In order to establish a biochemical genetic system in Drosophila populations in Korea, the $\\alpha$-glycerophosphate dehydrogenase alleles of eleven natural populations of D. melanogaster in Korea were examined by means of agarose gel electrophoresis. The results obtained are presented below: 1. $\\alpha$-Glycerophosphate dehydrogenase ($\\alpha$-GPDH) allele is scored for eleven natural populations of D. melanogaster in Korea, resulting that $\\alpha$-GPDH is found to be widely polymorphic for two electrophoretic variants. 2. The heterozygosity of $\\alpha$-GPDH is calculated as $40\\sim50%$. 3. The frequency of the FF genotype of $\\alpha$-GPDH is found to be roughly same as the SS genotype, but less than the FS genotype. 4. The F gene of $\\alpha$-GPDH is distributed almost frequently as the S gene.
Seo, D.S.;Yang, S.H.;Park, H.B.;Park, S.S.;Hong, K.C.;Ko, Y.
Korean Journal of Animal Reproduction
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v.23
no.2
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pp.159-163
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1999
Recent development of the molecular biology techniques has made it possible to characterize and analyze early diagnoses of genetic disorders and economic trait loci. In this study, porcine genomic DNA was extracted from both clotted and dried blood to analyze the porcine estrogen receptor (ER) gene by polymerase chain reaction (PCR). By the methods reported here, genomic DNA extracted from clotted or dried blood was efficient enough to detect ER gene by PCR. Moreover, the PCR-RFLP (restriction fragment length polymorphism) of ER gene was identified by PvuII restriction enzyme. Thus the results obtained from this study show that the clotted and dried blood was useful for identification of the certain genotype in a rapid manner with low cost. Importantly, this study implies that the whole blood can be economically utilized in studies of endocrinology, molecular biology, and genetics by obtaining both serum and DNA simultaneously in an efficient manner.
Park, J.A.;Kang, H.K.;Chae, E.J.;Seo, K.S.;Kim, S.H.;Yun, C.H.;Moon, Y.S.
Journal of Animal Science and Technology
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v.49
no.5
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pp.577-584
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2007
Adipocyte-specific secretory factor(ADSF)/resistin, an hormone, is a small cysteine-rich protein secreted from adipose tissue and ADSF/resistin has been implicated in modulating adipogenesis in human and rodents. Although the exact role of ADSF/resistin in bovine has not been identified, it may have directly or indirectly involved in adipocyte differentiation. The objective of this study was to investigate its DNA polymorphism associated with carcass traits in Korean Native Cattle(Hanwoo). To investigate DNA polymorphism in Hanwoo ADSF/resistin gene, blood samples were taken from 295 Hanwoo steers belonging to progeny testing at Hanwoo Improvement Center in Korea. Seven single nucleotide polymorphisms(SNPs) were found in intron regions but not in any other regions including promoter (1.7kb) and 4 exons. The highest frequency among SNPs was C186A(0.16/0.84) following G964A (0.156/0.884). The significant correlation(P<0.05) between the SNPs and economic traits was found on 764Ains associated with marbling but not from any other SNPs determined. A computer simulation was also conducted to assess the efficiency of marker assisted selection(MAS) versus the conventional breeding scheme. Results revealed that MAS was more efficient as a breeding tool compared to the conventional. In conclusion, ADSF/Resistin gene is one of candidate genes to evaluate the quality, especially marbling score, in Hanwoo.
Randomly amplified polymorphic DNA(RAPD) analysis was applied to detect the molecular polymorphisms in Gentiana scabra var. buergeri. A high level of molecular variability was found among wild plants and cultivars. In genetic analysis, eight of twenty primers were selected and 54 amplification products ranged 2. 2 to 0.2 kb were compared. Twenty - nine amplified products showed polymorphic, while five were monomorphic. Twenty of line specific bands were found. In genetic similarity and cluster analysis using PCR products, three wild plants collected from Naejangsan, Daedunsan and Keojedo and one cultivar Seochunjaerae were grouped into one cluster, while cultivar Jinbujaerae and Japanese line separated into another clusters, respectively. The identification of DNA polymorphisms by the RAPD technique will facilitate the selection of the lines from different origin.
As one way of evaluating polymorphism in maize, variation of peroxidase 8 (Px.8) in maize plants was investigated by means of horizontal acrylomide electrophoresis. The specific part of maize plants was stele and other parts of plants were also studied for 34 different maize lines and hybrids. The results obtained indicate that Px.8 has three distinct migrating patterns on gel such as fast, slow and fast-slow. The band pattern varied with materials used. Most hybrids were showing fast-slow band, indicating that those hybrids are heterozygous at least for Px.8 allele. Variation of band pattern was obseerved within a single inbred line. The Px.8 in stele tissue and in young leaf and nodal tissue was found to be identical, indicating the possible use of those tissues as an alternative tissue for Px.8 study. It was also found that there might be some definite relationship between Px.8 and Px.3 activities in the same tissue.
