• 제목/요약/키워드: ABI

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다양한 스트레스에 유도되는 들잔디 ZjWRKY3, ZjWRKY7의 분석 (Analysis of ZjWRKY3, ZjWRKY7 induced by multiple stress in Zoysia japonica)

  • 김우남;송인자;강홍규;선현진;양대화;이용억;권용익;이효연
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제44권3호
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    • pp.220-228
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    • 2017
  • 식용작물, 사료, 잔디를 포함하는 모든 작물은 건조, 염, 저온, 고온 등의 여러 가지 환경스트레스의 영향을 빈번히 받기 때문에 작물의 생산성이 떨어지게 된다. 식물은 환경스트레스 상황에서 스스로 벗어날 수 없다. 따라서 식물은 환경 스트레스를 극복하는 방향으로 진화하였다. ARF, ABI3, NAC, HSF, WRKY 같은 환경 스트레스에 반응하는 유전자들이 식물에서 보고되었다. 이 유전자들은 환경스트레스에 반응하는 전사인자로, 식물의 스트레스반응 경로에 연관되어 있다. OsWRKY76의 경우에는 저온 및 병원균에 대한 내성을 증가시켰고, AtWRKY28 의 경우 여러 가지 환경스트레스에 관련이 있는 것으로 보고되었다. 들잔디는 정원이나 골프코스에서 가장 흔하게 사용되는 잔디이다. 하지만 들잔디에서는 아직 WRKY 유전자가 알려지지 않았다. 본 연구에서는 들잔디로부터 1개의 WRKY domain을 포함하는 ZjWRKY3, ZjWRKY7 를 분리하였다. ZjWRKY3과 ZjWRKY7은 저온, 건조, 염 스트레스에 발현이 증가하였다. 들잔디의 갈색퍼짐병을 일으키는 R. solani의 감염이 ZjWRKY3과 ZjWRKY7의 발현을 증가시켰다. 또한 ZjWRKY3, ZjWRKY7이 Zjchi 유전자 promoter의 W-box에 결합하여 전사를 조절한다는 사실을 확인 하였다. 따라서 ZjWRKY3, ZjWRKY7 유전자는 전사인자로서 환경스트레스 및 병원균 관련 하위 유전자들을 조절할 것으로 예상된다.

실험적으로 항원에 의하여 일차 자극된 $CD4^+$ T 세포의 이차 면역 반응의 분석 (The Kinetics of Secondary Response of Antigen-Specific $CD4^+$ T Cells Primed in vitro with Antigen)

  • 박성옥;한영우;;;윤현아;어성국
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제6권2호
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    • pp.93-101
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    • 2006
  • Background: Memory T lymphocytes of the immune system provide long-term protection in response to bacterial or viral infections/immunization. Ag concentration has also been postulated to be important in determining whether T cell differentiation favors effector versus memory cell development. In the present study we hypothesized that naive Ag-specific $CD4^+$ T cells briefly stimulated with different Ag doses at the primary exposure could affect establishment of memory cell pool after secondary immunization. Methods: To assess this hypothesis, the response kinetics of DO11.10 TCR $CD4^+$ T cells primed with different Ag doses in vitro was measured after adoptive transfer to naive BALB/c mice. Results: Maximum expansion was shown in cells primarily stimulated with high doses of ovalbumin peptide $(OVA_{323-339})$, whereas cells in vitro stimulated with low dose were expanded slightly after in vivo secondary exposure. However, the cells primed with low $OVA_{323-339}$ peptide dose showed least contraction and established higher number of memory cells than other treated groups. When the cell division was analyzed after adoptive transfer, the high dose Ag-stimulated donor cells have undergone seven rounds of cell division at 3 days post-adoptive transfer. However, there was very few division in naive and low dose of peptide-treated group. Conclusion: These results suggest that primary stimulation with a low dose of Ag leads to better memory $CD4^+$ T cell generation after secondary immunization. Therefore, these facts imply that optimally primed $CD4^+$ T cells is necessary to support effective memory pool following administration of booster dose in prime-boost vaccination.

