• 제목/요약/키워드: phosphoglucomutase

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Cloning of phosphoglucomutase gene (pgm) in Streptococcus parauberis

  • Woo, Sung-Ho;Han, Hyun-Ja;Kim, Do-Hyung;Park, Soo-Il
    • 한국어병학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.239-244
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    • 2010
  • Here, we have cloned and sequenced Streptococcus parauberis pgm gene, encoding the enzyme phosphoglucomutase (PGM), which is known to be in association with virulence in other streptococcal species. The PGM of S. parauberis is the most closely related to that of S. iniae based on their amino acid sequences.

Methylovorus sp. strain SS1 DSM 11726의 메탄올 대사와 세포외 다당류 생합성 (Metanol Metabolism and Extracellular Polysaccharide Biosynthesis in Methylovorus sp. strain SS1 DSM 11726)

  • 김재성;김시욱;김영민
    • 미생물학회지
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    • 제34권4호
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    • pp.207-211
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    • 1998
  • 메탄올을 이용하여 성장하는 Methylovorus sp. strain SS1은 formaldehyde의 산화를 위한 linear route의 주효소인 $NAD^+$-linked formaldehyde dehydrogenase 및 $NAD^+$-linked formate dehydrogenas와 cyclic route의 주효소인 hexulose-6-phosphate synthase, glucose-6-phosphate isomerae, glucose-6-phosphate dehydrogenase, 6-phosphogluconate dehydrogenase 등의 활성을 나타내었는데, cyclic route에 관여하는 효소의 활성이 상대적으로 더 높았다. 이 세균은 formaldehyde의 동화와 관련된 ribulose monophosphate 경로의 주효소와 Entner-Doudoroff 경로의 주효소 및 transaldolase 활성과 함께 세포외 다당류 합성과 관련된 phosphoglucomutase, UDP-glucose pyrophyosphorylase, mannose-6-phosphate isomerase의 활성도 나타내었다. 2.3 mM의 ammonium sulfate가 포함된 배지에서 성장한 세균은 7.6 mM의 ammonium sulfate가 포함된 배지에서 성장한 세균보다 더 많은 세포외 다당류를 생산하였지만 균체 수율은 낮았고, 6-phosphogluconate dehydrogenase와 phosphoglucomutase 및 UDP-glucose pyrophoshorylase의 활성은 높게 나타내었으나 6-phosphogluconate dehydratase/2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase의 활성은 낮았다.

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국내 세 지역의 배추좀나방(Plutella xylostella (Linne)) 월동집단에서 나타나는 유전변이 분석 (Genetic Analysis of Three Overwintering Diamondback Moth, Plutella xylostella (Linne), Populations in Korea)

  • 김용균;박효찬;정명섭
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.227-233
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    • 2001
  • 네 가지 다형 동위효소를 이용하여 야외 월동세대의 배추좀나방(Plutella xylostella(Linne))의 집단 유전분석이 실시되었다. 세 지역 (안동, 영천, 양산)의 야외집단들은 모든 동위효소 유전좌위에서 서로 다른 대립유전자빈도를 보였다. 특히 두 동위효소(acid phosphatase and phosphoglucomutase)에서 나타나는 유전자 빈도의 불균형은 집단간에 임의교배가 이루어져 있지 않음을 나타냈다. 추정된 집단간 Nei의 유전거리는 0.0151(양산집단과 영천집단)에서 0.0877(안동집단과 영천집단)까지 다양했다. 기존의 배추좀나방 야외집단들의 유전거리 추정치에 비해 이러한 월동 초기세대들이 보인 다소 높은 유전분화는 이들 집단이 월동과정중 지역적 환경요인에 따른 상이한 도태압이 작용하여 유전적 병목현상이 초래되었음을 내포한다.

