• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제85권3호
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• pp.256-263
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• 2022

Background: Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is resistant to the β-lactam antibiotics due to a non-classical transpeptidase in the cell wall with β-lactamase activity. A recent study showed that meropenem combined with clavulanate, a β-lactamase inhibitor, was effective in multidrug-resistant (MDR) and extensively drug-resistant (XDR) tuberculosis (TB). However, in Korea, clavulanate can only be used as drugs containing amoxicillin. In this study, we investigated the susceptibility and genetic mutations of drug-resistant Mtb isolates to amoxicillin-clavulanate and meropenem-clavulanate to improve the diagnosis and treatment of drug-resistant TB patients. Methods: The minimum inhibitory concentration (MIC) of amoxicillin-clavulanate and meropenem-clavulanate was examined by resazurin microtiter assay. We used 82 MDR and 40 XDR strains isolated in Korea and two reference laboratory strains. Mutations of drug targets blaC, blaI, ldtA, ldtB, dacB2, and crfA were analyzed by polymerase chain reaction and DNA sequencing. Results: The MIC₉₀ values of amoxicillin/clavulanate and meropenem/clavulanate in drug-resistant Mtb isolates were 64/2.5 and 16/2.5 mg/L, respectively. Gene mutations related to amoxicillin/clavulanate and meropenem/clavulanate resistance could not be identified, but T448G mutation was found in the blaC gene related to β-lactam antibiotics' high susceptibility. Conclusion: Our results provide clinical consideration of β-lactams in treating drug-resistant TB and potential molecular markers of amoxicillin-clavulanate and meropenem-clavulanate susceptibility.

• 미생물학회지
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• 제52권4호
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• pp.428-436
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• 2016

항균제에 대한 내성 증가는 국내뿐만 아니라 세계적으로도 인류 건강에 큰논란이 되고 있다. 박테리아에 의한 감염을 치료하기 위해 같은 혹은 다른 계열의 항생제에 순차적으로 노출된다. 따라서, 본 연구는 ciprofloxacin과 meropenem의 순차적 처리에 따른 폐렴간균(Klebsiella pneumoniae)의 생육, 항생제 민감성, 돌연변이 빈도, ${\beta}$-lactamase activity, 생물막 형성 및 내성 관련 유전자 발현을 평가하기 위해 설계되었다. 처리군은 대조군(control; CON), 1/2 MIC ciprofloxacin (1/2CIP), 2 MIC ciprofloxacin (2CIP), 1/2 MIC ciprofloxacin+1/2 MIC meropenem+2 MIC ciprofloxacin (1/2CIP-1/2MEM-2CIP), 1/2 MIC ciprofloxacin+1/2 MIC meropenem+2 MIC meropenem(1/2CIP-1/2MEM-2MEM), 1/2 MIC ciprofloxacin+2 MIC ciprofloxacin+2 MIC meropenem (1/2CIP-2CIP-2MEM)을 포함한다. 24시간의 배양 동안 2CIP처리군에서 K. pneumoniae의 생육이 관찰되지 않았다. 모든 처리군에서 planktonic cell의 수는 7에서 10 log CFU/ml의 유의적인 차이를 보였으나 biofilm cell의 수는 7 log CFU/ml로 비슷하였다. 돌연변이 빈도는 1/2CIP-1/2MEM-2CIP에서 가장 낮은 14%을 보였다. 대조군과 비교하여 1/2CIP-2CIP-2MEM 처리 K. pneumoniae는 piperacillin, cefotaxime, nalidixic에 대한 민감도가 감소되었다. 1/2CIP-1/2MEM-2CIPrk 가장 높은 ${\beta}$-lactamase activity(22 nmol/min/ml)을 보인 반면 1/2CIP-2CIP-2MEM은 가장 낮은 ${\beta}$-lactamase activity (6 nmol/min/ml)을 보였다. Multidrug efflux pump 관련 유전자(acrA, acrB, and ramA)의 발현은 1/2CIP-1/2MER-2MER and 1/2CIP2CIP-2MER 처리된 K. pneumoniae에서 2배 이상 증가하였다. 따라서 순차적 항생제의 처리는 K. pneumoniae의 항생제 내성 양상을 변화시킬 수 있다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제51권2호
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• pp.214-216
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• 2023

