Kim, Eui-Chan;Kim, Kye-Hyun;Lee, Chul-Yong;Park, Eun-Ji
Journal of Korea Spatial Information System Society
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v.9
no.1
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pp.105-115
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2007
Data mining extracts interesting knowledge from a large database. Among numerous data mining techniques, research work is primarily concentrated on clustering and association rules. The clustering technique of the active research topics mainly deals with analyzing spatial and attribute data. And, the technique of association rules deals with identifying frequent patterns. There was an advanced apriori algorithm using an existing bit-clustering algorithm. In an effort to identify an alternative algorithm to improve apriori, we investigated FP-Growth and discussed the possibility of adopting bit-clustering as the alternative method to solve the problems with FP-Growth. FP-Growth using bit-clustering demonstrated better performance than the existing method. We used chess data in our experiments. Chess data were used in the pattern mining evaluation. We made a creation of FP-Tree with different minimum support values. In the case of high minimum support values, similar results that the existing techniques demonstrated were obtained. In other cases, however, the performance of the technique proposed in this paper showed better results in comparison with the existing technique. As a result, the technique proposed in this paper was considered to lead to higher performance. In addition, the method to apply bit-clustering to GML data was proposed.
The aim of this study was to evaluate spontaneous and LPS stimulated proinflammatory cytokines and chemokine release of alveolar macrophages in the patients with pulmonary tuberculosis and healthy individuals, as a control. Alveolar macrophages recovered from bronchoalveolar lavage fluids were cultured with or without LPS 0.1, 1, or 10 ${\mu}g/ml$ for 24 and 48 hours in 37C, 5% CO2. TNF-$\alpha$, IL-1$\beta$, IL-6 and IL-8 amount were evaluated using ELISA kit from the supernatants. There were a significant increase in the spontaneous 24 hours release of TNF-$\alpha$ and IL-6 from the involved segments of tuberculosis patients compared with uninvolved segments and normal control There were also increasing trends of release of them after LPS stimulation in involved segments, but not significant. IL-1$\beta$ and IL-8 were not evaluated from the involved segments of tubeculosis and there were not significant differences of them between uninvolved segments of tuberculosis and normal control. It is concluded that cytokine release of alveolar macrophages in the pulmonary tuberculosis was markedly increased, and it was localized to the alveolar macrophages from the involved segments.
Seoyeon Kim;Miju Jo;Sunmin An;Jiyoon Park;Jiwon Park;Sungkook Hong;Jiwoo Kim;Juhoon Cha;Yujin Roh;Da Som Kim;Mi jin Jeon;Won-Jae Chi;Sook-Young Park
Research in Plant Disease
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v.30
no.1
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pp.66-77
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2024
Black wood ear mushroom (Auricularia auricula-judae) is one of the most economically important mushrooms in China, Japan, and Korea. The cultivation of wood ear mushrooms on artificial substrates is more efficient in terms of time and cost compared with their natural growth on trees. However, if the substrate cultivation is infected by fast-growing fungi, the relatively slow-growing ear mushroom will be outcompeted, leading to economic losses. In this study, we investigated the competitive fungal isolates from substrates infected with fast-growing fungi for the cultivation of ear mushrooms in Jangheung and Sunchon, Korea. We collected 54 isolates and identified them by sequencing their internal transcribed spacer region with morphological identification. Among the isolates, the dominant isolates were Trichoderma spp. (92.6%), Penicillium spp. (5.6%), and Talaromyces sp. (1.8%). To find an appropriate eco-friendly biocontrol agent, we used five Streptomyces spp. and Benomyl, as controls against Trichoderma spp. and Penicillium spp. Among the six Streptomyces spp., Streptomyces sp. JC203-3 effectively controlled the fungi Trichoderma spp. and Penicillium spp., which pose a significant problem for the substrates of black wood ear mushrooms. This result indicated that this Streptomyces sp. JC203-3 can be used as biocontrol agents to protect against Trichoderma and Penicillium spp.
