풀무치(Locusta migratoria)는 벼과 작물(벼, 옥수수 등)에 큰 피해를 주는 세계적으로 유명한 메뚜기목 해충의 하나로서 밀도요인에 따라 형태와 행동적으로 구별되는 단독형(solitaria)과 군집형(gregaria)을 나타낸다. 풀무치는 전세계적으로 다양한 형태적인 변이가 알려져 있으나 최근의 분자생물학적 연구에 따르면 2가지 계통, 즉 남방계통(아프리카, 남유럽, 동남아시아, 호주)과 북방계통(동아시아, 유라시아)으로 나뉜다. 2014년 8월 전남 해남군 산이면에서 군집형 약충들이 대발생하여 주변 잡초 및 작물(벼, 기장)에 큰 피해를 주었다. 우리나라에서 군집형 풀무치의 발생에 대한 명확한 학술적 보고는 이번이 처음이다. 해남지역의 풀무치 대발생 지점에서 채집한 풀무치 12개체의 COI 염기서열을 분석한 결과, 0.0%-0.9%의 유전적 변이를 보였으며, 모두 북방계통에 속했다.
We analyzed seven Y chromosome binary markers (YAP, RPS4Y_711,\;M9,\;M175,\;LINE1,\;SRY_+465$ and 47z) in samples from a total of 254 males from Koreans and tow Mongolian ethnic groups (Buryat and Khalkh) to study the genetic relationship among these populations. We found eight distinct Y haplogroups constructed from the seven binary markers. Haplogroup DE-YAP was present at extremely low frequencies (∼2%) in the Korean and Mongolian populations. This result is consistent with earlier reports that showed the YAP+ chromosomes to be highly polymorphic only in populations from Japan and Tibet in east Asia. The observed high frequency of haplogroup $C-RPS4Y_711$ in the Mongolian populations (∼40%) is concordant with recent findings, showing that the $RPS4Y_711$-T chromosomes were distributed at high frequencies in Siberian and Mongolian populations compared with most other populations from east Asia. Thus, the relatively moderate frequency of haplogroup $C-RPS4Y_711$ in Korean (∼15%) can be seen as genetic evidence for probable interaction with Mongolian and/or Siberian populations. In contrast, the majority (∼75%) of modern Koreans studied here had high frequencies of Y chromosome lineages of haplogroup O-M175 and additional haplogroupts that define sublineage of O-M175, which are most likely related with modern populations in China. In conclusion, our data on the Y chromosome haplogroup distribution may provide evidence for interaction between Korean and Mongolian populations, but Korean tend to be much more related with those from southern-to-northern populations of China than to Mongolians in east Asia.
Sugar beet (Beta vulgaris L.) is known as a key product for agriculture in several countries across the world. Beet soil-borne virus (BSBV) triggers substantial economic damages to sugar beet by reducing the quantity of the yield and quality of the beet sugars. We conducted the present study to report the complete genome sequences of two BSBV isolates in Turkey for the first time. The genome organization was identical to those previously established BSBV isolates. The tripartite genome of BSBV-TR1 and -TR3 comprised a 5,835-nucleotide (nt) RNA1, a 3,454-nt RNA2, and a 3,005-nt RNA3 segment. According to sequence identity analyses, Turkish isolates were most closely related to the BSBV isolate reported from Iran (97.83-98.77% nt identity). The BSBV isolates worldwide (n = 9) were phylogenetically classified into five (RNA-coat protein read through gene [CPRT], TGB1, and TGB2 segments), four (RNA-rep), or three (TGB3) lineages. In genetic analysis, the TGB3 revealed more genetic variability (Pi = 0.034) compared with other regions. Population selection analysis revealed that most of the codons were generally under negative selection or neutral evolution in the BSBV isolates studied. However, positive selection was detected at codon 135 in the TGB1, which could be an adaptation in order to facilitate the movement and overcome the host plant resistance genes. We expect that the information on genome properties and genetic variability of BSBV, particularly in TGB3, TGB1, and CPRT genes, assist in developing effective control measures in order to prevent severe losses and make amendments in management strategies.
