Kim, Sunghyun;Ma, Pan-Gon;Park, Young-Seok;Yu, Young-Bin;Hwang, Kyu Jam;Kim, Young Kwon
Biomedical Science Letters
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v.23
no.3
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pp.223-229
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2017
Fungal infections by human pathogenic fungi are increasing globally in elderly, children and immune suppressed or deficient patients. Aspergillus fumigatus is one of the well-known pathogenic fungi and causes aspergilloses in human world widely. However, current identification and classification methods based on its phenotypic characteristics still have limitations. Therefore, currently, molecular biological tools using their DNA sequences are used for genotype identification and classification. In the present study, in order to analyze genetic variations of A. fumigatus clinical isolates, a total of six housekeeping genes were amplified by PCR using specific primer pairs and multi-locus sequence typing (MLST) assay. Results from phylogenetic tree analysis showed that most A. fumigatus strains (88.9%) from respiratory specimens were classified into cluster A and B, and approximately half of A. fumigatus strains (46%) from non-respiratory specimens were classified into cluster C and D. Although the sample size was limited, genetic characteristics of A. fumigatus clinical isolates according to their origins were very similar and well-correlated with other clinical data.
[ $(+)-Lyoniresinol-3{\alpha}-O-\beta-D-glucopyranoside$ ] (1) was isolated from an ethyl acetate extract of the root bark from Lycium chinense Miller, and its structure was determined using 1D and 2D NMR spectroscopy including DEPT, HMQC, and HMBC. $(+)-Lyoniresinol-3{\alpha}-O-\beta-D-glucopyranoside$ exhibited potent antimicrobial activity against antibiotic-resistant bacterial strains, methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolated from patients, and human pathogenic fungi without having any hemolytic effect on human erythrocytes. In particular, compound 1 induced the accumulation of intracellular trehalose on C. albicans as stress response to the drug, and disrupted the dimorphic transition that forms pseudo-hyphae caused by the pathogenesis. This indicates that $(+)-Lyoniresinol-3{\alpha}-O-\beta-D-glucopyranoside$ has excellent potential as a lead compound for the development of antibiotic agents.
This study was performed to screen antimicrobial activities of 198 extracts from 66 Korean mushrooms against 19 human pathogenic microorganisms using paper disc method. Mushrooms were extracted with petroleum ether 80% ethanol and distilled water in that order Among the extracts with antimicrobial activities, 1 water extract of Amanita virgineoides, 8 ethanolic extracts including Amanita and 1 petroleum ether extrac of Psathyrella hydrophila were highly active against fungi, respectively. In addition to, 24 extracts including Amanita pseudoporphyria, Amanita spissacea, 3 extaracts including Paxillus curtisii were highly active against Gram negative and positive bacteria, respectively.
For the control of pathogenic microorganisms, Bacillus spp. were isolated from diseased pepper fruits in Korea. Among them, Bacillus sp. IUB158-03 showed high inhibitory effect on mycelial growth and spore germination of C. gloeosporioides and Botrytis cinerea. The strain was identified as B. amyloliquefaciens IUB158-03 based on its physiological, biochemical characteristics and Microlog analysis. The highest level of antifungal substances by B. amyloliquefaciens IUB158-03 were obtained when the bacterium was cultured in medium containing 2% soluble starch, 3% yeast extract, 0.5% tryptone, 0.5% $NH_4H_2PO_4$, and 1% NaCl (pH 6.0) at $25^{\circ}C$ for 72 hrs. The antifungal substances were purified by butanol extraction, silica gel column chromatography, preparative thin layer chromatography, and high performance liquid chromatography. The purified antifungal substance was confirmed $R_f$ 0.27 by TLC. This substance exhibited antifungal activity against Fusarium solani, Rhizoctonia solani, Botrytis cineria, Alternata alternaria of plant pathogenic fungi and Trichophyton mentagrophytes, Epidermophyton floccosum, Cryptococcus neoformans of human pathogenic fungi.
Kim, Dong-Wook;Bang, Kyu-Ho;Rhee, Young-ha;Lee, Kyung-Tae;Park, Hee-Juhn
Archives of Pharmacal Research
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v.21
no.6
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pp.688-691
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1998
Antifungal activities of the compounds isolated from Kalopanax pictus against representative fungi of dermatomycosis were investigated using paper disc diffusion method. It was found that kalopanaxsaponins A and I were effective in inhibiting the growth of Candida albicans KCTC 1940 and Cryptococcus neoformans KCTC 7224 with minimum inhibitory concentration(MIC) of 25${\mu}g$/ml. It showed that antifungal activity of both compounds have strong selectivity against the fungi of dermatomycosis.
