Resistance of perilla varieties to Botrytis cinerea LVF12 was evaluated, while antagonistic bacteria were selected and tested for their efficacy towards biological control of gray mold rot caused by B. cinerea. Among 11 perilla varieties tested for disease resistance, Milyang variety showed some degree of resistance, while the rest of varieties showed no resistance. Among 250 bacterial isolates collected from perilla loaves and rhizosphere of perilla plants, six isolates showed high levels of inhibitory effect on mycelial growth and conidial germination of B. cinerea in in vitro test. Using the pot test in growth chambers these isolates showed high levels of disease suppression, with Nl isolate showing 95.3% of control value and N4 isolate showing 90.8% of control value. Further test was performed to evaluate the two isolates ability for disease prevention and/or disease therapy, and results showed almost 100% of control vague. Isolates Nl and N4 were identified as Bacillus licheniformis and 5. megatepium, respectively, according to Bergey's manual, API 20E and 50CHB test kit, and Transmission electron microscope.
A 1,3 kb cellulase gene encoding novel bifunctional cellulase-chitosanase activity was cloned from biopolymer-producing alkali-tolerant B. lichenformis NBL420 in E. coli. A recombinant cellulase-chitosanase, named CelA, was expressed and purified to homogeneity. The activity staining and the enzymatic characterization of the purified CeIA revealed bifunctional activities on carboxymethyl cellulose (CMC) and glycol-chitosan. The similar characteristics of the enzymatic activities at the optimum pH, optimum temperature, and thermostability Indicated that CelA used a common catalytic domain with relaxed substrate specificity. A comparison of the deduced amino acids in the N-terminal region revealed that the mature CelA had a high homology with the previously identified bifunctional cellulase-chitosanase of Myxobacter sp. AL- 1.
In the Bacillus amyloliquefaciens ${\alpha}$-amylase (BAA), the loop (residues 176-185; region I) that is the part of the calcium-binding site (CaI, II) has two more amino acid residues than the ${\alpha}$-amylase from Bacillus licheniformis (BLA). Arg176 in this region makes an ionic interaction with Glu126 from region II (residues 118-130), but this interaction is lost in BLA owing to substitution of R176Q and E126V. The goal of the present work was to quantitatively estimate the effect of ionic interaction on the overall stability of the enzyme. To clarify the functional and structural significance of the corresponding salt bridge, Glu126 was deleted (${\Delta}$E126) and converted to Val (E126V), Asp (E126D), and Lys (E126K) by site-directed mutagenesis. Kinetic constants, thermodynamic parameters, and structural changes were examined for the wild-type and mutated forms using UV-visible, atomic absoption, and fluorescence emission spectroscopy. Wild-type exhibited higher $k_{cat}$ and $K_m$ but lower catalytic efficiency than the mutant enzymes. A decreased thermostability and an increased flexibility were also found in all of the mutant enzymes when compared with the wild-type. Additionally, the calcium content of the wild-type was more than ${\Delta}E126$. Thus, it may be suggested that ionic interaction could decrease the mobility of the discussed region, prevent the diffusion of cations, and improve the thermostability of the whole enzyme. Based on these observations, the contribution of loop destabilization may be compensated by the formation of a salt bridge that has been used as an evolutionary mechanism or structural adaptation by the mesophilic enzyme.
서로 다른 11주의 Bacillus coagulans와 13종의 Bacillus 속 14주를 deoxyribonucleic acid(DNA)-DNA hybridization method에 의해서 분류학적인 연구를 하였다. 사용한 B. coagulans 11주중 6주는 흙에서(일본 오사까교외) 분리했고, 나머지 5주는 ATCC, IFO에서 authentic strains을 얻어서 사용했다. 사용된 B. coagulans는 Bergey's Manual(8th ed)에 의거 Gordon씨들의 방법으로 동정한 결과 B. coagulans로서 확인되었다. 이렇게 동정된 B. coagulans을 분자 생물학적 차원에서 지금까지의 Conventional taxonomic study와의 관계를 연구하기 위해서 사용한 11주의 B. coagulans중 ATCC 7070을 $^3$H labeled input 즉 standard로 해서 사용했을 때 B. coagulans 내의 intraspecific DNA homology indexes는 76% 이상으로 나타났다. 이와같은 발견은 Bergey's Manual에 의거한 conventional taxonomic study의 결과와 잘 일치하고 있었음으로 새로 분리한 6주와 authentic sources로부터 받은 5주는 같은 group의 B. coagulans라는 사실을 입증해 주었다. 그리고 B. coagulans와 다른 species의 Bacillus 속 즉 B. pumilus(168), B. licheniformis (IFO 12107), B. pumilus(IFO12110), B. firmus(ATCC 14575), B. lentus(ATCC 10840), B. circulans(ATCC 4513), B.macelans(ATCC 8244), B.polymyxa, (ATCC 842), B.sphaericus(ATCC 14577), B.brevis(ATCC 8246, IFO 12334), B.laterosporus(ATCC 64), B. pantothenticus(ATCC 14576) interspecific DNA homology indexes가 각각 2~4%을 보임으로써 B. coagulans는 molecular level면에서 이들 Bacillus 속과는 상동성 관계가 적음을 나타내었다. 반면에 B. coagulans(ATCC 7050)와 E. coli(F-12)와의 상동성은 1%이하였다.
