• 제목/요약/키워드: Artificial RNA

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The Inhibition of Melanogenesis Via the PKA and ERK Signaling Pathways by Chlamydomonas reinhardtii Extract in B16F10 Melanoma Cells and Artificial Human Skin Equivalents

  • Lee, Ayeong;Kim, Ji Yea;Heo, Jina;Cho, Dae-Hyun;Kim, Hee-Sik;An, In-Sook;An, Sungkwan;Bae, Seunghee
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제28권12호
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    • pp.2121-2132
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    • 2018
  • Abnormal melanin synthesis results in several hyperpigmentary disorders such as freckles, melanoderma, age spots, and other related conditions. In this study, we investigated the anti-melanogenic effects of an extract from the microalgae Chlamydomonas reinhardtii (CE) and potential mechanisms responsible for its inhibitory effect in B16F10, normal human epidermal melanocyte cells, and human skin-equivalent models. The CE extract showed significant dose-dependent inhibitory effects on ${\alpha}$-melanocyte-stimulating, hormone-induced melanin synthesis in cells. Additionally, the CE extract exhibited suppressive effects on the mRNA and protein expression of microphthalmia-associated transcription factor, tyrosinase, tyrosinase-related protein-1, and tyrosinase-related protein-2. The CE extract also inhibited the phosphorylation of protein kinase A and extracellular signal-related kinase, which function as upstream regulators of melanogenesis. Using a three-dimensional, reconstructed pigmented epidermis model, the CE-mediated, anti-pigmentation effects were confirmed by Fontana-Masson staining and melanin content assays. Taken together, CE extract can be used as an anti-pigmentation agent.

Physicochemical Analysis of Yogurt Produced by Leuconostoc mesenteroides H40 and Its Effects on Oxidative Stress in Neuronal Cells

  • Lee, Na-Kyoung;Lim, Sung-Min;Cheon, Min-Jeong;Paik, Hyun-Dong
    • 한국축산식품학회지
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    • 제41권2호
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    • pp.261-273
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    • 2021
  • Leuconostoc mesenteroides H40 (H40) was isolated from kimchi, and its probiotic properties and neuroprotective effect was evaluated in oxidatively stressed SH-SY5Y cells. H40 was stable in artificial gastric conditions and can be attached in HT-29 cells. In addition, H40 did not produce β-glucuronidase and showed resistant to several antibiotics. The conditioned medium (CM) was made using HT-29 cells refined with heat-killed probiotics (Probiotics-CM) and heated yogurts (Y-CM) to investigate the neuroprotective effect. Treatment with H40-CM not only increased cell viability but also significantly improved brain derived neurotropic factor (BDNF) expression and reduced the Bax/Bcl-2 ratio in oxidatively stress-induced SH-SY5Y cells. Besides, probiotic Y-CM significantly increased BDNF mRNA expression and decreased Bax/Bcl-2 ratio. The physicochemical properties of probiotic yogurt with H40 was not significantly different from the control yogurt. The viable cell counts of lactic acid bacteria in control and probiotic yogurt with H40 was 8.66 Log CFU/mL and 8.96 Log CFU/mL, respectively. Therefore, these results indicate that H40 can be used as prophylactic functional dairy food having neuroprotective effects.

First Report of Pectobacterium aroidearum Causing Soft Rot on Ficus carica in Korea

  • Kyoung-Taek Park;Leonid N. Ten;Soo-Min Hong;Song-Woon Nam;Chang-Gi Back;Seung-Yeol Lee;Hee-Young Jung
    • 식물병연구
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    • 제30권1호
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    • pp.88-94
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    • 2024
  • In July 2021, symptoms of soft rot were observed on the stems of Ficus carica in Yeongam, Jeollanamdo, Korea. To accurately diagnose the cause, infected stem was collected and bacterial strain was isolated. Among these, the pathogenic strain KNUB-08-21 was identified as Pectobacterium aroidearum through 16S rRNA gene sequencing and phylogenetic analysis based on the concatenated sequences of the dnaX, leuS, and recA genes. The affiliation of the isolate with this bacterial species was also confirmed by its biochemical characteristics obtained using API ID 32 GN system. Artificial inoculation confirmed the strain's pathogenicity in figs, causing significant damage to both stems and fruits. To our knowledge, this is the first report of P. aroidearum causing soft rot disease in F. carica in Korea.

