• 제목/요약/키워드: dN/dS

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Comparative study: nonsynonymous and synonymous substitution of SARS-CoV-2, SARS-CoV, and MERS-CoV genome

  • Sohpal, Vipan Kumar
    • Genomics & Informatics
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    • 제19권2호
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    • pp.15.1-15.7
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    • 2021
  • The direction of evolution can estimate based on the variation among nonsynonymous to synonymous substitution. The simulative study investigated the nucleotide sequence of closely related strains of respiratory syndrome viruses, codon-by-codon with maximum likelihood analysis, z selection, and the divergence time. The simulated results, dN/dS > 1 signify that an entire substitution model tends towards the hypothesis's positive evolution. The effect of transition/transversion proportion, Z-test of selection, and the evolution associated with these respiratory syndromes, are also analyzed. Z-test of selection for neutral and positive evolution indicates lower to positive values of dN-dS (0.012, 0.019) due to multiple substitutions in a short span. Modified Nei-Gojobori (P) statistical technique results also favor multiple substitutions with the transition/transversion rate from 1 to 7. The divergence time analysis also supports the result of dN/dS and imparts substantiating proof of evolution. Results conclude that a positive evolution model, higher dN-dS, and transition/transversion ratio significantly analyzes the evolution trend of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, severe acute respiratory syndrome coronavirus, and Middle East respiratory syndrome coronavirus.

THE LATTICE DISTRIBUTIONS INDUCED BY THE SUM OF I.I.D. UNIFORM (0, 1) RANDOM VARIABLES

  • PARK, C.J.;CHUNG, H.Y.
    • 대한수학회지
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    • 제15권1호
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    • pp.59-61
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    • 1978
  • Let $X_1$, $X_2$, ${\cdots}$, $X_n$ be i.i.d. uniform (0,1) random variables. Let $f_n(x)$ denote the probability density function (p.d.f.) of $T_n={\sum}^n_{i=1}X_i$. Consider a set S(x ; ${\delta}$) of lattice points defined by S(x ; ${\delta}$) = $x{\mid}x={\delta}+j$, j=0, 1, ${\cdots}$, n-1, $0{\leq}{\delta}{\leq}1$} The lattice distribution induced by the p.d.f. of $T_n$ is defined as follow: (1) $f_n^{(\delta)}(x)=\{f_n(x)\;if\;x{\in}S(x;{\delta})\\0\;otherwise.$. In this paper we show that $f_n{^{(\delta)}}(x)$ is a probability function thus we obtain a family of lattice distributions {$f_n{^{(\delta)}}(x)$ : $0{\leq}{\delta}{\leq}1$}, that the mean and variance of the lattice distributions are independent of ${\delta}$.

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쥐의 간 발암과정에서 N-3, N-6 지방산 섭취 및 d-Limonene 투여가 생체막 지질조성 및 Protein Kinase C 활성도에 미치는 영향 (Effect of N-3, N-6 Fatty Acid and d-Limonene Treatment on Membrane Lipid Composition and Protein Kinase C Activity in Experimental Rat Hepatocarcinogenesis)

  • 김미정;김정희
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제32권8호
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    • pp.1328-1336
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    • 2003
  • 본 연구는 우리나라에서 발병률이 높은 간암의 발생과정에서 정어리유와 d-limonene의 섭취가 미치는 영향을 세포막 지질조성 및 PKC활성도를 통해 조사하여 이들의 항암 작용관련 기전을 규명 하고자 하였다. 따라서 이유된 흰쥐를 지방산 조성이 아주 다른 옥수수유, 정어리유를 15% 수준으로 공급하고 d-limonene 섭취군은 5%수준으로 공급하여 실험군에서는 발암물질인 DEN을 2회 복강 주사하고 PB를 물에 섞어 주어 20주간 사육하여 membrane fraction의 지방산 조성 및 지질의 조성, glutathione-S-transferase, PKC 활성도를 조사하여 아래와 같은 결과를 얻었다. 간 세포막의 콜레스테롤과 인지질 함량에 대한 C/PL ratio는 옥수수유군에서 발암물질 투여나 d-limonene의 섭취에 따른 효과가 없었으나 정어리 유군에서는 발암물질 투여시, d-limonene 섭취시 유의적인 감소를 나타내어 식이지방의 종류에 따라 발암물질과 d-limonene의 작용이 차이가 있는 것으로 나타났다. Membrane fraction의 인지질 조성은 CL을 제외한 PE, PI, PG, PC, PS와 PE/PC ratio등 모두에 있어서 식이지방의 종류, 발암물질의 투여, d-liomnene섭취에 따른 차이가 나타나지 않았다. 세포막의 지방산 조성을 나타내는 n-6/n-3 ratio가 정어리유군에서 옥수수유군보다 유의적으로 낮았고, 옥수수유군에서는 발암물질 투여나 d-limonene의 섭취에 따라 유의적으로 증가했으나 정어리유군에서는 발암물질과 d-limonene에 의한 차이가 없었다. Cytosolic PKC의 활성은 식이지방의 종류와 발암물질 투여에 따른 차이는 없었고, d-limonene의 섭 취에 따라 유의적 감소를 나타냈으며, 막부착 PKC의 활성은 옥수수유군에서 유의적으로 높았고, d-limonene 섭취에 따라 감소 경향을 발암물질 투여에 따라서는 증가 경향을 보였으나 유의적인 차이를 나타내지는 않았다. GST활성은 식이 지방의 종류에 따른 차이는 없었으나 발암물질 투여와 d-limonene 섭취에 따라 유의적으로 증가하였으며, 발암물질과 d-limonene을 같이 공급시에 더욱 더 유의적으로 증가하였다. 이상의 실험 결과를 종합에 보면 암화과정에 일어나는 지방의 대사가 식이지방의 종류에 따라 차이를 보이며, 특히 정어리유군에서 d-limonene에 의한 C/PL ratio가 감소하여 막 유동성에 변화를 초래하고, 이에 따라 membrane bound enzyme의 활성에 변화를 가져오는 것으로 생각된다. 따라서 식이지방의 종류가 암의 발생에 미치는 영향이 다르고, 막부착 PKC 활성도를 감소시켜 발암을 억제하는 효과가 있으며, 이 효과는 지방의 종류에 따라 차이가 있는 것으로 생각된다. 최근 n-3 지방산이나 d-limonene이 PKC expression을 감소시키고, apopotosis 촉진 단백질의 발현을 증가시켜 tumor cell의 apoptosis를 증가시킨다고 하여 n-3 지방산과 d-limonene의 또 다른 발암억제기전을 설명하고 있다. 그러나 n-3 지방산과 d-limonene의 상호효과에 대한 연구는 부족한 실정이므로 d-limonene과 n-3 지방산의 교호작용에 의한 발암억제 기전에 대해서는 더 많은 연구가 필요하다고 하겠다.

