Cho, Eunae Sandra;Cha, Yong Hoon;Kim, Hyun Sil;Kim, Nam Hee;Yook, Jong In
Biomolecules & Therapeutics
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제26권1호
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pp.29-38
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2018
During cancer progression, cancer cells are repeatedly exposed to metabolic stress conditions in a resource-limited environment which they must escape. Increasing evidence indicates the importance of nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) homeostasis in the survival of cancer cells under metabolic stress conditions, such as metabolic resource limitation and therapeutic intervention. NADPH is essential for scavenging of reactive oxygen species (ROS) mainly derived from oxidative phosphorylation required for ATP generation. Thus, metabolic reprogramming of NADPH homeostasis is an important step in cancer progression as well as in combinational therapeutic approaches. In mammalian, the pentose phosphate pathway (PPP) and one-carbon metabolism are major sources of NADPH production. In this review, we focus on the importance of glucose flux control towards PPP regulated by oncogenic pathways and the potential therein for metabolic targeting as a cancer therapy. We also summarize the role of Snail (Snai1), an important regulator of the epithelial mesenchymal transition (EMT), in controlling glucose flux towards PPP and thus potentiating cancer cell survival under oxidative and metabolic stress.
Daily changes in phytoplankton abundance and species composition were monitored from July to September 2003 (n=47) to understand which factors control the abundance at a station in Jangmok Bay. During the study, the phytoplankton community was mainly composed of small cell diatoms and dinoflagellates, and the dominant genera were Chaetoceros, Nitzschia, Skeletonema and Thalassionema. Phytoplankton abundance varied significantly from $6.40{\times}10^4$ to $1.22{\times}10^7$ cells/l. The initially high level of phytoplankton abundance was dominated by diatoms, but replacement by dinoflagellates started when the NIP ratio decreased to <5.0. On the basis of the N/P and Si/N ratios, the sampling periofd could be divided into two: an inorganic silicate limitation period (ISLP, $14^{th}$$July-12^{th}$ of August) and an inorganic nitrogen limitation period (INLP, $13^{th}$ of August - the end of the study). Phosphate might not limit the growth of phytoplankton assemblages in the bay during the study period. This study suggests that phytoplankton abundance and species composition might be affected by the concentrations of inorganic nutrients (N and Si), and provides baseline information for further studies on plankton dynamics in Jangmok Bay.
Phosphatase activity was measured with other environmental factors in Cheonho reservoir in 1994. It ranged form 95 to 1,685 nM/1/h and was correlated significantly with chlorophyll-a. Such a close relation well matched the fact that over 90% of phosphatase activity was detected in > 3 $\mu\textrm{m}$ fraction. The phosphatase activity also correlated negatively with dissolved inorganic phosphate concentration, which implies derepression of phosphatase production by phosphate limitation. Significant correlation was analyzed between phosphatase activity and BOD, which also appeared to be closely correlated with chlorophyll-a. A great percentage of organic materials seems to be generated autochthonously by algae and extracellular enzyme even though allochthonous influence was thought to be stronger in Cheonho reservoir.
A Pseudomonas putida strain able to accumulate high amount of polyesters of medium-chain-length 3-hydroxyalkanoic acids ($PHA_{MCL)$) was isolated from soil in a landfill site using an enrichment technique. Culture condition of the isolated strain for polyester production in a one-step culture was optimized in a mineral-salts medium against pH and concentrations of ammonium sulfate, carbon source(e.g., octanoate), and phosphate. The optimal values for maximal cell growth and PHA accumulation were: pH; 7$\sim$8, $(NH_4)_2SO_4$; 8 mM, octanoate; 40 mM. The optimum temperature was in the range of $20\sim30^{\circ}C$, which was rather broader than in other bacteria. Cell growth was strongly inhibited by the phosphate limitation to less than 1 mM. An increase of phosphate concentration above 1 mM showed little effect on cell growth and polyester accumulation. When the strain was grown on octanoate under this optimized condition it produced 3.4 g dry biomass per liter and yielded 1.7 g PHA per liter amounting to 53 wt% of dry cells. The monomer units composing the polyester synthesized from octanoate were 3-hydroxyoctanoate (3HO), 3-hydroxycaproate (3HC), and 3-hydroxybutyrate (3HB) (85:13:2, mole ratio). Other low linear $C_3\simC_{10}$ monocarboxylic acids were also tested for polyester production.
