• 제목/요약/키워드: matrix analysis

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The Usage of an SNP-SNP Relationship Matrix for Best Linear Unbiased Prediction (BLUP) Analysis Using a Community-Based Cohort Study

  • Lee, Young-Sup;Kim, Hyeon-Jeong;Cho, Seoae;Kim, Heebal
    • Genomics & Informatics
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    • 제12권4호
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    • pp.254-260
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    • 2014
  • Best linear unbiased prediction (BLUP) has been used to estimate the fixed effects and random effects of complex traits. Traditionally, genomic relationship matrix-based (GRM) and random marker-based BLUP analyses are prevalent to estimate the genetic values of complex traits. We used three methods: GRM-based prediction (G-BLUP), random marker-based prediction using an identity matrix (so-called single-nucleotide polymorphism [SNP]-BLUP), and SNP-SNP variance-covariance matrix (so-called SNP-GBLUP). We used 35,675 SNPs and R package "rrBLUP" for the BLUP analysis. The SNP-SNP relationship matrix was calculated using the GRM and Sherman-Morrison-Woodbury lemma. The SNP-GBLUP result was very similar to G-BLUP in the prediction of genetic values. However, there were many discrepancies between SNP-BLUP and the other two BLUPs. SNP-GBLUP has the merit to be able to predict genetic values through SNP effects.

위상구성행렬식을 이용한 비압축성 순환망 형태의 유로망 해석에 관한 연구 (A Study on the Analysis of Incompressible and Looped Flow Network Using Topological Constitutive Matrix Equation)

  • 유성연;김범신
    • 설비공학논문집
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    • 제22권8호
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    • pp.573-578
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    • 2010
  • Topological matrix which reflects characteristics of network connectivity has been widely used in efficient solving for complicated flow network. Using topological matrix, one can easily define continuity at each node of flow network and make algorithm to automatically generate continuity equation of matrix form. In order to analyze flow network completely it is required to satisfy energy conservation in closed loops of flow network. Fundamental cycle retrieving algorithm based on graph theory automatically constructs energy conservation equation in closed loops. However, it is often accompanied by NP-complete problem. In addition, it always needs fundamental cycle retrieving procedure for every structural change of flow network. This paper proposes alternative mathematical method to analyze flow network without fundamental cycle retrieving algorithm. Consequently, the new mathematical method is expected to reduce solving time and prevent error occurrence by means of simplifying flow network analysis procedure.

일반 선형 모형에 대한 공분산 행렬의 비교 (Comparison of the covariance matrix for general linear model)

  • 남상아;이근백
    • 응용통계연구
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    • 제30권1호
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    • pp.103-117
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    • 2017
  • 경시적 자료분석에서 공변량 효과를 추정할 때 반복 측정된 결과들의 상관성은 고려되어야 한다. 따라서 공분산 행렬을 모형화하는 것은 매우 중요하다. 그러나 공분산 행렬의 추정은 모수들의 수가 많고 추정된 공분산행렬이 양정치성을 만족해야 하므로 쉽지 않은 문제이다. 이러한 제한을 극복하기 위해, 공분산행렬의 모형화를 위한 여러가지 방법을 제안하였다: 자기회귀/이동평균/자기회귀-이동평균 구조를 각각 적용한 수정 콜레스키분해 (Pourahmadi, 1999), 이동평균 콜레스키분해 (Zhang과 Leng, 2012)와 자기회귀-이동평균 콜레스키 분해 (Lee 등, 2017) 이들 구조를 가지는 공분산 행렬의 특징을 비교연구하고자 한다. 이 세 가지 모형의 성능을 비교하기 위한 모의실험을 실시한다.

블록순환 행렬에 의한 이중나선 DNA 구조 (I) (A Double Helix DNA Structure Based on the Block Circulant Matrix (I))

  • 이성국;박주용;이문호
    • 한국인터넷방송통신학회논문지
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    • 제16권3호
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    • pp.203-211
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    • 2016
  • 유전자 코드는 바이오 정보 처리에 키 포인트로 인체의 유기적인 조직체이다. 현대 과학에서는 유전자 코드 분자구조의 신비스러운 특성을 체계적으로 설명하고 이해하는데 연구가 집중되고 있다. 본 논문에서는 유전자 시스템을 대칭적으로 해석하는데 중점을 두었고, Jacket 행렬로 무잡음 RNA 유전자 코드를 가장 단순하게 해석했다. 이유는 Jacket 행렬과 RNA는 그 역행렬이 Element (Block)-wise Inverse로 그 역(Inverse)도 자신이란 점과 대칭적 성질, 그리고 Kronecker곱을 갖기 때문이다. 제안된 방법이 유전자 RNA 코돈(Codon : 괘(卦))의 견지에서 Jacket 행렬의 분해를 통해 간단하고 명료함을 보인다.

A simplified matrix stiffness method for analysis of composite and prestressed beams

  • Deretic-Stojanovic, Biljana;Kostic, Svetlana M.
    • Steel and Composite Structures
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    • 제24권1호
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    • pp.53-63
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    • 2017
  • The paper presents the simplified matrix stiffness method for analysis of composite and prestressed beams. The method is based on the previously developed "exact" analysis method that uses the mathematical theory of linear integral operators to derive all relations without any mathematical simplifications besides inevitable idealizations related to the material rheological properties. However, the method is limited since the closed-form solution can be found only for specific forms of the concrete creep function. In this paper, the authors proposed the simplified analysis method by introducing the assumption that the unknown deformations change linearly with the concrete creep function. Adopting this assumption, the nonhomogeneous integral system of equations of the "exact" method simplifies to the system of algebraic equations that can be easily solved. Therefore, the proposed method is more suitable for practical applications. Its high level of accuracy in comparison to the "exact" method is preserved, which is illustrated on the numerical example. Also, it is more accurate than the well-known EM method.

