A. nidulans ${\alpha}$-COP과 상호작용하는 단백질을 동정하기 위하여 ${\alpha}$-COP을 암호하는 유전자를 bait로 yeast two-hybrid 스크리닝용 A. nidulans cDNA 라이브러리를 탐색한 결과, COPI 소낭의 구성요소 중 하나인 ${\varepsilon}$-COP을 암호화하고 있는 유전자를 동정하고 $aneA^+$($\underline{A}$spergillus $\underline{n}$idulans $\underline{e}$psilon-COP, $AN{\varepsilon}$-COP)으로 명명하였다. $aneA^+$ 유전자는 총 296개의 아미노산을 암호화하고 있으며, 다른 균류의 ${\varepsilon}$-COP과 높은 상동성을 보였다. Yeast two hybrid 시스템으로 두 단백질 간의 상호작용 부위를 분석한 결과, ${\alpha}$-COP의 COOH 도메인과 ${\varepsilon}$-COP의 C-말단부가 필수 부위였으며, ${\alpha}$-COP N-말단의 WD 도메인과 ${\varepsilon}$-COP의 TPR 부위는 두 단백질 간의 결합을 촉진하는 조절부위로 밝혀졌다. 또한 사상균인 A. nidulans와 효모류인 S. cerevisiae에서 ${\alpha}$-COP과 ${\varepsilon}$-COP 간 작용양상이 유사한 것으로 보아, COPI 소낭의 구성요소인 ${\alpha}$-COP과 ${\varepsilon}$-COP 간의 상호작용 기전은 진핵세포 내에서 진화적으로 잘 보존되어 있는 것으로 추정되었다.
We have cloned a ${\alpha}-COP$ homolog, ancop, from Aspergillus nidulans by colony hybridization of chromosome specific library using ${\alpha}-COP$ homologous fragment as a probe. The probe DNA was amplified with degenerated primers designed by comparison of conserved region of the amino acid sequences of Saccharomyces cerevisiae ${\alpha}-COP$, Homo sapiens HEP-COP, and Drosophila melanogaster ${\alpha}-COP$. Full length cDNA clone was also amplified by RT-PCR. Comparison of genomic DNA sequence with cDNA sequence obtained by RT-PCR revealed 7 introns. Amino acid sequence similarity search of the anCop with other ${\alpha}-COPs$ gave an overall identity of 52% with S. cerevisiae, 47% with human and bovine, 45% with Drosophila and Arabidopsis. In upstream region from the transcription start site, a putative TATA and CAAT motif were also identified.
세포벽은 진균류의 생존과 삼투안전성 유지에 필수적인 구조체로, 세포부착성 단백질이나 가수분해효소 등과 같은 생물학적 활성을 갖는 다양한 단백질이 결합하거나 그 속에 자리잡고 작용할 수 있게 한다. 최근 효모류인 Saccharomyces cerevisiae와 사상균인 Aspergillus nidulans에서 세포 내 단백질 분비 소낭의 하나인 COPI 소낭을 구성하는 ${\alpha}-COP$ 단백질에 돌연변이가 일어날 경우, 온도의존적 삼투감수성이 나타나는 것으로 밝혀졌다. 이러한 사실은 ${\alpha}-COP$이 베타-1,3-글루칸 합성효소 복합체를 구성하는 단백질과 세포벽 단백질의 이송과정에 중요한 역할을 함으로써 세포벽 안정성 유지에 기여함을 시사하는 것이다. 본 총설에서는 세포 내 단백질 이송기구 중에서도 COPI 소낭을 구성하는 ${\alpha}-COP$과 균류의 세포벽 형성과정과의 관계에 대하여 기술하는 한편, 단백질 분비기구에 결손이 생긴 돌연변 이주를 이용한 세포벽 합성기작에 대한 기초 및 응용연구의 가능성에 대하여 검토하여 보았다.
CopA3를 이용하여 피부 염증에 대하여 연구를 하였다. 산화질소와 cytokine의 생산은 면역세포의 대표적인 염증인자이다. 세포는 LPS 처리 후 한 시간 뒤에 CopA3를 처리하였다. 세포 독성이 나타나지 않는 농도인 5, 25, 50, 100 ${\mu}g/ml$를 사용하였다. CopA3는 NO, TNF-${\alpha}$, IL-$1{\beta}$, IL-6, iNOS, COX-2의 생성을 저해 시켰다. iNOS와 COX-2 역시 100 ${\mu}g/ml$의 농도에서 각각 54%, 65%가 저해가 되었다. 게다가 CopA3는 염증성 사이토 카인인 TNF-${\alpha}$, IL-$1{\beta}$, IL-6의 생성을 감소 시켰다. 이러한 결과로 CopA3는 염증 예방과 치료에 효과적임을 확인 할 수 있었다.