Limitation of photosynthesis in detached Chinese cabbage (Brassica campestris L.) leaves was induced by feeding of mannose (25 mM) for 12 h in the light, and changes in the basic thylakoid functions under this condition were investigated. The acid soluble phosphate contend and CO2 uptake rate was decreased by 66% and 67%, respectively. However, the starch content was increased by 24% compared to those of controls. From the fast induction curves of chlorophyll fluorescence, dark level fluorescence (Fo) slightly increased while intermediate plateau fluorescence level (FI) to peak level fluorescence (Fp) transient was significantly decreased with a slight decrease in the Fo-to-FI transient. This data means that reduction of secondary electron acceptor of PSII (QB) might be more severely inhibited than that of primary electron acceptor of PSII (QA) by decrease in phosphate level. The strong decline of (Fv)m//Fm ratio suggests that efficiency of excitation energy capture by PSII was decreased markedly. The quenching of Fo (qO), an indicator of state transition, was also occurred over the slow induction kinetics of chlorophyll fluorescence. From quenching analysis, fluorescence was dominantly quenched by nonphotochemical quenchings (qE+qT). These results showed that the capture and transfer efficiency of excitation energy to PSII reaction center in thylakoid was decreased with the decline of leaf phosphate level, and that the state transition was occurred during the induction of photosynthesis under these conditions.
담수호인 영산호의 식물플랑크톤에 대한 광 제한과 영양염 제한의 영향을 파악하기 위해 2003년 3월부터 2004년 4월까지 (11월~12월제외) 월별조사를 실시하였다. 플랑크톤의 크기를 대형 (net-size)과 소형 (nano-size)으로 구분하여 콜로로필, pheopigment ratio를 측정하였고 물리화학적 환경특성을 측정하였다. 또한 광 제한 지수와 영양염 제한 지수를 산정하기 위해 기존 문헌의 수식을 이용하였다. 식물플랑크톤은 대형과 소형 모두 풍수기 특히 8월에는 낮은 현존량을 보였고 나머지 계절에 간헐적으로 현존량이 증가하는 형태를 보였다. 일조시간은 풍수기에 짧았고 갈수기에 증가하였고, 영양염 특히 인산염과 암모니아는 2004년 봄철에 상당 폭 증가하였다. 광 제한 8월에 최소값(0.01)을 기록하였고, 영양염 제한 지수는 5월과 9월을 제외하고 다소 높은 지수(>0.4)를 나타냈다. 영산호는 인곤 호소들보다 영양염 농도가 높은 점을 고려했을 때, 영양염 제한보다는 광 제한이 식물플랑크톤의 성장에 더 영향을 미칠 것으로 사료된다. 공간적으로는 광 제한 지수는 하류로 갈수록 증가하였지만 영양염 제한 지수는 큰 변동을 보이지 않았다. 상관성 분석에서 net-pheopigment index는 광 제한 지수 및 영양염 제한 지수와 음의 상관관계, nano-pheopigments index는 제한 지수들과 양의 상관관계를 보여 환경악화로 인한 영향이 식물플랑크톤의 크기별로 상이하게 나타날 수 있는 가능성을 보여준다.
