For the construction of railroads in Metropolytan area based upon the outcome of the future demand forecast, a total of 21 lines including electrified double track segment of Ui-Jung-Bu↔Dong-Du-Chun(18.9km) in Kyung-Won Line is expected. Considering the financial difficulties and investment effect of the lines, this in the sequel brings about an important matter of deforming priority Investment plan to build electrified lines among the candidates. In the case of Japan, Tokyo metropolytan area covered In total by 2,070.1km of various lines, i.e., subway lines(241km), private lines(952.7km), JR lines(876.4km), provides convenient means of transportation for the coummuters and makes a contribution to the development of its neighboring areas and to the expansion of settlement areas. Comparing the total length per 1,000$\textrm{km}^2$, Tokyo(105), Paris(117), and London(115) are at least 6 times as large as ours(15). The purpose of this study is two fold provide a basic scheme for building railroads in metropolytan area and determine priority order in accordance with some evaluation criteria.
Kim, Chang-Kug;Lee, Myung-Chul;Ahn, Byung-Ohg;Yun, Doh-Won;Yoon, Ung-Han;Suh, Seok-Cheol;Eun, Moo-Young;Hahn, Jang-Ho
Genomics & Informatics
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제6권2호
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pp.64-67
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2008
The Korean Rice Ds-tagging lines Database (KRDD) is designed to provide information about Ac/Ds insertion lines and activation tagging lines using japonica rice. This database has provided information on 18,158 Ds lines, which includes the ID, description, photo image, sequence information, and gene characteristics. The KRDD is visualized using a web-based graphical view, and anonymous users can query and browse the data using the search function. It has four major menus of web pages: (i) a Blast Search menu of a mutant line; Blast from rice Ds-tagging mutant lines; (ii) a primer design tool to identify genotypes of Ds insertion lines; (iii) a Phenotype menu for Ds lines, searching by identification name and phenotype characteristics; and (iv) a Management menu for Ds lines.
Kim, Dong-Sub;Lee, In-Sok;Jang, Cheol-Seong;Hyun, Do-Yoon;Lee, Sang-Jae;Seo, Yong-Weon;Lee, Young-Il
Journal of Plant Biotechnology
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제5권1호
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pp.33-41
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2003
Microspore-derived cell lines resistant to 5-methyltryptophan (5MT, a tryptophan analog) or S-(2-aminoethyl)-L-cysteine (AEC, a Iysine analog) were selected in rice by in vitro mutagenesis. For selection of 5MT or AEC resistant cell lines, suspension-cultured cells were irradiated with gamma rays. Thirteen 5MT resistant cell lines were selected and they were able to grow stably at 2 times higher 5MT concentration. A feedback insensitive form of anthranilate synthesis, the pathway specific control enzyme for tryptophan synthesis, was detected from the 5MT resistant lines. Contents of the free amino acids in five resistant lines (MR12-1 to MR12-5) showed a 7.4 to 46.6 times greater level than that in the control culture. Tryptophan, phenylalanine, and tyrosine levels in the shikimate pathway were 28.1 and 22.5 times higher in MR12-3 and MR12 4, respectively, than that measured in the control cells. Four AEC resistant cell lines were isolated from cultures grown on medium containing 1 mM AEC, They were able to grow stably with 2 mM AEC, while sensitive calli were inhibited by 0.5 mM AEC. Aspartate kinase activities of the resistant lines were insensitive to the natural inhibitor, Iysine, and accumulated 2.2 to 12.9-fold higher levels of free Iysine than that of the control cells. Especially, the levels of aspartate, asparagine, and methionine in the aspartate pathway showed higher accumulation in the AEC resistant lines than that in the control cells.
The induced genetic divergence was estimated in 44 mutant lines of finger millet variety GPU 26, developed by single and combination treatments with gamma rays, EMS and NG using three multivariate analyses. The mutant lines were grouped into eight genetically diverse clusters by multivariate D2 and canonical analyses and 11 clusters by dendrogram grouping through Gower's similarity coefficient. The clustering pattern in these three methods was almost similar. Twelve mutant lines in D2 and 13 in the dendrogram grouping method were grouped in the parental cluster(Cluster I) indicating that they did not possess enough divergence from the parent to be classified as micromutant lines. However a large proportion of mutant lines showed divergence from the parent variety and also among themselves. No definite relationship of mutagenic origin and clustering of mutant lines were observed. The mutant lines developed from the same mutagenic treatments often grouped into different clusters indicating that each mutagenic treatment was effective in inducing diverse types of changes in the nine traits studied. The hybridization program between the divergent mutant lines GE 2-2 or GE 3-4 with GG 3-1 is expected to give promising and desirable segregants in subsequent generations. Traits such as days to 50% flowering and days to maturity had major contributions to the induced genetic divergence.
