Tamlana sp. UJ94 isolated from seawater can degrade alginate. To identify the genomic basis of this activity, the genome was sequenced. The genome was composed of 4,116,543 bp, 3,609 coding sequences, and 35.2 mol% G + C content. A BLASTp search predicted the presence of 9 alginate lyases as well as 6 agarases, 5 amylases, 4 carrageenases, 1 cellulase, 4 pectate lyases, and 7 xylanases, indicating its ability to degrade diverse polysaccharides. The genome of strain UJ94 is a source of polysaccharide-degrading enzymes for bioconversion processes.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.33
no.10
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pp.1589-1593
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2004
The aims of this study were to investigate the antioxidative and antitumor effects of crude polysaccharide fraction from Pleurtus eryngii (CPPE). CPPE inhibited autoxidation of linoleic acid at 1,000 $\mu$g/mL concentration, and the inhibitory rates of lipid peroxidation in rat liver microsome were 5.28, 9.40, and 32.5% at 10, 100, and 1,000 $\mu$g/mL concentrations, respectively. After treatment with CPPE for 72 hours, the inhibitory rates against MCF-7, A549 and AGS cell lines showed 42.3, 33.4 and 26.7% at concentration of 1,000 $\mu$g/mL, respectively. Results of CPPE treatment at 100 and 300 mg/kg/day for 7 days in sarcoma-180 bearing-mice showed survival rates of 70 and 90%, respectively. Body weights of mice treated with CPPE were significantly decreased when compared with the control.
Batch kinetics during the exo-polysaccharide (EPS) fermentation of Ganoderma lucidum was investigated as a function of different substrates (glucose and starch), substrate concentration $(1{\sim}7%,\;w/v)$ and subculture (3 times). Logistic model for mycelial growth fitted the experimental data better than Monod and two thirds power model. The Luedeking-Pirt equation was adequate to fit the kinetic data of product formation and substrate consumption. The EPS production was strongly non-growth associated, although it was mixed type. The product formation and sustrate consumption by growth associated mechanism decreased as the concentration of glucose increased, while those of the non-growth associated mechanism increased. However, starch medium increased the growth associated and non-growth associated substrate consumption indicating higher availability of substrate. Also, batch culture in starch medium showed the higher specific growth rate and stability during subculture than those in glucose medium. In conclusion, the enhanced EPS production and stability in the subculture was found to be remarkably improved by use of starch as sole carbon source in medium. The maximum mycelium dry weight and EPS production of 9.463 and 10.410 g/l, respectively, were obtained after shake culture of 7 days at $30^{\circ}C$ from the media containing 7% starch.
The inhibition of nitric oxide (NO) and cyclooxygenase-2 (COX-2) production is considered to be a promising approach to the treatment of various diseases, including inflammation and cancer. In this study, we examined the effects of the Agrocybe chaxingu $\beta$-glucan (polysaccharide) on lipopolysaccaride (LPS)-induced nitric oxide (NO) and cyclooxygenase-2 (COX-2) expression in murine macrophage Raw 264.7 cells as well as 12-O-tetradecanoylphorbol 13-acetate (TPA)-induced ear edema in mice. The polysaccharide significantly inhibited (P < 0.01) LPS-induced iNOS and COX-2 expression levels in the cells. Furthermore, topical application of polysaccharide resulted in markedly inhibited (P < 0.01) TPA-induced ear edema in mice. These results suggest that this polysaccharide may be used for NO- and COX-2-related disorders such as inflammation and cancer.