벼줄무늬잎마름바이러스의 대 발생과 발생 요인 (Severe Outbreak of Rice Stripe Virus and Its Occurring Factors)

  • 김정수;이관석;김창석;최홍수;이수헌;김미경;곽해련;남문;김정선;노태환;강미형;조점덕;김진영;강효중;한종우;김병련;정성수;김주희;고숙주;이중환;김태성
    • 농약과학회지
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    • 제15권4호
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    • pp.545-572
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    • 2011
  • 벼줄무늬잎마름바이러스(Rice stripe virus, RSV)에 대하여 유전자 진단기술인 RT-PCR과 VC/RT-PCR 기술을 개발하였다. ELISA 진단법은 유묘 검정법 보다 평균 40.5%, RT-PCR 진단법은 ELISA 진단법 보다 21%의 진단 효율이 높았다. 2009년 경기도 김포, 평택, 시흥 지역에서 채집한 애멸구의 보독충률을 VC/RT-PCR 진단법과 ELISA 진단법으로 검정한 결과 전체 평균 보독충률은 9.2%로 동일하였다. 벼줄무늬잎마름바이러스가 감염된 벼 포장에서 수집한 13개 분리주의 유전자 유연성은 RNA1과 RNA2는 중국+한국, 중국+한국+일본의 2개의 군으로 구분되었다. 또한 병원성 발현에 관여하는 RNA3는 중국, 중국+한국, 한국+일본의 3개 군으로, RNA4는 중국, 한국, 중국+한국+일본, 한국+일본의 4개의 군으로 구분되었다. 경기도 등 7개 도의 주요 28개의 재배지역에서 채집한 애멸구의 전국 평균 보독충률은 2008년 4.3%, 2009년 6.1%, 2010년 7.2%로 매년 상승하였다. 2008년에는 경기도가 11.3%로 가장 높았으며, 2009년에는 전라남도가 20.1%, 2010년에는 경기도 12.0%, 충청북도 14.2%로 가장 높았다. 보독충률이 가장 높았던 지역은 2008년에는 전북 부안 지역이 22.1%, 2009년에는 전남 완도와 진도가 36%, 2010년에는 충북 보은이 30.0%였다. 월동 애멸구의 전국 평균 밀도는 2008년 13.1 마리, 2009년 13.9 마리, 2010년 5.6 마리였으며, 월동 애멸구의 밀도는 전북 부안 지역이 2008년 39.1 마리, 2009년 60.4 마리로 가장 높았으며, 2010년에는 경기 평택 지역이 14.0 마리로 가장 높았다. 2008년 RSV 발생은 전남 진도, 해남 지역을 중심으로 869 ha가 발생하였으며, 2009년에는 전국적으로 21,541 ha가 발생하였으며, 특히 서해안 지역의 경우 경기도, 인천시, 충남, 전북, 전남의 19개 시군, 39개 읍면, 53개 리에서 3,025 포장을 조사한 결과 55.2%가 부분 고사 이상의 피해가 발생하였다. 2008년부터 3년간 전북 부안, 전남 진도 등에서 월동 애멸구의 시기별 발육을 조사한 결과 5월 20일에서 6월 10일 경에는 월동 후 1세대는 대부분 3령과 4령 이었으며 성충은 6월 하순경에 최성기였다. 