• 제목/요약/키워드: multiplex-PCR

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소아 보카바이러스 호흡기 감염증의 역학적 특징 (Epidemiologic Characteristics of Human Bocavirus-Associated Respiratory Infection in Children)

  • 최재홍;백지연;최은화;이환종
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제18권1호
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    • pp.61-67
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    • 2011
  • 목 적 : 본 연구는 소아에서 보카바이러스와 연관된 하기도 감염증의 역학적인 특성에 대해 알아보고자 하였다. 방 법: 2000년 3월부터 2005년 9월까지 서울대학교 병원과 분당 서울대학교병원에 하기도 감염증으로 입원한 658명의 소아에게서 비인두 흡입 검체를 채취하였다. 다중 역전사 중합효소 연쇄 반응을 이용하여 11종의 바이러스를 조사하였고, 의무기록을 후향적으로 분석하였다. 결 과:전체 호흡기바이러스는 658명의 환아 중 325명(49.4%)에서 검출되었다. 보카바이러스는 62명(9.4%)에서 검출되었으며, 3개월 이상 5세 미만에서 많았다. 보카바이러스가 중복감염이 확인된 것은 37.1%로, 전체 바이러스 양성 환자들의 중복감염률(12.3%)보다 의미 있게 높은 것으로 확인되었다(P =0.000). 또한 늦은 봄부터 이른 여름인 5월부터 7월에 많이 검출되었다. 결 론 : 보카바이러스는 국내에서 소아의 하기도 감염증에서 유병률이 높았고, 특히 늦은 봄부터 초여름에 유행하였다.

Escherichia coli O114에 의한 용혈성 요독 증후군 2례 (Two cases of Hemolytic Uremic Syndrome Associated with Esecherichia coli O114)

  • 류수정;한혜원;유수진;이병선;이재규;김미나;김의종;박영서
    • Childhood Kidney Diseases
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    • 제6권1호
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    • pp.102-108
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    • 2002
  • 저자들은 stx2 유전자 양성인 E.coli O114 에 의한 용혈성 요독 증후군 2례를 경험하여 보고하는 바이다. 두 환자 모두 설사와 구토가 1-2일 지속된 후 급작스럽게 요량 감소와 빈혈, 혈소판감소증을 보였으며 10일 간의 복막 투석 치료를 받았으며 급성기에 혈압 증가와 함께 전신성 강직 간대성의 경련이 15-20분 간 있었다. 15여 일 경과 후 후유증 없이 회복되었다. 대변 배양액의 PCR에거 eae와 stx2 유전자를 확인하였고 colony hybridization을 시행하여 O114 혈청형으로 진단하였다. 본 증례는 E.coli O114에 의해 유발된 용혈성 요독 증후군의 첫 국내 보고이다.

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Modulation of Pituitary Somatostatin Receptor Subtype (sst1-5) mRNA Levels by Growth Hormone (GH)-Releasing Hormone in Purified Somatotropes

  • Park, Seung-Joon;Park, Hee-Soon;Lee, Mi-Na;Sohn, Sook-Jin;Kim, Eun-Hee;Jung, Jee-Chang;Frohman, Lawrence A.;Kineman, Rhonda D.
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제7권2호
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    • pp.79-84
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    • 2003
  • We have previously reported that expression of the somatostatin receptor subtypes, sst1-5, is differentially regulated by growth hormone (GH)-releasing hormone (GHRH) and forskolin (FSK), in vitro. GHRH binds to membrane receptors selectively located on pituitary somatotropes, activates adenylyl cyclase (AC) and increases sst1 and sst2 and decreases sst5 mRNA levels, without significantly altering the expression of sst3 and sst4. In contrast FSK directly activates AC in all pituitary cell types and increases sst1 and sst2 mRNA levels and decreases sst3, sst4 and sst5 expression. Two explanations could account for these differential effects: 1) GHRH inhibits sst3 and sst4 expression in somatotropes, but this inhibitory effect is masked by expression of these receptors in unresponsive pituitary cell types, and 2) FSK inhibits sst3 and sst4 expression levels in pituitary cell types other than somatotropes. To differentiate between these two possibilities, somatotropes were sequentially labeled with monkey anti-rat GH antiserum, biotinylated goat anti-human IgG, and streptavidin-PE and subsequently purified by fluorescent-activated cell sorting (FACS). The resultant cell population consisted of 95% somatotropes, as determined by GH immunohistochemistry using a primary GH antiserum different from that used for FACS sorting. Purified somatotropes were cultured for 3 days and treated for 4 h with vehicle, GHRH (10 nM) or FSK ($10{\mu}M$). Total RNA was isolated by column extraction and specific receptor mRNA levels were determined by semi-quantitative multiplex RT-PCR. Under basal conditions, the relative expression levels of the various somatostatin receptor subtypes were sst2>sst5>sst3=sst1> sst4. GHRH treatment increased sst1 and sst2 mRNA levels and decreased sst3, sst4 and sst5 mRNA levels in purified somatotropes, comparable to the effects of FSK on purified somatotropes and mixed pituitary cell cultures. Taken together, these results demonstrate that GHRH acutely modulates the expression of all somatostatin receptor subtypes within GH-producing cells and its actions are likely mediated by activation of AC.