Siberian flying squirrel, an endangered species in South Korea, is distributed through major mountain regions of South Korea. The number of Siberian flying squirrel(Pteromys volans) in South Korea has decreased and their habitats are fragmented and isolated because of anthropogenic activities. So far no molecular genetic data has, however, been available for their conservation and management. To obtain better information concerning genetic diversity and phylogenetic relationships of the Siberian flying squirrel in South Korea, we examined 14 individuals from South Korea, 7 individuals from Russia, and 5 individuals from northeastern China along with previously published 29 haplotypes for 1,140 bp of the mtDNA cytochrome b gene. The 14 new individuals from South Korea had 7 haplotypes which were not observed in the regions of Russia and Hokkaido. The level of genetic diversity(0.616%) in the South Korean population was lower than that in eastern Russia(0.950%). The geographical distribution of mtDNA haplotypes and reduced median network confirmed that there are three major lineages of Siberian flying squirrel, occupying; Far Eastern, northern Eurasia, and the island of Hokkaido. The South Korean population only slightly distinct from the Eurasia, and eastern Russian population, and is part of the lineage Far Eastern. Based on these, we suggest that the South Korean population could be considered to belong to one partial ESU(Far Eastern) of three partial ESUs but a different management unit. However, the conservation priorities should be reconfirmed by nuclear genetic marker and ecological data.
한국 동해안의 가장 대표적인 연어과 어류인 연어(Oncorhynchus keta)의 집단 분석을 위한 연구가 국내에서는 많이 수행되지 않았다. 최근 연어과 어류의 계군을 분석하는데 유전자를 이용하는 방법들이 시도되고 있으며, 단일염기다형성(SNP)을 이용한 집단 구분 방법이 점차 많이 이용되고 있다. 본 연구에서는 한국 연어의 소상하천간 유전적 유사성과 차이점 및 일본 연어와 유전적 관계를 살펴 보기 위하여, 미토콘드리아의 COIII-ND3-ND4L 지역 720 bp 염기 서열을 분석하였다. 한국의 3개 지역(고성 북천, 양양 남대천, 울진 왕피천)에서 채집된 108개체와 일본의 2개 지역(홋카이도의 마시케와 하코다데)에서 채집된 44개체를 분석하여 29개의 haplotype을 확인하였다. 유전적 다양성은 남대천 연어에서 가장 높고 하코다데에서 가장 낮았다. Pairwise $F_{ST}$와 AMOVA를 이용한 집단 분석 결과, 한국 연어는 소상하천간 유전적 차이가 거의 없으며 일본 연어와도 크게 구분되지 않았다($F_{ST}<0.07$). 그러나, haplotype 유사성으로 본 각 개체의 유전적 관계는 한국 연어의 일부(약 25%)가 일본 연어와 구분되는 독특한 유전적 가계(lineage)를 형성하고 있으며, 국내 남대천과 북천 연어에는 왕피천과 구분되는 연어 가계가 존재함을 보여준다.
Despite the broad distribution of leishmaniasis among Iranians and animals across the country, little is known about the genetic characteristics of the causative agents. Applying both HSP70 PCR-RFLP and sequence analyses, this study aimed to evaluate the genetic diversity and phylogenetic relationships among Leishmania spp. isolated from Iranian endemic foci and available reference strains. A total of 36 Leishmania isolates from almost all districts across the country were genetically analyzed for the HSP70 gene using both PCR-RFLP and sequence analysis. The original HSP70 gene sequences were aligned along with homologous Leishmania sequences retrieved from NCBI, and subjected to the phylogenetic analysis. Basic parameters of genetic diversity were also estimated. The HSP70 PCR-RFLP presented 3 different electrophoretic patterns, with no further intraspecific variation, corresponding to 3 Leishmania species available in the country, L. tropica, L. major, and L. infantum. Phylogenetic analyses presented 5 major clades, corresponding to 5 species complexes. Iranian lineages, including L. major, L. tropica, and L. infantum, were distributed among 3 complexes L. major, L. tropica, and L. donovani. However, within the L. major and L. donovani species complexes, the HSP70 phylogeny was not able to distinguish clearly between the L. major and L. turanica isolates, and between the L. infantum, L. donovani, and L. chagasi isolates, respectively. Our results indicated that both HSP70 PCR-RFLP and sequence analyses are medically applicable tools for identification of Leishmania species in Iranian patients. However, the reduced genetic diversity of the target gene makes it inevitable that its phylogeny only resolves the major groups, namely, the species complexes.
