대학병원의 임상검체에서 extended-spectrum-${\beta}$-lactamase (ESBL)생성 Klebsiella pneumoniae 51균주를 분리하였다. ESBL생성 K. pneumoniae 51균주는 광범위한 항생제에 내성을 보였고 대부분의 균주는 amikacin, gentamycin과 ciprofloxacin항생제에 내성을 나타내었다. 대학병원에서 분리한 51균주를 randomly amplified polymorphic DNA (RAPD)로 분석한 결과 충남대학병원 21균주와 충북대학병원에서 분리한 10균주는 Ia 와 Ib에 속하였고 경상대학 병원에서 분리한 20균주는 IIa, IIb에 속하였다. ESBL 생성 K. pneumoniae 51균주는 RAPD 분석으로 4가지의 유전형으로 구분 할 수 있었고 유전적으로 다양하였다. 이상의 결과로 RAPD 분석은 유전형분석에 빠르고 단순하고 경제적인 방법임을 알 수 있었다.
속도 4km/s 이상인 초고속 제트의 관통 깊이는 제트와 표적의 밀도 비를 통해 기술된다. 반면에 동일한 밀도인 경우 표적들 사이의 강도 차이는 관통 깊이 차이에 영향을 주지 않는다. 본 연구는 초고속 제트의 "강도 무관성"에 관한 연구를 다룬다. 이를 위해 초고속 성형작약탄두 제트(SCJ)에 의해 발생된 크레이터 압력의 변화를 유한요소해석을 통해 계산하고, 철강소재의 polymorphic 상변이 발현 가능성을 조사하였다. 결과적으로 초고속 제트는 표적 크레이터에 polymorphic 상변이를 일으킬 수 있고, 이로 인한 표적의 파괴 인성 저하가 강도 무관성의 원인으로 예측된다.
Tamarind (Tamarindus indica L.) is one of the multipurpose tree species distributed in the tropical and sub-tropical climates. It is an important fruit yielding tree that supports the livelihood and has high social and cultural values for rural communities. The vegetative, reproductive, qualitative, and quantitative traits of tamarind vary widely. Characterization of phenotypic and genetic structure is essential for the selection of suitable accessions for sustainable cultivation and conservation. This study aimedto examine the genetic relationship among the collected accessions of sweet, red, and sour tamarind by using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) primers. Nine accessions were collected from germplasm gene banks and subjected to marker analysis. Fifteen highly polymorphic primers generated a total of 169 fragments, out of which 138 bands were polymorphic. The polymorphic information content of RAPD markers varied from 0.10 to 0.44, and the Jaccard's similarity coefficient values ranged from 0.37 to 0.70. The genetic clustering showed a sizable genetic variation in the tamarind accessions at the molecular level. The molecular and biochemical variations in the selected accessions are very important for developing varieties with high sugar, anthocyanin, and acidity traits in the ongoing tamarind improvement program.
In Malaysia, Labisia pumila Benth & Hook f, popularly known as 'Kacip Fatimah' has been used traditionally to treat various elements of the woman's health in Malay community. The objective of this study was to develop randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) based DNA markers for the identification of L. pumila and to distinguish its three varieties from each other. Total DNA from nine accessions of L. pumila was extracted by CTAB method and polymerase chain reactions (PCR) were carried out to amplify the segments of DNA using different primers to develop DNA barcode using RAPD technique. To find out variety-specific DNA marker/s, twenty different 10-mer primer sequences with annealing temperature from 36-$40^{\circ}C$ were evaluated in triplicate. Out of 20 random primers, two primers (OPA-1 and OPA-2/A10) were selected which produced reliable RAPD band patterns. To have DNA based handle, two RAPD amplification products were cloned and sequenced to determine the identity of the DNA. RAPD analysis using two random primers generated 72 discrete bands ranging in size 200 bp-3,000 bp. Fifty nine of these were polymorphic loci (82%) and thirteen were non-polymorphic loci (18%). A total of 32 bands polymorphic loci (72%) were amplified with primer OPA-1 and analyzed by cluster analysis and UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic) to present a dendogram depicting the degree of genetic relationship among nine accessions of L. pumila. Our results shows the reasonable genetic diversity among the L. pumila varieties and within varieties; and two RAPD marker sequences obtained could be used to identify L. pumila at species level.