2009년 5월 31에서 6월 1일에 태안, 서산, 부안, 신안, 진도 등에서 공중 포충망에 채집한 애멸구는 모두 성충이었으며 밀도는 태안 지역이 963 마리, 서천 919 마리, 신안 819 마리 등으로 매우 많이 포획되었으며, 공중 포충망에 채집된 애멸구는 국내에서 월동한 애멸구 집단이 아니고 중국에서 비래한 애멸구 집단으로 확인되었다. 2010년에는 5월 중순에서 6월 중순까지 공중 포충망에 애멸구 성충이 거의 채집되지 않았다. 2009년 충남 홍성, 전북 부안, 전남 영광 등 서해안 8개 지역의 공중 포충망에서 채집한 애멸구 성충의 RSV 보독충률은 2.1%에서 9.5%로 변이가 컸으며, 보령이 9.5%로 가장 높았으며, 다음으로 충남 홍성 7.9%, 전남 영광 6.5%, 충남 태안 6.4%였다. 애멸구 비래 후 약 10일 후에 공중 포충망 주변의 논에 심겨진벼에 대하여 RSV의 유전자 진단 결과 태안 84.6%, 부안 65.4%, 진도 92.9% 이었으며, 평균 감염률은 81% 이었다. 보리는 RSV의 주요 월동 기주식물로 알려져 있으나 RSV의 감염률은 경기 평택 등 전국에서 530점을 채집하여 유전자 진단 결과 감염률이 0.2%로 매우 낮았다. RSV의 새로운 자연 기주식물로 29종이 확인되었다. 하계 일년생 식물은 조개풀 등 13종, 동계 일년생은 들묵새 등 11종, 다년생으로는 우산잔디 등 5종 이었다. RSV 감염률은 동계 일년생인 들묵새 24.9%, 하계 일년생인 바랭이 44.9%, 물피 95.2%, 가을강아지풀 65.5%이었으며, 다년생인 물억새는 33.3%였다. RSV에 감수성인 동진1호 등 8개 품종과 저항성인 삼광벼 등 17개 품종에 대하여 2009년 부안, 익산, 김제 지역의 자연 포장에서 병징 발현 여부를 조사한 결과 감수성 8개 품종은 모두 감수성이었으며, 진성 저항성 품종 중 온누리 등 12개 품종은 감수성이었으며 삼광벼 등 5개 품종은 포장 저항성이었다. RSV에 저항성인 남평벼 등 4 품종과 감수성인 동진1호 등 3 품종을 대상으로 바이러스를 인공접종한 결과 RSV의 병징 발현률은 감수성 품종의 경우 평균 53.3%이었으며 저항성 품종의 경우 평균 34.0%로 19.3% 낮았다. 감수성인 흑남벼와 저항성인 남평벼를 이용하여 병징 발현률과 바이러스 감염률을 조사한 결과 병징 발현률은 흑남벼 28%, 남평벼 12%로 감수성 품종이 병징 발현률이 2배 이상 높았다. 그러나 체내 바이러스 감염률은 흑남벼 85%, 남평벼 97%로 오히려 저항성 품종에서 12%의 높은 감염률을 보였다. 저항성 품종에서의 저항성 기작은 병징 발현에 대한 저항성이며 바이러스 증식에서는 저항성이 아니었다. RSV에 저항성 품종인 남평벼, 온누리와 감수성 품종인 동진1호, 운광벼를 이용하여 생육시기별로 인공접종하여 수량 감소를 2008년부터 3년간 조사한 결과 감수성 품종에서는 주당 수량을 보면 유묘기 감염시 7.8 g, 분얼기 감염시 8.5 g, 최고 분얼기 감염시 13.8 g으로 무처리에 비하면 수량 감소율이 유묘기 51%, 분얼기 46%, 최고 분얼기 13%로 일찍 감염될수록 수량 감소 영향이 컷다. 저항성 품종에서는 시기별 감염과 수량 감소가 통계적으로 상관이 없었다. 자연 발병된 농가 포장에서 운광 품종을 대상으로 태안과 진도지역에서 조사한 결과 발병경률 23.4% 이상이면 발병경률의 증가에 따라서 상관계수 0.94로 수량 감소율도 동일하게 증가하였다.