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Lipopolysaccharide 생합성에 관여하는 Vibrio anguillarum의 phosphomannomutase/phosphoglucomutase 유전자 cloning과 특성 (Cloning and Characterization of Phosphomannomutase/Phosphoglucomutase (pmm/pgm) Gene of Vibrio anguillarum Related to Synthesis of LPS)

  • 오륜경;문수영;조화진;장원제;김장호;이종민;공인수
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.355-362
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    • 2016
  • 수해양성 병원성 미생물로 알려진 Vibrio anguillarum으로부터 mannose-1-phosphate를 mannose-6-phosphate, glucose-1-phosphate를 glucose-6-phosphate로 가역적으로 변환시키는 phosphomannomutase/phosphoglucomutase (pmm/pgm)의 유전자를 sequencing하여 1338 bp의 open reading frame (ORF)을 밝혔다. 이는 446개의 아미노산을 포함하며 47,625 Da을 가지고 있다. 보고된 다른 Vibrio sp.의 pmm/pgm 유전자와 상동성을 비교하였을 때 V. mimicus V. vulnificus, V. splendidus, V. harveyi와 92.3%, 91.4%, 89.9%, 89.9%에 해당하는 상동성을 지니고 있었다. 증폭된 목적 유전자를 pET-28a(+) vector에 연결하여 대장균에서 단백질의 대량발현을 유도하였으며 이는 주로 soluble한 상태로 나왔다. Soluble fraction을 Ni-NTA column chromatography로 정제하여 약 50 kDa의 단백질을 얻었고 이는 주로 mannose-1-phosphate를 이용하는 효소로 확인되었으며 Mg2+ 이온이 존재할 때 효소의 활성이 나타나는 것을 확인할 수 있었다. 본 연구의 유전자는 낮은 온도의 stress하에서 발현이 증가됨을 Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR)을 통해 확인하였고, 상동성 재조합 (homologous recombination)에 의한 돌연변이 균주 제작을 통해 PMM/PGM protein과 lipopolysaccharide (LPS)의 생합성과의 관계를 규명하였다. V. anguillarum wild type과 mutant로부터 LPS를 분리하였고 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE)후 silver staining을 통해 LPS의 high molecular weight (HMW) 부분인 O-antigen에서의 변화를 확인하였다. 또한 V. anguillarum wild type과 mutant의 growth와 viability를 확인한 결과 mutant가 wild type보다 정지기까지 더 낮은 생육을 보였으며 viability가 감소함을 확인하였다. 본 연구를 통하여 V. anguillarum의 pmm/pgm 유전자가 미생물의 생육과 LPS 생합성에 관여하고 있음을 알 수 있었다.

동위효소 분석에 의한 느타리속의 종간 유연관계 (Interspecific Relationships within the Fungal Genus Pleurotus by Isozyme Analysis)

  • 이희경;유영복;차동열;민경희
    • 한국균학회지
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    • 제26권2호통권85호
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    • pp.163-172
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    • 1998
  • 국내외에서 수집된 Pleurotus속 13종 32균주와 종(species)이 밝혀지지 않은 4균주 등 모두 36균주의 동위효소 분석에 의한 종간 유연관계를 파악하기 위하여 본 실험을 수행하였다. Pleurotus속 균주들의 균사체에서 수용성 단백질을 추출하여 등전점 전기영동 isozyme polymorphic banding pattern법으로 여섯 종류의 동위효소 즉 esterase, glucosephosphate isomerase, leucine aminopeptidase, malate dehdrogenase, peroxidase, phosphoglucomutase를 분석하여 총 166개 밴드를 확인하였고 36개 느타리 균주의 종간 다형성을 관찰하였다. Esterase가 종간에 가장 다양한 밴드 pattern을 나타내어 종의 구별에 아주 유용한 동위효소라 생각되며, 다른 동위효소에서도 종간 다형성을 관찰할 수 있었다. 동위효소 분석 결과 유연관계가 가장 가까운 종은 P. florida와 P. sajor-caju로 유사도가 약 89%였으며, 연구에 이용된 총 13종간의 유사도는 약 77%였다. 분류상 논란이 많이 되는 P. ostreatus는 P. pulmonarius 종과 확실히 구별되었으며 P. florida도 독립된 종으로 판명되었다. 그러나 P. sapidus와 P. spodoleucus 균주들은 확실한 종의 판명이 어려웠다. Isozyme polymorphic banding pattern 결과와 현미경적인 형태 분류에 의한 종 판명 결과가 몇 종을 제의하고는 일치하였다. 동위효소를 이용한 분류는 매우 유용하다고 판단되었다.