메로페넴에 내성을 갖는 Pseudomonas peli CJ30 균주가 대한민국의 한강에서 분리되었다. CJ30 균주의 유전체는 크기가 4,919,106 bp이고 G + C 함량이 60.0%인 아홉 개의 contig로 조립되었다. CJ30 균주의 유전체 서열은 5,411개의 단백질 코딩 유전자, 18개의 rRNA 유전자 및 70개의 tRNA 유전자를 포함하였다. 균주 CJ30에는 bla_SFC-3 및 ampC β-락타마아제 유전자가 포함되어 있습니다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제51권4호
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• pp.444-452
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• 2019

주요 획득성 metallo-β-lactamase (MBL) 유전자에 의해 매개되는 carbapenem 내성, 특히 Acinetobacter spp. 균종의 임상 분리주에 대한 보고가 증가하고 있다. 본 연구에서 임상에서 비 중복으로 분리된 carbapenem 비감수성 Acinetobacter spp. 191주 중 125 (65.4%)주가 imipenem 혹은 meropenem-Hodge 변법시험에 양성이었고, 49 (25.7%)주가 imipenem-EDTA+SMA double disk synergy (DDS) 시험에 양성이었다. bla_VIM-2 allele와 bla_IMP-2 allele 검출을 위한 중합효소연쇄반응과 염기서열분석을 시행한 결과, A. baumannii와 A. calcoaceticus에서 각각 29주와 1주가 bla_VIM-2를 갖고 있었고, A. baumannii 16주와 A. calcoaceticus 2주가 bla_IMP-1을 갖고 있었다. A. genomospecies 3는 blaVIM-2와 bla_AIM-1을 동시에 갖고 있었다. 이들 MBL 유전자는 모두 class 1 integron에 있었다. bla_VIM-2 혹은 bla_IMP-6를 갖는 class 1 integron의 크기는 A. baumannii 분리주에서는 2.8 kb에서 3.2 kb이었고, A. genomospecies 3 분리주에서는 3.2 kb에서 3.5 kb이었다. bla_VIM-2는 대부분 class 1 integron에 첫번째 혹은 두번째에 위치하였고, aacA4를 흔히 가지고 있었다. 다양한 내성 유전자를 가질 수 있는 MBL 생성 Acinetobacter spp.뿐 아니라 다양한 내성 유전자를 가질 수 있는 integron의 전파로 imipenem이나 meropenem과 같은 carbapenem 내성을 포함하여 다제 내성 그람음성 세균의 증가가 예상된다. 또한, 위중한 Acinetobacter spp. 감염증 치료를 위한 새로운 항균제 개발이 필요하다.

• 미생물학회지
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• 제42권4호
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• pp.265-270
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• 2006

본 연구에서는 2005년 11월부터 2006년 3월 초까지 497개의 초밥, 김밥, 샌드위치 등의 식사대용 식품 검체를 수거하여 식품공전을 토대로 식사대용 식품에서 유래되는 미생물학적 인 오염도를 조사하고, 현대 사회에서 항생제 사용의 오남용으로 항생제 내성이 심각한 상황을고려하여 분리된 균에 대한 항생제 감수성 양상에 대하여 알아보고자 하였다. 수거된 검체를 실험한 결과 김밥에서 4개(1.4%)의 Escherichia coli가 분리되었고, 초밥, 샌드위치 등에서는 분리되지 앓았다. 또한 김밥에서 12개(4.4%), 초밥에서 8개(5.4%), 샌드위치에서 2개(4.3%)로 총22개(4.4%)의 Staphylococcus aureus가 분리되었다. 식사대용 식품에서 분리된 26개의 균주로 National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS)의 기준에 의거하여 vancomycin, teicoplanin, gentamycin, cipro-floxacin, synercid, cefotaxime, lincomycin, meropenem, cefazolin, amoxicillin-clavulanic acid으로 총 10개의 항생제를 사용하여 E. coli와 S. aureus의 항생제 감수성 양상을 파악해 보고자 하였다. 실험 결과 식사대용 식품에서 분리된 E. coli 4균주의 항생제 감수성 양상은 그람 음성균 치료에 주로 사용되는 항생제인 gentamycin, ciprofloxacin, cefotaxine, meropenem, cefazolin에 대해서는 감수성이 높다고 판단되었으나 amoxicillin-clavulanic acid에 대해서는 내성을 나타내었고, S. aureus의 항생제 감수성은 비교적 높다고 판단되었다.

