Development of PCR-base Diagnostic System for the Detection of Andean potato latent virus

Andean potato latent virus (APLV) is a phytopathogenic virus that belongs to the Group IV (+) sense ssRNA viruses of the genus Tymovirus. It mainly infects potatoes and is specified as a controlled quarantine virus in Korea. In this study, two primer sets of RT-PCR and nested PCR [set 2 ($404{\rightarrow}259bp$) and set 23 ($501{\rightarrow}349bp$)], were selected, which can rapidly and accurately diagnose APLV in quarantine sites. In addition, a modified-positive control plasmid is development, can possible verification of laboratory contamination in diagnosis of APLV detection. The PCR-base system developed in this study is expected to diagnose APLV and contribute to the plant quarantine in Korea.

Andean potato latent virus 검출을 위한 PCR 기반 진단시스템 개발

Andean potato latent virus (APLV)는 Group IV (+) sense ssRNA viruses, Tymovirus속으로 분류되는 식물 병원성 바이러스로, 주로 감자에 감염되며 국내 관리급 검역바이러스로 지정되어 있다. 본 연구에서는 검역현장에서 APLV를 신속 정확하게 진단할 수 있는 2개의 RT-PCR 프라이머 조합[조합 2 (404 bp)와 23 (501 bp)]과 각각의 nested PCR 조합($404{\rightarrow}259bp$ 및 $501{\rightarrow}349bp$)을 선발하였다. 또한, 진단에 양성대조군으로 활용할 수 있는 유전자변형 양성대조구를 개발하여 실험실 오염에 대한 검증이 가능하도록 하였다. 본 연구에서 개발한 PCR 기반 진단시스템은 향후 검역 현장에서 APLV를 검출하여 우리나라 식물검역에 기여할 것이라고 기대된다.