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이스트 two-hybrid 시스템을 이용한 hnRNP E1 cDNA의 클로닝과 hnRNP E1-hnRNP K 상호결합에 대한 연구 (Cloning of hnRNP E1 cDNA via yeast two-hybrid system and a study on protein-protein interaction between hnRNP E1 and hnRNP K)

  • 최미영
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제9권6호
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    • pp.1795-1799
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    • 2008
  • hnRNP K 단백질은 hnRNP 복합체를 구성하는 핵단백질들 중의 하나이며 시토신이 많은 RNA/DNA sequence에 잘 결합한다. 이 단백질은 핵 내에서만 머무르지 않고 핵과 세포질을 왕복하는 특징을 지니고 있다. hnRNP K의 기능을 조사하기 위하여 우선 hnRNP K와 상호 결합하는 세포내 단백질을 찾아내고자 하였다. 이를 위하여 본 연구에서는 이스트 two-hybrid 시스템을 사용하여 HeLa CDNA librar를 탐색하였다. 그 결과 얻은 클론들 중에는 사람의 hnRNP E1 (poly(rC) binding protein 1) cDNA (GenBank accession number XM_031585) 클론이 포함되어 있었다. 본 논문에서는 이스트 two-hybrid 시스템과 in vitro에서의 생화학적 실험을 통하여 hnRNP E1은 hnRNP K와 특이적으로 상호 결합한다는 것을 밝혔다.

인간 hnRNP A1 단백질에 포함된 RGG 상자의 기능 분석 (Analysis of the Role of RGG box of human hnRNP A1 protein)

  • 최미영
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제18권12호
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    • pp.575-580
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    • 2017
  • 본 연구는 hnRNP A1 단백질에 포함되어 있는 RGG 상자가 이 단백질의 세포내 위치에 미치는 영향 및 이 단백질의 안정화에 미치는 영향을 분석하는 것을 목적으로 하며 2014년 10월부터 약 3년 동안 수행되었다. 이를 위해 먼저, RGG상자 내의 6개의 아르기닌을 라이신으로 돌연변이를 만든 다음 pcDNA1-HA-hnRNP A1(6R/K)를 재조합하였다. 다음, 이 플라스미드 DNA를 HeLa 세포에 형질주입하여 HA-hnRNP A1(6R/K) 단백질의 세포내 위치에 미치는 영향을 면역형광현미경법으로 분석하였다. 그 결과 hnRNP A1(6R/K) 단백질은 (wt 단백질처럼 핵에 위치하지 못하고) 핵과 세포질 모두에 퍼져 있는 것을 확인하였다. hnRNP A1(6R/K)의 안정성을 조사하기 위해서는 pcDNA1-HA-hnRNP A1(6R/K)를 HeLa 세포에 형질 주입시킨 다음 발현된 단백질을 웨스턴 블랏 실험으로 분석하였는데, 그 결과 HA-hnRNP A1(6R/K)는 (잘려서) 크기가 작아진 것을 확인할 수 있었다. 이 결과들로부터 HA-hnRNP A1(6R/K)가 핵과 세포질 모두에 퍼져 있는 것은 6R/K 돌연변이가 hnRNP A1의 핵 위치 능력에 영향을 미쳤기 때문이 아니라 6R/K 돌연변이가 일어난 부위 또는 그 부근이 절단되어 hnRNP A1의 핵 위치 신호(nuclear localization singal)인 M9 도메인이 들어있는 C-말단 부위를 잃었기 때문이라는 점을 확인 할 수 있었다. 본 연구의 결과들은 hnRNP A1에 있는 RGG 상자의 아르기닌이 hnRNP A1의 안정성에 중요한 역할을 한다는 것을 제시한다. 세균에서 발현시켜서 정제된 hnRNP A1(6R/K)의 RNA-결합 능력에 대한 영향 분석은 추후 과제로 남겨둔다.

IGF결합 단백질-4(IGFBP-4)와 이질 핵 리보핵산단백질 L (hnRNP L)의 상호결합의 식별 (Identification of the Interaction between Insulin-like Growth Factor Binding Protein-4 (IGFBP-4) and Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein L (hnRNP L))

  • 최미영
    • 생명과학회지
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    • 제23권11호
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    • pp.1311-1316
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    • 2013
  • hnRNP L은 pre-mRNA에 결합하는 단백질들 중에서 핵심이 되는 단백질이다. hnRNP L은 양이 아주 많은 핵 단백질로서 핵과 세포질을 왕복하는 특성을 지니고 있다. 이 단백질은 염색질 변형(chromatin modification), pre-mRNA 스플라이싱, 인트론이 없는 유전자들에서 유래한 mRNA들의 세포질로의 반출(export), IRES-매개성 번역, mRNA의 안정성 조절, 정자형성과정 등, 세포 내의 여러 가지 과정에 관여하고 있는 것으로 알려져 있다. 이 논문에서는 hnRNP L과 결합하는 세포 내 단백질을 찾아내기 위하여 사람의 간세포 cDNA library를 사용하여 이스트 two-hybrid 탐색 실험을 수행하였다. 그 결과 사람의 간세포에서 IGFBP-4가 hnRNP L과 상호결합하는 새로운 파트너라는 것을 발견하였다. 본 연구를 통하여 hnRNP L이 이스트 two-hybrid 시스템에서 IGFBP-4와 특이적으로 상호 결합한다는 것을 처음으로 발견하였다. 본 연구에서는 또한 이스트 two-hybrid 시스템에서 hnRNP L이 IGFBP-4와 상호결합한다는 점을 in vitro pull-down 실험을 통하여 재확인하였다.

