• 한국임상약학회지
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• 제22권4호
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• pp.340-346
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• 2012

Background: Amphotericin B is a mainstay in the treatment of many systemic fungal infections due to its wide antifungal spectrum and low incidence of resistance. However, the use of amphotericin B is limited by its nephrotoxicity. Objectives: The objective of this study was to evaluate the incidence and risk factors of renal adverse drug reactions (ADRs) of conventional amphotericin B (Fungizone$^{(R)}$). In addition, we compared the changes of serum creatinine (SCr) between patients who remained conventional amphotericin B and patients who were switched to liposomal amphotericin B after occurrence of renal adverse reactions. Methods: Adult hospitalized patients who reported renal adverse reactions caused by conventional amphotericin B from January 2011 to July 2012 at pharmacovigilance center in Yonsei University Healthcare System included in this study. ADRs scored as 'doubtful' in Naranjo probability ADR scale were excluded. We retrospectively analyzed patients' basic clinical characteristics, concurrent diseases or nephrotoxic drugs in order to find variables that can correlate with occurrence of renal ADRs. Changes in SCr were compared between conventional amphotericin B group and liposomal amphotericin B group. Results: A total of 231 ADRs after administration of conventional amphotericin B in 75 patients were reported to pharmacovigilance center and assessed their severities as 'possible', 'probable', or 'definite'. Renal adverse reaction was the most common ADR with incidence rate of 42% (96 of 231 ADRs). Mean change in SCr from baseline was 0.26 mg/dL (change % 37.8) and statistically significant (p=0.000). Simple correlations analysis revealed that the number of concurrent diseases and number of nephrotoxic drugs were positively correlated with changes in SCr, but these results were not statistically significant. Among 43 patients who remained amphotericin B after occurrence of renal ADRs, 27 patients was administered conventional amphotericin B and 16 patients changed to liposomal amphotericin B. Mean change in SCr in amphotericin B group was 0.23 mg/dL (32.75%), whereas mean change in SCr in liposomal amphotericin B group were -0.28 mg/dL (19.38%) and difference between two groups was statistically significant (p=0.003). The numbers of patient with SCr elevation more than 30% were 9 (33.3%) in amphotericin B group and 2 (12.5%) in liposomal amphotericin B group (Odd Ratio=3.50, 95% Confidence Interval 0.65-18.85; p=0.130). Conclusion: An analysis of ADRs due to amphotericin B administration revealed significant mean changes in SCr from baseline. Switching to liposomal amphotericin B showed significant decrease in SCr compared with conventional amphotericin B.

• 생명과학회지
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• 제22권1호
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• pp.110-116
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• 2012

누룩은 탁주와 약주의 제조를 위한 당화효소와 알코올발효를 위한 미생물의 공급원으로서 제품의 맛과 품질을 결정하는 중요한 역할을 한다. 본 연구에서는 산성누룩의 세균과 진균의 다양성을 조사하기 위해 순수분리 종과 16S 및 28S rRNA gene를 대상으로 한 PCR-DGGE를 이용한 분석을 수행하였다. 누룩 내 세균의 수는 $2.7{\times}10^9$ CFU/g이었으며 순수분리와 PCR-DGGE 분석에서 우점종은 Kocuria spp., Pantoea spp., Lactobacillus spp., Pediococcous spp., Weissella spp., Staphylococcus spp. 그 외 endophytic bacterium, uncultured gamma-proteobacteria, uncultured Cyanobacteria와 Actinobacteria였다. PCR-DGGE profile에서 주된 우점종은 Pediococcous pentosaceus와 uncultured Cyanobacteria 이었다. 누룩 내 진균의 수는 $3.5{\times}10^8$ CFU/g이었으며 순수분리와 PCR-DGGE 분석에서 우점종은 Trichomonascus spp., Pichia spp., Torulaspora spp., Wickerhamomyces spp., Sacharomycopsis spp., Lichtheimia spp., Mucor spp., Rhizopus spp., Aspergillus spp., Cladosporium spp.였다. PCR-DGGE profile에서 주된 우점종은 Pichia kudriavzevii와 Aspergillus oryzae이었다. PCR-DGGE 기술은 본 연구에서 누룩의 미생물군집을 평가하기 위해 처음으로 사용되었으며 미생물 다양성을 설명하는 데 효과적임을 입증하였다.

