• 제목/요약/키워드: proteinase K

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Purification and Characterization of Extracellular Aspartic Proteinase of Candida albicans

  • Na, Byoung-Kuk;Lee, Seong-Il;Kim, Sin-Ok;Park, Young-Kil;Bai, Gill-Han;Kim, Sang-Jae;Song, Chul-Yong
    • Journal of Microbiology
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    • 제35권2호
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    • pp.109-116
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    • 1997
  • An extracellular proteinase of Candida albicans was purified by a combination of 0~75% ammonium sulfate precipitation, DEAE Sepharose Fast Flow ion exchange chromatography, and Sephacryl S-200 HR molecular sieve chromatography. Its mlecular weight was approximately 41 kDa on SDS-PAGE and isoelectric point was 4.4. The enzyme was inhibited by pepstain A. Optimum enzyme activity ranged from pH 2.0 to 3.5 with its maximum at pH 2.5 and a temperature of 45$^{\circ}C$. The addition of divalent cations, $Ca^{2+}$, Zn$^{2+}$ and $Mg^{2+}$, resulted in no significant inhibition of enzymatic activity. However, some inhibitory effects were observed by Fe$^{2+}$, Ag$^{2+}$ and Cu$^{2+}$. With BSA as substrate, an apparent $K_m$ was determined to be 7$\times$10$^{-7}$ M and $K_i$, using pepstatin A as an inhibitor, was 8.05$\times$10$^{-8}$ M. N-terminal amino acid sequence was QAVPVTLXNEQ. Degradation of BSA and fibronectin was shown but not collagen, hemoglobin, immunoglobulin G, or lysozyme. The enzyme preferred peptides with Glu and Leu at the P$_1$ position, but the enzyme activity was highly reduced when the P$_2$ position was phe or pro. This enzyme showed antigenicity against sera of patients with candidiasis.

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Molecular and biochemical characterization of hemoglobinase, a cysteine proteinase, in Paragonimus westermani

  • Choi Joon-Hyuck;Lee Jae-Hyuk;Yu Hak-Sun;Jeong Hae-Jin;Kim Jin;Hong Yeon-Chul;Kong Hyun-Hee;Chung Dong-Il
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제44권3호
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    • pp.187-196
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    • 2006
  • The mammalian trematode Paragonimus westermani is a typical digenetic parasite, which can cause paragonimiasis in humans. Host tissues and blood cells are important sources of nutrients for development, growth and reproduction of P. westermani. In this study, a cDNA clone encoding a 47 kDa hemoglobinase of P. westermani was characterized by sequencing analysis, and its localization was investigated immunohistochemically. The phylogenetic tree prepared based on the hemoglobinase gene showed high homology with hemoglobinases of Fasciola hepatica and Schistosoma spp. Moreover, recombinant P. westermani hemoglobinase degradaded human hemoglobin at acidic pH (from 3.0 to 5.5) and its activity was almost completely inhibited by E-64, a cysteine proteinase inhibitor. Immunohistochemical studies showed that P. westermani hemoglobinase was localized in the epithelium of the adult worm intestine implying that the protein has a specific function. These observations suggest that hemoglobinase may act as a digestive enzyme for acquisition of nutrients from host hemoglobin. Further investigations may provide insights into hemoglobin catabolism in P. westermani.

Isolation and characterization of a cDNA encoding a mammalian cathepsin L-like cysteine proteinase from Acanthmoeba healui

  • Hong, Yeon-Chul;Hwang, Mi-Yul;Yun, Ho-Cheol;Yu, Hak-Sun;Kong, Hyun-Hee;Yong, Tai-Soon;Chung, Dong-Il
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제40권1호
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    • pp.17-24
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    • 2002
  • We have cloned a cDNA encoding a cysteine proteinase of the Acanthamoeba healui OC-3A strain isolated from the brain of a granulomatous amoebic encephalitis patient. A DNA probe for an A. healui cDNA library screening was amplified by PCR using degenerate oligonucleotide primers designed on the basis of conserved amino acids franking the active sites of cysteine and asparagine residues that are conserved in the eukaryotic cysteine proteinases. Cysteine proteinase gene of A. healui (AhCPI) was composed of 330 amino acids with signal sequence, a proposed pro-domain and a predicted active site made up of the catalytic residues, $Cys^{25},{\;}His^{159},{\;}and{\;}Asn^{175}$. Deduced amino acid sequence analysis indicates that AhCPI belong to ERFNIN subfamily of C 1 peptidases. By Northern blot analysis. no direct correlation was observed between AhCPI mRNA expression and virulence of Acanthamoeba, but the gene was expressed at higher level in amoebae isolated from soil than amoeba from clinical samples. These findings raise the possibility that AhCPI protein may play a role in protein metabolism and digestion of phagocytosed bacteria or host tissue debris rather than in invasion of amoebae into host tissue.

