• 식물병연구
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• 제29권1호
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• pp.52-59
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• 2023

Cucurbit chlorotic virus (박과퇴록황화바이러스, CCYV)는 수박, 오이 등의 박과작물에 영향을 미치는 식물바이러스로 담배가루이에 의해 전반된다. 2018년 충북 오이에서 처음 진단된 이후 경상도 등 다른 지역에서도 보고되고 있다. 2020년 충북 진천, 음성지역의 박과작물 온실의 황화 바이러스병 조사에서 멜론, 수박, 잡초 등 채집시료 총 79시료에 대한 CCYV 특이 프라이머를 이용한 reverse transcription-polymerase chain reaction 결과 멜론 4개의 시료에서 CCYV가 확인되었다. 3점은 CCYV 단독감염, 1점는 Cucurbit aphid borne yellows virus와 Watermelon mosaic virus 복합감염으로 나타났다. 4개의 CCYV ES 분리주로부터 RNA 1, 2의 전체게놈을 얻었고, 이전에 GenBank에 보고된 CCYV 분리주들과 염기서열을 분석하였다. MEGA를 이용하여 계통분석결과 ES 분리주들은 하나의 그룹으로 나타났고, 중국 분리주들과 밀접한 관련이 있었다. ES 분리주들 유전적 다양성이 낮은 것으로 나타났고, 일반적으로 CCYV은 기주 및 지리적 기원에 따라 유전적 다양성이 거의 없었다. CCYV는 박과작물 생산에 심각한 위협이 될 가능성이 있다. 수박, 잡초 등을 포함한 다양한 CCYV 분리주에 대한 병원성, 가루이 전염 등의 특성에 대한 추가적인 연구가 필요하다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권7호
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• pp.1324-1330
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• 2017

Complete genome sequences of three new plant RNA viruses, Spinach deltapartitivirus 1 (SpDPV1), Spinach amalgavirus 1 (SpAV1), and Spinach latent virus (SpLV), were identified from a spinach (Spinacia oleracea) transcriptome dataset. The RNA-dependent RNA polymerases (RdRps) of SpDPV1, SpAV1, and SpLV showed 72%, 53%, and 93% amino acid sequence identities with the homologous RdRp of the most closely related virus, respectively, suggesting that SpDPV1 and SpAV1 were novel viruses. Sequence similarity and phylogenetic analyses revealed that SpDPV1 belonged to the genus Deltapartitivirus of the family Partitiviridae, SpAV1 to the genus Amalgavirus of the family Amalgaviridae, and SpLV to the genus Ilarvirus of the family Bromoviridae. Based on the demarcation criteria, SpDPV1 and SpAV1 are considered as novel species of the genera Deltapartitivirus and Amalgavirus, respectively. This is the first report of these two viruses from spinach.

• 한국식물병리학회지
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• 제11권1호
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• pp.87-90
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• 1995

Complementary DNA of the movement protein (MP) gene of tobacco mosaic virus Korean pepper strain (TMV-KP) was synthesized from purified TMV-KP RNA by using the reverse transcription and polymerase chain reaction (PCR) system. The synthesized double stranded cDNA was cloned into the plasmid pUC9 and transformed into Escherichia coli JM110. The movement protein gene of TMV-KP of the selected clones was subjected to sequence analysis by Sanger's dideoxy chain termination method. The complete sequence of viral MP gene from TMV-KP strain was 807 nucleotides long. The nucleotide of MP gene from TMV-KP has thirteen and two nucleotide differences from TMV vulgarae (TMV-OM) and Korean (TMV-K) strains, respectively. Thus, the nucleotide sequence of TMV-KP MP gene showed higher homology of 99% with that of TMV-K MP gene.