거봉 포도나무에 혹병을 일으키는 A. vitis 균주간의 DNA 다양성 평가를 하기 위하여 12종류의 URP primer 적용 성을 조사한 결과 URP1F, URP2F, URP2R, URP4R, URP17R primer가 균주 간 DNA 다형성검정에 유용하였다. 국내외에서 분리한 59 A. vitis 균주를 URP-PCR 증폭하였던 바 균주간의 매우 다양한 PCR 다형성 밴드를 형성 하였으며 12 strain type으로 나눌 수 있었으며 거봉포도로부터 분리된 A. vitis 균주는 4 strain type의 비교적 단순한 유전적 다양성으로 나타났으나, 거봉이외의 다른 포도 품종이나 국외에서 도입된 A. vitis 균주는 8 strain type의 많은 유전적 다양성을 보여 거봉품종 유래 국내 균주와는 PCR 다형성 type에 있어 차이점을 보였다. URP-PCR 다형성 밴드를 집괴 분석하여 UPGMA dendrogram을 작성한 결과 7개의 대 Group으로 분류할 수 있었으며, 그룹 간에는 $62{\sim}100$%까지 다양한 유전적 유사성이 나타났다.
본 연구는 뉴질랜드 넬슨 지역에 조림된 미송(美松) (Pseudotsuga menziesii Mirb. Franco)의 지위지수(地位指數) 식과 지위지수(地位指數) 곡선 구성에 관한 것이다. 지위지수(地位指數) 모델 구성에 146개의 영구 표본 플롯 (PSP)이 사용되었고, Difference 방정식을 이용하여 지위지수(地位指數) 식을 유도하였다. 모수(母數) 추정은 SAS의 PROC NLIN을 이용한 비선형 루틴에 의하여 수행하였다. Schumacher 다변태(多變態) 생장식이 사용된 여러 생장식 중 가장 정밀한 추정을 보여주었고, 모델 추정에 사용된 95% 관측치는 실측치의 ${\pm}1.2m$ 이내의 추정치를 나타내었다. 따라서, 지위지수(地位指數) 등급의 상이(相異)에따라 지위지수(地位指數) 곡선의 변형을 반영하는 다변태(多變態) 지위지수(地位指數) 곡선을 Schumacher 생장식으로부터 유도하였다. 또한 다변태(多變態) 방정식과 변태(變態) 방정식의 비교 결과는, 다변태(多變態) 방정식으로부터 보다 정확한 지위지수(地位指數) 식을 이끌어 냄을 알 수 있었다.
스크립트 바이러스는 제작이 쉽고 텍스트 형식으로 코드가 유포되는 특징으로 인해 변종 출현이 빈번하여, 시그너쳐에 의존하지 않고 탐지하려는 시도가 이루어지고 있다. 그러나 이러한 단순 휴리스틱 기법은 긍정 오류가 높은 단점이 있다. 이를 개선하기 위해 자료 흐름 분석을 이용하여 오류율을 낮춘 탐지 기법이 제시되었다. 그러나 이 기법은 탐지 대상이 다형성 바이러스여서 셀프를 읽어 들여 변형을 가한 후 새로 운 복사본을 만드는 방식으로 전파될 경우 탐지하지 못하는 단점을 지닌다. 이를 극복하기 위해 본 논문에서는 기존의 자료 흐름 분석 휴리스틱 기법이 가지는 정적 분석 기법을 확장하여 다형성 스크립트 바이러스가 가지는 특징도 탐지할 수 있도록 하는 기법을 제안한다. 확장된 자료 흐름 분석 휴리스틱 기법은 확장된 문법을 통해 기존의 기법이 인식할 수 없었던 변형된 복사 전파를 인식할 수 있다. 또한 본 논문에서는 제안된 기법을 구현하여 제안된 기법이 가지는 탐지율에 대한 실험 결과를 제시한다.
