면 중국재래돼지들이 모두 개시코돈 ATA를 갖는다고 보고되어 있다. 미토콘드리아 ND2 단백질의 합성과정에서 AIC가 어떤 영향을 미치는지는 설명할 수 없으나, 본 연구에서 나타난 AIC 다형성과 품종특이적인 분포양상은 돼지의 육종에 있어 모계추적을 위한 분자적 표지인자로서 이용될 수 있을 것을 사료된다.