Production of biodiesel from microalgae is dependent on the microalgal lipid content and free fatty acid composition. Both lipid and free fatty acid are regulated by nutrient sources. In this study, newly developed mutant Chlamydomonas reinhardtii with higher lipid content was investigated for the effect of nutrient limitation. Nitrogen $NO_3{^{-}}$ and phosphate $PO_4{^{3-}}$ were limited for nutrient starvation during the cultivation. Under nutrient starvation, total lipid content level was increased to 27~33% and C16:0 fatty acid content constituted over 31~43% of total fatty acid. Interestingly, we also found that the expression of fatty acid desaturase (FAD7) was decreased when nutrients were starved.
To evaluate the limitation for epiphytic and planktonic algal growth, acid extractable inorganic phosphorus (AP), implying the luxury uptake phosphorus, was measured in five reed zones of Lake Biwa. The AP in epiphytic substances was 0.7 to 1.4 mg P surface stem $m^{-2}$ in summer and 1.2 to 2.8 mg P $m^{-2}$ in winter. On the other hand, the amount in planktonic substances was 1.4 to 5.7 mg P m -3 and 0.8 to 5.4 mg P $m^{-3}$ in both seasons. Contribution of AP in the epiphytic and planktonic phosphorus was 23 to 31% and 8 to 27% in summer, and 17 to 22% and 9 to 17% in winter. It suggests that in summer both epiphytic and planktonic algae had been luxuriously taken up phosphate into cells. The weight ratios of C : N : P were averaged 79 : 20 : 1 for the epiphytic substances and 81 : 12 : 1 for the particulate substances. On the other hand, the ratios without the luxurious phosphorus were 93 : 24 : 1 and 103 : 15 : 1, showing much higher values than the Redfield ratio. High ratio in the epiphytic substances indicates that the phosphorus is the limiting parameter, rather than nitrogen, regulating the growth of epiphytic algal populations.
AfsR2 과발현 S. lividans TK21을 이용하여 DNA microarray를 수행하였다. 그 결과, phosphate starvation과 관련 있는 42개의 유전자들이 up-regulated 되었으며, 특히 SCO4139 (pstB, phosphate ABC transport system ATP-binding protein)와 SCO4142 (pstS, phosphate-binding protein precursor)는 afsR2가 phosphate와 같은 nutrient starvation에 적극적으로 관여한다는 것을 나타내며, SCO4228 (putative phosphate transport system regulatory protein)은 기존에 수행되었던 2D-electrophoresis 연구나 afsS null S. coelicolor를 이용한 DNA microarray 연구에서도 공통적으로 보고되었던 유전자로서 phosphate lilitation에 대한 afsR2의 효과가 지속적으로 검증되고 있음을 뜻한다. 또한 afsR2 과발현을 통해서 sigma factor인 SCO2954 (sigL)과 SCO5147 (sigE)의 발현이 유도되었으며 두 유전자의 구조적인 특징을 고려해 보았을 때 afsR2가 RNA polymerase와의 linker로서의 역할을 추측해 볼 수 있다. 뿐만 아니라 whi 관련 유전자들의 발현 또한 afsR2에 의해 증가되었다. 이는 afsR2가 단순히 2차 대사물질 생합성 조절에만 관여하는 것이 아니라 형태적 분화에 작용함으로써 최종적으로 여러 2차 대사물질의 합성을 유도한다고 말할 수 있다. 이러한 결과들을 토대로 afsR2가 기존에 항생제 생합성에만 관여하는 global regulatory 조절인자가 아닌 방선균이 stationary phase로 전환되는 시점에서 형태적 분화에 영향을 미치고 phosphate limitation stress를 줄여주는 2차 대사의 key-factor regulatory 유전자임을 알 수 있다.
The effects of environmental factors on the extracellular release of organic carbon by Scenedesmus qudricauda were studied. The PER (percentage extracellular release) was greater at high temperature and at high concentration of nitrogen and phosphate. The PER variation according to the change of M/P ratio showed high values at each extreme N/P ratio. This result suggested that the limitation of nitrogen or phosphorous resulted in the accumulation of carbohydrates as photosynthetic products, and the products in high concentration were excreted through algal cell membrane.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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