Direct Deletion Analysis in Two Duchenne Muscular Dystrophy Symptomatic Females Using Polymorphic Dinucleotide (CA)n Loci within the Dystrophin Gene

  • Giliberto, Florencia;Ferreiro, Veronica;Dalamon, Viviana;Surace, Ezequiel;Cotignola, Javier;Esperante, Sebastian;Borelina, Daniel;Baranzini, Sergio;Szijan, Irene
    • BMB Reports
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    • 제36권2호
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    • pp.179-184
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    • 2003
  • Duchenne muscular dystrophy (DMD) is the most common hereditary neuromuscular disease. It is inherited manifestations. In some rare cases, the disease can also be manifested in females. The aim of the present study was to determine the molecular alteration in two cases of nonrelated DMD symptomatic carriers with no previous history of DMD. Multiplex PCR is commonly used to search for deletion in the DMD gene of affected males. This method could not be used in females because the normal X chromosome masks the deletion of the mutated one. Therefor, we used a set of seven highly polymorphic dinucleotide $(CA)_n$ repeat markers that lie within the human dystrophin gene. The deletions were evidenced by hemizygosity of the loci under study. We localized a deletion in the locus 7A (intron 7) on the maternal X chromosome in one case, and a deletion in the region of introns 49 and 50 on the paternal X chromosome in the other. The use of microsatellite genotyping within the DMD gene enables the detection of the mutant allele in female carriers. It is also a useful method to provide DMD families with more accurate genetic counseling.

부산지역 호흡기감염증 환자로부터 분리한 아데노바이러스와 보카바이러스의 유행양상 분석 (Epidemiological Characterization of Adenovirus and Human Bocavirus Detected Acute Respiratory Patients in Busan)

  • 황수정;김남호;박동주;구평태;이미옥;진성현
    • 생명과학회지
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    • 제27권3호
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    • pp.275-282
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    • 2017
  • 부산지역 급성호흡기감염증으로 내원한 환자에서 호흡기바이러스 검사를 시행하여 아데노바이러스 및 보카바이러스의 특징적인 임상증상 및 유행양상을 알아보고자 하였다. 3,230명의 환자에서 총 1,485건(46.0%)의 호흡기바이러스가 검출되었고 이 중 아데노바이러스 257건(8.0%), 보카바이러스 68건(2.1%)을 확인하였다. 성별 발생양상은 남자가 여자보다 아데노바이러스, 보카바이러스로 인한 호흡기감염증에 취약하였으며, 모두 1~5세 연령군에서 높은 검출률을 보여 영 유아의 주요 감염요인임을 확인할 수 있었다. 주요 임상증상으로 아데노바이러스는 발열, 두통이 보카바이러스는 천명음이 통계적으로 유의하였다. 아형분석결과, 아데노바이러스는 1~6, 8형의 혈청형을 확인하였고 기존 분리주와 97% 이상의 상동성을 보였다. 연도별 유행 혈청형은 2011년 아데노바이러스 1형, 2012년 3형과 4형, 2013년에는 3형이 우점적으로 유행하였다. 아데노바이러스 3형의 경우, 대유행을 유발하는 아형으로 보인다. 보카바이러스는 모두 1형으로 나타났다.