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내열성 효소를 이용한 전분으로부터 6-인산과당의 제조 (Production of Fructose 6-Phoschate from Starch Using Thermostable Enzymes)

  • 권규혁;차월석;김복희;신현재
    • KSBB Journal
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    • 제22권5호
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    • pp.345-350
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    • 2007
  • 인산당은 모든 유기체에서 발견되며 무척 다양한 유용성을 지니고 있다. 특히 glucose 1-phosphate (G1P), glucose 6-phosphate (G6P), fructose 6-phosphate (F6P) 등은 해당과 정, 당합성과정, 5탄당 인산화과정 및 캘빈회로와 같은 탄수화물 대사와 에너지 생산 대사의 주요한 핵심 중간물질이다. 특히 해당과정에서 F6P는 G6P의 이성질화반응에 의하여 생성된다. F6P의 대량생산은 전분을 이용하는 것이 가능한데, 우선 전분에 인산화효소를 가하여 G1P를 얻고, 이 G1P를 자리옮김효소 (phosphoglucomutase, GM)와 이성질화효소 (phosphoglucoisomerase, GI)를 순차적으로 적용하여 G6P와 F6P를 생산하게 된다. 효소반응의 경우 전분의 용해도 증가, 반응속도의 향상 및 미생물의 오염방지 등을 위하여 중온성 효소보다는 고온성 효소 혹은 내열성 효소가 선호된다. 본 연구는 세 가지 내열성 효소를 이용하여 전분으로부터 두 단계반응으로 F6P를 생산하는 것에 관한 것이다. 실험에 사용된 효소는 대장균에서 발현된 재조합 효소로서, 효소의 생산은 유가식 배양을 이용하였다. 1.2% 가용성 전분 200 L를 이용하여 1,253 g의 순수한 G1P를 생산하였으며 이를 이용하여 최종적으로 30% 수율로 F6P를 생산할 수 있었다. 최대수율을 얻기 위하여 반응표면분석법을 이용하여 GM : GI = 1 : 1.23, 63.5$^{\circ}C$, pH 6.85의 조건이 도출되었으며, 이 조건하에서 실험을 통하여 20 g/L의 전분을 이용하여 30% 수율로 F6P가 생성됨을 확인할 수 있었다.

Dunaliella tertiolecta의 포도당산화와 산화효소계 (II) Cell-free Extracts를 사용한 Glycolytic 및 Pentose Phosphate Pathway의 존재확인 (Glucose Oxidation and It's Oxidative Enzyme Systems in Dunaliella tertiolecta. (II) Evidence for Glycolytic and Pentose Phosphate Pathways in Cell-free Extracts)

  • 권영명
    • Journal of Plant Biology
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    • 제12권2호
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    • pp.15-22
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    • 1969
  • By spectrophotometric assay method, the following enzymes could be detected in Dunaliella tertiolecta and Chlorella pyrenoidosa cell-free extracts: Hexokinase; Glucose-6-phosphate, 6-Phosphogluconate and Triosephosphate dehydrogenase; Transketolase; Phosphogluco and Ribosephosphate isomerase; Phosphoglucomutase; Phosphofructokinase; Fructosediphosphate aldorase and Ribulosephosphate 3-epimerase. Such enzymes are in accordance with the proposed pathway of glucose catabolism by D. tertiolecta as well as C. pyrenoidosa. Also, it could be estimated, under the presence of NADP, that pentose phosphate pathway were more active than glycolytic pathway in D. tertiolecta cell-free systems.

