• 제목/요약/키워드: mutation rate

검색결과 351건 처리시간 0.02초

베르니케 뇌병증으로 오인된 리 증후군: 증례 보고 (Leigh Syndrome Mimicking Wernicke's Encephalopathy: A Case Report)

  • 오지수;최진옥;김수정;유은애
    • 대한영상의학회지
    • /
    • 제81권6호
    • /
    • pp.1478-1485
    • /
    • 2020
  • 리 증후군 또는 아급성 괴사성 뇌병증은 드물며, 빠르게 진행하는 신경 퇴행성 장애이다. 일반적으로 생후 1년 이내 호흡곤란, 심장기능 저하 등과 같은 증상이 발생하여, 2~3년 동안 환자의 75%가 사망에 이르는 심각한 질환이다. 리 증후군의 원인은 DNA mutation으로, 약 75%의 환자에서 핵 데옥시리보핵산의 돌연변이가 나타나고, 25%의 환자에서 미토콘드리아 데옥시리보핵산의 돌연변이가 발견된다. 임상 증상은 영향을 받은 뇌 영역에 따라 달라지며, 신경영상은 리 증후군 환자의 진단에 있어 중요한 역할을 한다. 성인에서 발생한 리 증후군은 더욱 드물고 어린 나이에 발생한 경우보다 더 느리게 진행한다. 우리는 성인에서 발생한 베르니케 뇌병증으로 오인된 리 증후군 환자의 증례를 보고하고자 한다.

Predictive Factors for Switched EGFR-TKI Retreatment in Patients with EGFR-Mutant Non-Small Cell Lung Cancer

  • Kwon, Byoung Soo;Park, Ji Hyun;Kim, Woo Sung;Song, Joon Seon;Choi, Chang-Min;Rho, Jin Kyung;Lee, Jae Cheol
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
    • /
    • 제80권2호
    • /
    • pp.187-193
    • /
    • 2017
  • Background: Third-generation tyrosine kinase inhibitors of the epidermal growth factor receptor (EGFR-TKIs) have proved efficacious in treating non-small cell lung cancer (NSCLC) patients with acquired resistance resulting from the T790M mutation. However, since almost 50% patients with the acquired resistance do not harbor the T790M mutation, retreatment with first- or second-generation EGFR-TKIs may be a more viable therapeutic option. Here, we identified positive response predictors to retreatment, in patients who switched to a different EGFR-TKI, following initial treatment failure. Methods: This study retrospectively reviewed the medical records of 42 NSCLC patients with EGFR mutations, whose cancers had progressed following initial treatment with gefitinib or erlotinib, and who had switched to a different first-generation EGFR-TKI during subsequent retreatment. To identify high response rate predictors in the changed EGFR-TKI retreatment, we analyzed the relationship between clinical and demographic parameters, and positive clinical outcomes, following retreatment with EGFR-TKI. Results: Overall, 30 (71.4%) patients received gefitinib and 12 (28.6%) patients received erlotinib as their first EGFR-TKI treatment. Following retreatment with a different EGFR-TKI, the overall response and disease control rates were 21.4% and 64.3%, respectively. There was no significant association between their overall responses. The median progression-free survival (PFS) after retreatment was 2.0 months. However, PFS was significantly longer in patients whose time to progression was ${\geq}10months$ following initial EGFR-TKI treatment, who had a mutation of exon 19, or whose treatment interval was <90 days. Conclusion: In patients with acquired resistance to initial EGFR-TKI therapy, switched EGFR-TKI retreatment may be a salvage therapy for individuals possessing positive retreatment response predictors.