• 식물병연구
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• 제23권3호
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• pp.262-267
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• 2017

2015년부터 2016년까지 국내 5개 지역에서 기장 101점, 수수 200점의 시료를 채집하였다. 채집한 시료에 대해 paired-end RNA sequencing, RT-PCR 진단을 수행하였다. 그 결과, 경상도에서 채집한 수수에서 Rice black-streaked dwarf virus (RBSDV)가 검출되었으며, RBSDV, Rice stripe virus (RSV), Barley virus G (BVG), Cereal yellow dwarf virus (CYDV) 4종의 바이러스가 기장에서 검출되었다. 기장에서 검출된 4종의 바이러스 중 RSV와 RBSDV는 경상도에서 채집한 시료에서 높은 감염률을 보였다. 반면, BVG는 5개 지역에서 모두 감염이 확인되었으며, 이미 전국적으로 분포되어 있는 바이러스인 것으로 보인다. 본 연구에서는 국내 기장과 수수에서 RBSDV를 처음으로 동정하였으며, 수수에서 검출된 CYDV는 기존에 보고된 CYDV 분리주와 상동성이 상대적으로 낮은 것으로 보아 Polerovirus 속의 신종 바이러스로 예상된다.

• 식물병연구
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• 제23권1호
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• pp.69-74
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• 2017

2015년, 조 바이러스 발생양상을 구명하기 위하여 전국적인 조사를 실시하였다. 주요재배단지 7개 지역에서 이상 증상과 바이러스 병징을 보이는 식물체 100점을 수집하여, RT-PCR 진단과 RNA sequencing 방법을 이용하여 전체 4종의 바이러스를 동정하였다. 수집한 시료에서는 Barley virus G (BVG)가 10점, Rice stripe virus (RSV)는 4점, Northern cereal mosaic virus (NCMV), Sugarcane yellow leaf virus (ScYLV)가 각각 1점씩 검출되었다. 이들중에서 BVG와 NCMV는 국내 조에서 첫 발생보고이며, ScYLV는 Polerovirus속의 신종으로 예상된다. 본 연구결과는 조 식물체의 무병종자와 저항성 품종개발을 위한 기초연구 자료로 이용 가능할 것으로 생각된다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제38권5호
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• pp.533-540
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• 2022

Thunberg fritillary (Fritillaria thunbergii), a perennial used in traditional Chinese herbal medicine, is a members of the family Liliaceae. The degeneration of germplasm is a severe problem in the production of Fritillaria thunbergii var. chekiangensis. However, no information about viral infections of F. thunbergii var. chekiangensis has been reported. In this study, we sequenced the small RNAs of F. thunbergii var. chekiangensis from leaves and bulbs, and viruses were identified using a phylogenetic analysis and BLAST search for sequence. In addition, multiplex reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to rapidly detect viruses in this variety. Our study first reported that five viruses infected F. thunbergii var. chekiangensis. Among them, fritillary virus Y (FVY), lily mottle virus (LMoV), Thunberg fritillary mosaic virus (TFMV), and hop yellow virus (HYV) had been reported in F. thunbergii, while apple stem grooving virus was first reported in the genus Fritillaria. A multiplex RT-PCR method was developed to rapidly test the four viruses FVY, LMoV, TFMV, and HYV in F. thunbergii var. chekiangensis. Our results provide a better understanding of the infection of F. thunbergii var. chekiangensis by viruses and a basic reference for the better design of suitable control measures.

• The Plant Pathology Journal
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• 제22권1호
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• pp.51-62
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• 2006

Three strains of Cucumber mosaic virus (CMV) have been found to cause a lethal disease, referred to as fern leaf syndromes and mild mosaic symptoms in tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) crops grown in Kuwait. CMV strains were detected and identified based on host range, symptomatology, serology, electron microscopy, and ribonucleic acid (RNA) electrophoresis in polyacrylamide gels. A high degree of viral genomic heterogeneity was detected among CMV strains isolated in Kuwait, with no apparent correlation to symptomatology in tomato host plants. Two different virus satellites of 'CMV associated RNA 5', designated CARNA 5, were detected in two virus strains that caused both lethal disease and mild symptoms, designated CMV-D1 and CMV-S1 respectively. CARNA5 was not detected in the third CMV strain that caused fern leaf syndromes designated CMV-F. All the three isolated strains were serologically indistinguishable from each other and may belong to one serotype according to Ouchterlony gel diffusion tests. These strains transmitted via aphids (Myzus persicae Sulz) in a non-persistent manner. Physical properties of the virus strains were very similar where thermal inactivation test showed that virus withstood heating for 10 min at $70^{/circ}$, dilution end point was $10^{-4}$, and the longevity in vitro at room temperature was less than 5 days for all virus strains. CMV-D1 and CMV-F were the most devastating diseases spreading in both greenhouse and field-grown tomato where aborted flower buds failed on fruit setting due to the viral infection. This is the first report to isolate three different strains of CMV in Kuwait.