• Journal of Veterinary Science
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• 제22권5호
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• pp.68.1-68.15
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• 2021

Background: Colistin and carbapenem-resistant bacteria have emerged and become a serious public health concern, but their epidemiological data is still limited. Objectives: This study examined colistin and carbapenem resistance in Escherichia coli and Salmonella from pigs, pig carcasses, and pork in Thailand, Lao PDR, and Cambodia border provinces. Methods: The phenotypic and genotypic resistance to colistin and meropenem was determined in E. coli and Salmonella obtained from pigs, pig carcasses, and pork (n = 1,619). A conjugative experiment was performed in all isolates carrying the mcr gene (s) (n = 68). The plasmid replicon type was determined in the isolates carrying a conjugative plasmid with mcr by PCR-based replicon typing (n = 7). The genetic relatedness of mcr-positive Salmonella (n = 11) was investigated by multi-locus sequence typing. Results: Colistin resistance was more common in E. coli (8%) than Salmonella (1%). The highest resistance rate was found in E. coli (17.8%) and Salmonella (1.7%) from Cambodia. Colistin-resistance genes, mcr-1, mcr-3, and mcr-5, were identified, of which mcr-1 and mcr-3 were predominant in E. coli (5.8%) and Salmonella (1.7%), respectively. The mcr-5 gene was observed in E. coli from pork in Cambodia. Two colistin-susceptible pig isolates from Thailand carried both mcr-1 and mcr-3. Seven E. coli and Salmonella isolates contained mcr-1 or mcr-3 associated with the IncF and IncI plasmids. The mcr-positive Salmonella from Thailand and Cambodia were categorized into two clusters with 94%-97% similarity. None of these clusters was meropenem resistant. Conclusions: Colistin-resistant E. coli and Salmonella were distributed in pigs, pig carcasses, and pork in the border areas. Undivided-One Health collaboration is needed to address the issue.

• 대한임상검사과학회지
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• 제54권3호
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• pp.179-191
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• 2022

본 연구는 공중보건에 위협이 되고 있는 carbapenemase 유전자형 중 bla_KPC, bla_NDM, bla_IMP, bla_VIM, bla_OXA-48-like 유전자의 표현형적 검사 및 분자진단으로 검출하고 관련 유전자 분포 양상에 대해 알아보았다. 표현형적 검사결과 MHT는 41균주 모두에서 양성을 확인하고, CIT는 meropenem+PBA는 18균주 및 meropenem+EDTA에서 8균주의 양성을 확인하였다. PCR 결과 bla_KPC 28균주, bla_NDM 25균주, bla_IMP 5균주, bla_VIM 1균주, bla_OXA-48-like 13균주에서 증폭 산물을 확인하였다. 또한 bla_KPC+bla_NDM 7균주, bla_KPC+bla_IMP 1균주, bla_NDM+bla_OXA-48-like 1균주, bla_NDM+bla_VIM 1균주, bla_KPC+bla_NDM+bla_IMP 4균주, bla_KPC+bla_NDM+bla_OXA-48-like 4균주를 확인하였다. 실시간 중합효소 연쇄반응을 이용한 융해 곡선 분석결과는 PCR 결과와 100% 일치함을 확인하였다. 결론적으로 real-time PCR을 이용한 신속하고 특이성이 높은 CRE 조기진단을 통한 유전자 확인은 제한된 치료 옵션과 높은 사망률로 공중 보건 위협을 고조하는 CRE의 감시, 진단 및 치료를 개선할 수 있으며 전염을 방지하기 위한 효과적인 항균 치료 및 시기적절한 감염 통제가 가능할 것으로 사료된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제29권9호
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• pp.1460-1469
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• 2019