The strain A49, which produces a new type of extracellular polysaccharide was isolated from soil samples. From morphological, physiological and biochemical tests, the strain A49 was identified as a Bacillus polymyxa and named Bacillus polymyxa A49. Bacillus polymyxa A49 was found to produce a highly viscous extracellular polysaccharide when grown aerobically in a medium containing glucose as the sole source of carbon. The polysaccharide (A49 POL) showed a homogeneous pattern on gel permeation chromatography (GPC) and its molecular weight was estimated to be about 1.6 mega dalton (mDa). The FT-IR spectrum of A49-POL revealed typical characteristics of polysaccharides. As a result of investigations with HPLC and carbozole assay, A49-POL was found to consist of L-fucose, D-galactose, D-glucose, D-mannose, and D-glucuronic acid, with the molar ratio of these sugars being approximately 1:2:7:50:12. Rheological analysis of A49 POL revealed that it is pseudoplastic and has a higher apparent viscosity at dilute concentrations than does xanthan gum. The consistancy factor of A49 POL was found to be higher, and the flow index of A49 POL lower, than xanthan gum. Its apparent viscosity was comparatively unstable at various temperatures. the A49 POL showed the highest apparent viscosity at pH 3. When salts were added to A49 POL solution, the solution was compatible with up to 10% KCl, 35% NaCl, 55% $CaCl_2$, 55% $MgCl_2$, 55% $K_2HPO_4$, and 110% $Ca({NO_3})_2$, respectively.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.39
no.11
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pp.1640-1646
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2010
The optimum condition was investigated for the extraction of glycosaminoglycan (GAG) from sea hare, Aplysia kurodai. The most effective enzyme was Flavourzyme for extraction of glycosaminoglycan. The optimum incubation temperature and time for hydrolysis were $60^{\circ}C$ and 15 hr, respectively. The yield of precipitated polysaccharide depended on Brix and ethanol volume. The most effective concentration of Brix and ethanol were sixty and 5 volume of ethanol, respectively. Most GAG was eluted between 0.5 M and 0.75 M NaCl gradient on DEAE-Sepharose column, and identified by electroconductivity. The contents of hexuronic acid from polysaccharide extract and GAG were 1.0 g/100 g and 6.0 g/100 g, respectively. Hexosamine of polysaccharide and GAG as indicator of GAG component was 5.6 g/100 g and 25.7 g/100 g, respectively. GAG was identified as heparan sulfate compared with bands of other GAG on agarose gel electrophoresis, and its molecular weight was 29.6 kDa on Superdex 200 HR column.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.40
no.1
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pp.63-69
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2011
To characterize the polysaccharides which exist as soluble forms in Korean traditional alcoholic beverages, the polysaccharides were isolated from Korean pear wine and their anti-complementary activities were examined. The main polysaccharide, PW-1 was purified to homogeneity from the crude polysaccharide (PW-0) in pear wine by size exclusion chromatography using Sephadex G-75. Molecular mass of PW-1 was estimated to be 150 kDa and it contained significant proportion of mannose (81.8%) and 5 different minor component sugars such as arabinose (1.2%), galactose (2.7%), glucose (8.5%), galacturonic acid (5.3%) and glucuronic acid (0.5%). These analyses indicated that the main polysaccharide in pear wine was mainly present as a mannan which had originated from the cell walls of fermenting yeasts. On the other hand, PW-1 showed potent anti-complementary activity in a dose-dependent fashion. Identification of C3 activation products by the crossed immunoelectrophoresis using anti-human C3 and anti-complementary activity of PW-1 in $Ca^{++}$-free condition suggested complement activations by PW-1 from Korean pear wine occur via both classical and alternative pathways.
