• Journal of Microbiology
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• 제43권2호
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• pp.152-157
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• 2005

Strain Kw07$^T$, a Gram-negative, non-spore-forming, rod-shaped bacterium, was isolated from granules in an Up-flow Anaerobic Sludge Blanket (UASB) bioreactor used in the treatment of brewery waste­water. 16S rRNA gene sequence analysis revealed that strain Kw07T belongs to the a-4 subclass of the Proteobacteria, and the highest degree of sequence similarity was determined to be to Sphingopyxis macrogoltabida IFO 15033T (97.8%). Chemotaxonomic data revealed that strain Kw07T possesses a quinone system with the predominant compound Q-I0, the predominant fatty acid C,s:, OJ7c, and sphingolipids, aU of which corroborated our assignment ofthe strain to the Sphingopyxis genus. The results of DNA-DNA hybridization and physiological and biochemical tests clearly demonstrated that strain Kw07T represents a distinct species. Based on these data, Kw07T (= KCTC 12209T = NBRC 100800T) should be classified as the type strain for a novel Sphingopyxis species, for which the name Sphingopyxis granuli sp. novo has been proposed.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권11호
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• pp.1524-1528
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• 2010

The antioxidant properties of 46 lichen species, collected from the highly UV-exposed alpine areas of southwestern China, were evaluated for their potential therapeutic utilization. The anti-linoleic acid peroxidation activity, 1,1-diphenyl-2-picryl-hydrazyl (DPPH) scavenging activity, reducing power, and total phenolic contents were all assessed in vitro in the methanol extract of the lichens. A potent reducing power was detected in a number of the lichen extracts, when compared with butylated hydroxyanisole (BHA). In general, it was found that many of the lichens, with antioxidant properties, contained large quantities of phenolic content. Extracts of Peltigera praetextata and Sticta nylanderiana were found to exhibit the most potent activity in all of the antioxidant tests. In particular, extracts of S. nylanderiana displayed a 1.37 times greater anti-linoleic acid peroxidation activity, when compared with the ascorbic acid used as the positive control. S. nylanderiana also possessed the strongest free radical scavenging activity amongst all the tested species, with an inhibition rate of 90.4% at concentration of $330{\mu}g/ml$. Activity-guided bioautographic TLC and HPLC analyses were used to establish which compounds were responsible for the potent antioxidant activities of the S. nylanderiana extract. These analyses revealed lecanoric acid to be primarily responsible for the effective antioxidant properties of S. nylanderiana. Overall, these results have indicated that several highland lichens have the potential of being utilized as novel bioresources for naturally occurring antioxidant therapies.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제29권1호
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• pp.79-90
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• 2019

Lichens are generally known as self-sufficient, symbiotic life-forms between fungi and algae/cyanobacteria, and they also provide shelter for a wide range of beneficial bacteria. Currently, bacterial-derived biodegradable polyhydroxyalkanoate (PHA) is grabbing the attention of many researchers as a promising alternative to non-degradable plastics. This study was conducted to develop a new method of PHA production using unexplored lichen-associated bacteria, which can simultaneously degrade two ubiquitous industrial toxins, anthracene and naphthalene. Here, 49 lichen-associated bacteria were isolated and tested for PHA synthesis. During the GC-MS analysis, a potential strain of EL19 was found to be a 3-hydroxyhexanoate (3-HHx) accumulator and identified as Pseudomonas sp. based on the 16S rRNA sequencing. GC analysis revealed that EL19 was capable of accumulating 30.62% and 19.63% of 3-HHx from naphthalene and anthracene, respectively, resulting in significant degradation of 98% and 96% of naphthalene and anthracene, respectively, within seven days. Moreover, the highly expressed phaC gene verified the genetic basis of $PHA_{mcl}$ production under nitrogen starvation conditions. Thus, this study strongly supports the hypothesis that lichen-associated bacteria can detoxify naphthalene and anthracene, store energy for extreme conditions, and probably help the associated lichen to live in extreme conditions. So far, this is the first investigation of lichen-associated bacteria that might utilize harmful toxins as feasible supplements and convert anthracene and naphthalene into eco-friendly 3-HHx. Implementation of the developed method would reduce the production cost of $PHA_{mcl}$ while removing harmful waste products from the environment.