Allium 속 근연종인 파와 양파간 종간교잡을 이용하여 양파로부터 새로운 형질을 도입하는 과정에서 유래되는 종간교잡 F1과 여교잡 세대들의 게놈크기의 변화를 flow cytometry를 이용하여 측정한 결과 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 양파와 파의 종간교잡 F1의 식물학적 특성은 양친의 중간형을 보였으나 여교잡이 진전됨에 따라 반복친인 파의 표현형이 우세하였다. flow cytometry를 이용하여 2C nuclear DNA content을 측정한 결과 $F_1$은 양친에 비해 오히려 증가하였으나 여교잡이 진행됨에 따라 급속히 감소하여 $BC_2F_1$에서는 반복친과 비슷한 수준으로 감소하였다. 여교잡세대의 자식인 $BC_1F_2$은 반복친과 비슷한 $23.1{\pm}1.0pg$으로 측정되었으나 $BC_2F_2$는 $22.9{\pm}0.4pg$으로 반복친의 2C nuclear DNA content인 $23.2{\pm}0.2pg$ 보다 오히려 감소하였다.
Apoptosis, or programmed cell death, is a genetically regulated pathway that is altered in many cancers. Overexpression of bcl-2 leads to resistance to apoptosis and promotes tumorigenesis. To determine the effect of bcl-2 antisense treatment in human lung cancer cell lines, a 20 mer full phosphorothioate oligonucleotide (ODN) targeted at the coding region of the bcl-2 mRNA was synthesized. Western blot analyses were used to examine bcl-2 protein level in five human non-small cell lung cancer (NSCLC) cell lines (NCI-H226, SK-MES-1 NCI-H358, NCI-H522 and NCI-Hl 299) and four human small cell lung cancer (SCLC) cell lines (NCI-H69, NCI-H4l7, HCC-2108 and SW2). Three out of five NSCLC (NCI-H226, SK-MES-1 and NCI-Hl 299) and all of SCLC cell lines expressed Bcl-2 protein. Treatment of these cell with antisense ODN for 48 hours reduced their viability and Bcl-2 protein level. As a conclusion, bcl-2 antisense treatment appears reduction of the Bcl-2 protein levels and cytotoxic effect including apoptosis in human lung cancer cell lines.
Somaclonal variation was observed in the field on doubled haploid plants derived from single pollen of a rice cultivar "Hwaseongbyeo". The variations of seven quantitative traits including plant height and one qualitative trait (pubescence) in 436 lines ($R_2$ generation) were analyzed. The number of lines which fell beyond the boundaries of the 95% confidence intervals of the check variety, Hwaseongbyeo was checked for each quantitative trait, and of those fertility showed the highest variation frequency (85.6%), followed by plant height (77.5%), flag leaf length (66.5%), grains per panicle (42.2%), days to heading (34.5%), panicle length (30.7%) and panicles per hill (22.7%). And the variations of quantitative traits except days to flowering appeared to move in the negative direction compared to "Hwaseongbyeo". Variability within lines was also observed for quantitative and qualitative traits. Twenty-nine $R_2$ lines (7%) segregated for pubescence and 130 $R_2$ lines (30%) showed variation with regard to fertility. This suggests that mutations usually occur before diploidization. Twenty-nine $R_2$ lines representing a wide spectrum of variation were chosen for RAPD analysis. The number of lines showing DNA polymorphism compared to Hwaseongbyeo ranged 0 from to 10 according to the primer used and this seems to indicate that specific loci have highly mutable genomic site.utable genomic site.
Oxaliplatin is a first-line therapy for colorectal cancer, but cancer cell resistance to the drug compromises its efficacy. To explore mechanisms of drug resistance, we treated colorectal cancer cells (HCT116 and SW620) long-term with oxaliplatin and established stable oxaliplatin-resistant lines (HCT116-OX and SW620-OX). Compared with parental cell lines, $IC_{50}$s for various chemotherapeutic agents (oxaliplatin, cisplatin and doxorubicin) were increased in oxaliplatin-resistant cell lines and this was accompanied by activation of nuclear factor erythroid-2 p45-related factor 2 (Nrf2) and NADPH quinone oxidoreductase 1 (NQO1). Furthermore, luteolin inhibited the Nrf2 pathway in oxaliplatin-resistant cell lines in a dose-dependent manner. Luteolin also inhibited Nrf2 target gene [NQO1, heme oxygenase-1 (HO-1) and $GST{\alpha}1/2$] expression and decreased reduced glutathione in wild type mouse small intestinal cells. There was no apparent effect in Nrf2-/- mice. Luteolin combined with other chemotherapeutics had greater anti-cancer activity in resistant cell lines (combined index values below 1), indicating a synergistic effect. Therefore, adaptive activation of Nrf2 may contribute to the development of acquired drug-resistance and luteolin could restore sensitivity of oxaliplatin-resistant cell lines to chemotherapeutic drugs. Inhibition of the Nrf2 pathway may be the mechanism for this restored therapeutic response.