Kim, Min-Ho;Baek, Ki-Ook;Park, Gyeong-Gook;Jang, Je-Youn;Lee, Jin-Hong
Safety and Health at Work
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v.11
no.4
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pp.517-525
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2020
Background: The study was planned to show the status of indoor microorganisms and the status of the reduction device in the military dog clinic. Methods: Airborne microbes were analyzed according to the number of daily patient canines. For identification of bacteria, sampled bacteria was identified using VITEK®2 and molecular method. The status of indoor microorganisms according to the operation of the ventilation system was analyzed. Results: Airborne bacteria and fungi concentrations were 1000.6 ± 800.7 CFU/m3 and 324.7 ± 245.8 CFU/m3. In the analysis using automated identification system, based on fluorescence biochemical test, VITEK®2, mainly human pathogenic bacteria were identified. The three most frequently isolated genera were Kocuria (26.6%), Staphylococcus (24.48%), and Granulicatella (12.7%). The results analyzed by molecular method were detected in the order of Kocuria (22.6%), followed by Macrococcus (18.1%), Glutamicibacter (11.1%), and so on. When the ventilation system was operated appropriately, the airborne bacteria and fungi level were significantly decreased. Conclusion: Airborne bacteria in the clinic tend to increase with the number of canines. Human pathogenic bacteria were mainly detected in VITEK®2, and relatively various bacteria were detected in molecular analysis. A decrease in the level of bacteria and fungi was observed with proper operation of the ventilation system.
Root of Asarum sieboldii has been used in chinese medicine. It was been known that the extract of A. sieboldii has medicinal effect such as antifebrile, anodyne, and anti-inflammatory. Antifungal activity of the essential oil extracted from A. sieboldii against various epiderman and opportunistic human pathogenic fungi was investigated. Steam-distillated essential oil demonstrated very high antifungal activity against Aspergillus fumigatus, Aspergillus niger, Cryptococcus neoformans, and Candida albicans. MIC (minimum inhibitory concentration) of the essential oil against C. albicans was 5 ul/ml, indicating that the essential oil may be used as natural preserves for cosmetic and nutritional products.
Babu, A. Giridhar;Kim, Sang Woo;Yadhav, Dil Raj;Adhikari, Mahesh;Kim, Changmu;Lee, Hyang Burm;Lee, Youn Su
Mycobiology
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v.42
no.4
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pp.397-400
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2014
Pseudallescheria boydii KNU13-2 was isolated from crop field soil and identified by analysis of internal transcribed spacer regions of rDNA and morphological characteristics. In the literature, P. boydii has been mentioned as a human pathogen. This is the first record of P. boydii isolated from crop field soil in Korea.
An antifungal antibiotic-producing strain, BCNU 2003, was isolated from forest soil in Korea. The morphological and physiological characters, and 16S rRNA sequences analysis of strain BCNU 2003 identified this strain as Bacillus genus. The Bacillus sp. BCNU 2003 showed strong antifungal activities against Aspergillus niger, Trichophyton mentagrophytes and Trichophyton rubrum with inhibition ranging from 62.05 to 63.49% by using dual culture technique. Bacillus sp. BCNU 2003 produced a maximum level of antifungal substances under aerobic incubation at 28oC and pH 6.5-7.2 for 6 days in LB broth. Ethyl acetate extract of the cultured broth showed strong antifungal activity and a broad antifungal spectrum against various pathogenic fungi. The minimum inhibitory concentration (MIC) values for its active extracts ranged between 0.0625 mg/ml and 1 mg/ml. In addition, Bacillus sp. BCNU 2003 was determined to have the ability to produce enzymes such as amylase, protease, gelatinase and catalase.
Strain BCNU 5011 was isolated from forest soil samples collected in the Taebaek mountain in the Gangwon province, Korea. The biochemical, physiological and 16S rRNA sequence analysis strongly indicated that this isolate was most closely related to Paenibacillus polymyxa. A maximum production level of antimicrobial substances of Paenibacillus sp. BCNU 5011 was achieved under aerobic incubation at $30^{\circ}C$ for 3 days in SST broth.Paenibacillus sp. BCNU 5011 showed a broad spectrum of activity against Gram positive and Gram negative bacteria, including methicllinresistant Staphylococcus aureus (MRSA). Paenibacillus sp. BCNU 5011 was also shown to inhibit the growth of different potential human pathogenic bacteria and fungi in vitro. Peptide extract showed better antimicrobial activity than solvent extracts. But active antimicrobial compounds might be included in both peptide extract and solvent extracts. Further separation, purification and identification of active principles leads project to develop antimicrobial agents and anti-MRSA agents.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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