고등학교 논의기반 탐구 과학수업에서 학생 평가활동이 주장과 증거 형성에 미치는 영향 (Impact of Student Assessment Activities on Claim and Evidence Formation in High School Argument-Based Inquiry)

  • 이선우;남정희
    • 대한화학회지
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    • 제62권3호
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    • pp.203-213
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    • 2018
  • 이 연구는 논의기반 탐구 과학수업에서 학생 평가활동이 고등학생들의 주장과 증거 형성에 어떠한 영향을 미치는지 알아보고자 하였다. 이를 위해 인문계 고등학교 1학년 166명을 대상으로 논의기반 탐구 과학수업을 실시하였으며, 실험집단 학생(84명)들은 모둠의 주장과 증거에 대한 평가 기회를 제공받았고 비교집단 학생(82명)들은 이 단계를 생략하였다. 학생 평가활동이 학생들의 주장과 증거 형성에 미치는 영향 알아보기 위해 학생들이 작성한 주장과 증거 그리고 학생 평가활동의 결과를 분석하였으며, 인터뷰와 설문조사를 통해 학생 평가활동의 타당성과 활용정도를 알아보았다. 연구 결과, 논의활동에서 증거를 형성하는 능력이 비교집단보다 실험집단이 통계적으로 유의미하게 높게 나타났으며, 실험집단 학생들이 비교집단 학생들보다 더 정확하고 충분한 증거를 제시하는 것으로 나타났다. 또한 실험집단 학생들은 평가활동을 통해 주장에 대한 증거가 적절한지, 증거가 충분한지, 제시된 증거 자료는 정확한지 대해 평가하며 지속적으로 평가결과를 피드백으로 활용하였음을 알 수 있었다. 학생들은 평가 결과가 대체적으로 타당하다고 인식하고 있으며, 평가 결과를 다음 활동에 반영하여 다양한 증거를 제시하는 능력이 향상되었다고 인식하고 있음을 알 수 있었다. 이를 통해 논의기반 탐구 과학수업에서 학생 평가활동이 학생들의 주장과 증거를 형성할 때 주장의 타당성과 정당성을 높이는 증거 형성에 효과적이라는 것을 알 수 있다.

위성 자료를 이용한 지표면 흡수단파복사 산출 알고리즘들의 비교 분석 (Comparative Analysis of Algorithm for Calculation of Absorbed Shortwave Radiation at Surface Using Satellite Date)

  • 박혜인;이규태;조일성;김부요
    • 대한원격탐사학회지
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    • 제34권6_1호
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    • pp.925-939
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    • 2018
  • 지표면 흡수단파복사(Absorbed Shortwave Radiation, ASR)는 대기와 육지 및 해양 사이의 에너지 수지 분석을 위한 필수 요소이다. 이 연구에서는 천리안위성 2A호(GEO-KOMPSAT-2A; GK-2A)에 적용하기 위하여 복사 모델과 지표면 알베도 자료를 이용하여 지표면 흡수단파복사를 산출(GWNU 방법)하였고, 그 결과는 기준 자료로 선정한 CERES (Clouds and the Earth's Radiant Energy System) 위성 센서 및 지상 관측 자료와 비교하였다. 또한 이 연구 결과(GWNU 방법)는 미국 정지궤도위성 GOES-R의 ABI (Advanced Baseline Imager)에 의한 물리적 및 통계적 방법 그리고 Li et al.(1993) 및 Kim and Jeong (2016)의 회귀 방정식 방법들과 비교하였으며, 그 결과 GWNU 방법에 의하여 계산된 지표면 흡수단파복사는 다른 방법들에 의한 값보다 정확 하였다. 그러나 GWNU 방법을 활용하여 지표면 흡수단파복사를 산출할 때 계산 시간과 지표면 알베도 자료의 정확성 문제가 발생될 경우 위에 제시된 경험적 방법들이 GWNU 방법과 함께 사용되어야 할 것이다.

동일인에서 한쪽 다리에만 압박스타킹을 착용했을 때 유발되는 다리 근육의 근전도 변화에 대한 정량적 분석 (Effect of Wearing a Compression Stocking on Electromyogram of the Legs)

