• Applied Biological Chemistry
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• 제30권3호
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• pp.219-226
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• 1987

녹두의 자엽에서 peroxidase isozyme을 $(NH_4)_2SO_4$ 침전, Sephadex G-75, DEAE-cellulose 및 DEAE-Sephadex A-50 column chromatography 등으로 63배 정제하여 그 특성 및 결정구조를 조사하였다. Isozyme C는 Rm 값이 0.24로서 분자량이 50,000 dalton인 단량체였다. 이 효소의 반응 최적 PH는 o-dianisidine에 대하여 5.0, guaiacol에 대해서는 6.0, 반응 최적온도는 $70^{\circ}C$였으며 열에 대해서도 비교적 안정하였다. o-dianisidine과 guaiacol에 대한 Km 값은 각각 0.11mM, 60.98mM이었으며, isozyme C에 대한 기질과 cyanide는 경쟁적 저해형식을 나타내었다. Isozyme C는 평면상 직사각형의 결정구조를 하고 있었다.

• Asian Journal of Atmospheric Environment
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• 제6권1호
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• pp.33-40
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• 2012

In this study, we characterized the physical form of allergenic Cry j 1 in the urban atmosphere. Through an immunofluorescence antibody method, we showed that allergenic Cry j 1 exists as fine particles (${\leq}1.1{\mu}m$). To determine Cry j 1 concentrations and its particle size distribution, we used the ELISA method to confirm that most Cry j 1 exists as fine particles in the urban atmosphere and is found at high concentrations on fine day next to rainy day. Furthermore, we evaluated Cry j 1 denaturation by using the Biacore J system based on the surface plasmon resonence (SPR) principle and sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). We showed that the dissociation constant ($K_D$) of Cry j 1 that has been exposed to urban polluted air is lower ($1.76{\times}10^{-14}$ M) than that of Cry j 1 ($1.32{\times}10^{-9}-3.37{\times}10^{-9}$ M) of original pollen grains that has not been exposed to air pollutants. Cry j 1 turns into low molecular weight proteins by reacting with various acidic solutions. In sum, we showed that allergenic Cry j 1 exists as fine particles that can deposit in the lower respiratory tract. This finding clarifies the relationship between Japanese cedar pollinosis and air pollutants.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제25권2호
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• pp.166-172
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• 1997

Aspergillus niger was selected as a strain producing the potent raw starch hydorlyzing enzyme. These experiments were conducted to investigate the conditions of the glucoa- mylase production, the purification of the enzyme, some characteristics of the purified enzyme and hydrolysis rate on various raw starches such as com, rice, potato, glutinous rice, sweet potato, wheat and barley. The optimum cultural temperature and time for the enzyme production on wheat bran medium were $30^{\circ}C$ and 96hrs, respectively. The respective addition of yeast extract and nutrient broth on wheat bran medium increased slightly the enzyme production. The enzyme was purified by ammonium sulfate fractionation and DEAE-cellulose column chromatography. The specific activity of the purified enzyme was 30.7u/mg-protein and the yield of enzyme activity was 25.8%. The purified enzyme showed a single band on polyacrylamide disc gel electrophoresis and its molecular weight was estimated to be 56,000 by SDS-polyacrylamide disc gel electrophoresis. The isoelectric point for the purified enzyme was pH3.7. The optimum temperature and pH were $65^{\circ}C$ and pH 4.0, respectively. The purified enzyme was stable in the pH range of pH 3.0-9.5 and below $45^{\circ}C$, and its thermal stability was slightly increased by the addition of $Ca^{2+}$. The purified enzyme was activated by $Co^{2+},\;Sr^{2+},\;Mn^{2+},\;Fe^{2+},\;Cu^{2+}$. Raw rice starch, raw corn starch, raw glutinous rice starch, raw sweet potato starch, raw wheat starch and raw barley starch showed more than 90% hydrolysis rate in 48hrs incubation. Even raw potato starch, most difficult to be hydrolyzed, showed 80% hydrolysis rate. The purified enzyme was identified as glucoamylase.

