• 셀메드
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• 제2권1호
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• pp.9.1-9.13
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• 2012

Jeechool-Whan (JW) is a prescription of Ponciri Fructus Immaturus and Atractylodis Rhizoma Alba and improves the functions of the stomach and the spleen. Although it is said in Korean Medicine that the spleen and the stomach are the roots of the body's resistance, the meaning of 'improving the spleen and the stomach' is very comprehensive. Moreover, there are lots of drugs that are said to improve the spleen and the stomach, and the number of prescriptions using these drugs is huge. In this study, we focused on the new effect and mechanism of the JW on the ovalbumin (OVA)-induced allergic rhinitis (AR) model. The increased number of rubs and the increased levels of IgE and histamine in the OVA-sensitized mice were inhibited by JW administration. The balance of Th1/Th2 cytokine level was regulated by JW administration. The levels inflammatory proteins were decreased by JW administration in the nasal mucosa of the OVA-sensitized mice. Eosinophils and mast cells infiltration increased by OVA-sensitization was also decreased in the JW-administered mice. In addition, JW inhibited caspase-1 activity in the same nasal mucosa tissue. In activated human mast cells, JW inhibited the receptor interacting protein-2, I${\kappa}$B kinase-${\beta}$, nuclear factor-${\kappa}$B/Rel A, and caspase-1 activation. In conclusion, this study will be support the clear understanding of the concept of the spleen and the stomach in traditional Korean medicine as well as for a possibility of finding a cure for this AR in traditional medical treatments.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제12권7호
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• pp.3096-3102
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• 2011

바닐로이드 수용체 TRPV1(transient receptor potential vanilloid 1)은 캡사이신, pH, 열 등의 통증 유발물질에 의해 활성화되는 비특이적 양이온 채널로서 통증발현에 핵심적인 막 단백질이다. TRPV1의 막 수송에 관한 연구가 미미한 가운데 FIP3(family of Rab11 interacting protein 3)가 TRPV1 채널과 결합하여 막수송에 관여한다고 보고되었다. FIP3는 Rab11과 결합하는 단백질인데 최근 Rab11 단백질이 여러 채널 단백질의 막수송에 직접적으로 또는 간접적으로 중요하다고 보고되었다. 그러므로 본 연구에서는 Rab11이 TRPV1의 막 수송에서의 역할을 알아보기 위하여 세포 생물학적, 생화학적으로 알아보았다. 공촛점 현미경을 통하여 확인한 결과 Rab11은 실제로 세포내에서 TRPV1과 동일한 위치에서 발현되어 있음을 확인하였다. 하지만 생화학적인 방법인 GST-pulldown을 실시하였을 때 TRPV1과 Rab11간에는 서로 직접적인 결합은 하지 않는 것으로 나타났다. 비록 직접적인 결합은 하지 않지만 Rab11이 TRPV1의 막 수송에 관여한다고 가정하고 Rab11의 TRPV1의 막수송에서의 역할을 더 자세히 알아보기 위하여 세포내 Rab11a의 발현을 siRNA를 사용하여 Rab11a의 발현을 50%수준으로 저해한 후 TRPV1의 세포막으로의 이동을 알아본 결과 Rab11 발현 저해 시 세포막에 이동된 TRPV1이 현저히 감소함을 확인할 수 있었다. 이 결과로부터 Rab11이 아마도 FIP3을 포함하는 방법으로 TRPV1의 막 수송에 영향을 주는 것으로 결론지을 수 있다.

• 생명과학회지
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• 제13권4호
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• pp.541-550
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• 2003

본 실험에서는 C형 간염바이러스 (HCV)의 외피 단백질인 E2 당단백질에 결합하는 세포단백질들을 클로닝하기 위해 간세포 cDNA를 phage 표면에 발현시킨 phage library를 제작하였고, 12-mer peptide library와 함께 E2 단백질에 대해 panning을 실시하였다. 검색결과 세포내 신호전달과 cytoskeleton 구성에 관여하는 tensin, membrane protein band 4.1 등 세포질내 단백질과 CCR7, CKR-L2, insulin-like growth factor-1 receptor 등 세포막 단백질 등이 확인되었다. 이들 단백질들을 발현하는 phage들은 수용성 E2단백질을 이용한 결합중화반응 결과 E2 단백질에 특이적으로 결합함이 확인되었다. 사람 T 세포에서 주로 발현되는 CCR7 유전자를 PHA로 활성화된 사람 T 세포의 total RNA를 이용하여 증폭하고 클로닝하였다. 293T 세포에 transfection시켜 단백질 발현양상을 flow cytometer로 분석하여 70% 이상의 세포들이 CCR7을 발현하고 있음을 관찰하였다. 수용성 E2 단백질을 CCR7이 transfection된 세포와 mock transfection된 대조군 세포에 각각 반응시킨 결과 dose-dependent 양상으로 CCR7에 결합하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제14권5호
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• pp.1031-1037
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• 2004