Epidermal Growth Factor Receptor Mutations in Non-Small Cell Lung Cancers in a Multiethnic Malaysian Patient Population

  • Liam, Chong-Kin;Leow, Hwong-Ruey;How, Soon-Hin;Pang, Yong-Kek;Chua, Keong-Tiong;Lim, Boon-Khaw;Lai, Nai-Lang;Kuan, Yeh-Chunn;Pailoor, Jayalakshmi;Rajadurai, Pathmanathan
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
    • /
    • 제15권1호
    • /
    • pp.321-326
    • /
    • 2014
  • Background: Mutations in the tyrosine kinase domain of the epidermal growth factor receptor (EGFR) in non-small cell lung cancer (NSCLC) are predictive of response to EGFR-targeted therapy in advanced stages of disease. This study aimed to determine the frequency of EGFR mutations in NSCLCs and to correlate their presence with clinical characteristics in multiethnic Malaysian patients. Materials and Methods: In this prospective study, EGFR mutations in exons 18, 19, 20 and 21 in formalin-fixed paraffin-embedded biopsy specimens of consecutive NSCLC patients were asessed by real-time polymerase chain reaction. Results: EGFR mutations were detected in NSCLCs from 55 (36.4%) of a total of 151 patients, being significantly more common in females (62.5%) than in males (17.2%) [odds ratio (OR), 8.00; 95% confidence interval (CI), 3.77-16.98; p<0.001] and in never smokers (62.5%) than in ever smokers (12.7%) (OR, 11.50; 95%CI, 5.08-26.03; p<0.001). Mutations were more common in adenocarcinoma (39.4%) compared to non-adenocarcinoma NSCLCs (15.8%) (p=0.072). The mutation rates in patients of different ethnicities were not significantly different (p=0.08). Never smoking status was the only clinical feature that independently predicted the presence of EGFR mutations (adjusted OR, 5.94; 95%CI, 1.94-18.17; p=0.002). Conclusions: In Malaysian patients with NSCLC, the EGFR mutation rate was similar to that in other Asian populations. EGFR mutations were significantly more common in female patients and in never smokers. Never smoking status was the only independent predictor for the presence of EGFR mutations.

인면역결핍 바이러스 pol 유전자 염기서열 결정에 의한 지도부딘 (ZDV) 내성 돌연변이의 탐지 (Detection of Mutations to Zidovudine in the pol Gene of Human Immunodeficiency Virus-1 by Direct Sequencing)

  • 조영걸;이희정;성흥섭;김유겸;김영봉;이용진;김미정;김대곤;원영호;조군제
    • 대한바이러스학회지
    • /
    • 제29권4호
    • /
    • pp.271-281
    • /
    • 1999
  • The nested polymerase chain reaction (PCR) assay was used to determine the sequences of reverse transcriptase (RT) codons 41, 67, 70, 210, 215 and 219 of human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) pol gene. Template DNA was obtained from uncultured peripheral blood mononuclear cells from 27 Korean HIV-1 infected patients treated with ZDV and Korean red ginseng. The second PCRs were done for 2 separated regions (RT codons $13{\sim}98$ and $152{\sim}259$) with $5\;{\mu}l$ of the first PCR productNucleotide sequences were determined by direct sequencing. In the 27 patients, CD4+ cell count decreased from $230{\pm}117/{\mu}l$ to $152{\pm}162/{\mu}l$ for $46{\pm}26$ months (Mo), and actual duration of ZDV intake was $72{\pm}16$ Mo. In the 16 patients who had been treated with ZDV therapy ${\ge}25$ Mo, the incidences of 70R, 215F/Y, and 41L were 61%, 28% and 22%, respectively and those of 67N, 210W and 219Q were 17%. The incidences of 215F/Y were 6.7% for group ${\le}12$ Mo treatment, 22.7% for group with 13 to 24 Mo, and 27.8% for group ${\ge}25$ Mo. There was no mutation in 9 patients. It might be associated with the interruption of ZDV therapy for more than 6 months in 6 patients. This study shows that the detection of mutation could be useful prognostic marker with other clinical and virological data, and very low mutation rate is dectected compared to overseas reports.