• 식물병연구
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• 제28권3호
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• pp.152-161
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• 2022

Several types of chemical bactericides have been used to control fire blight. However, their excessive usage leads to environmental deterioration. Therefore, several researchers have analyzed antagonistic microorganisms as promising, effective, and safe biological control agents (BCAs). The primary aim of this study was to screen for potential antagonistic bacteria that suppress Erwinia amylovora. Among the 45 isolates studied, 5 strains showed the largest inhibition zone against E. amylovora. 16S rRNA gene sequencing identified them as Bacillus amyloliquefaciens (KPB 15), B. stratosphericus (KPB 21), B. altitudinis (KPB 25), B. safensis (KPB 31), and B. subtilis (KPB 39). KPB 25 and 31 reduced the lesion size of fire blight by 50% in immature apple fruits, and did not show antagonism against each other. Therefore, KPB 25 and 31 were selected to develop an antagonistic mixture against fire blight. Although the mixture with KPB 25 and 31 showed a slightly increased ability to reduce lesion size on immature fruits, they did not exhibit a synergistic effect in reducing E. amylovora population compared to each strain alone. Nevertheless, we have identified these two strains as useful and novel BCAs against fire blight with additional benefits safety and potential in developing a mixture without loss of their activity, owing to the absence of antagonism against each other.

• Mycobiology
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• 제51권6호
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• pp.388-392
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• 2023

A yeast strain, designated as JAF-11^T, was isolated from flower of Prunus mume Sieb. et Zucc. in Gwangyang, Republic of Korea. Phylogenetic analysis showed that strain JAF-11^T was closely related to Neodothiora populina CPC 39399^T with 2.07 % sequence divergence (12 nucleotide substitutions and three gaps in 581 nucleotides) in the D1/D2 domain of the large subunit (LSU) rRNA gene, and Rhizosphaera macrospora CBS 208.79^T with 4.66 % sequence divergence (25 nucleotide substitutions and five gaps in 535 nucleotides) in the internal transcribed spacer (ITS) region. Further analysis based on the concatenated sequences of the D1/D2 domain of the LSU rRNA gene and the ITS region confirmed that strain JAF-11^T was well-separated from Neodothiora populina CPC 39399^T. In addition to the phylogenetic differences, strain JAF-11^T was distinguished from its closest species, Neodothiora populina CPC 39399^T and Rhizosphaera macrospora CBS 208.79^T belonging to the family Dothioraceae by its phenotypic characteristics, such as assimilation of carbon sources. Hence, the name Neodothiora pruni sp. nov. is proposed with type strain JAF-11^T (KACC 48808^T; MB 850034).

• 생명과학회지
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• 제20권6호
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• pp.922-928
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• 2010

한방 생약재로부터 안전하면서도 신규의 항혈전제를 개발하기 위해, 현재 국내에서 유통되고 있는 국내 및 국외산 한방 생약재 33종을 대상으로 40종의 에탄올 추출물을 조제하고, 이들의 thrombin time (TT), prothrombin time (PT), activated partial thromboplastin time (aPTT)을 평가하였다. 생약재중 중국산은 28종으로 대부분이 국외산이었으며, 부위별로는 종자 및 뿌리 부위가 19종을 차지하였다. 평균 수분함량은 $6.85{\pm}2.26%$, 평균 추출율은 $5.27{\pm}4.25%$를 나타내었다. 조제된 시료의 TT평가 결과, 사인(중국), 고본, 팔각향, 계지, 당삼, 계혈등, 행인, 오배자, 괄루근 및 포황에서 우수한 트롬빈 저해활성을 확인하였으며, 다양한 농도에서 평가 결과 계혈등, 행인, 팔각향, 계지, 오배자 추출물 순으로 트롬빈 저해능이 강력함을 확인하였다. PT 평가 결과 오배자, 계혈등, 행인에서, aPTT 평가결과 오배자 및 계혈등에서 우수한 항혈전능을 확인하였다. 한편 추출물의 인간적혈구 용혈활성을 평가한 결과, 계혈등, 팔각향, 계지, 오배자 추출물은 $500\;{\mu}g/ml$ 농도에서도 용혈활성이 없음을 확인하여 이들 4종을 최종 선정하였다. 본 연구결과는 이미 대량생산이 확립된 한방생약제로부터 우수한 항혈전제 개발이 가능함을 제시하고 있으며, 트롬빈 및 혈장 응고 인자에 대한 특이 저해제 개발이 가능함을 제시하고 있다.