대두 Kunitz Trypsin Inhibitor 전구체의 동정 (Identification of the Precursor for the Soybean Kunitz Trypsin Inhibitor)

  • 김정호;김수일;최양도
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제32권3호
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    • pp.222-231
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    • 1989
  • 대두에 존재하는 단백질 분해 효소 저해제로는 Kunitz trypsin inhibitor (SKTI), Bowman-Birk proteinase inhibitor, 그리고 그의 isoinhibitor들이 알려져 있다. SKTI는 분자량이 20K이며 181개의 아미노산으로 구성되어 있다. SKTI의 분자 구조 및 발현 특이성을 밝히기 위하여, 콩에서 순수 분리한 SKTI를 항원으로 사용하여 항체를 제조하였다. 이 항체는 항원으로 사용한 SKTI에 대하여 특이적으로 반응할 뿐만 아니라 기내에서 합성된 그의 전구체와도 특이적으로 반응하였다. 기내에서의 단백질 합성은 미성숙 대두 종자에서 mRNA를 분리한 후, wheat germ extract를 이용하여 실시하였다. 합성된 단백질 중에서 대두에 존재하는 SKTI는 검출되지 않는 반면에 면역침전법에 의해 분자량이 24K인 전구체가 존재하고 있음을 확인하였다. 이와 같이 SKTI는 mRNA로부터 전구체가 합성된 후 post-translational modification에 의해 완전한 SKTI로 변환됨을 알 수 있었다. 또한 SKTI는 대두 종자의 성숙과 함께 발현이 되는 것으로 보아 조직 및 분화 특이성 발현형태를 나타내는 것을 알 수 있었다.

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적토룡 추출 단백분획의 프로테나제 유도 수용체-2의 활성화 및 형행개선 효과 (Protein Fraction Extracted from the Earthworm Lumbricus rubellus Activates Proteinase Activated Receptor-2 and is Effective on Hemokinesis)

  • 이철규;신장식;최영근;임채곤;조일환;김철
    • 약학회지
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    • 제41권2호
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    • pp.247-254
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    • 1997
  • The proteinase-activated receptor (PAR-2) belongs to the family of seven transmembrane region receptors, like the thrombin receptor, it is activated by specific proteolytic clea vage of its extracellular amino terminus and a synthetic peptide (SLIGRL). The earthworm protein fraction (EPF) extracted from Lumbricus rubellus elicted dose- and endothelium-dependent relaxations in phenylephrine-contracted rat thoracic aorta, whereas heat inactivated EPF (0.5 ${\mu}g$ /ml) had no effect. In the presence of the nitric oxide synthase inhibitor NG-methyl-L-arginine (1.8 micro M), EPF (0.5 ${\mu}g$ /ml)-induced relaxations were partially inhibited. Furthermore, EPF (0.5 ${\mu}g$ /ml) dramatically caused relaxation of thrombin-desenstized rat thoracic aorta. These results indicate that EPF activates PAR-2 in vascular endothelial cell. Intravenous injection of EPF (20 mg/kg, bolus) into anesthetized rats produced a marked depressor response. EPF (0 ~ 80 ${\mu}g$ /ml, gradient) was very effective on increasing of perfusion volume in rabbit ear vessel preparations. These results imply the usefulness of EPF as a vascular smooth muscle relaxant and indicate that the activation of PAR-2 may be a mechanism of EPF on hemokinetic improvement.

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김치로부터 Lactobacillus plantarum 생육저해 박테리오신 생산균주의 분리 및 박테리오신 생산의 유도효과 (Characterization of the Antagonistic Activity against Lactobacillus plantarum and Induction of Bacteriocin Production)