  • PDF

폐 편평세포암에서 자발성 아포토시스와 원격전이 (Spontaneous Apoptosis and Metastasis in Squamous Cell Carcinoma of the Lung)

  • 오윤경;기근홍
    • Radiation Oncology Journal
    • /
    • 제17권3호
    • /
    • pp.203-208
    • /
    • 1999
  • 목적 : 폐암 환자의 대부분은 진단 당시 수술을 받을 수 없는 병기로 발견되기 때문에 수술 조직이 아닌 기관지내시경 조직에서 자발성 아포토시스 정도를 평가하여 이의 임상적 의의에 대한 기초 자료로 삼고자 본 연구를 시행하였다. 대상 및 방법 : 1990년 9월부터 1994년 9월까지의 4년동안 흉부에 방사선치료를 받은 폐 편평세포암 환자 중 조직표본이 충분히 보관되어 있으며 추적이 가능하였던 19명을 대상으로 하였다. 병기는 II기가 1명, IIIa기 8명, IIIb기 5명, IV기 5명이었다. 면역조직화학적 염색법으로 자발성 아포토시스율(Al)과 p53 단백질 양성률을 관찰하였다. 결과 : 19명 중 16명은 $5\~15$ 개월 후에 사망하였으며 3명은 55, 67, 67 개월간 생존하고 있다. 중앙생존기간은 17개월, 평균 생존기간은 24 개월이었다. AI는 $0\~1\%$의 범위로 중앙값이 $0.4\%$였다. AI가 낮은 군에서 진단 당시 원격전이가 있었던 경우가 $50\%$ (5/10) 였고, 높은 근에서는 원격전이가 전혀 없었다(0/9). 생존기간에 영향을 줄 수 있는 예후인자들의 분석 결과 단변량 분석에서는 M병기가 통계학적으로 유의한 차이를 보였고, 다변량 분석에서는 AI, 화학요법, M병기, T병기, 병기가 의의가 있었다. 자발성 아포토시스와 p53 변이 사이의 관련은 관찰되지 않았다. 결론 : AI는 진단 당시 원격전이와 관련이 있으며, p53 변이와는 관련이 없었다. AI가 낮은 군에서 높은 군보다 생존기간이 짧은 경향을 보였다.

  • PDF

글루타치온 고함유 정미성 효모추출물 개발 (Development of a Flavor-Enriched Yeast Extract with a High Glutathione Content)

  • 배인영;구승현;유현재;김종민;배현아;전은정;오언;이대희;허병석;이현규
    • 한국식품과학회지
    • /
    • 제42권5호
    • /
    • pp.549-553
    • /
    • 2010
  • 본 연구에서는 다양한 효모 배양액을 자가소화 시킨 후 관능검사를 통해 1차적으로 8종(S. cerevisiae 3종, C. utilis 4종 및 Z.rouxii 1종)을 선별하였다. 이 중 정미성과 균체 성장율을 고려하여 C. utilis인 SEM-Y8을 선정하여 고글루타치온 생산을 위한 균주 개량을 수행하였다. 두 번의 UV 처리를 통해 SEM-Y8보다 글루타치온 생성능이 2.0배 증가된 SY8-M2-1 개량 효모 균주를 얻었으며, 선택배지(4.0% yeast extract, 1.5% glucose, 0.04% $NH_4H_2PO_4$, 0.04% L-cystein)를 사용함으로써 글루타치온 함량을 1.5배 더 향상시킬 수 있었다. 이상의 조건에서 얻어진 고글루타치온 함유 효모추출물은 마늘과 양파엑기스보다 우수한 감칠맛과 부드럽고 깊은 맛을 나타내었으며, SEM-Y8 대비 3.2배 향상된 라디컬 소거능을 나타내었다.

쌀의 돌연변이 억제활성에 미치는 가공처리의 영향 (Effect of Processing on the Antimutagenicity of Rice)