The interaction of chemoattractant receptors and $G{\alpha}_{16}$ was studied to provide the molecular basis to elucidate the interaction of chemoattractant receptors with $G{\alpha}_{16}$ subunit, thereby possibly contributing to finding novel targets for designing new type of G protein antagonists with anti-inflammatory effects. Experiments were performed to characterize the $G{\alpha}_{16}$ subunit domains responsible for efficient coupling to chemoattractant receptors. Thus, a series of chimeric $G{\alpha}_{11}G{\alpha}_{16}$ and $G{\alpha}_{16}G{\alpha}_{11}$ cDNA constructs were expressed, and the ability of chimeric proteins to mediate C5a, IL-8, and fMLP-induced release of inositol phosphate in transfected Cos-7 cells was tested. The results showed that short stretches of residues 154 to residue 167 and from residue 174 to residue 195 of $G{\alpha}_{16}$ contribute to efficient coupling to the C5a receptor. On the other hand, a stretch of amino acid residues 220-240 of $G{\alpha}_{16}$ that is necessary for interacting with C5a receptor did not play any role in the interaction with IL-8 receptor. However, a stretch from residue 155 to residue 195 of $G{\alpha}_{16}$ was found to be crucial for efficient coupling to IL-8 receptor in concert with C-terminal 30 amino acid residues of this ${\alpha}$ subunit. Coupling profiles of a variety of chimeras, composed of $G{\alpha}_{11}G{\alpha}_{16}$ to fMLP receptor indicate that the C-terminal 30 amino acids are most critical for the coupling of $G{\alpha}_{16}$ to fMLP receptor. Taken together, $G{\alpha}_{16}$ subunit recruits multiple and distinctive coupling regions, depending on the type of receptors, to interact.

• BMB Reports
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• 제48권6호
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• pp.303-312
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• 2015

Receptor-interacting protein kinase-3 (RIP3, or RIPK3) is an essential protein in the "programmed", or "regulated" necrosis cell death pathway that is activated in response to death receptor ligands and other types of cellular stress. Programmed necrotic cell death is distinguished from its apoptotic counterpart in that it is not characterized by the activation of caspases; unlike apoptosis, programmed necrosis results in plasma membrane rupture, thus spilling the contents of the cell and triggering the activation of the immune system and inflammation. Here we discuss findings, including our own recent data, which show that RIP3 protein expression is absent in many cancer cell lines. The recent data suggests that the lack of RIP3 expression in a majority of these deficient cell lines is due to methylation-dependent silencing, which limits the responses of these cells to pro-necrotic stimuli. Importantly, RIP3 expression may be restored in many cancer cells through the use of hypomethylating agents, such as decitabine. The potential implications of loss of RIP3 expression in cancer are explored, along with possible consequences for chemotherapeutic response. [BMB Reports 2015; 48(6): 303-312]

• Molecules and Cells
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• 제37권11호
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• pp.819-826
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• 2014

Protein modifications of recombinant pharmaceuticals have been observed both in vitro and in vivo. These modifications may result in lower efficacy, as well as bioavailability changes and antigenicity among the protein pharmaceuticals. Therefore, the contents of modification should be monitored for the quality and efficacy of protein pharmaceuticals. The interface of EPO and its receptor was visualized, and potential amino acids interacting on the interface were also listed. Two different types of modifications on the interface were identified in the preparation of rHu-EPO BRP. A UPLC/Q-TOF MS method was used to evaluate the modification at those variants. The modification of the oxidized variant was localized on the Met54 and the deamidated variants were localized on the Asn47 and Asn147. The extent of oxidation at Met54 was 3.0% and those of deamidation at Asn47 and Asn147 were 2.9% and 4.8%, respectively.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제29권5호
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• pp.527-535
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• 2021

Sclerostin (SOST), a regulator of bone formation in osteocytes, inhibits the canonical Wnt signaling by interacting with low-density lipoprotein receptor-related protein 5/6 (LRP5/6) to prevent Wnt binding. Loss-of-function mutations of the SOST gene caused massive bone outgrowth and SOST-null mouse exhibited a high bone density phenotype. Therefore, SOST has been suggested as a promising therapeutic target for osteoporosis. A few previous studies with X-ray crystallography identified the binding interfaces between LRP6 and SOST, but there are limitations in these studies as they used truncated SOST protein or SOST peptide. Here, we analyzed the conformational dynamics of SOST-LRP6 E1E2 complex using hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS). We examined the effect of the C-terminal tail of SOST on LRP6 conformation upon complex formation. HDX-MS analysis suggested a new potential binding interface for the C-terminal region of SOST that was missing from the previous crystal structure of the SOST-LRP6 E1E2 complex.

