• 제목/요약/키워드: internal transcribed spacer(ITS)

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Molecular Taxonomical Re-classification of the Genus Suillus Micheli ex S. F. Gray in South Korea

  • Min, Young Ju;Park, Myung Soo;Fong, Jonathan J.;Seok, Soon Ja;Han, Sang-Kuk;Lim, Young Woon
    • Mycobiology
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    • 제42권3호
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    • pp.221-228
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    • 2014
  • The fungal genus Suillus Micheli ex S. F. Gray plays important roles in the survival and growth of plant seedlings. Humans have utilized these ectomycorrhizal fungi to enhance the nutrient uptake and defense systems of plants, particularly in the reforestation of coniferous forests. The genus Suillus is easily distinguishable by its distinctive morphological features, although the morphology of the fruiting body does not facilitate reliable interspecies discrimination. On the basis of micro-morphological features and internal transcribed spacer sequence analysis, we found that 51 of 117 Korean Suillus specimens had initially been misidentified. The list of the 12 Suillus species previously recorded in Korea was re-evaluated and revised to only eight distinct species: S. americanus, S. bovinus, S. granulatus, S. grevillei, S. luteus, S. pictus, S. placidus, and S. viscidus. We provide taxonomical descriptions for six of these species from the sample specimens.

표주박이끼(Funaria hygrometrica)에서 분리된 2종의 국내 미기록 내생균 (Two Unrecorded Endophytic Fungi Isolated from Funaria hygrometrica in Korea)

  • 최현숙;박혁;엄안흠
    • 한국균학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.313-318
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    • 2019
  • 표주박이끼의 헛뿌리(rhizoid)에서 내생균을 분리하였다. 분리된 균주는 형태적 특성 및 internal transcribed spacer, large subunit rDNA 영역의 분자적 분석을 토대로 동정하였다. 연구 과정에서 2종의 국내 미기록종 내생균 균주를 확인하였고, 확인된 종은 Curvularia protuberata, Didymella anserina이다. 미기록종 내생균 균주의 형태적 특성 및 계통 분석 결과에 대해 기술하였다.

감나무 잎에서 분리한 Phialocephala piceae에 대한 보고 (A New Report on Phialocephala piceae Isolated from Leaf of Diospyros kaki in Korea)

  • 박상규;이승열;이재진;강인규;이향범;정희영
    • 한국균학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.188-192
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    • 2016
  • 경상북도 상주시에 재식된 감나무 잎의 표면에서 국내 미기록종인 곰팡이를 분리하여 형태학적 및 계통학적 분석을 수행하였다. 분리된 곰팡이는 Phialocephala piceae의 형태적 특징인 암갈색 균총과 굵고 짧은 분생자경 유사조직을 관찰할 수 있었다. Phialocephala속의 동정에 사용되는 internal transcribed spacer 영역과 RNA polymerase II largest subunit 유전자를 이용한 계통학적 분석을 통해 해당균이 P. piceae임이 확인되었고, 이를 통해 최초로 국내에 P. Piceae가 존재함을 보고하였다.

구상나무의 잎에서 분리한 두 종의 국내 미기록 내생균 (Two Unreported Species of Endophytic Fungi Isolated from Leaves of Abies koreana in Korea)

  • 박혁;김동여;엄안흠
    • 한국균학회지
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    • 제46권1호
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    • pp.22-27
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    • 2018
  • 제주도 한라산 구상나무의 잎에서 내생균을 분리하여 다양성을 확인하는 과정에서 두 종의 국내 미기록 균주를 확인하였다. 분리된 균주는 형태적 특징과 internal transcribed spacer (ITS) 지역, large subunit (LSU) rDNA 지역 염기서열의 계통분석을 통해 동정하였다. 확인된 두 미기록종 균주는 Coleophoma parafusiformis와 Coniochaeta ligniaria이며, 두 균주에 대한 형태적 특징과 염기서열의 분석 결과를 제시하였다.

제주지역 수생식물에서 발굴된 Sordariomycetes강 균류 3종의 국내 최초 보고 (New Records of Three Sordariomycetes Fungi Isolated from Aquatic Plants in Jeju, Korea)

  • 오유선;문혜연;고재덕;정남일
    • 한국균학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.91-97
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    • 2018
  • 본 연구에서는 제주 습지 환경에서 채집한 수생식물에서 내생균류를 분리하였다. 분리된 균을 형태학적 특징과 internal transcribed spacer 영역의 염기서열 분석을 통하여 동정한 결과, NNIBRFG2982, NNIBRFG2984, NNIBRFG3040 균주는 각각 Acremonium tubakii, Colletotrichum cliviae, Cylindrocarpon pauciseptatum으로 확인되었다. 이들 3종의 균류는 Ascomycota문의 Sordariomycetes강에 속하는 균류로 국내 미기록종으로 보고하는 바이다.

