• 제목/요약/키워드: $bla_{VIM}

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국내 대학병원에서 분리된 Metallo-β-Lactamase (MBL) 생성 Acinetobacter spp. 분리주의 높은 출현율과 유전형 특징 (High Prevalence and Genotypic Characterization of Metallo-β-Lactamase (MBL)-Producing Acinetobacter spp. Isolates Disseminated in a Korean Hospital)

  • 염종화
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.444-452
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    • 2019
  • 주요 획득성 metallo-β-lactamase (MBL) 유전자에 의해 매개되는 carbapenem 내성, 특히 Acinetobacter spp. 균종의 임상 분리주에 대한 보고가 증가하고 있다. 본 연구에서 임상에서 비 중복으로 분리된 carbapenem 비감수성 Acinetobacter spp. 191주 중 125 (65.4%)주가 imipenem 혹은 meropenem-Hodge 변법시험에 양성이었고, 49 (25.7%)주가 imipenem-EDTA+SMA double disk synergy (DDS) 시험에 양성이었다. blaVIM-2 allele와 blaIMP-2 allele 검출을 위한 중합효소연쇄반응과 염기서열분석을 시행한 결과, A. baumannii와 A. calcoaceticus에서 각각 29주와 1주가 blaVIM-2를 갖고 있었고, A. baumannii 16주와 A. calcoaceticus 2주가 blaIMP-1을 갖고 있었다. A. genomospecies 3는 blaVIM-2와 blaAIM-1을 동시에 갖고 있었다. 이들 MBL 유전자는 모두 class 1 integron에 있었다. blaVIM-2 혹은 blaIMP-6를 갖는 class 1 integron의 크기는 A. baumannii 분리주에서는 2.8 kb에서 3.2 kb이었고, A. genomospecies 3 분리주에서는 3.2 kb에서 3.5 kb이었다. blaVIM-2는 대부분 class 1 integron에 첫번째 혹은 두번째에 위치하였고, aacA4를 흔히 가지고 있었다. 다양한 내성 유전자를 가질 수 있는 MBL 생성 Acinetobacter spp.뿐 아니라 다양한 내성 유전자를 가질 수 있는 integron의 전파로 imipenem이나 meropenem과 같은 carbapenem 내성을 포함하여 다제 내성 그람음성 세균의 증가가 예상된다. 또한, 위중한 Acinetobacter spp. 감염증 치료를 위한 새로운 항균제 개발이 필요하다.

임상검체에서 분리된 그람음성막대균으로부터 카바페넴 내성 유전자 검출 (Detection of the Carbapenem Resistance Gene in Gram-negative Rod Bacteria Isolated from Clinical Specimens)

  • 양병선
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제54권3호
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    • pp.179-191
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    • 2022
  • 본 연구는 공중보건에 위협이 되고 있는 carbapenemase 유전자형 중 blaKPC, blaNDM, blaIMP, blaVIM, blaOXA-48-like 유전자의 표현형적 검사 및 분자진단으로 검출하고 관련 유전자 분포 양상에 대해 알아보았다. 표현형적 검사결과 MHT는 41균주 모두에서 양성을 확인하고, CIT는 meropenem+PBA는 18균주 및 meropenem+EDTA에서 8균주의 양성을 확인하였다. PCR 결과 blaKPC 28균주, blaNDM 25균주, blaIMP 5균주, blaVIM 1균주, blaOXA-48-like 13균주에서 증폭 산물을 확인하였다. 또한 blaKPC+blaNDM 7균주, blaKPC+blaIMP 1균주, blaNDM+blaOXA-48-like 1균주, blaNDM+blaVIM 1균주, blaKPC+blaNDM+blaIMP 4균주, blaKPC+blaNDM+blaOXA-48-like 4균주를 확인하였다. 실시간 중합효소 연쇄반응을 이용한 융해 곡선 분석결과는 PCR 결과와 100% 일치함을 확인하였다. 결론적으로 real-time PCR을 이용한 신속하고 특이성이 높은 CRE 조기진단을 통한 유전자 확인은 제한된 치료 옵션과 높은 사망률로 공중 보건 위협을 고조하는 CRE의 감시, 진단 및 치료를 개선할 수 있으며 전염을 방지하기 위한 효과적인 항균 치료 및 시기적절한 감염 통제가 가능할 것으로 사료된다.