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한국인의 성분비액에서의 Phosphoglucomutase-1(PGM$_1$)아형에 관한 연구 (Studies on the Phosphoglucomutase-1 (PGM$_1$) Subtypes in Sex Secretions in Korean)

  • 최상규;김문규
    • 한국동물학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.133-141
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    • 1988
  • 본 연구는 polyacryiamide gel등을 전기영동을 응용, 보존시간에 따른 정액반, 질액반 등에서 PGM$_1$아형의 검출 및 효소활성의 안전성을 조사하여 다음과 같은 결론을 얻었다. (1). 정액반의경우, 실온에서 보존후 7일에는 85%,14일에는 15%의 PGM$_1$아형의 판정이 가능하였고, 21일에는 전혀 판정이 불가능 하였다. (2). 질액반의 경우, 실온에서 보존 후 7일에는 675의 PGM$_1$아형의 판정이 가능하였으나, 14일에는 전혀 불가능 하였다. 한편, 질액에 정액이 혼합된 경우, 질액의 PGM$_1$아형을 판정함으로서, 정액의 PGM$_1$아형의 추정이 가능하였다. 이 결과를 통하여 실제 법생물학 분야에 활용이 가능하다고 인정하였다.

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Agrobacterium sp. ATCC31750에 대한 beta-l,3-glucan 합성 대사경로의 주요 단백질 검출 (Identification of Key beta-1,3-glucan Synthesis Enzymes in Agrobacterium sp. ATCC31750)

  • 김려화;이중헌
    • KSBB Journal
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    • 제19권5호
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    • pp.406-409
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    • 2004
  • Matrix Assisted Laser Desorption ionization Time of Flight (MALDI-TOF) was used for enzymes identification related to B -1,3-glucan synthesis. Agrobacterium sp. ATCC31750 was cultivated with two stage Continuous Stirrer Tank Reactor (CSTR) and the cells were harvested and their protein profiles were analysed by two dimensional electrophoresis. The specific enzyme spot was treated with trypsin and ana lysed by MALDI-TOF to get peptide molecular weight. The peptide molecular weights were matched with Agrobacterium tumefacience's Data Base from the matrix science site, then could identify the avaliable key enzymes. In this study, we identified key metabolite of synthesis of beta-1,3-glucan, such as glucose-6-phosphate isomerase, phosphoglucomutase, B-1,3-glucan synthase and glucokinase, and we also identified uracil phosphoribocyl transferase and Ribosome recycling factor also.

Study on Productivity and Genotype Structure by Several Enzyme Loci of Silkworm(Bombyx mori L.) Parthenoclones Obtained by Thermal and Combined(Low-High Temperature) Method

  • Vasileva, Jolanda Bogdanova;Staykova, Teodora Atanasova;Tzenov, Panomir Ivanov
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제18권2호
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    • pp.131-134
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    • 2009
  • The purpose of this study was to establish whether there are differences in the productivity of the same silkworm(Bombyx mori L.) parthenoclones, obtained by two different methods-thermal and combined, as well as to study their genotype structure by several enzyme loci. It was established that all individuals of parthenoclones Joana, Joana(${\downarrow}{\uparrow}$), Pohi and Pohi(${\downarrow}{\uparrow}$), are homozygous by the studied esterase and phosphoglucomutase loci, which substantiated the clones' genetic stability. By comparative analysis of some biological and technological properties, it was found that parthenoclone Pohi(${\downarrow}{\uparrow}$) obtained by low-high temperature activation is characterized by higher values of these properties as compared to parthenoclone Pohi obtained by thermal parthenogenesis. Comparing the two methods of inducing ameiotic parthenogenetic development, we would recommend that parthenoclone Joana is sustained by thermal parthenogenesis, and parthenoclone Pohi-by the combined method (low-high temperature).