목본식물 잎에서 분리된 Phyllosticta 속의 국내 미기록종 내생균 (Unrecorded Endophytic Fungi Belonging to Genus Phyllosticta Isolated from Leaves of Woody Plants)

  • 박혁;이종철;권주희;이향범;엄안흠
    • 한국균학회지
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    • 제49권1호
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    • pp.81-86
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    • 2021
  • 전남 여수 금오산의 청미래덩굴 잎과 경남 통영 한산도의 삼나무 침엽을 표면살균하여 내생균을 분리하였다. 분리된 균주는 internal transcribed spacer (ITS), large subunit rDNA (LSU), translation elongation factor 1-α DNA (TEF)의 염기서열을 이용한 계통분석 및 형태적 특성을 이용하여 동정하였다. 본 연구에서 Phyllosticta 속에 속하는 두 종의 국내 미기록종 내생균이 확인되었으며, 확인된 종은 Phyllosticta ericaum과 Phyllosticta philoprina이다. 두 종의 내생균 균주에 대해 형태적 특성 및 계통분석의 결과를 보고하고자 한다.

유전자증폭반응 기법을 이용한 홍조류 잔금분홍잎 및 누은분홍잎의 구별 (Discrimination of Two Red Algae Acrosorium polyneurum and A. yendoi Using Polymerase Chain Reaction Technique)

  • 김용국;진형주;김영식;박중연;남기완;홍용기
    • 한국수산과학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.585-588
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    • 1997
  • The polymerase chain reaction (PCR) technique was used to distinguish from two morphologically similar red algal species; Acrosorium polyneurum and A. yendoi. Total DNA was extracted by the LiCl method. The extracted DNA (15 ng) in a $25{\mu}\ell$ reaction volume was amplified by the PCR technique using primers covering with mitochondrial D-loop gene, nuclear rDNA internal transcribed spacer (ITS), and nuclear rDNA external transcribed spacer. A. yendoi could be distinguished from A. polyneurum on the producible basis of amplified ITS fragment of 650 bp.

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ITS 영역 증폭에 의한 소나무 송이균 뿌리 감염 확인 및 RAPD에 의한 타 균근과의 비교 (Identification of Tricholoma matsutake in a Pine Root by ITS Region Amplification and RAPD Analysis with Different Mycorrhiza)

  • 김명길;유선화;박원철;박현;가강현;손희경
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제34권6호
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    • pp.96-103
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    • 2006
  • 대량 배양된 송이 균사를 배양병 안에 있는 소나무에 접종한 접종묘를 실시하였는데, 접종묘 내 소나무 뿌리내로 송이 균사가 침투하여 감염이 되었는지를 판별하는 방법으로 ITS (Internal transcribed spacer) 영역에서 특이 primer set인 ITS1-ITS4 (TCCGTAGGTGAACCTGCGG/TCCTCCGCTTATGATATGC)를 선택하여 정하고, 그를 바탕으로 홍천 시험지(강원도 홍천군 동면 노천리)와 홍릉수목원(서울시 동대문구 청량리 2동) 내에서 수집한 다른 균근과 비교하고자 RAPD (Rapid Amplified Polymorphic DNA) 기법으로 각 6종, 10 종의 균근을 동정하였다.

Phylogenetic Relationships of Ulva and Enteromorpha Inferred from nrDNA Internal Transcribed Spacer2 Sequences

  • Kang, Sae-Hoon;Lee, Ki-Wan
    • 한국어업기술학회:학술대회논문집
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    • 한국어업기술학회 2001년도 추계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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    • pp.303-304
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    • 2001
  • The family Ulvaceae species are difficult to distinguish from one another on the basis of morphological and cytological criteria alone. ITS2 sequences are hewn to evolve quickly and have been reported to be useful for the study of intraspecific and interspecific variation and biogeography in algae (Bakker et al., 1992). We will here describe the basic characteristics of the ITS2 sequences in Ulva and Effteromorpha to compare our result with the above previous studies. (omitted)

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Characterization of Rhizodermea veluwensis Isolated from the Roots of Rhododendron mucronulatum in Korea

  • Park, Hyeok;Eom, Ahn-Heum
    • 한국균학회지
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    • 제45권2호
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    • pp.102-106
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    • 2017
  • A fungal strain was isolated from surface-sterilized roots of Rhododendron mucronulatum, a plant species belonging to the Ericaceae family, collected from Mt. Minjujisan, Korea. This fungal strain was identified as Rhizodermea veluwensis based on its morphological characteristics and based on phylogenetic analysis of its internal transcribed spacer regions and large-subunit rDNA. R. veluwensis has not been previously reported in Korea, and for the first time, we report and describe it herein.