• 생명과학회지
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• 제20권11호
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• pp.1640-1647
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• 2010

혈전성 질환을 예방, 개선할 수 있는 안전한 항혈전제를 개발하기 위해, 일반적으로 항혈전 효과가 있다고 알려진 식용 해조류 35종(갈조류 17종, 홍조류 11종 및 녹조류 7종)을 대상으로 메탄올 추출물을 조제하고, 이들의 thrombin time (TT), prothrombin time (PT), activated partial thromboplastin time (aPTT)을 평가하였다. 트롬빈 저해(TT)의 경우 35종 중에서 감태, 곰피, 대황, 넓패, 패, 알송이모자반 및 야마다모자반에서 강력한 활성을, 프로트롬빈 저해(PT)의 경우 트롬빈 저해활성이 나타난 7종 중 야마다모자반을 제외한 6종에서 강력한 활성을 확인하였으며, 혈액응고인자 저해(aPTT)에서는 감태, 곰피, 대황, 넓패, 패, 알송이모자반 및 톳에서 강력한 활성이 나타났다. 선별된 8종의 시료를 대상으로 다양한 농도에서 항혈전 활성을 평가한 결과 알송이모자반에서 가장 강력한 활성을 확인하였으며, 곰피, 대황 및 넓패가 효과적이었다. 항혈전 활성과 해조류 추출물의 총 flavonoid, 총 polyphenol, 총당 및 환원당 함량과의 상관 관계를 검토한 결과, 활성물질은 flavonoid성 물질로 추측되었으며, 선별된 8종은 총 flavonoid 함량 및 총 polyphenol 함량이 매우 높은 특징을 나타내었다. 본 연구 결과는 경제적이면서 대량공급이 가능한 식용 해조류로부터 신규의 안전한 항혈전제 개발이 가능함을 제시하며, 야마다모자반과 톳은 트롬빈 또는 혈장내 응고 인자에 대한 특이 저해제로 개발 가능함을 제시하고 있다.

• 생명과학회지
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• 제21권4호
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• pp.576-583
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• 2011

유용생리활성의 해조류를 이용한 식품소재 개발 연구의 일환으로, 35종 해조류(갈조류 17종, 홍조류 11종 및 녹조류 7종)의 메탄올 추출물을 대상으로 in-vitro 항산화 및 nitrite 소거활성을 평가하였다. 해조류 추출물($500\;{\mu}g/ml$) 중 감태, 곰피, 대황, 넓패, 패, 모자반, 알송이모자반, 야마자모자반 및 잘피의 9종에서 60% 이상의 DSA 활성을 나타내었으며, ASA활성은 DSA활성과 높은 상관관계를 나타내었다(상관계수 0.855). 환원력 평가 결과에서는 감태, 곰피 및 대황의 3종만이 0.88 ($Abs_{700}$) 이상의 강력한 활성을 나타내었다. 한편 식품에서의 발암인자인 nitrosoamine생성억제와 관련된 NSA평가의 경우, 전체 35종의 해조류 중 19종에서 60% 이상의 NSA를 나타내었으며, 특히 기존에 알려지지 않은 모자반, 야마다모자반, 알송이모자반, 패, 넓패에서 우수한 활성을 확인하였다. 1차 선별된 9종 해조류의 DSA, ASA, NSA의 $IC_{50}$를 조사한 결과, 기존의 항산화능이 알려진 곰피, 대황, 감태 이외에도 야마다모자반 및 넓패에서 강력한 항산화 활성과 nitrite 소거활성을 확인하였다. 본 연구결과는 야마다 모자반 및 넓패를 이용하여 항혈전, 항산화, NSA 활성을 동시에 나타내는 기능성 식품소재로의 개발이 가능함을 제시하고 있다.

• 식물병연구
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• 제24권3호
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• pp.221-232
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• 2018

근권세균은 식물 생육과 건강 증진에 중요한 역할을 하며 생물학적 스트레스뿐만 아니라 저온, 고온, 건조 및 염과 같은 비생물적 스트레스에도 내성을 부여한다. 본 연구는 토마토에 생물적 및 비생물적 스트레스를 완화시키는 기능을 가진 식물생장촉진 근권세균(plant growth promoting rhizobacteria, PGPR)을 선발하는 것을 목표로 하였으며 토마토 근권에서 Variovorax sp. PMC12균주를 분리하였다. PMC12균주는 in vitro에서 PGPR의 특성으로 알려진 암모니아, IAA, 시드로포아 및 ACC 탈아민효소를 생성하였다. PMC12 균주를 처리한 토마토는 대조구에 비해 염, 저온 및 건조 스트레스 조건에서 지상부 생체중이 유의적으로 높았다. 또한 PMC12 균주를 처리한 토마토는 Ralstonia solanacearum에 의한 세균성 시들음병에 대한 저항성이 증가되었다. 결과적으로 PMC12 균주는 식물의 비생물적 스트레스 및 생물적 스트레스에 대한 감수성을 감소시키는 유망한 생물학적 방제제 및 생물활성제로 사용될 수 있을 것으로 전망된다.