재래흑염소 개체식별과 친자확인을 위한 Microsatellite Marker Set 개발 (Development of a Microsatellite Marker Set for the Individual Identification and Parentage Verification of Korean Native Black Goats)

  • 이상훈;강호찬;이성수;이진욱;김은호;명철현;김관우;임현태
    • 생명과학회지
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    • 제30권10호
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    • pp.912-918
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    • 2020
  • 본 연구는 재래흑염소와 교잡종 염소 총 304두를 대상으로 Microsatellite (MS) marker의 대립유전자형 분석을 통해 염소의 개체식별과 친자확인을 목적으로 실시하였다. 각 MS marker 별 대립유전자형의 다형성을 토대로 11종의 MS marker를 선발하였다. 선발된 MS marker를 사용할 경우 동일한 유전자형을 가진 개체가 출현할 확률이 무작위, 반형매 교배집단에서 각각 5.58×10-10, 1.15×10-7으로 분석되었다. 또한 친자감정 확률은 부모의 정보가 있을 경우 0.999996, 부모의 정보가 없을 경우 0.999833으로 분석되어 국내에서 사육하고 있는 염소들의 개체식별 및 친자확인이 가능할 것으로 사료된다. 또한 국내 재래흑염소 4 계통과 교잡종 염소들 간의 혈연관계 분석을 통해 국내 재래흑염소의 유전적 특성을 확인하였다. 본 연구의 결과는 염소의 개량 기반 구축에 필요한 개체관리와 친자감별 및 향후 염소고기의 생산 이력 구축에 유용하게 활용 할 수 있을 것으로 판단된다.

인천지역 급성 설사환자의 group A rotavirus 감염 실태 및 P와 G 유전자형 분포 (The Prevalence and Distribution of the P and G Genotypes of a Group A Rotavirus Detected in Acute Gastroenteritis Patients from Incheon)

  • 최혜진;오보영;이미연;고연자;공용우;허명제;이제만;김용희;정혜숙;천두성
    • 생명과학회지
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    • 제22권5호
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    • pp.600-604
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    • 2012
  • 인천지역 병 의원에 내원한 급성위장염환자의 대변 검체 총 11,607건을 효소 면역법(ELISA)을 이용하여 group A rotavirus의 계절별 발생 양상을 조사한 결과 2005년부터 2010년간 인천지역에서는 1~2월이 가장 많이 발생하였으나, 기간별로 차이가 존재했다. 또, group A rotavirus 양성 검체 160건에 유전자 분석 결과 VP4는 P8형, VP7는 G1형, G와 P 조합형으로는 G1P8이 가장 많았다. 그러나 이전의 연구와 비교했을 때 연구 지역과 기간에 따라 혈청형과 유전형의 변화가 빈번하였으므로 효율적인 방역을 위해 지속적인 모니터링이 필요하다고 사려된다. 또 이번 연구는 현재 유통 중인 rotavirus 백신의 효율적인 사용의 기초 자료가 될 것이다.

Analysis of Small Fragment Deletions of the APC gene in Chinese Patients with Familial Adenomatous Polyposis, a Precancerous Condition

  • Chen, Qing-Wei;Zhang, Xiao-Mei;Zhou, Jian-Nong;Zhou, Xin;Ma, Guo-Jian;Zhu, Ming;Zhang, Yuan-Ying;Yu, Jun;Feng, Ji-Feng;Chen, Sen-Qing
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권12호
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    • pp.4915-4920
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    • 2015
  • Background: : Familial adenomatous polyposis (FAP) is an autosomal dominant inherited disease mainly caused by mutations of the adenomatous polyposis coli (APC) gene with almost complete penetrance. These colorectal polyps are precancerous lesions that will inevitable develop into colorectal cancer at the median age of 40-year old if total proctocolectomy is not performed. So identification of APC germline mutations has great implications for genetic counseling and management of FAP patients. In this study, we screened APC germline mutations in Chinese FAP patients, in order to find novel mutations and the APC gene germline mutation characteristics of Chinese FAP patients. Materials and Methods: The FAP patients were diagnosed by clinical manifestations, family histories, endoscope and biopsy. Then patients peripheral blood samples were collected, afterwards, genomic DNA was extracted. The mutation analysis of the APC gene was conducted by direct polymerase chain reaction (PCR) sequencing for micromutations and multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) for large duplications and/or deletions. Results: We found 6 micromutations out of 14 FAP pedigrees, while there were no large duplications and/or deletions found. These germline mutations are c.5432C>T(p. Ser1811Leu), two c.3926_3930delAAAAG (p.Glu1309AspfsX4), c.3921_3924delAAAA (p.Ile1307MetfsX13), c3184_3187delCAAA(p.Gln1061AspfsX59) and c4127_4126delAT (p.Tyr1376LysfsX9), respectively, and all deletion mutations resulted in a premature stop codon. At the same time, we found c.3921_3924delAAAA and two c.3926_3930delAAAAG are located in AAAAG short tandem repeats, c3184_3187delCAAA is located in the CAAA interrupted direct repeats, and c4127_4128 del AT is located in the 5'-CCTGAACA-3', 3'-ACAAGTCC-5 palindromes (inverted repeats) of the APC gene. Furthermore, deletion mutations are mostly located at condon 1309. Conclusions: Though there were no novel mutations found as the pathogenic gene of FAP in this study, we found nucleotide sequence containing short tandem repeats and palindromes (inverted repeats), especially the 5 bp base deletion at codon 1309, are mutations in high incidence area in APC gene,.

