Choi, Hyun-Sook;Kim, Kwang-sun;Park, Jeong Won;Jung, Young Hwan;Lee, Younghoon
Molecules and Cells
/
제19권2호
/
pp.239-245
/
2005
Factor for inversion stimulation (FIS), the Escherichia coli protein, is a positive regulator of the transcription of genes that encode stable RNA species, such as rRNA and tRNA. Transcription of the rnpB gene encoding M1 RNA, the catalytic subunit of E. coli RNase P, rapidly declines under stringent conditions, as does that of other stable RNAs. There are multiple putative FIS binding sites upstream of the rnpB promoter. We tested whether FIS binds to these sites, and if so, how it affects rnpB transcription. In vitro binding assays revealed specific binding of FIS to multiple sites in the rnpB promoter region. Interestingly, FIS bound not only to the upstream region of the promoter, but also to the region from +4 to +18. FIS activated rnpB transcription in vitro, but the level of activation was much lower than that of the rrnB promoter for rRNA. We also examined the effects of FIS on rnpB transcription in vivo using isogenic $fis^+$ and $fis^-$ strains. rnpB transcription was higher in the $fis^-$ than the $fis^+$ cells during the transitions from lag to exponential phase, and from exponential to stationary phase.
Escherichia coli RNase P is composed of a large RNA subunit (M1 RNA) and a small protein subunit (C5 protein). Since both subunits are assembled in a 1:1 ratio, expression of M1 RNA and C5 protein should be coordinately regulated for RNase P to be efficiently synthesized in the cell. However, it is not known yet how the coordination occurs. In this study, we investigated how overexpression of C5 protein affects expression of the rnpB gene encoding M1 RNA, using a lysogenic strain, which carries an rnpB-lacZ transcription fusion. Primer extension analysis of rnpB-lacZ fusion transcripts showed that the overexpression of C5 protein increased the amount of the fusion transcripts, suggesting that rnpB expression increases with the increase of intracellular level of C5 protein.
Kim, Yool;Han, Kook;Lee, Jung-Min;Kim, Kwang-Sun;Lee, Young-Hoon
Bulletin of the Korean Chemical Society
/
제28권6호
/
pp.1010-1014
/
2007
M1 RNA is the catalytic component of RNase P, a tRNA-processing enzyme in Escherichia coli. M1 RNA is produced in the cell by transcription of the rnpB gene and subsequent processing at the 3' end. The 3' flanking region of rnpB contains repeated sets of overlapping sequences coding for small proteins. The issue of whether these proteins are expressed remains to be established. In this study, we showed the expression of a small protein encoded by the first repeat within the 3' flanking region of rnpB. Interestingly, protein expression was increased at lower temperatures. The termination efficiency of rnpB terminators was decreased at lower temperatures, suggesting that antitermination is responsible for enhanced protein expression. Moreover, the purified small protein contained M1 RNA, implying a role as a specific RNA-binding protein.
Park, Jeong-Won;Jung, Young-Hwan;Park, Bo-Hyun;Jeoung, Yeon-Hee;Lee, Young-Hoon
BMB Reports
/
제29권3호
/
pp.221-224
/
1996
To examine the growth-phase dependent control of Escherichia coli rnpB gene we used a combination of Northern analysis for RNA determination and Southern analysis for plasmid DNA determination. The relative amounts of metabolically unstable transcript derived from the internally deleted rnpB gene harbored on a multicopy plasmid as well as the relative plasmid contents were measured by Northern analysis and Southern analysis, respectively, of total nucleic acids from E coli cells containing the plasmid. The relative transcription activity of the rnB was represented by a ratio of the relative amount of the transcript to that of the plasmid DNA during bacterial growth. The rnpB transcription increased rapidly with time during exponential growth, but started to decrease before the transition period of an exponential growing cell culture into the stationary phase. Although the expression pattern was similar to the changes of ${\beta}-galactosidase$ activity expressed from the lysogenic strain carrying the chromosomal rnpB-lacZ fusion which were shown in a previous work, the present data appears to represent a more actual growth-phase control of the rnpB transcription than the previous data by the ${\beta}-galactosidase$ assay. In addition the present method described for a direct analysis of both RNA and plasmid DNA provides a rapid and efficient method that can applied to an examination of transcription control by using a multicopy plasmid.
