• 생명과학회지
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• 제30권8호
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• pp.708-712
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• 2020

리트로머(retromer)는 VPS26, VPS29, VPS35 분자로 구성된 복합체로, 세포막에 존재하는 특정 단백질을 엔도솜에서 트렌스골지망으로 리사이클에 관여하는 단백질 복합체이다. 2000년대 초반 콜롬비아대학의 Scott A, Small 팀에 의해서, 알츠하이머 환자에서 리트로머 분자의 발현량이 저하된다는 것을 발견하였으며, 리트로머를 구성하는 VPS35 발현을 저하시킨 마우스를 이용한 Morris Water Maze (MWM) 실험에서 인지능력이 떨어진다는 것을 보고 하였다. 본 연구진은 리트로머를 구성하는 VPS26 분자에 대한 서브타입인 VPS26b를 발견하였고, 낙아웃 마우스를 제작하였다. VPS26b 낙아웃 마우스 뇌조직을 이용한 웨스턴 블롯 결과, 낙아웃 마우스 뇌조직에서 VPS29와 VPS35의 발현량의 50% 정도로 감소되는 것을 확인하였다. 또한, VPS29 낙아웃 마우스를 이용하여 MWM실험은 한 결과 인지능력이 저하되는 것을 확인하였으며 뇌조직의 해마 CA3영역의 세포 분포도가 정상마우스에 비해 감소되는 것을 확인하였다. 결과적으로 이번 연구를 통하여 VPS26b 낙아웃 마우스는 뇌질환 연구에 대한 실험 동물로서 기초 자료를 제공할 수 있을 것임을 보여준다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권5호
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• pp.2153-2158
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• 2014

Beclin 1 is a key factor for initiation and regulation of autophagy, which is a cellular catabolic process involved in tumorigenesis. To investigate the role of alternative splicing of Beclin1 in the regulation of autophagy in leukemia cells, Beclin1 mRNA from 6 different types of cell lines and peripheral blood mononuclear cells from 2 healthy volunteers was reversely transcribed, subcloned, and screened for alternative splicing. New transcript variants were analyzed by DNA sequencing. A transcript variant of Beclin 1 gene carrying a deletion of exon 11, which encoded a C-terminal truncation of Beclin 1 isoform, was found. The alternative isoform was assessed by bioinformatics, immunoblotting and subcellular localization. The results showed that this variable transcript is generated by alternative 3' splicing, and its translational product displayed a reduced activity in induction of autophagy by starvation, indicating that the spliced isoform might function as a dominant negative modulator of autophagy. Our findings suggest that the alternative splicing of Beclin 1 might play important roles in leukemogenesis regulated by autophagy.

• BMB Reports
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• 제44권1호
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• pp.58-63
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• 2011

Zinc finger (ZNF) proteins play a critical role in cell growth, proliferation, apoptosis, and intracellular signal transduction. In this paper, we cloned and characterized a novel human KRAB-related zinc finger gene, ZNF425, which encodes a protein of 752 amino acids. ZNF425 is strongly expressed in the three month old human embryos and then is almost undetectable in six month old embryos and in adult tissues. An EGFP-ZNF425 fusion protein can be found in both the nucleus and the cytoplasm. ZNF425 appears to act as a transcription repressor. Over-expression of ZNF425 inhibits the transcriptional activities of SRE, AP-1, and SRF. Deletion analysis indicates that the C2H2 domain is the main region responsible for the repression. Our results suggest that the ZNF425 gene is a new transcriptional inhibitor that functions in the MAPK signaling pathway.

• BMB Reports
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• 제43권3호
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• pp.193-198
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• 2010

In this study, we report the identification and characterization of a novel C2H2 zinc finger protein, ZNF552, from a human embryonic heart cDNA library. ZNF552 is composed of three exons and two introns and maps to chromosome 19q13.43. The cDNA of ZNF552 is 2.3 kb, encoding 407 amino acids with an amino-terminal KRAB domain and seven carboxyl-terminal C2H2 zinc finger motifs in the nucleus and cytoplasm. Northern blotting analysis indicated that a 2.3 kb transcript specific for ZNF552 was expressed in liver, lung, spleen, testis and kidney, especially with a higher level in the lung and testis in human adult tissues. Reporter gene assays showed that ZNF552 was a transcriptional repressor, and overexpression of ZNF552 in the COS-7 cells inhibited the transcriptional activities of AP-1 and SRE, which could be relieved through RNAi analysis. Deletion studies showed that the KRAB domain of ZNF552 may be involved in this inhibition.