Kang, Eun-Hye;Song, Eun-Jung;Kook, Jun Ho;Lee, Hwan-Hee;Jeong, Bo-Ri;Park, Hee-Moon
Mycobiology
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제43권1호
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pp.31-36
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2015
We have previously isolated ${\varepsilon}$-COP, the ${\alpha}$-COP interactor in COPI of Aspergillus nidulans, by yeast two-hybrid screening. To understand the function of ${\varepsilon}$-COP, the $aneA^+$ gene for ${\varepsilon}$-COP/AneA was deleted by homologous recombination using a gene-specific disruption cassette. Deletion of the ${\varepsilon}$-COP gene showed no detectable changes in vegetative growth or asexual development, but resulted in decrease in the production of the fruiting body, cleistothecium, under conditions favorable for sexual development. Unlike in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae, in A. nidulans, over-expression of ${\varepsilon}$-COP did not rescue the thermo-sensitive growth defect of the ${\alpha}$-COP mutant at $42^{\circ}C$. Together, these data show that ${\varepsilon}$-COP is not essential for viability, but it plays a role in fruiting body formation in A. nidulans.
Yoon, I Na;Hong, Ji;Zhang, Peng;Hwang, Jae Sam;Kim, Ho
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제27권2호
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pp.350-356
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2017
We previously reported that the CopA3 peptide (LLCIALRKK, ${\small{D}}-form$) originally isolated from the Korean dung beetle has antimicrobial and immunosuppressive effects. However, the high cost of producing the synthetic peptide, especially the ${\small{D}}-form$, has limited the development of CopA3 for therapeutic purposes. Here, we investigated whether the CopA3 deletion derivative, CopA5, which is composed of only five amino acids (LLCIA) and has the ${\small{L}}-form$ structure, could inhibit the lipopolysaccharide (LPS)-induced activation of macrophages. Peritoneal exudate macrophages (PEM) were isolated from mice and exposed to LPS in the presence or absence of CopA5, and biomarkers of macrophage activation were measured. Our results revealed that LPS-induced nitric oxide (NO) production, tumor necrosis factor $(TNF)-{\alpha}$ secretion, and phagocytic activity of PEM were significantly inhibited by CopA5 treatment. Similar to CopA3, the structurally modified CopA5 peptide had no cell toxicity (as assessed by measurement of cell viability loss and apoptosis) in PEM. Moreover, the LPS-induced upregulation of the activating phosphorylation of signal transducer and activator of transcription 1 (STAT1) was markedly inhibited by CopA5 treatment. These results suggest that, similar to CopA3, CopA5 inhibits macrophage activation by inhibiting STAT1 phosphorylation and blocking the release of NO and $TNF-{\alpha}$. CopA5 may therefore prove therapeutically useful in the realm of immune suppression.
자외선은 피부 노화를 가속화하여 피부 광노화를 유발하고, 일광 화상, 피부암 등을 유발한다. 자외선 차단제를 사용하더라도 일부 자외선에 의하여 피부 손상은 유발될 수 있기 때문에 자외선에 대한 피부 자체의 방어력을 올려주는 것이 필요하다. 최근, 식물에서 자외선 보호 기능을 하는 것으로 알려진 COP1이 사람의 피부에서도 자외선에 대한 반응들을 조절한다고 새롭게 밝혀졌다. 본 연구에서는, COP1과 그의 결합 단백질 DET1이 사람 피부의 각질형성세포에서 자외선에 대한 시그날 조절 물질인 c-Jun 단백질 양을 조절하는 것을 확인하였다. 자외선에 노출 시 COP1과 DET1 발현이 감소하였고, 그 영향으로 c-Jun 단백질이 증가하였다. 반대로 COP1과 DET1을 발현하는 DNA를 transfection 시켜줄 경우 c-Jun 단백질 양이 감소하였다. 피부 각질형성 세포에서 COP1과 DET1의 발현을 조절할 수 있는 물질을 탐색한 결과, 초피나무 열매 추출물이 COP1과 DET1의 발현을 증가시켜 주었다. 초피나무 열매 추출물은 c-Jun 시그날에 의해서도 조절되는 MMP1이 자외선에 의해 유도되는 것을 억제하였다. 뿐만 아니라, 초피나무 열매 추출물 PPAR-${\alpha}$ 활성이 있어 장벽강화를 통한 피부 보호 효과가 있는데, 자외선에 의하여 염증 유발 물질인 IL-6와 IL-8의 발현이 증가하는 것도 억제하였다. 사람의 팔에 자외선을 쪼여 준 경우에도 초피나무 열매 추출물이 홍반이 생기는 것을 억제하고 홍반에 의한 색소침착도 억제하였다. 종합적으로, 초피나무 열매 추출물은 다양한 메카니즘을 통하여 자외선으로부터 피부를 보호해 줄 것으로 기대된다.