These experiments were carried out to find genetic polymorphisms of Serum protein like Pre-albumin(Pr), Albumin(Al) and Transferrin(Tf), and establish preservation of pure pedigree in Korean Native Goats(KNG). Their serum was collected and examined from the total of 74 KNG that raised in Tang Jin district, Chungnam-province. They were biochemically analysed by polyacrylamide gel(7.5%) electrophoresis(PAGE) in order to estimate the frequencies of genotypes and alleles existing on each trait locus. The results obtained in these experiments were summarized as follows ; 1. In the serum Pre-albumin(Pr) locus, the frequencies of genotypes for hetero AB and homo BB observed were 55.4%, and 44.6%, respectively. While homo AA was not found in the Pr locus. The frequencies of gene in PrA and PrB were 0.723 and 0.277, respectively. Accordingly, the Pr loci were assumed to be controlled by alleles PrA and PrB. 2. The frequencies of genotypes of homo BB and hetero AB detected in Albumin(Al) locus were 75.7% and 24.3%, respectively. However, AA type was not observed in the Al locus. The gene frequencies of AlA an AlB were 0.879 and 0.121, respectively. Also, the Al loci were considered to be controlled by alleles AlA and AlB. 3. The frequencies of genotypes for hetero AD and homo DD found in Transferrin (Al) locus were 79.7% and 20.3%, respectively. Whereas, homotype AA was not detected in this locus. The gene frequencies of TfA and TfD were 0.399 and 0.601, respectively. Therefore, the serum Tf loci were assumed to be controlled by alleles Tfa and Tfd.
Park In-Seok;Kim Pyong Kih;Kim Jong Man;Choi Gyeong Cheol;Kim Dong Soo
Journal of Aquaculture
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v.9
no.2
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pp.133-140
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1996
Hybird and allotriploid between female rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) and male coho salmon (O. kisutch) were produced by artificial fertilization and heat shocks. Hatching and survival rate of allotriploid at 2 month after hatching was $77.6\%$ and $54.5\%$ respectively, and these rates clearly exceeded those of their hybrid. Cell and nuclear sizes of the erythrocyte of hybrid were intermidiate of their parents and those of allotriploid were larger than thier hybird. The somatic chromosome number of viable hybrid was 2n = 60 and that of allotriploid was $90\~93$ with chromosomal polymorphism. Allotriploid karyotpe was constituted by two sets of rainbow trout chromosome and one set of coho salmon chromosome.
The usefulness of randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) was evaluated to access the genetic variation in somaclones derived from different cytotype plants of Scilla scilloides Complex, AA (2n=16), BB (2n=18) and AABB (2n=34). Three arbitrary decamer primers were successfully used to amplify genomic DNA from the somaclones. DNA polymorphism was observed between cytotypes. The total number of bands in AA, BB and AABB somaclones were 110, 116 and 103, and marker bands examined were 15, 19 and 26, respectively. The diversity of types using PCR in AA, AABB and BB somaclones were 39.2%, 72.3% and 45.7%, respectively. RAPD band patterns suggest that type AA is more stable than type BB and AABB. The frequencies of specific band in AA, BB or AABB somaclones were 0.9%, 4.3% and 4.9%, respectively. The applicability and reliability of RAPD markers for evaluating the somaclones are discussed.
Trifolium pratense (red clover, Fabaceae) is a short-lived herbaceous species and the species is introduced from Europe or North America to Korea approximately 60 years ago. Allozyme variability was examined in populations representing this species. A high level of genetic variation was found in T. pratense populations. Ten of 19 loci $(52.6\%)$ showed detectable polymorphism. Genetic diversity was 0.220. The sexual reproduction, high fecundity, and colonization process are proposed as possible factors contributing to high genetic diversity. Genetic diversity (0.220) was lower than that (0.285) of North American red clover, T. pratense. Korean populations of red clover may be founded by a small sample of larger or moderate populations. An indirect estimate of the number of migrants per generation (Nm = 4.20) indicated that gene flow was extensive among Korean populations of this species.
Enzyme electrophoresis was used to estimate genetic diversity and population structure of Chimaphila japonica Miq. in Korea. The percent of polymorphic loci within the enzymes was 48.7%. Genetic diversity at the species level and at the population level was high (Hes=0.278 ; Hep=0.222, respectively), whereas the extent of the population divergence was relatively low ( $G_{ST}$ =0.079). $F_{IS}$ , a measure of the deviation from random mating within the 7 populations, was 0.355. An indirect estimate of the number of migrants per generation (Nm=2.61) indicates that gene flow is high among Korean populations of the species. In addition, analysis of fixation indices revealed a substantial heterozygosity deficiency in some populations and at some loci. Factors contributing to the high levels of genetic dive-rsity found in the entire species of C. japonica include wide distribution, long-lived perennials, ability to regenerate due to rhizomatous spread, outcrossing induced by animal vectors, and occasional pollen dispersal by wind.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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