Park, Jinhak;Kwon, Taewoong;Lee, Younsu;Choi, Sangsoo;Song, Jungsuk
Journal of the Korea Institute of Information Security & Cryptology
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v.27
no.4
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pp.821-830
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2017
The internet is an important infra resource that it controls the economy and society of our country. Also, it is providing convenience and efficiency of the everyday life. But, a case of various are occurred through an using vulnerability of an internet infra resource. Recently various attacks of unknown to the user are an increasing trend. Also, currently system of security control is focussing on patterns for detecting attacks. However, internet threats are consistently increasing by intelligent and advanced various attacks. In recent, the darknet is received attention to research for detecting unknown attacks. Since the darknet means a set of unused IP addresses, no real systems connected to the darknet. In this paper, we proposed an algorithm for finding black IPs through collected the darknet traffic based on a statistics data of port information. The proposed method prepared 8,192 darknet space and collected the darknet traffic during 3 months. It collected total 827,254,121 during 3 months of 2016. Applied results of the proposed algorithm, black IPs are June 19, July 21, and August 17. In this paper, results by analysis identify to detect frequency of black IPs and find new black IPs of caused potential cyber threats.
Antimicrobial drug-resistance is natural response to antimicrobial stress based on selection, which weakens chemotherapy effect. Introduction of large numbers of chemotherapeutic agents to clinical practice has generated strains of microorganisms that survive and multiply in vivo with high-drug concentrations. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), bacteria found in normal daily life, can be easily ingested through milk vegetables, and meats, etc. MRSA emerged in many port of the world, increasing complex clinical problems. Therefore, new agents are needed to treat MRSA. Glycyrrhiza uralensis was extracted using 80% MeOH to investigate its antimicrobial activity against MRSA stains KCCM 11812, 40510, and 40512 through bacterial measurement, disc diffusion, and O.D. methods, MIC values, MRSA gene expression investigation, and scanning electron microscope observation. Results revealed MecA, Mecl, MecRI, and FemA were the most highly manifested MRSA genes. Methanolic extract of G. uralensis significantly inhibited MRSA and thus could be used in development of antibacteria.
Choi, Jae Chan;Kim, Young Chul;Choi, Hwan Jun;Park, Jeon Oh;Jeong, Hyun Do
Journal of fish pathology
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v.28
no.1
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pp.27-35
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2015
VHSV is a major viral agent that affects freshwater and marine fish, causing serious economic losses in aquaculture in the world. Due to their filter-feeding activity, bivalve mollusks may act as viral transmitters after accumulation of the fish viruses released into seawater from infected fish. Amplification by RT-PCR was carried out to investigate the presence of VHSV in pacific oysters (Crassotrea gigas) and blue mussels (Mytilus edulis), inhabiting regions around aquatic farms in Korea. Primers designed from conserved regions of VHSVs allowed us to detect four different types of VHSV in a single PCR. Twenty two of the eighty four samples showed positive results of VHSV in a 2-step RT-PCR. Using six positive samples from three different regions in Korea, we cloned and sequenced the glycoprotein (G) gene (467-bp long) of VHSVs. Genetic analysis of the VHSVs detected in shellfish in various geographical areas of Korea showed highly restricted results to VHSV type Iva. This was in agreement with the reports showing only a single genotype of VHSV (Iva genotype) in outbreaks in cultured or wild fish in Korea. Consequently, we investigated VHSVs carried by bivalve mollusks inhabiting the vicinity of aquatic farms, and revealed correlationship between the type of viral accumulated in shellfish by filter-feeding, and those detected in disease outbreaks in fish.
In recent decades, oncolytic viruses (OVs) have extensively been investigated as a potential cancer drug. Oncolytic viruses have primarily the unique advantage in the fact that they can only infect and destroy cancer cells. Secondary, oncolytic viruses induce the activation of specific adaptive immunity which targets tumor-associated antigens that were hidden during the initial cancer progression. In 2015, one genetically modified oncolytic virus, talimogene laherparepvec (T-VEC), was approved by the American Food and Drug Administration (FDA) for the treatment of melanoma. Currently, various oncolytic viruses are being investigated in clinical trials as monotherapy or in combination with preexistent cancer therapies like immunotherapy, radiotherapy or chemotherapy. The efficacy of oncolytic virotherapy relies on the balance between the induced anti-tumor immunity and the anti-viral response. Despite the revolutionary outcome, the development of oncolytic viruses for the treatment of cancer faces a number of obstacles such as delivery method, neutralizing antibodies and induction of antiviral immunity due to the complexity, variability and reactivity of tumors. Intratumoral administration has been successful reducing considerably solid tumors with no notable side effects unfortunately some tumors are not accessible (brain) and require a systemic administration of the oncolytic viruses. In order to overcome these hurdles, various strategies to enhance the efficacy of oncolytic viruses have been developed which include the insertion of transgenes or combination with immune-modulatory substances.