  • 이지윤;육소희;유효경;홍남주;전인철;정동주
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제51권2호
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    • pp.185-190
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    • 2019
  • 하지정맥류 발생을 억제하기 위한 방법으로 압박스타킹 착용이 폭넓게 이용되고 있지만, 압박스타킹 착용으로 인한 인체의 생리지표에 어떤 영향을 줄 수 있는지는 잘 알려져 있지 않다. 압박스타킹을 장시간 착용할 경우 어떤 생리적 지표가 변화될 수 있는지 실험을 통해 확인하였다. 압박스타킹 착용으로 인해 변화될 수 있을 것으로 예측되는 생리지표인 혈압, 심전도, 발목 상완지수, 근전도를 측정하였다. 압박스타킹은 시중에서 구입할 수 있는 20~30 mmHg 정도의 압력을 가진 것으로 종아리를 덮는 형태의 것을 사용하였다. 6명의 20 초반 성인이 한쪽 다리에만 7일간 착용을 하였고, 실험 기간 중 몸을 씻기 위해 벗는 것을 제외하고는 늘 착용한 상태에서 일상생활을 하였다. 실험을 시작하기 직전, 3일째 되는 날, 7일째 되는 날에 혈압, 심전도, 근전도, 발목상완지수의 변화를 압박스타킹을 착용한 다리와 착용하지 않은 다리에서 각각 측정하였다. 측정한 결과 착용한 다리의 앞정강이근과 장딴지근에서 근전도의 증가가 나타났으며 다른 생리지표는 변화가 없었다. 근전도의 증가는 시간이 길어질수록 이에 비례하여 증가하였다. 압박스타킹을 착용하지 않은 다리에서는 시간이 지남에 따라 오히려 근전도가 감소하는 결과가 나타났다. 근전도 감소 역시 시간이 길어질수록 감소폭이 커졌다. 즉 이번 실험은 압박스타킹의 착용이 해당 근육의 근전도를 증가시킬 수 있음을 나타내고, 착용하지 않은 부위에서 의도치 않은 근전도의 감소를 일으킬 수 있음을 나타낸다. 이번 연구에서는 압박스타킹의 장시간 착용에 따른 생리적 변화에 대한 결과를 알아봄으로써 올바른 사용에 대한 정보를 제공하고 착용에 따른 위험요소를 알아 볼 수 있는 결과를 제공한다.

Insertional Transposon Mutagenesis of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KXO85 by Electroporation

  • Lee, Byoung-Moo;Park, Young-Jin;Park, Dong-Suk;Kang, Hee-Wan;Lee, Gil-Bok;Hahn, Jang-Ho
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제20권3호
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    • pp.229-233
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    • 2004
  • The bacterial leaf blight, which is caused by Xantho-monas oryzae pv. oryzae, is the most damaging and intractable disease of rice. To identify the genes involved in the virulence mechanism of transposon TnS complex, which possesses a linearized transposon and transposase, was successfully introduced into X. oryzae pv. oryzae by electroporation. The transposon mutants were selected and confirm the presence of transposition in X. oryzae pv. oryzae by the PCR amplification of transposon fragments and the Southern hybridization using these mutants. Furthermore, transposon insertion sites in the mutant bacterial chromosome were deter-mined by direct genomic DNA sequencing using transposon-specific primers with ABI 3100 Genetic Analyzer. Efficiency of transposition was influenced mostly by the competence status of X. oryzae pv. oryzae cells and the conditions of electroporation. These results indicated that the insertion mutagenesis strategy could be applied to define function of uncharacterized genes in X. oryzae pv. oryzae.

Forensic STR Analysis of Mixed Chimerism after Allogeneic Bone Marrow Transplantation

  • Eom, Yong-Bin
    • 대한의생명과학회지
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    • 제16권3호
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    • pp.193-196
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    • 2010
  • Multiplex PCR-based short tandem repeat (STR) analysis is considered as a good tool for monitoring bone marrow engraftment after sex-mismatched allogeneic transplantation and provides a sensitive and accurate assessment of the contribution of both donor and/or recipient cells in post-transplantation specimens. Forensic STR analysis and quantitative real time PCR are used to determine the proportion of donor versus recipient each contained within the total DNA. The STR markers were co-amplified in a single reaction by using commercial $PowerPlex^{(R)}$ 16 system and $AmpFISTR^{(R)}$ $Identifiler^{(R)}$ / $Yfiler^{(R)}$ PCR amplification kits. Separation of the PCR products and fluorescence detection were performed by ABI $PRIS^{(R)}$ 3100 Genetic Analyzer with capillary electrophoresis. The $GeneMapper^{TM}$ ID software were used for size calling and analysis of STR profiles. Extracted DNA was quantified by the $Quantifiler^{TM}$ Human DNA / Y Human Male DNA Quantification Kit The intent of this study was to analyze the ratio of donor versus recipient cells in the post-transplant peripheral blood, spleen, lung and kidney specimens. Specimens were taken from the traffic accident male victim who had been engrafted from bone marrow female donor. Blood and spleen specimens displayed female donor DNA profile. Kidney specimen showed male recipient DNA profile. Interestingly, lung tissue showed mixed profiles. The findings of this study indicate that the forensic STR analysis using fluorescence labeling PCR combined with capillary electrophoresis is quick and reliable enough to assess the ratio of donor versus recipient cells and to monitor the mixed chimeric patterns.