전통 발효 청국장으로부터 분리한 Bacillus 균주들의 특성 및 기능 분석 (Characteristics and functional analysis of Bacillus strains from the fermented soybean products, Cheonggukjang)

  • 문지영;권순우;홍승범;석순자;김정선;김수진
    • 미생물학회지
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    • 제51권3호
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    • pp.300-307
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    • 2015
  • 좋은 청국장을 발효하는 균주를 선발하기 위하여 청국장 시료로부터 8개의 균주를 선발하였다. 이들 중 7균주는 Bacillus subtilis subsp. subtilis와 99.9% 이상의 가장 높은 16S rRNA 유사도를 보였고, 한 균주는 B. licheniformis와 높은 유사도를 보였다. 선발 균주의 효소 생성을 분석한 결과 모든 균주에서 amylase, cellulase, protease 그리고 lipase 활성을 보였고, 6균주에서 혈전용해능을 보였다. 또한 전통방법으로 제조한 청국장에서 분리한 균주들의 안전성을 확보하고자 분리균주와 계통학적으로 가까운 Bacillus cereus의 독소유전자 7종의 유무를 확인한 결과 모든 선발균주에서 독소유전자 7종을 가지고 있지 않았다. 선발 균주 중 8균주에서 histamine과 tyramine의 생성이 없거나 최소한의 생성을 보였고, HPLC를 이용한 바이오제닉 아민 분해능 분석 결과 대부분의 균주가 tyramine 분해능을 보였다. 선발된 균주로 발효한 청국장의 발효능, 관능, 휘발성염기질소 생성을 확인 하여 7균주가 좋은 품질의 청국장을 만드는 것으로 확인되었고, 이들 선발된 균주로 만든 청국장의 metabolic profile을 분석하였다.

안지오텐신 전환효소 저해 활성 및 항산화 활성을 가진 젖산균의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of Lactic Acid Bacteria with Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitory and Antioxidative Activities)

  • 박성보;김정도;이나리;정진하;정성윤;이희섭;황대연;이종섭;손홍주
    • 생명과학회지
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    • 제21권10호
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    • pp.1428-1433
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    • 2011
  • 본 연구에서는 ACE 저해능 및 항산화능이 있는 식물성 젖산균을 다양한 식물체로부터 분리한 후, 그 특성을 조사하였다. 김치, 부추, 포도 및 동동주에서 K-1, K-21, L-5, G-3 및 D-3 균주가 분리되었으며, 16S rRNA gene 염기서열 분석을 통하여 이들은 각각 Pediococcus pentosaceus, Lactobacillus plantarum, Weissella cibaria, L. plantarum 및 L. brevis로 동정되었다. 분리균주들은 MRS broth에서 44.3-71.9%의 ACE 저해능을 나타내었으며, 특히 G-3, L-5, K-1 균주는 skim milk가 함유된 MRS broth에서 59.0-8-98.6%의 높은 ACE 저해능을 나타내었다. 분리 균주는 42.5-82.7%의 DPPH radical 소거능을 나타내었으며, G-3 및 K-1 균주는 pH 2.5의 인공위액에서 42.2-88.1%의 높은 생존율을 나타내었다. 분리균주는 0.3% oxgall에서 24시간 배양시 55.4-112.8%의 내성을 나타내었다. 또한 분리균주는 유기산 생성에 따른 pH 감소 효과로 인하여 Pseudomonas aeruginosa를 포함한 일부 병원성 세균의 생육을 억제할 수 있었다.