• Journal of Ginseng Research
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• 제22권3호
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• pp.168-172
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• 1998

Systematic electrophoretic analysis of alcohol-soluble proteins and salt-soluble proteins of 247 Panax ginseng (P.g) and Panax quinquefolium (P.q) germplasms seed was carried out on an improved lactate-polyacrylamide gel electrophoresis, a method with high resolving power, good reproducibility and stability. The electrophoregrams of proteins, according to their migration rate, were classified into four groups such as ${\alpha}$, ${\beta}$, ${\gamma}$ and $\omega$ for the alcohol-soluble proteins and three such as I, II and III for the salt-soluble ones. Panax ginseng or Panax quinquefolium had their own unique band pattern distinguishable from each other, regarding as their specific "fingerprint". In this study, 3 of 168 (1.8%) P.g germplasms and 1 of 79 (1.3%) P.q germplasms had their own unique band pattern, showing that P.g and P.q germplasms have poor genetic diversity in species. The band patterns of dry seed and stratified seed (embryo rate=60%) were basically the same. The band number of the F, hybrid of p.gx p.q was exactly equivalent to the number of the common bands plus the specific bands of the two parents, indicating that the difference of band patterns was a genetic trait con- trolled by the nuclear genes. The electrophoregram of F1 of P.g x P.q could be predicted by that of the two parents and the band pattern of the F1 hybrids could be demnonstrated by that of the mixed seed extract from the two parents.

• 농약과학회지
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• 제2권1호
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• pp.91-96
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• 1998

모기에 독성을 보이는 cry11Aa 유전자를 발현시키기 위해 cyanobacteria와 E. coli에서 발현 될 수 있는 두 가지 상이한 벡터 (pCYASK5-1, pCYASK5-2)를 제작하였다. 구축한 두 벡터를 E. coli에 형질전환하여 cry11Aa 유전자의 발현을 SDS-polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE)와 Western blot analysis을 통해 조사한 결과, pCYASK5-1와 pCYASK5-2으로 형질전환된 E. coli는 각각 72kDa과 64kDa 크기의 cry11Aa 유전자를 발현하였다. 형질전환체의 모기살충성을 조사한 결과, pCYASK5-1과 pCYASK5-2을 가지는 형질전환체는 빨간집 모기유충(Culex pipiens)에 대해 각각 93%, 89%의 치사율을 보였다.

• 생약학회지
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• 제40권2호
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• pp.109-117
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• 2009

We examined the purity of six heparin samples by using heparinase, chondroitinase, $^{1}H-NMR$, and polyacrylamide gel electrophoresis. To obtain high molecular weight contaminants from heparin samples, heparinase I - digested samples were subjected to the exhaustive microcon filtration. The filtration process removed heparin-derived di- and oligosaccharides effectively. By combining chondroitinase ABC treatment and strong anion exchange - high performance liquid chromatography, the result showed all six samples contained chondroitin sulfate as a contaminant ranging from 1.3 to 14.9%. Among them, sample S3 showed the highest content of 14.9%, which was further analyzed by chondroitinase AC treatment to confirm chondroitin sulfate B (dermatan sulfate). $^{1}H-NMR$ chemical shifts of N-acetyl groups clearly suggested the existence of chondroitin sulfate B (sample S3) and oversulfated chondroitin sulfate (samples S2 and S4) as contaminants. In addition, polyacrylamide gel electrophoresis was useful for qualitative detection on the sample's purity. These results suggest that the tools of heparinase I and chondroitinase ABC in combination with NMR spectroscopy would give very useful information for investigation of heparin contaminants such as oversulfated chondroitin sulfate and dermatan sulfate in heparin samples.

• 식물병연구
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• 제14권3호
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• pp.223-225
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• 2008

2005년 전북 고참에서 채집한 옥수수 이병주로부터 벼검은줄오갈병 바이러스를 동정하였다. 이들 이병주로부터 게놈 dsRNA를 추출하여 polyacrylamide gel 전기영동으로 게놈 패턴을 분석 하였다. 전기영동 결과 이미 알려진 10개의 분절게놈을 확인하였으며 채집지역별 isolate에서 게놈 dsRNA이동도의 차이를 확인하였다. 추출된 dsRNA를 주형으로 하여 S10의 full-length 특이 primer를 사용하여 RT-PCR한 결과 1,801의 예상되는 band를 확인하여 RBSDV로 동정하였다. S10을 pGEM-T vector에 크로닝하여 염기서열 분석 결과 1,801nt, 559aa로 구성되어 있었다. 이는 벼에 발생하는 RBSDV S10의 크기와 동일하였으며 상동성 분석결과 18개 염기에서 변이가 확인되어 99%의 상동성을 나타내었다.