더러브렛 말에서 분리한 Streptococcus equi subsp. zooepidemicus의 RAPD 분석 및 약제 감수성 (RAPD Analysis and Antimicrobial Susceptibility of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus Isolated from Thoroughbred Horses)

  • 최성균;박용수;조광현;조길재
    • 생명과학회지
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    • 제20권5호
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    • pp.649-654
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    • 2010
  • Streptococcus equi subsp. zooepidemicus는 말의 생식기 질환을 유발하는 중요한 병원체 중 하나로서 국내 말의 생산성 향상을 도모할 목적으로 제주도에서 사육중인 더러브렛 암말의 유산태아 및 그 말의 자궁내용물과 장수목장에서 암말의 교배전 생식기 질환이 의심되는 말의 질 내용물로부터 시료를 채취하여 Streptococcus equi subsp. zooepidemicus을 분리하여 그 분리균의 특성 및 항균제 감수성 검사를 실시한 결과, RAPD typing에서는 크게 4개의 cluster로 구분되었다. 특히 제주도에서 분리한 균주와 장수목장에서 분리한 하나의 균주가 동일한 pattern을 나타내었다. 항균제 감수성 검사에서는 대부분의 균주가 ampicillin 등의 약제에 감수성이 있음을 확인하였다. 본 연구의 결과는 국내에서 사육중인 암말의 생식기 질병의 예방 및 치료에 유용할 것으로 생각된다.

시판 축산물 및 수산물에서 Enterococcus faecalis와 Enterococcus faecium 분포 및 항생제 감수성에 관한 연구 (Prevalence and Antimicrobial Resistance of Enterococus faecalis and Enterococcus faecium Isolated from Beef, Pork, Chicken and Sashimi)

  • 성창현;천정환;곽효선;김현숙;서건호
    • 한국축산식품학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.133-138
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    • 2013
  • 본 연구에서는 서울시내 256곳의 판매점에서 구입한 축산물 및 수산물에서 Enterococcus faecalis 와 Enterococcus facium을 분리하였으며 분리된 균주의 항생제 내성양상과 vancomycin 내성 유전자 보유여부를 검증하였다. 총 256개 시료 중 117개에서 E. faecalis(40.6%)와 E. faecium(5.1%)가 검출되어 45.7%의 분리율을 나타내었다. 축산물은 192개 중 105개 균주가 분리되어 54.7%의 분리율을 나타내었는데 닭고기에서 가장 높은 68.8%의 분리율을, 돼지고기에서 50.0%의 분리율을, 쇠고기에서 45.3%의 분리율을 나타내었다. 횟감어류에서는 18.8%의 분리율을 나타내었다. 분리된 균주에 대한 항생제 내성 양상은 10종의 항생제 디스크를 이용하여 검증하였다. Tetracycline의 내성률이 52.1%로 가장 높았으며, erythromycin의 내성률이 27.4%로 두 번째로 높게 나타났다. Ampicillin과 penicillin는 1개의 균주를 제외하고는 모두 감수성을 보였으며, amoxicillin & clavulanic acid에는 모든 균주가 감수성을 보였다. Vancomycin에는 모든 균주가 감수성을 보여 VRE는 검출되지 않았다. 분리된 균주의 vancomycin 내성유전자의 검출은 multiplex PCR을 이용하여 vanA gene과 vanB gene 보유여부를 확인하였다. vanA gene이 검출된 균주는 없었으나, vancomycin에 감수성을 나타내던 9개의 균주에서 vanB gene이 검출되어 VRE균 출현의 잠재적인 가능성을 보여주었다.