Analysis Genetic Similarity of Gentiana scabra var. buergeri by Randomly Amplified Polymorphic DNA

RAPD를 이용한 용담의 유전적 유사도 분석

  • Published : 1996.09.25

Abstract

Randomly amplified polymorphic DNA(RAPD) analysis was applied to detect the molecular polymorphisms in Gentiana scabra var. buergeri. A high level of molecular variability was found among wild plants and cultivars. In genetic analysis, eight of twenty primers were selected and 54 amplification products ranged 2. 2 to 0.2 kb were compared. Twenty - nine amplified products showed polymorphic, while five were monomorphic. Twenty of line specific bands were found. In genetic similarity and cluster analysis using PCR products, three wild plants collected from Naejangsan, Daedunsan and Keojedo and one cultivar Seochunjaerae were grouped into one cluster, while cultivar Jinbujaerae and Japanese line separated into another clusters, respectively. The identification of DNA polymorphisms by the RAPD technique will facilitate the selection of the lines from different origin.

서철재래종, 내장산 수집종, 대둔산 수집종, 거제도 수집종, 진부재래종 및 일본 도입종 등 계통의 용담을 대상으로 RAPD 분석을 통한 유사도 분석을 수행한 결과 적용한 20가지의 10-merprimer 중 8가지에서 54개의 증폭된 DNA 절편을 얻었다. 그 중 53.7%에 해당하는 29개의 band가 다형현상을 보였으며, 9.3%에 해당하는 5개의 band는 모든 계통에서 공통적으로 나타났고, 37%인 20개의 band가 특이성을 보였다. 특이성을 보이는 band들은 내장산 수집종에서 2개, 거제도 수집종에서 1개, 진부재래종에서 11개, 일본 도입종에서 6개가 관찰되었다. 유전적 유사도의 분석결과 서천재래종, 내장산 수집종, 대둔산 수집종 및 거제도 수집종이 0.76-0.87의 유사도를 보여 한 집단으로 구분되었으며, 이 집단과 진부재래종 및 일본 도입종 사이의 유사도는 0.23-0.34로 각 각 다른 집단으로 구별되었다. 또한 진부재래 종과 일본 도입 종 사이의 유사도는 0.41로 나타나 서로 구분되었다.

Keywords