Cop protein has been overexpressed in Escherichia coli using a T7 RNA polymerase system. Purification to apparent homogeneity was achieved by the sequential chromatography on ion exchange, affinity chromatography, and reverse phase high performance liquid chromatography system. The molecular weight of the purified Cop was estimated as 6.1 kDa by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). But the molecular mass of the native state Cop was shown to be 19 kDa by an analytical high performance size exclusion chromatography, suggesting a trimer-like structure in 50 mM Tris-HCI buffer (pH 7.5) containing 100 mM NaCl. Cop protein Was calculated to contain $39.1% {\alpha}-helix, 16.8% {\beta}-sheet$, 17.4% turn, and 26.8% random structure. The DNA binding property of Cop protein expressed in E. coli Was preserved during the expression and purification process. The isoelectric point of Cop was determined to be 9.0. The results of amino acid composition analysis and N-terminal amino acid sequencing of Cop showed that it has the same amino acid composition and N-terminal amino acid sequence as those deduced from its DNA sequence analysis, except for the partial removal of N-terminal methionine residue by methionyl-aminopeptidase in E. coli.
The 43-residue defensin-like peptide coprisin, which is isolated from dung bettle, Copris tripartitus, is a potent antimicrobial peptide. In our previous work, we determined the tertiary structure of coprisin and found that alpha helical region of coprisin from residue 19 to residue 30 is important for its antimicrobial activities. Here, we designed cop12mer and cop9mer analogs of coprisin based on the tertiary structure of coprisin. To investigate the relationship between hydrophobicity and antimicrobial activities and develop the potent peptide antibiotics, we designed cop9mer-1 with substitution of $His^2$ with Trp in cop9mer. The results showed that cop9mer-1 has higher toxicities as well as improved antimicrobial activities compared to cop9mer. In order to reduce the toxicity of cop9mer-1, we designed cop9mer-2 and cop9mer-3 with substitution of $Cys^3$ with Lys or Ser. Substitution of $Cys^3$ with these hydrophilic amino acids results in lower cytotoxicities compared to cop9mer-1. Cop9mer-2 with substitution of $Cys^3$ with Lys in Cop9mer-1 showed high antibacterial activities against drug resistant bacteria without cytotoxicity. Antibiotic action of cop9mer-1 analog appears to involve permeabilization of the bacterial cell membrane while cop9mer-2 and cop9mer-3 may have different mechanism of action. These results imply that that optimum balance in hydrophobicity and hydrophilicity in these 9-meric peptides plays key roles in their antimicrobial activities as well as cytotoxicities.
콜레스테롤을 함유하는 수용성 모형계에서 erythrosine의 첨가농도, 광도, tocopherol과 ${\beta}-carotene$의 첨가에 따른 headspace내의 산소량의 변화와 콜레스테롤 산화물의 생성량의 변화를 연구하였다. Erythrosine의 첨가량이 증가할수록 headspace내 산소량의 감소가 컸고, 각종 COP 생성량은 증가하였다. 형광등의 조도가 증가할수록 headspace내 산소량의 감소가 컸고, 이에 비례하여 콜레스테롤은 감소하였고 총 COP의 생성량은 증가하였다. 일중항 산소 소거제로 tocopherol과 ${\beta}-carotene$을 첨가하였을 때 headspace내의 산소량은 완만하게 감소하였으며, 이에 비례하여 콜레스테롤의 감소가 완만하였고 총 COP의 생성량 또한 감소하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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