Park, Mi-Jung;Ahn, Mi-Jeong;Kim, Jin-Woong;Ze, Keum-Ryon;Lee, Heum-Sook
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.36
no.1
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pp.131-135
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2007
Various Phellinus species (Hymenochaetaceae) including P. linteus, P. baumii, P. pini, and P. igniarius of domestic and foreign products, were examined by gas chromatography to validate their composition of crude polysaccharides. The crude polysaccharide fraction, which is known to be one of the physiologically active fractions, were prepared by a cold ethanol precipitation method and the yield of the crude polysaccharide fractions of P. linteus, P. baumii, P. pini, and P. igniarius were 15.0%, 5.1%, 6.3% and 5.7%, respectively. The total monosaccharide amount of the crude polysaccharide fraction of P. linteus was 148.713 mg/g (dry weight of mushroom) while those of P. baumii, P. pini and P. igniarius were 29.022 mg/g, 29.222 mg/g and 1.546 mg/g, respectively. Although the major monosaccharide of all Phellinus mushrooms was glucose, there were remarkable differences in the absolute quantity of each monosaccharide. P. linteus included plenty of monosaccharides except mannose and ribose in comparison with P. baumii and P. pini. The absolute quantities of monosaccharides of P. baumii and P. pini were nearly similar except arabinose. The total monosaccharides of P. igniarius were minimal, but the portions of galactose and mannose in P. igniarius were greater than in the other species.
Enteromorpha polysaccharides (EP) extracted from green algae have displayed a wide variety of biological activities. However, their high molecular weight leads to a high viscosity and low solubility, and therefore, greatly restrains their application. To solve this problem, bacteria from the surface of Enteromorpha were screened, and an Alteromonas macleodii strain B7 was found to be able to decrease the molecular weight of EP in culture media. Proteins harvested from the supernatant of the A. macleodii B7 culture were subjected to native gel electrophoresis, and a band corresponding to the Enteromorpha polysaccharide lyase (EPL) was detected by activity staining. The enzyme identity was subsequently confirmed by MALDI-TOF/TOF mass spectrometry as the putative ${\alpha}$-amylase reported in A. macleodii ATCC 27126. The amylase gene (amySTU) from A. macleodii B7 was cloned into Escherichia coli, resulting in high-level expression of the recombinant enzyme with EP-degrading activity. AmySTU was found to be cold-adapted; however, its optimal enzyme activity was detected at $40^{\circ}C$. The ${\alpha}$-amylase was highly stable over a broad pH range (5.5-10) with the optimal pH at 7.5-8.0. The highest enzyme activity was detected when NaCl concentration was 2%, which dropped by 50% when the NaCl concentration was increased to 16%, showing an excellent nature of halotolerance. Furthermore, the amylase activity was not significantly affected by tested surfactants or the presence of some organic solvents. Therefore, the A. macleodii strain B7 and its ${\alpha}$-amylase can be useful in lowering EP molecular weight and in starch processing.
Choi Yong Seok;Koo Jae Geun;Ha Jin Hwan;Yoon Jang Tak
Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
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v.35
no.5
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pp.519-523
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2002
Soluble polysaccharide (SP) from green layer, Enteromorpba prolifera was extracted 3 times with distilled water at 100$^{\circ}C$ for 2 hrs and fractionated with cetylpyridinium chloride (CPC) and ion exchange chromatography (DEAE Separose CL-6B). The SP amounted to $23.7\%$ of the dry seaweed weight and contained $68.8\%$ carbohydrate. It was mainly constituted of rhamnose, glucose, xylose, sulfate and uronic acid and was fractionated with CPC into three (CPC-S, CPC-PS, CPC-PP) tractions. The major acid fraction CPC-PS accounted for $10.2\%$ of the dry algal weight. CPC-PS was further fractionated on DEAE Sepharose CL-6B into Fr-1 ($8.0\%$), Fr-2 ($35.8\%$), Fr-3 ($23.7\%$) fractions. The Fr-3 fraction contained $2.2\%$ protein, $21.4\%$ sulfate, $15.3\%$ uronic acid, and $72.4\%$ polysacchnrides composed of rhamnose, xylose and glucose. The Fr-2 fraction, which was richer in uronic acid ($17.5\%$) and poorer in sulfate ($19.0\%$) and total sugar ($68.8\%$) than the Fr-3, had a sugar composition close to that of Fr-3. The average molecular weights of Fr-2 and Fr-3 were 510,000 and 830,000 daltons, respectively. Fr-3 turned out to be homogeneous by cellulose acetate electrophoresis.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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