The GC-rich discriminator sequence between the -10 region and the transcription start site of the rnpB promoter is responsible for stringent control of M1 RNA synthesis. The rnpB promoter also contains a G nucleotide at the previously identified transcription start site. In this study, we examined by mutagenesis of G to A whether this +1G nucleotide is involved in the stringent response. We found that the change did not alter the stringent response. Since the +1 mutation might alter transcription initiation, we compared the transcription start sites of the wt and mutant promoters by primer extension analysis. Surprisingly, we found that wild type rnpB transcription starts at both the +1G position (70%) and the -1C position (30%), and that the +1A mutation led to transcription initiation exclusively at the -1C position. We also generated two transversion mutations at the -1 position, both of which led to transcription starting exclusively at that position. The -1G mutant promoter gave a stringent signal similar to the wild-type, whereas the -1A mutant generated a significantly less stringent signal. Base on these results, we propose that a short sequence, up to 7 bp downstream of the -10 region, is involved in the stringent response of the rnpB promoter.
Systemic lupus erythematosus (SLE) is the prototypic systemic autoimmune disease characterized by production of autoantibodies to various nuclear antigens and overexpression of genes regulated by IFN-I called IFN signature. Genetic studies on SLE patients and mutational analyses of mouse models demonstrate crucial roles of nucleic acid (NA) sensors in development of SLE. Although NA sensors are involved in induction of antimicrobial immune responses by recognizing microbial NAs, recognition of self NAs by NA sensors induces production of autoantibodies to NAs in B cells and production of IFN-I in plasmacytoid dendritic cells. Among various NA sensors, the endosomal RNA sensor TLR7 plays an essential role in development of SLE at least in mouse models. CD72 is an inhibitory B cell co-receptor containing an immunoreceptor tyrosine-based inhibition motif (ITIM) in the cytoplasmic region and a C-type lectin like-domain (CTLD) in the extracellular region. CD72 is known to regulate development of SLE because CD72 polymorphisms associate with SLE in both human and mice and CD72-/- mice develop relatively severe lupus-like disease. CD72 specifically recognizes the RNA-containing endogenous TLR7 ligand Sm/RNP by its extracellular CTLD, and inhibits B cell responses to Sm/RNP by ITIM-mediated signal inhibition. These findings indicate that CD72 inhibits development of SLE by suppressing TLR7-dependent B cell response to self NAs. CD72 is thus involved in discrimination of self-NAs from microbial NAs by specifically suppressing autoimmune responses to self-NAs.
A Reum Han;Ha Rim Shin;Jiyeon Kweon;Soo Been Lee;Sang Eun Lee;Eun-Young Kim;Jiyeon Kweon;Eun-Ju Chang;Yongsub Kim;Seong Who Kim
BMB Reports
/
제57권1호
/
pp.60-65
/
2024
The CRISPR-Cas9 system has significantly advanced regenerative medicine research by enabling genome editing in stem cells. Due to their desirable properties, mesenchymal stem cells (MSCs) have recently emerged as highly promising therapeutic agents, which properties include differentiation ability and cytokine production. While CRISPR-Cas9 technology is applied to develop MSC-based therapeutics, MSCs exhibit inefficient genome editing, and susceptibility to plasmid DNA. In this study, we compared and optimized plasmid DNA and RNP approaches for efficient genome engineering in MSCs. The RNP-mediated approach enabled genome editing with high indel frequency and low cytotoxicity in MSCs. By utilizing Cas9 RNPs, we successfully generated B2M-knockout MSCs, which reduced T-cell differentiation, and improved MSC survival. Furthermore, this approach enhanced the immunomodulatory effect of IFN-r priming. These findings indicate that the RNP-mediated engineering of MSC genomes can achieve high efficiency, and engineered MSCs offer potential as a promising therapeutic strategy.
Unless otherwise stated, we always assume that X is a Banach space, and $1 < p, q < \infty with \frac{p}{1}+\frac{q}{1} = 1$. We use S(X) and B(X) to denote the unit sphere and the unit ball in X respectively.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.