• Mycobiology
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• 제47권4호
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• pp.449-456
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• 2019

Invasive fungal infections caused by Cyberlindnera fabianii have recently increased. However, biochemical kits such as API 20 C AUX and Vitek-2C have misidentified this species as other Candida spp. such as C. pelliculosa or C. utilis due to no information of Cy. fabianii in yeast database. During our 2016-2017 surveys, eleven isolates of Cy. fabianii were obtained in International St. Mary's Hospital in Korea. Here, we describe its morphological and molecular characteristics and tested its antifungal susceptibility against nine antifungal agents. The sequences of the ITS region and the D1/D2 region of LSU revealed 100% identity with the sequences of Cy. fabianii. In comparison with the results from MALDI-TOF mass spectrometry, we found that Cy. fabianii can be distinguished from other species. In antifungal susceptibility test, voriconazole and echinocandins exhibited good antifungal activities against the majority of Cy. fabianii isolates despite the absence of standard criteria.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제51권3호
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• pp.269-277
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• 2013

Amoebic keratitis (AK) caused by Acanthamoeba is one of the most serious corneal infections. AK is frequently misdiagnosed initially as viral, bacterial, or fungal keratitis, thus ensuring treatment delays. Accordingly, the early detection of Acanthamoeba would contribute significantly to disease management and selection of an appropriate anti-amoebic therapy. Recently, the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method has been applied to the clinical diagnosis of a range of infectious diseases. Here, we describe a rapid and efficient LAMP-based method targeting Acanthamoeba 18S rDNA gene for the detection of Acanthamoeba using clinical ocular specimens in the diagnosis of AK. Acanthamoeba LAMP assays detected 11 different strains including all AK-associated species. The copy number detection limit for a positive signal was 10 DNA copies of 18S rDNA per reaction. No cross-reactivity with the DNA of fungi or other protozoa was observed. The sensitivity of LAMP assay was higher than those of Nelson primer PCR and JDP primer PCR. In the present study, LAMP assay based on directly heat-treated samples was found to be as efficient at detecting Acanthamoeba as DNA extracted using a commercial kit, whereas PCR was only effective when commercial kit-extracted DNA was used. This study showed that the devised Acanthamoeba LAMP assay could be used to diagnose AK in a simple, sensitive, and specific manner.

• 생명과학회지
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• 제30권2호
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• pp.122-128
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• 2020

Candida albicans가 칸디다 혈증의 주요 원인 균으로 알려져 있지만, 최근에는 non-albicans Candida (NAC)에 의한 심각한 감염이 증가하고 있다. NAC 중에서 C. glabrata는 두 번째로 병원성을 나타내는 원인 균이지만 C. glabrata의 구조, 역학 등의 기본적인 연구는 거의 없는 실정이다. 따라서 본 연구에서는 다양한 유형의 임상 표본으로부터 분리된 총 102개의 C. glabrata균주로 multi-locus sequence typing (MLST)을 수행하였다. FKS, LEU2, NMT1, TRP1, UGP1 및 URA3을 포함한 6개의 하우스키핑 유전자를 증폭하여 염기서열을 분석하였다. 총 3,345개의 DNA 염기서열 중 49개의 가변 염기서열 부위가 발견되었으며, 그 결과 102개의 균주에서 총 12개의 상이한 서열 유형을 확인하였고, 알려지지 않은 서열 유형(USTs) 중 UST1이 가장 많이 나타났다. 이 연구의 결과는 국내 C. glabrata 항생제 처방에 도움이 될 것으로 사료되며, 한국에서 유행하는 C. glabrata에 대한 추가 연구를 위한 기본 역학자료로 사용될 것으로 기대한다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제33권5호
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• pp.383-388
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• 2018

본 연구에서는, 표고버섯 균사체 발효 생물전환공법으로 생산된 미강생물전환소재(BPP-RB)가 가금티푸스의 주요 원인균인 S. Gallinarum에 감염된 닭 유래 대식세포주 HD-11에 미치는 효과를 조사하였다. 그 결과, 미강생물전환소재 추출액은 S. Gallinarum 277에 대한 직접적인 성장억제 효과를 보여주지 않았으며, 총단백질 및 분비단밸질 발현 양상에 어떠한 변화도 유도하지 못하였다. 하지만, 미강생물전환소재 추출액은 (i) HD-11 대식세포의 탐식 능력(phagocytic activity)을 활성화하였고, (ii) Th1-type cytokines(tumor necrosis factor-${\alpha}$, interleukin $(IL)-1{\beta}$, iNOS)과 immunosuppressive cytokine IL-10의 발현 증가를 유도하였으며, (iii) Th2-type cytokines (IL-4, IL-6)의 발현은 감소시키는 것으로 확인되었다. 이러한 결과를 종합하면, 미강생물전환소재는 가금 농장에서 가금티푸스 및 다른 Salmonella종의 감염을 예방하기 위한 사료첨가제로서의 가능성을 가지고 있다고 사료된다.

• 생명과학회지
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• 제25권7호
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• pp.833-838
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• 2015