제주도의 여섯 지역과 인천 작약도 근해의 해수로부터 내염성 그람양성 세균 25균주를 분리하여 화학 분류학적 특징과 표현형적 특성을 조사하였다. 분리된 균주들은 화학 분류학적 특징에 의거하여 4개의 group으로 구분되었다. Group1은 40.~49.9 mol% 의 G+C함량과 MK-7의 menaquinome type, peptidoglycan의 주요 아미노산으로 meso-A2pm을 함유하며 Bacillus pumilus와 Bacillus licheniformis, Bacillu megaterium, bacillus subtilis로 동정되었으며, Group 2는 63.9~66.4 mol% 의 G+C 함량과 MK-8을 함유하는 Arthrobacter속 세균이었으며 , Group 3은 31.0~37.6 mol%의 G+G 함량과 MK-7을 함유하며 Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus saprophyticyus, Staphylococcus intermedius 로 , Group 4는 72.0 mol% 의 G+C 함량과 MK-8을 주요 quinone으로 함유하는 Micrococcus luteus로 동정되었다. 분리된 세균들 중 Bacillus 속 세균들은 68%로 우세한 분포를 나타내었다.
동결건조한 chitosan-ascorbate(CAs)와 chitosan-acetate(CAc)의 용해성, 항균성, 항산화성을 비교하였다. 용해성을 조사한 결과 CAs는 증류수, 식초, 녹차, 소주, 맥주, 적포도주에 0.5%이상의 농도로 용해되었으나 간장, 두유, 우유, 오렌지주스, 커피, 참기름, 대두유에는 녹지 않았다. CAc도 CAs의 경우와 비슷하나 맥주에서는 0.1%이하의 농도에서 용해되었으며 적포도주에서는 커드를 형성하였다. CAc의 전자공여능, 항산화능 및 SOD활성은 CAc에서는 각각 0, 40.0 및 10.0%였으나 CAs의 경우는 48.2, 90.6 및 67.5%로 CAc보다 높은 활성을 나타내었다. B. circulans, B. brevis, B. licheniformis, B. arabitane, B. sterothermophillus에 대한 CAs와 CAc의 최소저해농도(MIC)는 다같이 $200\;{\mu}g/disc$이었으며, E. coli O157, Listeria monocytogenous, B. cereus, B. subtilis에 대한 MIC는 다같이 $400\;{\mu}g/disc$으로 뚜렷한 차이를 보이지 않았다. CAs와 CAc의 Hunter's L*값은 $81.95{\sim}82.97$로 뚜렷한 차이가 없었으나 Hunter's a* 및 b*값은 CAs가 높았다. 관능검사 결과, CAs는 CAc에 비하여 신맛과 쓴맛은 낮았으나 떫은맛은 뚜렷한 차이가 없었다. 결론적으로 CAs는 CAc에 비하여 항균성, 항산화성 및 기호도 측면에서 우수하여 식품에의 활용이 기대된다.
The genes encoding the thermostable $\alpha$-amylase and maltogenic amylase from Bacillus lichenciformis were cloned and expressed in E. coli. The recombinant plasmid pTA322 was found to contain a 3.1kb EcoRI genomic DNA fragment of the thermostable $\alpha$-amylase. The cloned $\alpha$-amylase was compared with the B. licheniformis native $\alpha$-amylase. Both $\alpha$-amylase have the same optimal temperature of $70^{\circ}C$ and are stable in the pH range of 6 and 9. The complete nucleotide sequences of the thermostable $\alpha$-amylase gene were determined. It was composed of one open reading rame of 1,536 bp. Start and stop codons are ATG and TAG. From the amino acid sequence deduced from the nucleotide sequence, the cloned thermostable $\alpha$-amylase is composed of 483 amino acid residues and its molecular weight is 55,200 daltons. The content of guanine and cytosine is $47.46mol\%$ and that of third base codon was $53_41mol\%$. The recombinant plasmid, pIJ322 encoding the maltogenic amylase contains a 3.5kb EcoRI-BamHI genomic DNA fragment. The optimal reaction temperature and pH of the maltogenci amylase were $50^{\circ}C$ and 7, respectively. The maltogenic amylase was capable of hydrolysing pullulan, starch and cyclodextrin to produce maltose from starch and panose from pullulan. The maltogenic amylase also showed the transferring activity. The maltogenic amylase gene is composed of one open reading frame of 1,734bp. Start and stop codons are ATG and ATG. At 2bp upstream from start codon, the nucleotide sequence AAAGGGGGAA seems to be the ribosome-binding site(RBS, Shine-Dalgarno sequence). A putative promoter(-35 and-10 regions) was found to be GTTAACA and TGATAAT. From deduced amino acid sequence from the nucleotide srquence, this enzyme was comosed of 578 amino acid residues and its molecular weight was 77,233 daltons. The content of guanine and cytosine was $48.1mol\%$. The new recombinant plasmid, pTMA322 constructed by inserting the thermostable $\alpha$-amylase gene in the EcoRI site of pIJ322 to produce both the thermostable $\alpha$-amylase and the maltogenic amylase were expressed in the E. coli. The two enzymes expressed from E. coli containing pTMA322 was reacted with the $15\%$ starch slurry at $40^{\circ}C$ for 24hours. The distribution of the branched oligosaccharides produced by the single-step process was of the ratio 50 : 50 between small oligosaccharide up DP3 and large oligosaccharide above DP3.