  • 김인호;전향숙;하태열;문태화
    • 한국식품과학회지
    • /
    • 제27권6호
    • /
    • pp.944-949
    • /
    • 1995
  • 쌀을 cooking, steaming, parching 등의 가공처리 형태로서 밥, 백설기, 미싯가루를 제조하여 methanol로 추출한 후 돌연변이 억제활성의 유지여부를 조사하기 위하여 Salmonella typhimurium reversion assay로 조사하고 SOS Chromotest로 확인하였다. S. typhimurium reversion assay에 대하여 직접변이원 4NQO로 유도한 frameshift type 돌연변이의 경우 $46%{\sim}100%$의 억제효과를 나타내었으며 억제활성이 투여농도에 비례하였다. Base substitution type 돌연변이의 경우는 각 가공물의 용매 추출물에서 억제활성이 미약하거나 서의 효과를 발견할 수 없었다. 간접변이원의 경우는 직접변이원과 비교하여 모든 처리구에서 억제효과가 관찰되었다. Trp-p-1으로 유도된 frameshift type 돌연변이의 경우 $75{\sim}100%$의 활성을 나타내었으며 $AFB_1$으로 유도된 base substitution type 돌연변이의 경우는 $66{\sim}87%$의 활성을 보여 직접변이원보다 억제활성이 높았다. SOS chromotest에 대하여는 4NQO로 유도된 돌연변이의 경우 억제활성이 없었으며 Trp-p-2로 유도된 돌연변이의 경우는 19-67%의 억제활성으로 S. typhimurium reversion assay와 같은 경향이 나타남을 확인하였다. 쌀의 항변이원성 물질은 rice-cooking, steaming, parching 등의 가공처리에 의해 억제활성이 소실되지 않아 가공 안정성이 있는 물질인 것으로 조사되었다.

  • PDF

Multiplex PCR과 Conformation Sensitive Gel Electrophoresis를 이용한 혈우병B F9 유전자 돌연변이 직접 진단법 (Direct detection of hemophilia B F9 gene mutation using multiplex PCR and conformation sensitive gel electrophoresis)

  • 유기영;김희진;이광철
    • Clinical and Experimental Pediatrics
    • /
    • 제53권3호
    • /
    • pp.397-407
    • /
    • 2010
  • 목 적 : F9 유전자는 혈우병B의 병인 유전자이다. 기존의 RFLP를 이용한 연관분석은 정보제공율이 55.6%에 불과하였다. 직접 염기서열 분석법은 98%의 돌연변이를 진단할 수 있지만, 고가의 비용이 든다. 본 연구는 F9 유전자를 대상으로 돌연변이의 선별검사로써 mPCR-CSGE를 사용하고, 이후 특정 유전자 부위만을 염기서열 분석하여 mPCR-CSGE의 유용성을 확인하기 위해 고안되었다. 방 법 : 연구대상은 비혈연 관계인 27명의 혈우병B 환자였다. 직접염기서열 분석법은 독립된 다른 기관에서 시행하였고, mPCR-CSGE 선별 후 염기서열 분석법은 본 연구자의 기관에서 시행되었다. 직접 염기서열 분석법의 결과가 참고치가 되어 mPCR-CSGE 선별 후 염기서열 분석법을 정확성, 경제성, 신속성, 편이성 측면에서 비교하였다. 두가지 방법으로 진단이 되지 않는 환자에게는 MLPA를 이용하여 돌연변이를 발견하였다. 결 과 : 직접 염기서열 분석법으로 26명(96.3%)의 환자에서 돌연변이를 확인할 수 있었다. mPCR-CSGE 선별 후 염기서열 분석법으로는 23명(85.2%)의 환자에서 돌연변이를 찾아낼 수 있었다. 1명의 환자는 MLPA로써 돌연변이를 확인할 수 있었다. 27명의 환자에게 21개의 독립적인 돌연변이가 있었다. mPCR-CSGE 선별 후 염기서열 분석법은 직접 염기서열 분석법에 비해 비용은 55.7%로 줄일 수 있었으나, 실험 단계는 더욱 복잡하였고, 시간도 하루가 더 걸렸으며, 세심한 실험상의 주의가 필요하였다. 결 론 : mPCR-CSGE 선별 후 염기서열 분석법은 85.2%의 높은 돌연변이 선별력을 보이고, 직접 염기서열 분석법의 57.7%의 비용만 소모하였으나, 실험과정에 세한 주의가 요구되었으며, 노동집약적이고, 실험 시간도 하루가 더 소요되었다.