Prevalence and Diversity of MBL Gene-Containing Integrons in Metallo-β-Lactamase (MBL)-Producing Pseudomonas spp. Isolates Disseminated in a Korean Hospital

  • Yum, Jong Hwa
    • 대한의생명과학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.321-330
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    • 2019
  • Carbapenem is recently considered as the last resort of the therapeutics for gram negative bacterial infection. Increasing of organisms producing metallo-β-lactamase (MBL), we have difficulty in choosing the antimicrobial agents. Among 345 clinical isolates of Pseudomonas spp., 61 isolates (17.7%) were positive for the modified imipenem or meropenem-Hodge test and 55 isolates (15.9%) were positive for the imipenem-EDTA + SMA double disk synergy test (DDS). PCR and sequencing of blaVIM-2-allele and blaIMP-1-allele showed that 17 isolates of Pseudomonas aeruginosa, 9 isolates of Pseudomonas taiwnensis and 2 Pseudomonas plecoglossicida had blaVIM-2, and 22 isolates of P. aeruginosa and one Pseudomonas otitidis had blaIMP-6. These MBL genes were all in class 1 integron. The size of class 1 integron with blaVIM-2 ranged from 3.5 kb to 5.5 kb in clinical isolates of Pseudomonas spp. including P. aeruginosa. blaVIM-2 was most often located first in the class 1 integron, sometimes in the second or third position, and these integrons often had aacA4 or aadA1. Strict infection control measures are needed to more effectively prevent further spread of these MBL-producing Pseudomonas spp. In addition, MBL-producing Pseudomonas spp. is expected to continue to spread in various countries and regions.

육류용 고기로부터 분자진단을 이용한 항생제내성 유전자 양상 (Molecular detection of blaVIM, blaBIC, blaKPC, and blaSIM genes from isolated bacteria in retail meats)

  • 황유진
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제22권6호
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    • pp.413-419
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    • 2021
  • 본 연구의 목적은 확장 스펙트럼 𝛽-락타마제(ESBL) 항생제가 그람 음성 세균에 의한 감염을 치료하고 예방하는데 사용하고 있으며 임상에서 심각한 감염을 치료하는데 선택하는 마지막 옵션 역할을 한다. 미생물의 확장 스펙트럼 𝛽-락타마제(ESBL) 및/또는 카르바페네마제(Carbapenemase) 내성에 대한 보고는 전 세계적으로 확산되는 것으로 보고되며 항생제 치료에 많은 제한을 주는 요인으로 다약재 내성과 관련이 있기 때문에 보건 서비스에 큰 관심을 가지고 있다. 본 연구는 국내 시장에서 구매하여 분리한 육류로부터 세균을 분리 동정하여 항생제 저항성 테스트인 디스크 확산법을 사용하여 내성균을 분리 실험하였고, PCR과 DNA 시퀜싱방법을 수행아였다. 결과는 PCR을 수행하여 항생제 내성유전자와 유전자를 생산하는 ESBL의 존재를 검출하고 결과를 얻었다. 총 36개의 샘플 육류로부터 181개의 각각 분리된 세균을 추출하여 실험결과을 얻었다. 결과는 PCR과 DNA 염기서열을 분석하여 항생제내성 유전자로 blaVIM, blaBIC, blaKPC, blaSIM으로 나타났다. 분리한 육류 속의 박테리아는 별도 유전자 서열분석으로 4개의 다른 박테리아가 확인되었다. 이러한 결과는 소매되는 육류에서 발견되는 박테리아에 ESBL 내성유전자인 blaVIM, blaBIC, blaKPC, blaSIM를 가진 박테리아 균주가 있을 수 있으며 이는 특수 확장 스펙트럼 𝛽-락타마제(ESBL) 및/또는 카르바페네마제(Carbapenemase) 내성유전자가 확산될 수 있다는 것을 시사한다.

임상에서 분리된 Metallo-β-lactamase 생성 Pseudomonas aeruginosa의 분자역학 (Molecular Epidemiology of Metallo-β-lactamase Producing Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolates)

  • 최명원
    • 생명과학회지
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    • 제22권9호
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    • pp.1268-1276
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    • 2012
  • 사람의 감염증 치료에 사용되는 carbapenem계 약제에 대한 내성균의 출현 및 확산은 감염증 치료를 제한할 뿐만 아니라 집단 발병의 원인이 될 수 있다. 이에 본 연구에서는 ${\beta}$-lactam 약제에 내성을 갖는 Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa)를 대상으로 metallo-beta-lactamase (MBL)의 유전형을 규명함으로써 내성세균의 감염증 치료지침 및 확산방지책 마련에 기초 자료를 제공하고자 하였다. 본 연구의 대상이 된 254개의 임상 검체 중에서 42주의 P. aeruginosa 를 분리하여 imipenem 혹은 meropenem에 내성을 나타내는 Hodge 변법과 EDST에서 각각 28주와 23주가 양성반응을 보였다. DNA의 염기서열 분석결과 $bla_{IMP-6}$ 유전자 보유균이 8주, $bla_{VIM-2}$ 유전자 보유균이 17주로 59.5%(25/42)가 MBL을 생성하는 것으로 나타났다. $bla_{IMP-6}$의 유전자 환경은 $bla_{IMP-6}$-qac-aacA4-$bla_{OXA-1}$-aadA1 유전자 배열을 지니고 있었다. 또한 ERIC PCR 결과 IMP-6과 VIM-2를 생성하는 일부 균주에서 역학적 연관성이 있음이 확인되었다. 본 연구에서 분리한 carbapenem계 항균제 내성 P. aeruginosa가 보유한 $bla_{IMP-6}$ 유전자는 대구지역에서 발병이 보고된 유전자의 gene cassette와 일치하는 것으로 확인되었다. 따라서 이들 세균이 지역사회에 정착하고 있고 이들을 보유한 세균에 의한 감염증 치료시 치료약제에 대한 선택압을 증가시킬 것으로 우려된다. 그러므로 항균제 내성 검사를 통하여 적절한 항균제를 선택하고, 항균제 내성균들의 출현과 확산을 막는 연구가 계속되어야 할 것으로 생각된다.