The extensive distribution of multidrug-resistant (MDR) methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) poses a threat to healthcare worldwide. This study aimed to investigate the MDR and molecular patterns of MRSA isolates in children admitted to the two biggest tertiary care pediatric hospitals in northern and southern Vietnam. A total of 168 MRSA strains were collected to determine antibiotic susceptibility by minimum inhibitory concentration tests. Antibiotic-resistant genes, pulsed-field gel electrophoresis, staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) typing, and multilocus sequence typing were used for the molecular characterization of MRSA. Among the total strains, the MDR rate (51.8%) was significantly higher in the northern hospital than in the southern hospital (73% vs. 39%, p < 0.0001). The MDR-MRSA with the highest rates were "ciprofloxacin-erythromycin-gentamicintetracyclines" (35.6%), followed by "erythromycin-tetracycline-chloramphenicol" (24.1%), and "ciprofloxacin-erythromycin-gentamicin" (19.5%), showing an accumulative total of 79.3%. The most susceptible antibiotics were rifampicin (100%) and vancomycin (100%), followed by doxycycline (94.0%), meropenem (78.0%), and cefotaxime (75.0%). The SCCmecII strains showed greater resistance to gentamicin, ciprofloxacin, tetracycline, meropenem and cephalosporins compared with the other strains. The SCCmecII strains exhibited the highest rate in the tested genes (aacA/aphD: 55.2%, ermA/B/C: 89.7%, and tetK/M: 82.8%). ST5-SCCmecII was the predominant clone in the northern hospital, whereas SCCmecIVa was more pronounced in the southern hospital. In conclusion, our results raised concerns about the predominant MDR-MRSA strains in the pediatric hospitals in Vietnam. The north-south difference in the antibiotic resistance patterns and genetic structure of MRSA suggests different MRSA origins and various uses of antimicrobial agents between the two regions.

• 한국동물위생학회지
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• 제44권1호
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• pp.21-26
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• 2021

The aim of this study was to investigate the antimicrobial resistance among Pseudomonas (P.) aeruginosa isolated from dogs and cats. A total of 45 (6.2%) P. aeruginosa was isolated from 710 dogs and 21 cats with clinical signs. Resistance to one or more of the antimicrobials tested was observed in 26 (57.8%) P. aeruginosa. Resistance to cefepime was the most frequent (44.4%), followed by ofloxacin (22.2%), levofloxacin (17.8%), norfloxacin (8.9%), ciprofloxacin (6.7%), ceftazidime, aztreonam, colistin, polymixin B and gentamicin (4.4%, respectively), while resistance to piperacillin/tazobactam, imipenem, tobramycin and amikacin was 2.2%, respectively. All isolates were susceptibility to doripenem and meropenem. Antimicrobial susceptibility testing should be a crucial step in selection of appropriate antimicrobial therapy in veterinary medicine. Also, the prudent use of antimicrobials and continuous monitoring for companion animals are required.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제49권3호
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• pp.367-373
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• 2021

The antimicrobial resistance of Staphylococcus spp. and Gram negative strains present in air samples from waste sorting facilities was assessed. Phenotypic studies have revealed a high percentage of strains of Staphylococcus spp. resistant to methicillin. Genotypically and by RT-PCR, it was found that the mecA gene usually associated with methicillin resistance was present in 8% of the Staphylococcus strains isolated. About 30% of the Gram negative strains from the same samples also displayed resistance to meropenem and 79% of these were resistant to multiple antibiotics from different classes, namely cephalosporins and β-lactams. The results suggest that in professional activities with high levels of exposure to biological agents, the quantification and identification of the microbial flora in the work environment, with the determination of the presence of potential agents displaying multi-resistances is of relevance to the risk assessment. The personal protection of workers is particularly important relevance in these cases, since many of the strains that exhibit multi-resistance are potential opportunistic agents.