Transposon 및 NTG 돌연변이를 이용한 재조합 대장균의 라이코펜 생산성 증진 (Enhanced Lycopene Production in Recombinant Escherichia coli by Random Transposon and NTG Mutagenesis)

  • 윤상활;고민수;박경애;정경화;신용철;이영미;이숙희;김선원
    • KSBB Journal
    • /
    • 제21권2호
    • /
    • pp.90-95
    • /
    • 2006
  • 라이코펜 생산성을 향상시키기 위하여 몇 가지 대장균 균주들을 대상으로 생산성 시험을 한 결과 MG1655 균주가 가장 우수하였다. 대장균 MG1655 균주의 염색체 DNA 내에 존재하는 특정 유전자의 기능이 상실되었을 때 라이코펜 생산성이 증가되는 변이체를 선발하기 위해 transposon 돌연변이를 수행하였으며, 5종의 우수 transposon 변이체를 얻었다. 특히, Tn4 변이체는 야생형 MG1655에 비해서 라이코펜 생산량은 6배, 균체 내 함량은 7배로 가장 높았다. Transposon 삽입에 의해 결손된 유전자를 파악하기 위해 inverse PCR을 통해 염기서열을 확인하였으며, 결손된 유전자는 rfaH, treB, B2436으로 규명되었다. 또한 특정 유전자 기능의 상실뿐만 아니라 기능의 강화나 변화 등에 의한 라이코펜 생산성이 증가된 변이체를 선발하기 위해 NTG 돌연변이를 수행하였으며, 4개의 우수한 NTG 변이체를 얻었다. 이들 중에 NTG4 변이체가 가장 높은 라이코펜 생산량을 보였다. 특히, NTG4 변이체는 발현유도물질인 arabinose의 소량(0.013mM) 첨가 시에 라이코펜 농도, 6 mg/L와 균체 내 함량 4 mg/g DCW로 최대의 라이코펜 생산성을 보였고, 이것은 야생형 MG1655에 비해서 각각 18배와 12배 높은 생산성이다.

EGFR 돌연변이 검출에 있어 PNA-Mediated Real-Time PCR Clamping과 직접 염기서열 분석법의 비교 분석 (Comparative Analysis of Peptide Nucleic Acid (PNA)-Mediated Real-Time PCR Clamping and DNA Direct Sequencing for EGFR Mutation Detection)

  • 김희정;김완섭;신경철;이관호;김미진;이정은;송규상;김선영;이계영
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
    • /
    • 제70권1호
    • /
    • pp.21-27
    • /
    • 2011
  • Background: Although the gold standard method for research trials on epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations has been direct sequencing, this approach has the limitations of low sensitivity and of being time-consuming. Peptide nucleic acid (PNA)-mediated polymerase chain reaction (PCR) clamping is known to be a more sensitive detection tool. The aim of this study was to compare the detection rate of $EGFR$ mutation and EGFR-tyrosine kinase inhibitor (TKI) responsiveness according to $EGFR$ mutation status using both methodologies. Methods: Clinical specimens from 112 NSCLC patients were analyzed for $EGFR$ mutations in exons 18, 19, 20, and 21. All clinical data and tumor specimens were obtained from 3 university hospitals in Korea. After genomic DNA was extracted from paraffin-embedded tissue specimens, both PNA-mediated PCR clamping and direct-sequencing were performed. The results and clinical response to $EGFR$-TKIs were compared. Results: Sequencing revealed a total of 35 (22.9%) mutations: 8 missense mutations in exon 21 and 26 deletion mutations in exon 19. PNA-mediated PCR clamping showed the presence of genomic alterations in 45 (28.3%) samples, including the 32 identified by sequencing plus 13 additional samples (6 in exon 19 and 7 in exon 21). Conclusion: PNA-mediated PCR clamping is simple and rapid, as well as a more sensitive method for screening of genomic alterations in $EGFR$ gene compared to direct sequencing. This data suggests that PNA-mediated PCR clamping should be implemented as a useful screening tool for detection of $EGFR$ mutations in clinical setting.