점탄성 감쇠기가 설치된 고층건물의 효율적인 동적 해석 (Efficient Dynamic Analysis of Tall Buildings with Viscoelastic Dampers)

  • 김상태;홍성일;이동근
    • 한국지진공학회논문집
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    • 제1권3호
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    • pp.11-19
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    • 1997
  • 본 논문은 점탄성 감쇠기가 설치된 고층건물의 효율적인 동적 해석방법에 대한 연구이다. 점탄성 감소기가 건물의 진동을 적절히 제어하기 위하여 사용되고 있으며 이러한 점타성 감쇠기가 설치된 건물의 동적거동을 예측하기 위하여 적절한 해석방법이 필요하다. 해석의 효율성을 높이기 위해서 강막가정과 행렬의 응축기법을 적용할 수 있는데, 점탄성 감쇠가가 설치된 건물은 강막가정을 고려한 행렬의 응축기법을 쉽게 적용할 수 없다. 따라서 제안된 해석방법에 감쇠행렬의 새로운 응축방법을 사용하였다. 그리고 예제 건물의 해석을 통하여 해석방법의 정확한 효율성에 대하여 살펴 보았다.

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디지털 모델링 기법에 의한 1차원 연속계의 모드 해석 (Modal Analysis of One Dimensional Distributed Parameter Systems by Using the Digital Modeling Technique)

  • 홍성욱;조종환
    • 소음진동
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    • 제9권1호
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    • pp.103-112
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    • 1999
  • A new modeling and analysis technique for one-dimensional distributed parameter systems is presented. First. discretized equations of motion in Laplace domain are derived by applying discretization methods for partial differential equations of a one-dimensional structure with respect to spatial coordinate. Secondly. the z and inverse z transformations are applied to the discretized equations of motion for obtaining a dynamic matrix for a uniform element. Four different discretization methods are tested with an example. Finally, taking infinite on the number of step for a uniform element leads to an exact dynamic matrix for the uniform element. A generalized modal analysis procedure for eigenvalue analysis and modal expansion is also presented. The resulting element dynamic matrix is tested with a numerical example. Another application example is provided to demonstrate the applicability of the proposed method.

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전력계통의 확대상태행렬 고유치감도 해석 (Eigen-sensitivity Analysis of Augmented System State Matrix)

  • 심관식;남해곤;김용구
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 1996년도 하계학술대회 논문집 B
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    • pp.749-753
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    • 1996
  • This paper presents a new method for first and second order eigen-sensitivity analysis of system matrix in augmented form. Eigen-sensitivity analysis provides invaluable informations in power system planning and operation. However, conventional eigen-sensitivity analysis methods, which need all the eigenvalues and eigenvectors, can not be applicable to large scale power systems due to large computer memory and computing time required. In the proposed method, all sensitivity computations for a mode are carried out using the augmented system matrix and its own eigenvalue and right & left eigenvectors. In other words sensitivity analysis for a mode does not need informations on the other eigenvalues and eigenvectors and sparsity technique can be fully utilized. Thus compuations can be done very efficiently with moderate computer memory and computing time even for large power systems. The proposed algorithm is tested for one machine infinite bus system.

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에너지기술의 R&D 생산성 제고를 위한 포트폴리오 매트릭스 분석 (Portfolio matrix analysis for the improvement of R&D productivity in the energy technology sector)

  • 박년배;김경택;박상용;최상진;홍종철
    • 에너지공학
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    • 제29권3호
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    • pp.1-6
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    • 2020
  • 에너지 부문의 정부출연금 R&D 예산 지원을 받는 과제들을 대상으로, R&D 생산성을 제고하기 위한 목적으로 포트폴리오 매트릭스 분석을 하였다. 2018년에 27개 프로젝트(42개 세부기술)를 대상으로 활용가능성과 기술경쟁력 측면에서 5점 척도로 평가하였으며, 분석은 2회 실시하였다. 포트폴리오 매트릭스 분석 결과는 진행 중인 다양한 에너지기술 R&D 프로젝트들을 한꺼번에 조망하고, 개별 프로젝트의 발전전략을 수립하는 피드백 자료로 활용되는 한편, 포트폴리오 매트릭스의 4개 영역별로 R&D 생산성을 제고하기 위한 차별화된 관리 방향을 수립하는데 기여할 수 있다.

강성 저하된 적층복합판의 비선형 해석 (Non-linear Analysis of Laminated Composite Plates with Multi-directional Stiffness Degradation)

  • 한성천;박원태;이원홍
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제11권7호
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    • pp.2661-2669
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    • 2010
  • 본 연구에서는 매트릭스가 손상된 적층복합판의 비선형 거동을 분석하기 위한 일차전단변형이론에 기초한 유한요소 정식을 유도하였다. Duan and Yao가 제안한 Matrix 균열의 강성 치환 방법을 적용하여 다방향 강성저하식을 구성하였다. 발생된 Matrix 균열은 탄성계수, 전단탄성계수 및 프아송비의 변화로 표현할 수 있으며, 이를 이용하여 판의 국부 강성 변화를 예측할 수 있다. 가정된 자연변형률 방법을 적용한 쉘요소를 이용하여 면내 및 전단잠김 현상이 발생하지 않았다. 적층복합판의 선형해석은 물론 비선형 해석결과들은 참고문헌의 결과들에 수렴되었다. 매트릭스가 손상된 적층복합판의 해석 결과들은 향후 연구에 비교자료로 활용될 수 있을 것이다.