Fluorescent In Situ Hybridization방법으로 분석한 소양호 세균 군집 구조의 계절적 변화 (Seasonal Changes of bacterial community analysed by fluorescent in situ hybridization method in Lake Soyang)

  • 홍선희;안태석
    • 미생물학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.169-174
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    • 1998
  • 소양호에서 세균군집의 계절적, 수심별 변화를 파악하고자 총세균수와 EUB338, ALG1b, BET42a, GAM42a와 CF probe 등 fluorescent rRNA target oligonuvleotide probe와 반응하는 세균 개체수를 측정하였다. 총세균수는 $0.5{\sim}2.01{\times}10^6cells{\cdot}ml^{-1}$이였으며, 2 m와 5 m 수층에서 높게 나타났다. 총세균수에 대한 Eubacteria의 비율은 22~100%이였고, Proteobacteria ${\alpha}$-group은 Eubacteria의 2.6~66.7%, ${\beta}$-group은 4.5~53.5%, ${\gamma}$-group은 4.6~76.7%, 그리고 Cytophage-Flavobacterium group은 2.1~35.9%이였다. 또한 세균군집은 계절별, 수심별로 다양한 변화를 보여, 겨울철은 ${\beta}$-group이, 봄철과 초여름은 ${\gamma}$-group이, 여름철은 ${\alpha}$-group이 우점하였고, Cytophage-Flavobacterium group이 특정적으로 우점하는 시기는 없었다. 이러한 세균 군집 구조의 분포로 계절별, 수심별로 호수에 대한 독특한 특징을 알 수 있었다.

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귀전우, 백화사설초, 와송 추출물을 처치한 난소암과 자궁경부암 세포에서의 단백질 발현 변화 (Altered Protein Expression in Ovarian and Cervical Cancer Cells by the Treatment of Extracts from Euonymus alatus Sieb, Oldenlandia diffusa (Willd.) Roxburgh, and Orostachys japonicus A. Berger)

  • 김경순;예성철;유병철;조종관;이연월;유화승
    • 대한한방내과학회지
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    • 제32권1호
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    • pp.33-42
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    • 2011
  • Background : Despite recent advances in cancer management, prognosis of ovarian cancer is poor. Anticancer effects of herbal medicine, such as Euonymus alatus Sieb, Oldenlandia diffusa (Willd.) Roxburgh, and Orostachys japonicus A. Berger, have been reported in treatment of ovarian and cervical cancers, but the systematic approaches to explain their molecular mechanism(s) have not yet been established. Objectives : To establish a basis of understanding for anti-cancer mechanisms of herbal medicine, we profiled protein expression in human ovarian and cervical cancer cells treated with the extracts from Euonymus alatus Sieb, Oldenlandia diffusa (Willd.) Roxburgh and Orostachys japonicus A. Berger. Methods : Human ovarian cancer cell line NIH:OVCAR-3, and human cervical cancer cell line HeLa were employed in the present study. Whole protein was obtained from the cells harvested at 48 hours after the treatment with herbal water-extract, and analyzed by 2DE-based proteomic approach. Results : Various changes of protein expression induced by the herbal treatment were monitored : down-regulation of molecular chaperone (calreticulin variant), glycolytic enzymes (D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase and alpha-enolase), RNA processing molecules (hnRNP A2/B1), and antioxidant protein (peroxiredoxin 1). Conclusions : Repression of glycolysis has been accepted as the mechanism to increase anticancer reagent's effect. Thus, down-regulation of glycolytic enzymes by the herbal extracts suggested a possible synergistic effect of herbs in the presence of platinum-based therapeutics. In further study, as well as the synergistic effect of the herbs, it has to be further validated whether artificial regulation of hnRNP A2/B1 in ovarian cancer cells affects various cancer survival factors, since RNA processing can be interrupted by deranged expression of hnRNP subtypes, and it results in an inhibition of cancer cell growth.