다제약제 내성을 가지는 슈퍼 박테리아, 곰팡이, 바이러스, 기생충 감염은 주요한 건강위협인자들이다. 하지만, 건강위협 상황을 극복하기위해 현재 약제의 대안들중 항생펩타이드를 들 수 있다. 항생펩타이드는 자연계 다양한 종에서 생산된다. 항생펩타이드는 작은 단백질로 어류, 양서류, 파충류, 식물 그리고 동물의 감염으로부터 다세포생명체를 보호하는 선천성 면역에 관여하고 있다. 1980년대 이후로 매년 항생펩타이드의 수가 증가하고 있다. 박테리아, 원생생물, 곰팡이, 식물, 동물로부터 동정된 2,000가지 이상의 항생펩타이드가 항생펩타이드 데이터베이스에 등록되어 있다. 이러한 항생펩타이드의 대부분은 11-50개의 아미노산으로 구성되어 있고 하전상태는 0에서 +7까지이며 소수성은 31-70%를 차지하고 있다. 본 보고는 항생펩타이드를 생물학적 원천, 생물학적 기능, 펩타이드 성질, 공유결합패턴, 3차구조등에 의해 분류하였다. 항생펩타이드의 기능은 항균작용외에 세포주화성과 같은 세포생물학적 활성에도 기능성을 가지고 있다. 더욱이 림프절 스트로마로부터 기원한 fibroblastic reticular cell (FRC)에 염증상황 유도시 항생펩타이드가 발현되는 것을 확인하였다. FRC로부터 유도된 항생펩타이드는 whey acidic protein (WAP) 도메인을 포함하고 있었다. 이것은 단백질 도메인에 의해서도 항생펩타이드를 분류 할 수 있다는 것을 제시한다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제30권4호
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• pp.206-211
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• 2006

국내에서 채집되는 산삼의 내생균근(Arbuscular Mycor-rhizal Fungi, hMF) 감염을 조사하기 위해 전국 각지에서 생산되는 산삼으로부터 뿌리시료를 채취하였다. 균근감염은 채취한 뿌리를 세척하고 곰팡이의 균사를 frypan blue로 염색하여 관찰하였다. 본 연구에서 산삼의 품질은 12인의 전문가로 구성된 한국산삼협회의 산삼감정단에 의해 감정되었.다. 감정 의뢰된 산삼의 품질은 다섯 가지,즉,천종(순수 자연산삼), 지종(야생 산삼의 씨앗을 자연 상태에 파종하여 생산), 인종(약간의 변경이 가해진 자연환경에 otf산삼의 씨앗이나 모종을 심어서 생산), 품질미달(연령이 10년 미만 또는 병, 상처발생 등),수입 산삼 등 이다. 감염된 균근의 형태는 vesicle이 드물고, 세포 내부에는 arbuscule 대신 hyphal coil이 발견되어 hE?F중에서 Paris-type로서 확인되었다. 본 연구대상 산삼의 평균 균근감염율은 58.3%였으며, 다섯품질 간의 감염율에 큰 차이가 없었다 가는 뿌리에서 채취한 시료를 관찰해본 결과 총길이의 18.7%가 균근에 감염되어 있었다. 경기지방과 해발 1,200m이하에서 채집한 산삼의 균근감염율이 각각 84.2%, 70%로 평균보다 높은 반면,경북지방에서 채집한 산삼의 균근감염율이 27.8%로 낮았다. 연령이 오래된 산삼의 균근감염율이 상대적으로 낮은 것으로 나타났다.

• 생명과학회지
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• 제17권12호
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• pp.1709-1716
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• 2007

본 연구에서는 몇 가지 암세포를 대상으로 마늘 열수추출물(WEAS)의 항암활성을 조사하였으며, 비교적 높은 감수성을 보인 백혈병세포를 대상으로 세포증식억제가 apoptosis 유도와 연관성이 있음을 제시하였다. WEAS에 의한 U937 세포의 apoptosis 유도는 세포주기 G2/M arrest와 연관성이 있었으며, 다양한 apoptosis조절 유전자들의 발현 변화를 동반하였음을 확인하였다. 이러한 apoptosis조절 인자들의 발현변화는 미토콘드리아 막 전위의 소실과 연관성이 있었으며, WEAS에 의한 암세포의 G2/M arrest에 의한 apoptosis 유발에 ROS가 중요한 조절자로 작용함을 알 수 있었다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제64권10호
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• pp.504-510
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• 2021

Population screening of newborns is an extremely important and informative diagnostic approach that allows early identification of babies who are predisposed to the development of a number of serious diseases. Some of these diseases are known and have effective treatment methods. Neonatal screening enables the early diagnosis and subsequent timely initiation of therapy. This helps to prevent serious complications and reduce the percentage of disability and deaths among newborns and young children. Primary immunodeficiency diseases and primary immunodeficiency syndrome (PIDS) are a heterogeneous group of diseases and conditions based on impaired immune system function associated with developmental defects and characterized by various combinations of recurrent infections, development of autoimmune and lymphoproliferative syndromes (genetic defects in apoptosis, gene mutation Fas receptor or ligand), granulomatous process, and malignant neoplasms. Most of these diseases manifest in infancy and lead to serious illness, disability, and high mortality rates. Until recently, it was impossible to identify children with PIDS before the onset of the first clinical symptoms, which are usually accompanied by complications in the form of severe coinfections of a viral-bacterial-fungal etiology. Modern advances in medical laboratory technology have allowed the identification of children with severe PIDS, manifested by T- and/or B-cell lymphopenia and other disorders of the immune system. This review discusses the main existing strategies and directions used in PIDS screening programs for newborns, including approaches to screening based on excision of T-cell receptors and kappa-recombination excision circles, as well as the potential role and place of next-generation sequencing technology to increase the diagnostic accuracy of these diseases.