• 생명과학회지
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• 제17권12호
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• pp.1627-1633
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• 2007

c-Jun N-terminal kinase (JNK)-interacting protein 1(JIP1)은 비계단백질(scaffold protein)로서 신경 세포와 ??장${\beta}$세포에서 많이 발현된다. 본 연구에서는 배양한 흰쥐 해마신경세포에서 JIP1, JIP-2 및 JIP-3을 모두 인식하는 항체를 이용하여 이들의 세포내 표현을 조사하였다. 전반적으로 JIP은 세포체와 가지돌기에 반점 모양으로 표현되었다. 이 JIP 반점들을 통계적으로 분석한 결과 흥분성 연접후표지인 PSD95 및 ${\alpha}CaMKII$ 반점 과 각각 $54.8{\pm}4.0%$ 및 $94.1{\pm}4.5%$가 겹쳐졌다. 반면에 억제성 연접후표지인 그리신수용체 및 gephyrin 반점과는 각각 단지 $8.6{\pm}0.5%$ 및 $7.3{\pm}0.5%$만 겹쳐졌다. 한편 lipid raft의 표지인 flotillin 반점의 상당부분$(29.3{\pm}1.0%)$이 JIP 반점과 겹쳐졌다. 또한, JIP은 일부 가지돌기의 끝부분에 매우 강하게 발편되었으며 축삭에는 표현이 미미하였다. 이 결과들은 JIP 단백질이 흥분성 연접후구역, 일부 lipid raft, 그리고 일부 가지돌기 끝부분에 주로 위치함을 의미한다.

• 생명과학회지
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• 제26권7호
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• pp.868-874
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• 2016

수용체 상호작용 단백질 인산화 효소 RIPK1 (Receptor-interacting protein kinases 1)과 RIPK3은 고도로 보존된 인산화 효소 부위를 통하여 세린이나 트레오닌의 하이드록실기를 인산화하는 세린 또는 트레오닌-단백질 인산화 효소 군에 속한다. RIPK군은 염증이나 선천성 면역뿐 만 아니라 세포사멸이나 괴사와 같은 프로그램화된 세포사 멸을 중재하는데 중요한 역할을 담당한다. RIPK1과 다른 TNFR1 관련 단백질들의 상호작용은 TNF 수용체 1(TNFR1)에 사이토카인이 결합할 때 생존 촉진 전사인자 NF-κB의 활성을 조절하는 신호전달복합체 I을 조립하는 것으로 알려져 왔다. 뿐만 아니라, RIPK1과 RIPK3은 프로그램화된 세포괴사를 중재하는 RIP 동형 상호작용 모티브(RHIM)를 통하여 상호작용하고, 이러한 괴사는 세포사멸의 유형과는 다른 형태학적 특징을 가진 돌발적이고 제어되지 않는 세포사멸 유형으로 오랫동안 알려져 왔다. RIPK1과 RIPK3에 존재하는 RHIM의 고도로 보존된 서열들이 이들의 상호작용을 조절하며 이들은 necrosome이라 불리는 세포질 내 아밀로이드 복합체의 조립을 유도 한다. 또한 necrosome은 최근에 하위 신호전달을 조절하는 RIPK3의 기질로 확인된 혼합형 인산화 효소 도메인-유사 단백질(MLKL)을 포함한다. 본 리뷰는 TNF 신호전달에서 RIPK와 MLKL의 기능적, 생리적 특징들에 관한 개요를 제공한다.

• 한국가금학회지
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• 제50권4호
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• pp.193-202
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• 2023

인플루엔자 A 바이러스(IAVs)는 많은 조류 종의 호흡 기관에 감염되며 사람을 비롯한 다른 동물로 전파될 수 있는 포장된 음극성 역전사 RNA 바이러스이다. 이 연구에서는 이전 연구의 마이크로어레이 데이터를 다시 분석하여 닭에서 공통 및 특이하게 발현되는 유전자(DEG) 및 그들의 생물학적 활동을 식별하였다. 고병원성(HPAIV) 및 저병원성(LPAIV) 인플루엔자 A 바이러스 감염된 닭 세포에서 각각 760개와 405개의 DEG가 발굴되다. HPAIV 및 LPAIV는 각각 670개와 315개의 DEG를 가지고 있으며, 이 중 90개의DEG가 두 바이러스에서 공유된다. HPAIV 감염으로 인해DEG의 기능 주석에 따르면 세포 주기의 기본적인 생물학적 기능과 연관된 다양한 유전자가 발굴되었다. 대상 유전자중에서 CDC Like Kinase 3(CLK3), Nucleic Acid Binding Protein 1(NABP1), Interferon-Inducible Protein 6(IFI6), PIN2 (TERF1) Interacting Telomerase Inhibitor 1(PINX1), 그리고Cellular Communication Network Factor 4(WISP1)의 발현은 polyinosinic:polycytidylic acid(PIC)로 처리된 DF-1 세포에서 변화되었다. 이것은 toll-like receptor 3(TLR3) 리간드인 TLR3 신호에 의해 이러한 유전자의 전사가 조절될 수 있음을 시사하며, 닭에서 AIV의 병리 생리학에 대한 더 나은 이해를 얻기 위해서는 AIV 감염 과정 중에 호스트 반응을 조절할 수 있는 메커니즘을 구명하는 데 더 많은 연구에 초점을 맞추는 것이 필요하다고 사료된다. 이러한 메커니즘에 대한 이해는 신규 치료 전략 개발에 활용될 수 있다.