소비자 에너지 정보 표시 장치를 이용한 에너지 절감 효과의 분석 (Analysis of Energy Savings using In-Home Display(IHD))

  • 최태섭;고경록;박성찬;임상국;윤용태
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 2009년도 제40회 하계학술대회
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    • pp.535_536
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    • 2009
  • 에너지 관련 자원 가격의 급등으로 전력 생산 비용이 증가하여 세계 여러 나라의 전력 회사들이 재정적인 어려움에 직면하고 있다. 이러한 전력 생산 비용과 판매가격의 왜곡을 해결하기 위한 방법으로 여러 방법이 모색되고 있다. 제안된 여러 방법 중 스마트 미터링 시스템은 에너지 소비자의 에너지 소비 패턴을 변화시키고 자율적인 에너지 절감을 유도하는 효과가 있는 것으로 알려져 있다. 세계 여러 나라에서 이 시스템 도입을 검토하고 있으며 우리나라에서도 이 시스템의 보급을 위해 2008년 실효성 검증을 위한 실증 연구 과제를 추진하였다. 본 논문에서는 2008년 수행한 스마트 미터링 시스템 실증 과제에서 개발된 한국형 스마트 미터링 시스템을 소개하고 실증을 통해 에너지 정보 표시 장치의 에너지 절감 효과를 검증한다. 실증 연구는 2008년 12월부터 2009년 2월까지 약 2개월동안 청주와 서울에서 77가구를 대상으로 수행되었다. 본 논문에는 실증을 통해 얻어진 에너지 절감 효과와 참가자들을 대상으로 한 설문 조사의 결과에 대해 소개한다.

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Identification of Sperm mRNA Biomarkers Associated with Sex-Determination in Korean Native Cows

  • Min, Kwan-Sik;Byambaragchaa, Munkhzaya;Kim, Hyun;Park, Myung-Hum
    • 한국동물생명공학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.111-116
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    • 2019
  • This study was conducted to analyze the specific genes associated with sex-determination in Korean native cow. The highly organized spermatogenesis requires accurate spatial and temporal regulation of gene expression, which is governed by transcriptional, post-transcriptional, and epigenetic processes. Recently, farmers have been interested in determining the sexual identity of the calves in their farm. We analyzed the sperm of Korean native and Holstein cows, which were supplied from Hanwoo Improvement Center. We evaluated sperm motility and expression of sperm-specific genes after treating semen with both male- and female reagents. Sperm motility in Korean native cows decreased by approximately 10% in the first 30 minutes after treatment with sex-determination reagent. However, sperm motility of Holstein cows decreased to 60-70% after 15 minutes and to 20-30% after 30 minutes. We selected six specific genes expressing in the spermatozoa to analysis the gene expression level. The Real-time PCR results suggest that the selected genes (Gimap4, Tmeff1, Rac2, Abi2, Rac1, and Clu) were highly expressed in the group treated with the male reagent compared to the group treated the female reagent and to the untreated-group (control). In the present study, we suggest that the selected genes play a pivotal role in sex-determination.

Diet Folate, DNA Methylation and Polymorphisms in Methylenetetrahydrofolate Reductase in Association with the Susceptibility to Gastric Cancer

  • Gao, Shang;Ding, Li-Hong;Wang, Jian-Wei;Li, Cun-Bao;Wang, Zhao-Yang
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권1호
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    • pp.299-302
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    • 2013
  • Methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) has been reported to be associated with DNA methylation, an epigenetic feature frequently found in gastric cancer. We conducted a case-control study to explore the association of MTHFR C677T polymorphisms with gastric cancer risk and its relation with the DNA methylation of COX-2, MGMT, and hMLH1 genes. Genotyping of P16, MGMT and HMLH1 was determined by methylation-specific PCR after sodium bisulfate modification of DNA, and genotyping of MTHFR C677T was conducted by TaqMan assays using the ABI Prism 7911HT Sequence Detection System. Folate intake was calculated with the aid of a questionnaire. Compared with the MTHFR 677CC genotype, the TT genotype was significantly associated with 2.08 fold risk of gastric cancer when adjusting for potential risk factors. Individuals who had an intake of folate above $310{\mu}g$/day showed protective effects against gastric cancer risk. The effect of MTHFR C677T polymorphisms on the risk of gastric cancer was modified by folate intake and methylation status of MGMT (P for interaction <0.05).