Human Ribosomal Protein L18a Interacts with hnRNP E1

  • Han, Sun-Young;Choi, Mie-Young
    • Animal cells and systems
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    • 제12권3호
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    • pp.143-148
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    • 2008
  • Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein E1(hnRNP E1) is one of the primary pre-mRNA binding proteins in human cells. It consists of 356 amino acid residues and harbors three hnRNP K homology(KH) domains that mediate RNA-binding. The hnRNP E1 protein was shown to play important roles in mRNA stabilization and translational control. In order to enhance our understanding of the cellular functions of hnRNP E1, we searched for interacting proteins through a yeast two-hybrid screening while using HeLa cDNA library as target. One of the cDNA clones was found to be human ribosomal protein L18a cDNA(GenBank accession number BC071920). We demonstrated in this study that human ribosomal protein L18a, a constituent of ribosomal protein large subunit, interacts specifically with hnRNP E1 in the yeast two-hybrid system. Such an interaction was observed for the first time in this study, and was also verified by biochemical assay.

폐암 조기 진단을 위한 단백질 바이오마커 측정용 전압-전류법 기반의 나노바이오 분석법 개발 (Development of Voltammetric Nanobio-incorporated Analytical Method for Protein Biomarker Specific to Early Diagnosis of Lung Cancer)

  • 리징징;스윈페이;누드듀돈타뉴;이혜진
    • 공업화학
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    • 제32권4호
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    • pp.461-466
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    • 2021
  • 본 논문에서는 이동성이 좋고 경제적이며, 간편하게 일회용 진단칩으로 제작 가능한 스크린 프린팅 한 탄소칩 전극[screen printed carbon electrode (SPCE)] 기반의 전압전류법 나노물질 융합형 바이오센서를 제작하여 폐암 조기진단에 활용 가능한 단백질 표지 인자 중에 하나인 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 (hnRNP A1) 단백질의 농도를 정량 분석하고자 하였다. 먼저 SPCE 표면에 금 나노입자를 전기적으로 증착한 후 크로스링커를 이용하여 hnRNP A1에 특이적으로 결합할 수 있는 바이오리셉터인 DNA 압타머를 고정하였다. Ethanolamine을 블로킹 시약으로 사용하여 압타머와 함께 센서 표면에 고정하여 그 표면을 처리함으로써 비특이적인 생물질의 흡착에 의한 방해 신호를 최소화하고자 하였다. DNA칩과 hnRNP A1 용액을 접촉하여 DNA와 hnRNP A1을 결합시킨 후 alkaline phosphatase (ALP) 효소로 접합한 hnRNP A1 항체(anti-hnRNP A1)을 센서칩 표면으로 주입하여 샌드위치 복합체를 형성하고, 이를 기질인 4-aminophenyl phosphate (APP)와 효소-기질 특이적 산화 반응에 의한 전류 변화를 순환 전압전류법과 시차 펄스전압전류법으로 측정하여 단백질의 농도를 정량적으로 분석하였다. 상기 산화 반응에 의한 피크 전류 변화는 순환전압전류법과 시차 펄스 전압전류법을 사용할 때 -0.05와 -0.17 V (vs. Ag/AgCl) 전위 값에서 각각 일어났다. 개발한 나노바이오센서를 실제 정상인 혈청 시료 분석에 적용 가능함을 보여줌으로써 혈청 한 방울로 폐암의 조기진단 가능성을 제시하고자 하였다.

Effect of Modulation of hnRNP L Levels on the Decay of bcl-2 mRNA in MCF-7 Cells

  • Lim, Mi-Hyun;Lee, Dong-Hyoung;Jung, Seung-Eun;Youn, Dong-Ye;Park, Chan-Sun;Lee, Jeong-Hwa
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제14권1호
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    • pp.15-20
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    • 2010
  • It has been shown that CA repeats in the 3'-untranslated region (UTR) of bcl-2 mRNA contribute the constitutive decay of bcl-2 mRNA and that hnRNP L (heterogenous nuclear ribonucleoprotein L) interacts with CA repeats in the 3'-UTR of bcl-2 mRNA, both in vitro and in vivo. The aim of this study was to determine whether the alteration of hnRNP L affects the stability of bcl-2 mRNA in vivo. Human breast carcinoma MCF-7 cells were transfected with hnRNP L-specific shRNA or hnRNP L-expressing vector to decrease or increase hnRNP L levels, respectively, followed by an actinomycin D chase. An RT-PCR analysis showed that the rate of degradation of endogenous bcl-2 mRNA was not affected by the decrease or increase in the hnRNP L levels. Furthermore, during apoptosis or autophagy, in which bcl-2 expression has been reported to decrease, no difference in the degradation of bcl-2 mRNA was observed between control and hnRNP L-knock down MCF-7 Cells. On the other hand, the levels of AUF-1 and nucleolin, transacting factors for ARE in the 3'UTR of bcl-2 mRNA, were not significantly affected by the decrease in hnRNP L, suggesting that a disturbance in the quantitative balance between these transacting factors is not likely to interfere with the effect of hnRNP L. Collectively, the findings indicate that the decay of bcl-2 mRNA does not appear to be directly controlled by hnRNP L in vivo.