서해안 해수로부터 분리한 한천분해 해양미생물 Pseudoalteromonas sp. H9의 동정 및 특성 연구 (Isolation and Characterization of an Agar-hydrolyzing Marine Bacterium, Pseudoalteromonas sp. H9, from the Coastal Seawater of the West Sea, South Korea)

  • 지원재;윤영상;김종희;홍순광
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제43권2호
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    • pp.134-141
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    • 2015
  • 대한민국 대천 해수로부터 agarase를 생산하는 균주 H9을 분리하였다. 본 균주는 16S rRNA 염기 염기서열 분석결과로부터 Pseudoalteromonas espejiana NCIMB2127T (98.98%), Pseudoalteromonas carrageenovora ATCC12662T (98.78%), Pseudoalteromonas atlantica IAM12927T (98.64%), Pseudoalteromonas issachenkonii KMM3549T (98.63%) 등과 높은 상동성을 보였다. 균주 H9은 genomic DNA 내 G+C 농도가 41.56%이고 주요 퀴논으로 quinone-8을 포함하고 있다. 균주 H9의 주요 지방산으로 C16:1ω7c (34.3%), C16:0 (23.72%), C18:1ω7c (13.64%) 등이 포함되었다. 이러한 유전적, 생리적 특성에 따라 균주 H9은 Pseudoalteromonas 속의 균으로 분류하여 Pseudoalteromonas sp. H9으로 명명하였다. 균주 H9이 세포외부로 분비하는 총 agarase는 40-45℃와 pH 7.0-8.0의 조건에서 높은 효소 활성을 갖으며, agarose를 분해하여 (neo)agarotetraose와 (neo)agarohexaose를 생산하였다. 균주 H9은 한천분해를 위해 유용하게 사용될 수 있으며, 다양한 생리활성을 갖는 (neo)agarooligosaccharide는 기능성 식품, 화장품 등의 산업에 유용하게 사용될 수 있을 것으로 기대된다.

잠재적 사료첨가제로서 Pediococcus acidilactici SRCM102607의 생균제 특성 및 면역활성 효과 (Probiotic Properties and Immunomodulator Evaluation of the Potential Feed Additive Pediococcus acidilactici SRCM102607)

  • 신수진;하광수;정수지;류명선;김진원;양희종;곽미선;성문희;정도연
    • 생명과학회지
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    • 제30권10호
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    • pp.896-904
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    • 2020
  • 본 연구에서는 가축의 면역증강용 생균제 개발을 위하여 Pediococcus acidilactici SRCM102607의 프로바이오틱스 특성 및 면역활성을 조사하였다. 전통발효식품으로부터 유산균을 분리 하였고, 분리 유산균을 대상으로 가축유해 미생물 5종에 대한 항균활성을 측정하였다. 우수한 결과를 나타내는 5종의 유산균을 1차 선별하였고, 이를 대상으로 생균제 소재 활용 가능성을 확인하기 위해 용혈성, 담즙산염 분해효소, 항산화 활성 분석을 실시하여 최종적으로 SRCM102607을 선별하였으며, 16S rRNA 유전자 염기서열 분석을 통해 Pediococcus acidilactici SRCM102607로 명명하였다. SRCM102607의 pH 2 조건에서 내산성은 1.54×105 CFU/ml의 생균수를 보였으며, 0.5% 이상의 oxgall이 포함된 조건에서도 105 CFU/ml 이상의 높은 생균수를 나타내었다. 또한, 선발균주의 산업적으로 활용할 수 있는 가능성을 검토하기 위해 항생제 내성 및 분해 효소능을 측정하였고 다양한 항생제에 대한 내성과 유해 효소를 생성하지 않음을 확인하였고, 최종적으로 면역 증강제로서의 활용 여부를 확인하기 위해 TNF-α 생성능(171.86±4.00 ng/ml)을 확인하였다. 본 연구를 기반으로 SRCM102607은 가축 생균제 소재로 활용 가능성과 면역활성이 뛰어난 유산균으로 생균제 산업에서의 잠재적 적용 가능성을 확인하였다.