• BMB Reports
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• 제43권1호
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• pp.17-22
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• 2010

In this study, a novel member of BTB-kelch proteins, named KBTBD7, was cloned from a human embryonic heart cDNA library. The cDNA of KBTBD7 is 3,008 bp long and encodes a protein product of 684 amino acids (77.2 kD). This protein is highly conserved in evolution across different species. Western blot analysis indicates that a 77 kD protein specific for KBTBD7 is wildly expressed in all embryonic tissues examined. In COS-7 cells, KBTBD7 proteins are localized to the cytoplasm. KBTBD7 is a transcription activator when fused to GAL4 DNA-binding domain. Deletion analysis indicates that the BTB domain and kelch repeat motif are main regions for transcriptional activation. Overexpression of KBTBD7 in MCF-7 cells activates the transcriptional activities of activator protein-1 (AP-1) and serum response element (SRE), which can be relieved by siRNA. These results suggest that KBTBD7 proteins may act as a new transcriptional activator in mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling.

• 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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• 제34권2호
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• pp.109-118
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• 2007

최근 PDA, 스마트카드, 휴대폰, MP3 플레이어와 같은 이동 컴퓨팅 장치의 데이타 저장소로 플래시 메모리를 많이 사용하고 있다. 이런 장치는 데이타를 효율적으로 삽입, 삭제, 검색하기 위해 B-트리와 같은 색인기법을 필요로 한다. 플래시 메모리 상에서의 B-트리 구현에 관한 기존 연구로서는 BFTL(B-Tree Flash Translation Layer) 기법이 최초로 제안 되었다. 플래시 메모리는 읽기연산보다 쓰기연산 비용이 훨씬 크며, 덮어쓰기(overwrite)가 불가능하다는 특정을 갖고 있다. 따라서 BFTL 기법에서는 B-트리 구축 시 발생되는 다량의 쓰기연산을 최소화하는데 초점을 맞추고 있다. 하지만 BFTL 기법에 성능 개선의 여지가 많이 남아 있으며, BFTL 기법이 SRAM 메모리 공간을 증가시킨다는 단점 때문에 비현실적이다. 본 논문에서는 플래시 메모리 상에서 효율적으로 B-트리를 구축하기 위한 BOF(B-Tree On Flash Memory)기법을 제안한다. BOF 기법의 핵심은, B-트리 구축 시 사용하는 임시 버퍼의 인덱스 유닛(index unit)들을 플래시 메모리에 저장할 때 같은 노드에 속하는 인텍스 유닛들을 같은 섹터에 저장하는 것이다. 본 논문에서는 성능평가 실험을 통해 BOF 기법의 우수성을 보인다.

• 동의생리병리학회지
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• 제20권3호
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• pp.651-656
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• 2006

Activation of $NF-{\kappa}B$ is known to be a trigger of various cellular disorders including inflammatory and autoimmune diseases such as rheumatoid arthritis. Numerous approaches are ongoing within laboratories to identify potential therapeutic agents which inhibit the $NF-{\kappa}B$ activation. In this study, we have tested the inhibitory effects of five traditional medicines on the activation of $NF-{\kappa}B$ by NIK. Among three medicines which exhibited inhibitory effect on the expression of $NF-{\kappa}B$ repoter plasmid, we investigated further the inhibitory mechanism of Dichroa febrifuga in connection with IKKY activity. Wild type $IKK{\gamma}$ inhibited the $NF-{\kappa}B$ activation by NIK but the C-terminal deletion mutant of IKKY did not show the inhibitory effect, indicating that the C-terminal leucine zipper domain of $NF-{\kappa}B$ is important for the inhibition of $NF-{\kappa}B$ activation. The water extract of Dichroa febrifuga(DFE) also strongly inhibited the $NF-{\kappa}B$ activation by NIK. The inhibitory activity of DFE appeared to be independent of the expression of $IKK{\gamma}$, suggesting that the pathways of inhibition by Dichroa febrifuga and $IKK{\gamma}$ are different. Our results suggest that Dichroa febrifuga can be used as a medicine for inhibition of the $NF-{\kappa}B$ activation in a wide range of cells without relation to the expression of $IKK{\gamma}$.

• KSBB Journal
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• 제17권4호
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• pp.370-375
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• 2002

새로운 유전자를 클로닝하고 그 발현양상을 결정하는 것은 유전자의 기능을 이해하는데 필수적이다. 인간유전자 12q13의 고해상 물리지도를 작성하면서 이 지역의 D12S359와 D12S1618 사이에 내재하는 것으로 mapping된 stSG 3435 EST의 유전자를 클로닝하고 그 발현양상을 조사하였다. NIBI library를 조사하여 stSG 3435를 포함하는 클론 325E4를 분리하여 순차적 결실 방법으로 클로닝하여 자동염기서열분석으로 염기서열을 결정하였다. 1,331 bp의 염기서열을 가진 이 유전자는 Blast search에 의하면 376 개의 아미노산으로 이루어진 단백질로써 인간의 MYGI과 동일하며 마우스의Gamml, melanocyte proliferation gene 1과 86%의 동질성을 보였다. MYGI은 인간염색체의 12에 내재하며 마우스의 Gamml은 syntenic 부위인 마우스 염색체 15에 내재하므로 마우스의 Gamml의 homolog으로 간주된다. Northern blot analysis 결과 MYG1은 인간의 모든 조직에서 발현되며 정소에서 가장 강한 발현을 보였다. 이 유전자의 세포내 발현을 green fluorescence protein과 융합시켜 발현 귀착지를 confocal 현미경으로 동정한 결과 MYG1 단백질은 핵과 리소좀을 제외한 소기관에서 발현되는 것을 관찰하였다.