• 농업과학연구
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• 제42권2호
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• pp.105-109
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• 2015

Andean potato latent virus (APLV)는 Group IV (+) sense ssRNA viruses, Tymovirus속으로 분류되는 식물 병원성 바이러스로, 주로 감자에 감염되며 국내 관리급 검역바이러스로 지정되어 있다. 본 연구에서는 검역현장에서 APLV를 신속 정확하게 진단할 수 있는 2개의 RT-PCR 프라이머 조합[조합 2 (404 bp)와 23 (501 bp)]과 각각의 nested PCR 조합($404{\rightarrow}259bp$ 및 $501{\rightarrow}349bp$)을 선발하였다. 또한, 진단에 양성대조군으로 활용할 수 있는 유전자변형 양성대조구를 개발하여 실험실 오염에 대한 검증이 가능하도록 하였다. 본 연구에서 개발한 PCR 기반 진단시스템은 향후 검역 현장에서 APLV를 검출하여 우리나라 식물검역에 기여할 것이라고 기대된다.

• 식물병연구
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• 제12권1호
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• pp.25-27
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• 2006

벼오갈병바이러스(Rice dwarf virus, RDV)는 Phytoreovius 속에 속하며 게놈은 double stranded RNA의 12분절로 이루어져 있는데 전기영동상에서 크기가 큰 것부터 S1에서 S12로 명명한다. 본 실험에서는 RDV 입자 및 P12 단백질의 세포질 내에서의 소재양식을 확인하였다. 바이러스 입자 및 P12 단백질 특이적 항혈청에 protein A-gold 입자를 immunolabelling하여 전자현미경에서 gold입자의 존재양상을 관찰하였다. 바이러스 입자 특이적 항혈청을 사용한 경우에는 gold 입자가 세포질내의 바이러스 입자에 특이적으로 반응한 것이 관찰되었다. P12단백질 특이적 항혈청의 경우 gold 입자가 세포질내의 세포소기관에 특이적으로 존재하지 않고 세포질전체에 산재하여 존재하였다. 이 결과로서 RDV S12가 코드하는 단백질 P12가 세포질내에 존재함을 확인하였다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제27권1호
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• pp.44-52
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• 2011

Field surveys were conducted in 45 stone fruit orchards in seven districts of Isparta Province located in western Mediterranean region of Turkey important for stone fruit production. Leaf samples were collected from 175 trees showing virus-like symptoms. These samples were first tested by ELISA for five different RNA viruses including Apple mosaic ilarvirus (ApMV), Prunus necrotic ringspot ilarvirus (PNRSV), Prune dwarf ilarvirus (PDV), Plum pox potyvirus (PPV), Apple chlorotic leafspot trichovirus (ACLSV). While no ApMV and PPV infection was found, 46, 24 and 16 samples were tested positive for PDV, ACLSV and PNRSV, respectively, in ELISA showing about 45% of symptomatic trees in the region were infected with at least one of these viruses. In addition, it was found that nine sweet cherry trees were mixed infected with two or three of these viruses and PDV with an infection rate of 26.3% was the most widespread virus in symptomatic trees in western Mediterranean region. Thirty samples were selected and tested by a multiplex RT-PCR (mRT-PCR) for simultaneous detection of these viruses. While PPV was not detected, more than half of the tested 20 samples were individually or mixed infected with ApMV, ACLSV, PNRSV and PDV. The mRT-PCR results were confirmed by detection of these viruses individually in some of the field samples using RT-PCR with primes specific to each virus. Comparison of ELSA and mRT-PCR results of 30 samples showed that numbers of infected and mixed infected samples as well as infection and mixed infection rates were significantly higher in RT-PCR (20 and 66.7%) than in ELISA (14 and 46.7%). The results confirm that mRT-PCR is more sensitive than ELISA.