• 미생물학회지
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• 제40권3호
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• pp.232-236
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• 2004

Streptomyces coelicolor A3(2)의 acetyl xylan esterase (AxeA)가 Escherichia coli의 과산화수소 저항성에 미치는 영향을 알아보고자 하였다. AxeA 발현은 isopropyl-$\beta$-thiogalactoside로 유도되었고 생산된 AxeA는 SDS-polyacrylamide gel electrophoresis방법으로 확인하였다. AxeA 발현에 따른 과산화수소 저항성의 변화를 E. coli의 생장곡선과 생존율을 통하여 조사하였다. AxeA가 발현되지 않으면 모든 처리 농도 (1 mM, 2.5mM, 5mM)에서 균의 사멸이 일어났다. AxeA가 발현되는 조건에서는 5mM을 제외한 과산화수소 1mM와 2.5mM에서 E. coli의 사멸이 저지되었다. 또한 1.5mM의 과산화수소에 대한생존율이 59%에서 74%로 높다졌다. 동시에 E. coli의 최고생장온도에서에 근접한 $45^{\circ}C$에서의 생존율도 증가되는 결과를 얻었다. 그러므로 AxeA 단백질은 산화적 스트레스와 온도스트레스에 대해 교차 저항성을 나타내는 역할을 한다고 결론지었다.

• 한국식품과학회지
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• 제21권4호
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• pp.569-574
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• 1989

Kiwifruit에서 pretense를 추출 정제하여 그의 특성을 검토하였다. 조효소는 유안분획, sephadex G-100 filtration 및 DEAE-sephadex A-50 column chromatography를 거쳐 정제되었으며 정제효소의 비활성은 30.10으로 10.95배 증가하였고 활성수율은 7.48%에 달하였다. 정제효소는 casein및 hemoglobin을 잘 분해하였고 작용 최적 pH는 7.0이었으며 pH$7.0{\sim}8.0$에서 안정하였고 작용 최적온도는 $45^{\circ}C$이고 $50^{\circ}C$이하에서 안정하였다. 0.5 mM $HgCl_2$와 $MnSO_4$에 의해 강한 저해를 받았으며 2 mM cysteine과 0.5 mM EDTA에 의해 활성이 촉진되었으며 Km값은 50.5 mg/ml 이었고 분자량은 SDS 전기영동법에 의하여 측정하였을 때 23,500이었다.

• 한국시뮬레이션학회논문지
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• 제20권2호
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• pp.77-85
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• 2011

생물 및 의학계에서는 생물정보학(bioinformatics)의 데이터 중 혈청 단백질(proteome)에서 추출한 데이터가 질병의 진단에 관련된 정보를 가지고 있고, 이 데이터를 분류 분석함으로 질병을 조기에 진단 할 수 있다고 믿고 있다. 본 논문에서는 혈청 단백질(2-D PAGE: Two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis)로부터 암과 정상을 판별하는 새로운 복합분류기를 제안한다. 새로운 복합 분류기에서는 support vector machine(SVM)와 다층 퍼셉트론(multi-layer perceptron: MLP)와 k-최근 접 이웃(k-nearest neighbor: k-NN)분류기를 앙상블(ensemble) 방법으로 통합하는 동시에 다중 부스팅(boosting) 방법으로 각 분류기를 확장하여 부분류기(subclassifier)의 배열(array)으로서 복합분류기를 구성하였다. 각 부분류기에서는 최적 특성 집합 (feature set)을 탐색하기 위하여 유전 알고리즘(genetic algorithm: GA)를 적용하였다. 복합분류기의 성능을 측정하기 위하여 암연구에서 얻어진 임상 데이터를 복합분류기에 적용하였고 결과로서 단일 분류기 보다 높은 분류 정확도와 안정성을 보여 주었다.