현재, 유전자의 in vivo 기능을 연구하기 위해 가장 많이 이용되고 있는 transgenic mice를 생산하기 위한 기본적으로 이용되고 있는 방법이 one cell-stage embryo에 pronuclear microinjection (PMI)이다. 그러나, 이 PMI 후에 one cell-stage embryo들의 생존율은 현저히 감소 (65.4%)할 뿐만 아니라 PMI 후의 embryo의 출생률(26.4%)이 PMI 처리를 하지 않은 것 (41.9%) 보다 현저히 낮다. 더욱이, PMI 방법에 의해 태어난 transgenic founder들의 간 조직에 병리학적 변화가 14.8% 정도에 대해서 같은 한배의 새끼 non-transgenic founder들의 경우도 간 조직에 병리학적 변화가 14.3%로 나타났다. 결론적으로, 이 PMI 방법에 의한 염색체에 물리적 손상은 형질전환 마우스의 생산 및 표현형에 영향을 미치는 잠재적 요소로 생각된다.
The phylogeny and geography of the medaka (Oryzias latipes) populations of Korea were investigated by analyzing sequence data for the mitochondrial control region. From the 41 haplotypes including 25 Korean haplotypes detected in 64 Korean specimens and data for the Japanese and Chinese populations, phylogenetic and nested clade analyses were executed to examine the phylogeny of haplogroups and the relation of the genetic architecture of the haplotypes to the historical geography of the Korean medaka fish. The analyses suggest that there are two very distinct lineages of Korean medaka, and that these result from reproductive isolation mechanisms due to geographic barriers. The southeastern lineage has experienced recent range expansion to the western region. The northwestern lineage, sister to Chinese populations, showed evidence of internal range expansion with shared haplotypes.
Restoration ecology is undergoing rapid growth as academic field over the last 15 years. The specification of goals for restoration projects is frequently described as the most important component of a project. The endeavor for universal development of goals for ecological restoration continues to generate many discussion and controversy. I discuss the importance of restoration goals and diverse roots of restoration ecology, and show how the complex lineages within restoration ecology. I review the three major theme that currently are used to develop the restoration goals : restoration of species, restoration of whole ecosystem or landscapes, and the restoration of ecosystem services. Restoration ecology, landscape ecology and conservation biology share goals to conserve biodiversity, but differ in focus of approach. I review the differences among three fields. Conservation biology has been more zoological, more descriptive, and theoretical, and more emphasized the population and genetic research. However, restoration ecology has been more plant ecological, more experimental, and emphasized the community and plant succession. Landscape ecology has emphasized the interaction of ecosystem and dispersal among populations. I suggest the integration of restoration ecology, landscape ecology and conservation biology. For example, conservation biology will contribute to the preservation of original habitats by population study, restoration ecology will contribute to regenerate damaged ecosystem and ex situ preservation, and landscape ecology will contribute to restoration of population and landscape.
Horizontal gene transfer (HGT) is the movement of genetic material between kingdoms and is considered to play a positive role in adaptation. $Cryptosporidium$$parvum$ is a parasitic protozoan that causes an infectious disease. Its genome sequencing reported 14 bacteria-like proteins in the nuclear genome. Among them, cgd2_1810, which has been annotated as CysQ, a sulfite synthesis pathway protein, is listed as one of the candidates of genes horizontally transferred from bacterial origin. In this report, we examined this issue using phylogenetic analysis. Our BLAST search showed that $C.$$parvum$ CysQ protein had the highest similarity with that of proteobacteria. Analysis with NCBI's Conserved Domain Tree showed phylogenetic incongruence, in that $C.$$parvum$ CysQ protein was located within a branch of proteobacteria in the cd01638 domain, a bacterial member of the inositol monophosphatase family. According to Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway, the sulfate assimilation pathway, where CysQ plays an important role, is well conserved in most eukaryotes as well as prokaryotes. However, the Apicomplexa, including $C.$$parvum$, largely lack orthologous genes of the pathway, suggesting its loss in those protozoan lineages. Therefore, we conclude that $C.$$parvum$ regained cysQ from proteobacteria by HGT, although its functional role is elusive.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.