• 말소리와 음성과학
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• 제12권1호
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• pp.51-63
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• 2020

음운인식은 음운론 영역의 상위언어인식 능력으로, 읽기 및 어휘력 등의 언어능력을 예측하는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 음운인식 능력과 기타 음운처리 능력, 그리고 언어능력 간의 관계를 일반아동 집단과 언어발달지연 아동 집단 간 비교를 통해 살펴보고자 하였다. 4~6세의 언어발달지연 아동(n=15)과 일반아동(n=18)을 대상으로 음운인식 능력을 평가하기 위하여 음절수세기, 음절탈락, 음절변별 과제를 실시하였다. 또한 비단어 따라말하기, 숫자 거꾸로 회상하기의 두 가지 음운처리 과제와 수용 및 표현어휘력, 문법성판단 과제와의 상관관계를 분석하고, 언어능력을 예측하는 음운인식 하위과제가 무엇인지 검토하였다. 음운인식 하위과제 중 음절수세기를 제외한 음절탈락, 음절변별 과제 수행력의 집단 간 차이가 유의하였다. 또한 일반아동 집단은 음절탈락과 숫자 거꾸로 회상하기, 음절변별과 수용어휘력 과제 수행력 간 상관관계가 유의하였으며, 언어발달지연 아동 집단은 음절수세기 과제와 숫자 거꾸로 회상하기, 수용어휘력, 표현어휘력, 문법성판단 과제의 수행력 간 상관관계가 유의하였다. 그리고 단계적 중다회귀분석 결과 일반아동 집단은 음절변별 과제가 수용어휘력 및 문법성판단 과제 수행력을 유의하게 예측하는 것으로 나타났으며, 언어발달지연 아동 집단은 음절수세기 과제가 수용어휘력, 표현어휘력, 문법성판단 과제 수행력을 유의하게 예측하는 것으로 나타났다. 언어발달지연 아동 집단은 일반아동 집단에 비해 음절수세기를 제외한 나머지 음절 수준의 음운인식 과제의 수행력이 저조하였으며, 이러한 특징이 상관관계 분석 및 회귀분석 결과에도 반영되었다. 또한 각 집단에서 음운인식 과제 수행력이 언어능력을 유의하게 예측하는 것으로 나타난 결과는 음운론 영역의 상위언어인식 능력의 중요성을 시사한다.

• 한국응용곤충학회지
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• 제35권4호
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• pp.315-320
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• 1996

Drosophila의 actin 5C 유전자 promoter에 쥐의 DNA polymerase $\beta$cDNA를 도입시킨 형질전환 초파리가 고감수성 환경성 변이원 검출계로 사용할 수 있는지를 조사하였다. 체세포 염색체 재조환과 체세포 염색체 돌연변이의 검출을 위해서는 geterozygous(mwh/+) 계통을 사용하였다. 염색체상의 결실이나 비분리 등에 의한 small mwh spot의 자연 발생적 빈도는 non-transgenic w 계통과 transgenic p[pol $\beta$]-130 계통에서 각각 0.351 및 0.606 정도였다. 체세포 염색체 재조환에 의한 large mwh spot의 자연 발생적 빈도의 경우는 transgenic p[pol $\beta$]-130 계통(0.063)이 non-transgenic w 계통(0.021)에 비해 약 3배 정도 높게 나타났다. IQ, Glu-P-1 및 {TEX}$AFB_{1}${/TEX} 등의 돌연변이원의 처리에 의한 경우, 두 종류의 mutant clone의 발생 빈도는 쥐의 DNA polymerase $\beta$가 도입된 transgenic p[pol $\beta$]-130 계통이 non-transgenic w 계통에 비하여 모두 약 2-3배 정도 높게 나타났다. 본 연구의 결과는 쥐의 DNA polymerase $\beta$가 최소한 체세포 염색체 돌연변이 유발이나 체세포 염색체 재조환의 생성 과정에 관여함을 의미하며, 형질전환 초파리 계통이 환경성 변이원 검출계로서 충분한 응용가능성이 있음을 보여 주었다.