Jung, Su Jin;Hwang, Ji Hyun;Oh, Mi Ra;Chae, Soo Wan
Journal of Nutrition and Health
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v.52
no.3
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pp.258-267
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2019
Purpose: Upper respiratory tract infections are major causes of the common cold throughout the world. Cordyceps militaris (C. militaris) is a well-known functional food for its anti-fatigue and immunomodulating activities. On the other hand, there are no reports on the protective effect against upper respiratory tract infections (URI). This study was a 12 week randomized, double-blind, and placebo-controlled trial in healthy volunteers. Methods: A total of 100 subjects 20 ~ 70 years of age with a history of at least two colds in the year were enrolled in the study. The participants were required to record any adverse events and rate any cold-related incidents in a diary during the investigation period. The efficacy end point was the symptoms and incidence of URI, and changes in cytokines, IgA and natural killer (NK) cell activity. Results: The Cordyceps militaris group over 12 weeks showed no significant impact on the incidence and symptomatology of URI compared to the placebo group. On the other hand, the experimental group showed significantly higher NK cell activity (p = 0.047) and IgA level (p = 0.035) compared to the placebo group. The NK-cell activity and IgA level were increased significantly by Cordyceps militaris over 12 weeks. Conclusion: The results suggest the possible beneficial immunomodulating effects, but the protective effects on URI could not be demonstrated under these conditions. Additional research will be needed to determine the efficacy and mechanisms of Cordyceps militaris function.
Han, Jeong A;Choo, Ji Eun;Shon, Jee Won;Kim, Youn Sook;Suh, Su Yeon;An, Won Gun
Journal of Life Science
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v.29
no.2
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pp.181-190
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2019
The purpose of this study was to acquire the active compounds of Anisi stellati fructus (ASF) and to analyze the genes and diseases it targets, focusing on its antibacterial effects using a system pharmacological analysis approach. Active compounds of ASF were obtained through the Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology (TCMSP) Database and Analysis Platform. This contains the pharmacokinetic properties of active compounds and related drug-target-disease networks, which is a breakthrough in silico approach possible at the network level. Gene information of targets was gathered from the UnitProt Database, and gene ontology analysis was performed using the David 6.8 Gene Functional Classification Tool. A total of 201 target genes were collected, which corresponded to the nine screened active compounds, and 47 genes were found to act on biological processes related to antimicrobial activity. The representative active compounds involved in antibacterial action were luteolin, kaempferol, and quercetin. Among their targets, Chemokine ligand2, Interleukin-10, Interleukin-6, and Tumor Necrosis Factor were associated with more than three antimicrobial biological processes. This study has provided accurate evidence while saving time and effort to select future laboratory research materials. The data obtained has provided important data for infection prevention and treatment strategies.
Ji, Seon Yeong;Hwangbo, Hyun;Lee, Hyesook;Koo, Young Tae;Kim, Jin Soo;Lee, Ki Won;Noh, Dong Jin;Choi, Yung Hyun
Journal of Life Science
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v.31
no.8
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pp.745-754
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2021
Deterioration of the immune function weakens the body's resistance to various infections, leading to a series of diseases. Immunomodulatory biomaterials have been used to reduce the side effects of immunosuppressants or to enhance immunity. Agarwood is the aromatic resinous portion of Aquilaria trees that has been traditionally used as a medicinal herb for the treatment of various diseases. Although previous studies have shown that agarwood can improve the body's immunity, evidence for this claim is still lacking. In this study, the immune-enhancing effects of the agarwood methanol extracts of Aquilaria malaccensis Lamk were evaluated in a RAW 264.7 macrophage model. Based on the results, the agarwood extracts markedly enhanced phagocytosis in the absence of cytotoxicity. The agarwood extract-treated RAW 264.7 cells exhibited the typical morphology of activated macrophages, which are spindle-shaped with elongated filopodia. Agarwood extract also significantly increased the production of nitric oxide (NO), which is associated with the increased expression of inducible NO synthase. Moreover, the secretion and expression levels of cytokines, such as tumor necrosis factor-α and interleukin (IL)-1β and IL-6, were increased by agarwood treatment. Notably, these are also associated with a mitogen-activated protein kinase signaling pathway. Taken together, our findings provide scientific evidence that agarwood has potential immune-enhancing effects in vitro.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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