항-U1RNP 항체 양성인 신생아 홍반성 루푸스 1례 (A Case of Neonatal Lupus Erythematosus Associated with Anti-U1RNP Antibodies)

  • 안병훈;이구창;윤태영;김미정
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제48권3호
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    • pp.342-345
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    • 2005
  • 저자들은 전신성 홍반성 루푸스 산모에서 출생한 생후 1개월된 신생아에서 매우 드물게 나타나는 항-$U_1RNP$ 항체 양성으로 인한 신생아 홍반성 루푸스 1례를 경험하였기에 그 임상적 특징을 문헌고찰과 함께 보고하는 바이다.

Tra2${\alpha}$ and hnRNP K might be Functional Partners of Rbm for Regulation of RNA Processes during Spermatogenesis

  • Lee, Jungmin;Kim, Euisu;Jang, Sung Key;Rhee, Kunsoo
    • Animal cells and systems
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    • 제8권1호
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    • pp.65-70
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    • 2004
  • Rbm is a male infertility gene located in the AZFb region of the Y chromosome. Expression pattern of Rbm indicates that Rbm is critical for early phase of male germ cell development. It shares strong structural homology with hnRNP G, suggesting a function as an RNA processing factor. In order to gain a clue on the molecular mechanisms of Rbm on male germ cell development, we examined interactions of Rbm with selected proteins in yeast. The results revealed specific interactions between Rbm, hnRNP K and Tra2${\alpha}$. These results suggest that hnRNP K and Tra2${\alpha}$ may be functional partners of Rbm in male germ cells. We propose a model in which hnRNP K may playa role as a platform for Rbm and Tra2${\alpha}$.

재활전문간호사에게 기대되는 역할과 기능 (Roles and Functions of the Rehabilitational Nurse Practitioner Expected by Nurses and Doctors in Rehabilitation Hospital)

  • 김금순;임난영;조복희;소희영;전미영;박송자;이혜영;김종일;조남옥
    • 재활간호학회지
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    • 제8권2호
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    • pp.85-93
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    • 2005
  • Purpose: This study aims to identify the role and function of the RNP(rehabilitational nurse practitioner) expected by nurses and doctors. Method: This study was a survey. The data were collected 188 nurses and 21 doctors who worked for disabled patients in the rehabilitation hospital during months of June, 2004 and August, 2005. Results: 98.4% of nurse and 61.9% of doctors agreed at opening of RNP course. The major role of RNP expected by nurses were educator, counsellor and case manager. The major role of RNP expected by doctors were direct care, self care promoter & exercise and emotional care. There was a significant difference about the need for opening of RNP course and major role and function of RNP between the group of nurses and doctors. Conclusion: The results of this study showed that the need for opening of RNP was identified and the major role of RNP was educator, counsellor, case manager and direct care. So there is a need for further research about major role of RNP related to various setting including rehabilitation hospital, nursing home, home care etc.

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A Modeling Study of Co-transcriptional Metabolism of hnRNP Using FMR1 Gene

  • Ro-Choi, Tae Suk;Choi, Yong Chun
    • Molecules and Cells
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    • 제23권2호
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    • pp.228-238
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    • 2007
  • Since molecular structure of hnRNP is not available in foreseeable future, it is best to construct a working model for hnRNP structure. A geometric problem, assembly of $700{\pm}20$ nucleotides with 48 proteins, is visualized by a frame work in which all the proteins participate in primary binding, followed by secondary, tertiary and quaternary binding with neighboring proteins without additional import. Thus, 40S hnRNP contains crown-like secondary structure (48 stemloops) and appearance of 6 petal (octamers) rose-like architectures. The proteins are wrapped by RNA. Co-transcriptional folding for RNP fibril of FMR1 gene can produce 2,571 stem-loops with frequency of 1 stem-loop/15.3 nucleotides and 53 40S hnRNP beaded structure. By spliceosome driven reactions, there occurs removal of 16 separate lariated RNPs, joining 17 separate beaded exonic structures and anchoring EJC on each exon junction. Skipping exon 12 has 5'GU, 3'AG and very compact folding pattern with frequency of 1 stem-loop per 12 nucleotides in short exon length (63 nucleotides). 5' end of exon 12 contains SS (Splicing Silencer) element of UAGGU. In exons 10, 15 and 17 where both regular and alternative splice sites exist, SS (hnRNP A1 binding site) is observed at the regular splicing site. End products are mature FMR-1 mRNP, 4 species of Pri-microRNAs derived from introns 7,9,15 and 3'UTR of exon17, respectively. There may also be some other regulatory RNAs containing ALU/Line elements as well.