Multidrug-Resistant Providencia Isolates Carrying $bla_{PER-1},\;bla_{VIM-2}$, and armA

  • Lee, Hee-Woo;Kang, Hee-Young;Shin, Kyeong-Seob;Kim, Jung-Min
    • Journal of Microbiology
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    • 제45권3호
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    • pp.272-274
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    • 2007
  • During May to July 2004, three strains of Providencia spp. with multidrug-resistance (MDR) were isolated from urinary specimen of three patients hospitalized with a same hospital room. By PCR analysis, all three strains have been found to carry both VIM-2 type $metallo-{\beta}-lactamase$ gene and PER-1 type extended spectrum ${\beta}-lactamase$ gene. One out of three strains carried additional resistance gene, armA, 16S rRNA methylase gene responsible for high level resistance to aminoglycosides. To our knowledge, this is the first report on the identification of Providencia spp. simultaneously carrying $bla_{VIM-2},\;bla_{PER-1}$, and armA genes.

Investigation of ${\beta}$-Lactamase-producing Multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa Isolated from Non-Tertiary Care Hospitals in Korea

  • Sohn, Eui-Suk;Yoo, Jeong-Sik;Lee, Jeom-Kyu;Lee, Kyeong-Min;Chung, Gyung-Tae;Shin, Eun-Shim;Han, Sun-Young;Lee, Sang-Hee;Kim, Joon;Lee, Yeong-Seon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권10호
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    • pp.1733-1737
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    • 2007
  • A total of 2,280 nonduplicate clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa, obtained nationwide from Korean non-tertiary care hospitals from 2002 to 2005, were identified and their susceptibilities to aminoglycosides, antipseudomonal penicillins, carbapenems, cephalosporins, monobactams, and quinolones were studied, together with their production of ${\beta}$-lactamases. Using disk diffusion and minimum inhibitory concentration tests, it was found that 2.9% of isolates were multidrug-resistant (MDR) P. aeruginosa. An EDTA-disk synergy test, PCR amplification with specifically designed primers, and direct sequencing of the PCR products showed that the $bla_{OXA-10}$, $bla_{VIM-2}$, $bla_{OXA-2}$, $bla_{OXA-17}$, $bla_{PER-1}$, $bla_{SHV-12}$, and $bla_{IMP-1}$ genes were carried by 34.3%, 26.9%, 3.0%,3.0%, 1.5%, 1.5%, and 1.5% of 67 MDR P. aeruginosa isolates, respectively. The prevalence of MDR P. aeruginosa was three-fold higher, compared with that from the United States. More than two types of ${\beta}$-lactamase genes were carried by 10.4% of isolates. The most prevalent ${\beta}$-lactamase genes were $bla_{VIM-2}$ and $bla_{OXA-10}$. This study is the first description of MDR P. aeruginosa trom non-tertiary care hospitals in Korea and the coexistence of the $bla_{VIM-2}$, $bla_{IMP-1}$, or $bla_{PER-1} in these clinical isolates.

분자학적 방법을 이용한 Carbapenemase-Producing Klebsiella oxytoca 검출 (Carbapenemase-Producing Klebsiella oxytoca Detection Using Molecular Methods)