Five broiler chicken lines, namely HC, BPB2, CPB2, PB2 and UM1, involving in a selection program and differing in selection intensity and genetic background, were screened for randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) polymorphism using 10 selected decamer primers. Nine primers amplified the genomic DNA, generating 200 to 2,500 bp and all detected polymorphism between lines. Out of 74 bands scored using these primers, 34 (50.0%) were found to be polymorphic. The number of polymorphic loci ranged from 3 to 6 with an average of 4.33. Lines differed considerably for within-population genetic similarity estimated by band frequency (WS = 93.55 to 99.25). Between-line genetic similarity estimates based on band sharing as well as on band frequency ranged from 71.35 to 86.45 and from 73.38 to 87.68, respectively. Lines HC and PB2 were the most closely related to the other, while BPB2 and CPB2 appeared to be more distant from each other. The between-line genetic distance based on both band sharing and band frequency revealed the similar trends as for Between-line genetic similarity. Based on BS and BF criteria, BPB2 and CPB2 as well as PB2 and UM1 lines can be merged to launch a new genetic group for further progress in biometrical objectives. A phylogenetic tree, derived using Nei's coefficient of similarity revealed the different pattern of genetic distance between lines.
최근 시설재배의 증가나 새만금 간척지의 개발 등 염류 농도가 높은 토양에서의 작물 재배에 대한 수요가 점차적으로 증가하고 있는 상황에서 고염환경 하에서 세포내로 주입된 염 분자를 제한된 구역으로 격리하여 염류내성을 주도록 하는 anti-porter 유전자 TANHX, HVNHX를 우리나라 주요 화훼작물이며 수출유망 작물인 국화로 도입하는 분자육종이 백마 등 5품종에 대하여 이루어졌다. 선발 마커를 이용한 배지선발 과정을 통하여 선발된 기내 식물체 390개체를 대상으로 토양 순화를 거쳐 284계통의 국화 형질전환체가 획득되었으며, 얻어진 식물체 중 임의로 40계통을 선발하고 PCR을 거쳐 진성 여부를 확인한 결과 30계통에서 target band가 검출되어 75%의 배지 발 성공률을 나타내었다. PCR 분석 선발 계통을 포함하여 토양 순화된 284계통을 대상으로 직접적으로 NaCl 0.2 ~ 1.2% (300 mM) 범위로 내염성 생물검정을 실시한 결과 NaCl 0.8% (200 mM) 농도에서도 생존 및 생장이 가능한 15계통이 선발되었으며 이중 7계통은 NaCl 1.2%(300 mM) 내에서도 생존이 가능하였다. 내염성 특성형질 도입을 위하여 anti-porter 유전자 HVNHX가 도입되어 선발된 형질전환 계통의 스트레스 저항성 정도 및 세포 형태적 특성변화가 관찰되었다. 선발된 계통은 NaCl 1.2% (300 mM) 처리 생존가능 7계통을 포함하여 NaCl 0.8% (200 mM) 관수 처리 하에서 생존 및 생장이 가능한 15계통이었다. 세포형태 특성은 전자현미경 (SEM)을 이용하여 형질전환체 및 비 형질전환체의 공변세포를 염 처리 후 관찰함으로서 이루어졌는데 형질전환체, 비형질전환체 모두 무처리에 비해 NaCl 처리한 식물체의 공변세포의 두께가 두꺼워지고 조직 치밀도가 증가하였으며 형질전환체의 경우 비 형질전환체에 비해 두꺼워지는 정도나 조직의 치밀도 증가 정도가 높아 염에 대한 내성이 강화되었음을 알 수 있었고 염 처리 후 세포의 생존정도 비교를 통한 내염 스트레스에 대한 저항성 정도를 측정하고자 TTC 검정을 실시한 결과 강 내염성 계통의 TTC 수치가 높게 나왔으며 NaCl 처리 농도가 높아질수록 TTC 수치가 낮아지는 경향이었으나 강 내염성 7계통은 1.2% NaCl 처리에서도 0.206 ~ 0.331로 비형질전환체의 0.046 중내염성 계통의 0.114 ~ 0.193에 비해 높은 세포생존 비율을 나타내었다. 또한 식물이 스트레스에 대항하기 위하여 분비하는 아미노산인 Proline의 함량을 계통별로 측정한 결과 강 내염성 형질전환 계통이 높게 나왔으며 NaCl 처리 농도가 높아질수록 증가하는 경향을 나타내어 강 내염성 7계통은 1.2% NaCl 처리에서 2.255 ~ 2.638 mg/kg로 중 내염성 형질전환 계통의 1.496 ~ 2.125에 비해 높게 형성되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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