프로그램 내 바이러스 코드 패턴을 탐색하는 현재의 백신 프로그램은 암호화 바이러스나, 다형성 바이러스를 탐지하는 데 어려움이 있다. 다형성 바이러스는 암호를 해제하는 코드 부분이 감염된 때마다 변형된다. 그래서, 이 바이러스를 탐지하기 위해서는 바이러스 본체를 해제하는 암호해제 코드의 행동을 추적해보아야 하며, 코드 분석시 많은 시간이 소요되는 것이 일반적이다. 특히, 바이러스 제작자가 바이러스 암호 해제 코드의 반복 실행 수를 늘려 놓았다면 기존의 방식으로는 이를 발견하기 어렵다. 본 논문에서는 이러한 다형성 바이러스를 탐지하기 위해서 개선된 알고리즘을 이용한 에뮬레이터를 제안한다. 이론 이용하여 다형성 바이러스를 탐지해본 결과, 기존의 에뮬레이터에 비해 다형성 바이러스 진단율이 약 2%정도 향상되었다. 또한, 제안된 다형성 바이러스 진단 시스템은 MS-Windows 뿐만 아니라 Linux 등 Unix 계열 플랫폼에서도 동작할 수 있다는 장점이 있다.
Moniem, Hebatallah Abdel;Zong, Yang Yao;Abdallah, Alwasella;Chen, Guo-hong
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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제32권11호
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pp.1664-1672
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2019
Objective: This study aimed to measure genetic diversity and to determine the relationships among fourteen goose breeds. Methods: Microsatellite markers were isolated from the genomic DNA of geese based on previous literature. The DNA segments, including short tandem repeats, were tested for their diversity among fourteen populations of geese. The diversity was tested on both breeds and loci level and by mean of unweighted pair group method with arithmetic mean and structure program, phylogenetic tree and population structure were tested. Results: A total of 108 distinct alleles (1%) were observed across the fourteen breeds, with 36 out of the 108 alleles (33.2%) being unique to only one breed. Genetic parameters were measured per the 14 breeds and the 9 loci. Medium to high heterozygosity was reported with high effective numbers of alleles (Ne). Polymorphic information contents (PIC) of the screened loci was found to be highly polymorphic for eleven breeds; while 3 breeds were reported moderately polymorphic. Breeding coefficient ($F_{IS}$) ranged from -0.033 to 0.358, and the pair wise genetic differentiation ($F_{ST}$) ranged from 0.01 to 0.36 across the fourteen breeds; for the 9 loci observed and expected heterozygosity, and Ne were same as the breeds parameters, PIC of the screened loci reported 6 loci highly polymorphic and 3 loci to be medium polymorphic, and $F_{IS}$ ranged from -0.113 to 0.368. In addition, genetic distance estimate revealed a close genetic distance between Canada goose and Hortobagy goose breeds by 0.04, and the highest distance was between Taihu goose and Graylag goose (anser anser) breed by 0.54. Conclusion: Cluster analyses were made, and they revealed that goose breeds had hybridized frequently, resulting in a loss of genetic distinctiveness for some breeds.
통신망을 통하여 자동적으로 확산되는 악성 프로그램인 웜에 대응하기 위하여, 웜 관련 패킷들을 분석하여 시그니처를 생성하여 웹을 탐지하는 방법들이 많이 사용되고 있다. 그러나 이런 시그니처-기반 탐지 기법을 회피하기 위하여, 변형된 폴리모픽 형태의 공격 코드 사용이 점차 증가하고 있다. 본 논문에서는 폴리모픽 공격 코드의 복호화 루틴을 탐지하기 위한 새로운 정적 분석 방법을 제안한다. 제안된 방법은 통신망 플로에서 폴리모픽 공격 코드에 함께 포함되어 암호화된 원본 코드를 복호화하는 역할을 수행하는 코드 루틴을 탐지한다. 실험 결과를 통하여 제안된 방법이 정적 분석 방지 기법들이 사용된 폴리모팍 코드들도 탐지할 수 있는 것을 보여준다. 또한 처리 성능에서 에뮬레이션 기반 분석 방법보다 효율적인 것으로 나타났다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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