해수클로렐라 (Chlorella elliposidea C020) 에탄올 추출물로부터 항균 및 항곰팡이 활성, 항산화활성, tyrosinase inhibitory 활성 (미백효과)과 용혈활성을 실험하였다. 효율적인 추출을 위해서 동결건조 후 95% 에탄올로 2시간 추출하는 것이 가장 좋다는 것을 알 수 있었다. 해수클로렐라 에탄올 추출물의 항균 및 항곰팡이에 대한 활성을 측정한 결과, B. subtilis PM125와 B. licheniformis, V. parahemolyticus와 E. tarda NUF251에서 활성을 나타내었다. 그러나, 곰팡이인 C. albicanse에 대하여서는 활성을 나타내지 않았으며, 인간의 적혈구로 용혈활성 실험한 결과, 아주 낮은 활성을 나타내었다. DPPH방법을 이용하여 항산화 능력을 측정한 결과, 2 mg/mL에서 75% 라디칼 소거능력을 나타내었다. 해수클로렐라 에탄올 추출물의 tyrosinase 저해활성 $IC_{50}$는 10.87 mg/mL로 나타났다. 이러한 결과를 바탕으로 해수클로렐라 에탄올 추출물로부터 다양한 생리활성물질을 개발하여 고부가가치 제품을 창출할 수 있을 것으로 판단된다.
본 연구에서는 제주도 양식장에서 사육되고 있는 붉바리 장내에서 균주를 분리·동정하여, 산업적으로 활용할 수 있는 프로바이오틱스의 잠재적 가능성을 평가하였다. 붉바리 장내에서 순수 분리된 129균주를 대상으로 1차적으로 자체적인 간이 항균활성 실험을 통해 clear zone이 10 mm 이상 되는 12균주를 선별하여 내담즙성, pH 농도별 내산성, 항산화 활성, 항생제 내성, API kti을 이용한 생리생화학적 특성 실험에 이용하였다. 각 특성 실험을 통해 probiotics으로 잠재적 가능성을 가진 균으로 선발되어진 미생물은 G1, G3, G15, G21, B1, B2, B3, B5 총 8종이다. 8종 중 B균주 그룹(B1, B2, B3, B5)은 G균주 그룹(G1, G3, G15, G21)보다 유의하게 높은 활성을 나타내었다. 선발되어진 미생물의 16S rRNA 염기서열 분석을 통한 계통 분석을 한 결과를 바탕으로 B1 균주는 L. paracasei B1, B2는 L. lactis B2, B3 균주는 Lb. plantarum B3, B5 균주는 L. lactis subsp. hordniae B5, G1은 B. licheniformis G1, G3는 B. velezensis G3, G15는 B. frigoritolerans G15, G21 균주는 B. pumilus G21로 명명하였다.
콩과 옥수수 가루의 천연발효과정에서 분리한 균주들중 phytase 생산성이 우수한 균주는 Bacillus licheniformis와 Enterobacter cloacae로 동정되었으며 그들의 최적배양조건과 최적 phytase 생산조건을 검토한 결과는 다음과 같다. B. licheniformis는 초기 pH 6.0, 온도 3$0^{\circ}C$에서 5일간 배양하였을 때 phytase 생산성이 최대에 달하였고 탄소원은 3%의 glucose를, 질소원으로는 0.5%의 peptone을 첨가하였을 때 최대에 달하였다. E. cloacae의 경우는 pH 7.0, 온도 35$^{\circ}C$에서 5일간 배양하였을 때 최대의 phytase 생산성을 보였으며 탄소원의 첨가는 이당류인 lactose, maltose 및 sucrose를 각각 0.1%, 질소원은 (NH$_4$)$_2$SO$_4$를 0.1% 첨가했을 때 최대의 생산성을 보였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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