  • 양은주;장지윤;이형주;김정환;정대균;이종훈;장해춘
    • 한국식품과학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.311-318
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    • 2002
  • Lactobacillus plantarum에 대해 항균활성을 지니는 유산균을 김치로부터 분리하였다. 이 균은 Leuconostoc mesenteroides으로 동정되었으며 Leuconostoc mesenteroides B7으로 명명하였다. Leuconostoc mesenteroides B7이 생산하는 박테리오신은(박테리오신 B7) pH 및 열 안정성이 뛰어나 pH $2.5{\sim}9.5$ 그리고 $4^{\circ}C{\sim}120^{\circ}C$ 열처리에서도 항균활성을 안정하게 유지하였다. 박테리오신 B7은 proteinase K, trypsin, ${\alpha}-chymotrypsin$, 그리고 protease 처리에 의해 항균활성이 실활되므로 peptide나 단백질로 이루진 구조임을 알 수 있었다. 정제된 박테리오신 B7은 Tricine-SDS-PAGE를 통하여 분자량이 약 3,500 dalton임을 확인하였다. Leuconostoc mesenteroides B7과 이에 감수성인 균주, Lb. plantarum KFRI 464 혹은 Lb. delbruekii KFRI 347와의 혼합배양에 의하여 박테리오신 B7 생산이 증가됨을 확인하였고, 이는 박테리오신 생산 유도물질이(inducing factor) 감수성균주내에 존재함을 시사한다. 감수성균주의 세포분획을 통하여 inducing factor는 감수성균주의 세포벽과 세포내에 존재함을 알았다. 이 inducing factor가 proteinase K처리로 박테리오신 유도활성을 상실함으로써 이는 단백질성물질임을 시사하였다.

결핵균 PCR에서 이온교환수지를 이용한 신속한 DNA 분리 (Rapid Extraction of DNA using Ion Exchange Resin for Early Detection of Mycobacterium tuberculosis by the Polymerase Chain Reaction)

  • 김철민;박승규;손말현;송선대;김영;전은숙;손한철;정병선
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제43권1호
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    • pp.30-37
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    • 1996
  • 연구배경: 본 연구는 결핵의 조기검출을 위하여, PCR을 이용하는데 있어서의 중요한 문제점의 하나인 임상검체로부터 결핵균을 분리 방법을 개선하여, 교차오염의 가능성을 최소화하고 PCR에 의한 결핵균의 DNA검출을 보다 쉽고 안전하게 실시하여 대량의 검체를 처리해야하는 일상 임상검사법으로 정착시키고자 하는데 그 목적이 있다. 방법: 다양한 방법으로 DNA를 검출하여 동일한 방법으로 PCR을 수행하여 이차 PCR 산물의 전기영동 결과를 AFB도말 및 배양검사 결과와 함께 비교하여 감수성, 특이성, 양성예측도 및 음성예측도의 항목으로 비교분석하였다. 실험 1은 Proteinase K 처리후 phenol로 추출하는 방법과 Chelex 100 이온교환 수지를 이용한 InstaGene법을 100예에서 비교하였으며, 실험 2에서는 Microwave 처리후 원침 상청액을 직접 시용하는 방법과 Chelex 100 이온교환 수지를 이용한 InstaGene 법을 98예에서 비교하였다. 결과: 세 DNA 분리법으로 실시한 PCR결과에서 모두 특이성과 양성예측도가 매우 낮았다. 실험 1에서 Proteinase K 법에 의한 경우 보다 Insta Gene을 이용한 경우에 약 20% 높은 감수성과 10%~20% 높은 음성예측도를 보이고 있으며, 특이성은 2%~8% 낮고, 양성예측도는 2.5%~4% 높은 것으로 나타났다. 실험 2에서는 Microwave법과 Insta Gene을 이용한 경우에 거의 비슷한 결과를 보였다. 결론: 결핵진단시 PCR을 위한 객담검체에서의 DNA 분리시에 Microwave법과 $InstaGene^{TM}$ DNA분리 kit가 매우 효율적이며, 특히 InstaGene법이 교차오염의 가능성이 거의 없고, 처리 시간이 짧으며, 조작이 매우 간단하며 매우 경제적인 것으로 나타났다. 다만 특이성을 더욱 높일 수 있도록 연구가 추가되어야 할 것이며 일반 인구집단에서 충분한 임상검체를 대상으로 연구가 추가되면 InstaGene법의 유용성이 더욱 확실히 검증 될 것으로 사료된다.

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Lactobacillus spp.로부터 RNA 추출을 위한 신속/간단한 방법 (Simple/Rapid Method for RNA Preparation from Lactobacillus spp.)

  • 소재성;오은택;최민지;윤현식
    • KSBB Journal
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    • 제17권3호
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    • pp.311-313
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    • 2002
  • L. crispatus KLB46는 Gram-positive bacteria로써 인간의 건강에 중요한 역할을 한다. 본 연구에서는 glass bead를 이용하여 세포벽을 파괴하고 hot phenol RNA 분리방법을 이용하여 RNA를 성공적으로 분리하였다. 또한 Iysozyme과 proteinase K 처리과정을 배제하여 시간적, 경제적인 면에서 유용한 방법임을 확인할 수 있었다. Gram-positive bacteria에서 glass bead를 이용한 RNA 분리는 특수한 조건에 의해 전사 되거나 반감기가 찬은 mRNA의 연구에 유용한 방법이라 사료된다.