  • 양병선;박지애
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.428-435
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    • 2019
  • Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)와 같은 carbapenem 분해효소의 급속한 증가와 보급은 의료 관련 감염 분야 내에서 주요한 문제가 되었다. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) 감염을 치료하기 위한 항생제는 거의 없으므로 내성의 박테리아 메커니즘의 확인은 감염 통제와 역학 연구에 매우 중요하다. 그러므로 KPC 균주를 검출하는 신속하고 효과적인 방법은 치료상의 실패를 피하고, 이러한 다제 내성세균의 유통을 방지 및 통제하는 대책으로 도입할 필요가 있다. 분석에 이용한 31균주에서 Acinetobacter spp. 7균주, Morganella morganii 6균주, Pseudomonas aeruginosa 5균주, Proteus mirabilis 5균주, Proteus vulgaris 1균주, Enterobacter cloacae 2균주, Enterobacter aerogenes 1균주, Klebsiella pneumoniae 1균주, Klebsiella oxytoca 1균주, Serratia marcescens 1균주, Escherichia coli 1균주를 확인하였다. 그람음성 간균이 분리된 검체의 빈도는 urine (35.5%), blood (19.4%), sputum (16.1%), pus (9.7%), ascitic fluid (9.7%), tracheal aspirates (6.5%), bile juice (3.2%) 순으로 나타났다. PCR 방법을 이용한 유전자분석 결과 blaIMP, blaVIM, blaOXA-48 에서는 증폭이 확인된 균주가 없었으나, Klebsiella oxytoca 1 균주에서 blaKPC 유전자를 확인하였다. 결론적으로, PCR 방법을 이용한 진단법은 KPC를 정확하고 신속하게 진단할 수 있으며, 그로 인해 병원 내 KPC의 전파방지를 위한 신속한 예방대책 수립이 가능하다 할 수 있다.

Analysis of Class 1 Integrons in Imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa

  • Sung, Ji Youn
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제43권2호
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    • pp.68-74
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    • 2011
  • Pseudomonas aeruginosa is an aerobic, Gram-negative, glucose-nonfermenting bacterium, which has emerged as a serious opportunistic pathogen. Recently, outbreaks of carbapenem resistant P. aeruginosa give rise to significant therapeutic challenges for treating nosocomial infections. The genes of metallo-${\beta}$-lactamase (MBL), a powerful carbapenemase, are carried as a part of the mobile gene cassettes inserted into integrons playing an important role in rapid dissemination of antibiotic resistance genes among bacterial isolates. In this study, we investigated the prevalence of integron in imipenem resistant P. aeruginosa isolates. A total of 61 consecutive, non-duplicate, and imipenem resistant P. aeruginosa strains were isolated from a university hospital in the Chungcheong province of Korea. We employed repetitive extragenic palindromic sequence-based PCR (rep-PCR) method for the selection of clonally different P. aerusinosa strains. PCR and DNA sequencing were conducted for the detection of integrons. Twenty-one clonally different P. aeruginosa strains were isolated. Only one (P28) of the strains harbored $bla_{VIM-2}$ that was found as gene cassettes in class 1 integrons. Four of 21 carbapenem resistant P. aeruginosa strains harbored class 1 integron containing aminoglycoside resistance determinant. All of the integrons detected in the study contained more than one resistance gene cassette, which can mediate resistance to multiple antibiotics. To prevent further spreading of the multi-drug resistant P. aeruginosa, conseguent monitoring and clinical polices are required.

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Imipenem 비감수성 Carbapenemase 생성 Pseudomonas aeruginosa에 의한 항생제 내성유형과 분자생물학적인 특성 (Patterns of Antimicrobial Resistance and Genotyping of Carbapenemase-producing Imipenem-nonsusceptible Pseudomonas aeruginosa)

  • 이진희;이규상;임관훈;엄용빈;김신무;김종배
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제42권2호
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    • pp.71-80
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    • 2010
  • Pseudomonas aeruginosa are important nosocomial pathogens. Their resistance to carbapenem is increasing and causing concerns in Korea. An increasing prevalence of carbapenem resistance mediated by acquired carbapenemase is being reported. Over a 10 month-period from July 2007 to April 2008, 32 strains of imipenem-nonsusceptible P. auruginosa were isolated from Kangwon National University Hospital. To determine the prevalence and genotypes of the carbapenemase-producing clinical isolates, the antibiotic susceptibility was determined by Microscan Walkaway 96 SI System and the carbapenem activity was detected by the modified Hodge test and the imipenem-EDTA-SMA double-disk synergy test. The metallo-${\beta}$-lactamase gene and OXA-type ${\beta}$-lactamase gene reported in Korea were detected by PCR. As for the result of PCR, 30 isolates of P. aeruginosa were found to have $bla_{IMP-1}$-like and 1 isolate was found to have $bla_{IMP-1}$-like and $bla_{IMP-2}$. No clinical isolates were found to have $bla_{SIM-1}$, $bla_{OXA-23}$-like and $bla_{OXA-24}$-like. Random amplified polymorphic DNA (RAPD)-PCR and dendrogram for genetical similarity to band patterns of each clinical isolates were examined. P. aeruginosa were grouped into 7 clusters of up to 50% of similarity index. In the P. aeruginosa group, PS3 was resistant to the most antibiotics, PS1 was susceptible to the most antibiotics. PS7 was resistant to aztreonam unlike other groups. This is the first report of prevalence of carbapenemase in Chuncheon.

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