A NOTE ON SKEW DERIVATIONS IN PRIME RINGS

  • De Filippis, Vincenzo;Fosner, Ajda
    • 대한수학회보
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    • 제49권4호
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    • pp.885-898
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    • 2012
  • Let m, n, r be nonzero fixed positive integers, R a 2-torsion free prime ring, Q its right Martindale quotient ring, and L a non-central Lie ideal of R. Let D : $R{\rightarrow}R$ be a skew derivation of R and $E(x)=D(x^{m+n+r})-D(x^m)x^{n+r}-x^mD(x^n)x^r-x^{m+n}D(x^r)$. We prove that if $E(x)=0$ for all $x{\in}L$, then D is a usual derivation of R or R satisfies $s_4(x_1,{\ldots},x_4)$, the standard identity of degree 4.

KRONECKER FUNCTION RINGS AND PRÜFER-LIKE DOMAINS

  • Chang, Gyu Whan
    • Korean Journal of Mathematics
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    • 제20권4호
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    • pp.371-379
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    • 2012
  • Let D be an integral domain, $\bar{D}$ be the integral closure of D, * be a star operation of finite character on D, $*_w$ be the so-called $*_w$-operation on D induced by *, X be an indeterminate over D, $N_*=\{f{\in}D[X]{\mid}c(f)^*=D\}$, and $Kr(D,*)=\{0\}{\cup}\{\frac{f}{g}{\mid}0{\neq}f,\;g{\in}D[X]$ and there is an $0{\neq}h{\in}D[X]$ such that $(c(f)c(h))^*{\subseteq}(c(g)c(h))^*$}. In this paper, we show that D is a *-quasi-Pr$\ddot{u}$fer domain if and only if $\bar{D}[X]_{N_*}=Kr(D,*_w)$. As a corollary, we recover Fontana-Jara-Santos's result that D is a Pr$\ddot{u}$fer *-multiplication domain if and only if $D[X]_{N_*} = Kr(D,*_w)$.

돈사 내 및 부지경계에서 악취물질 발생 조사 연구 (A Field Survey on Concentration of Odor Compounds in Pig Buildings and Boundary Areas)

  • 유용희;김태일;정종원;곽정훈;최희철;송준익;양창범;장영기;김호정;송기봉
    • 한국축산시설환경학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.45-54
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    • 2005
  • 본 연구는 대규모, 중규모, 소규모 양돈장을 선정 각 성장단계별 돈사내 및 부지경계선에서 악취물질 발생 농도에 대한 1차적인 기초 자료를 얻고자 수행하였다. 조사한 돈사의 형태는 무창돈사, 개방돈사이며 분뇨처리는 슬러리, 톱밥돈사 등으로 구성되어 있었다. 돈사 내에서 악취물질 발생 농도를 조사한 결과 성장단계, 사육규모에 관계없이 암모니아:0.9${\~}$21.0ppm으로 가장 높았고, 그 다음 황화수소:51.9${\~}$6,712.4ppb, 메틸머캅탄:N. D.${\~}$12.9ppb, 다이메틸설파이드:N. D.${\~}$5.2ppb, 다이메틸다이설 파이드:N. D.${\~}$2.6ppb 순으로 악취물질 발생 농도가 낮은 것으로 나타났다. 부지경계의 악취물질 농도는 돈사시설에서 풍하 방향을 고려하여 20m 외곽에서 실시하였다. 조사 당시 풍속은 0.23${\~}$0.73m/s 이었다. 악취물질 발생 농도 범위는 암모니아 0.2${\~}$4.5ppm, 황화수소 0.0l${\~}$0.06ppb, 메틸머캅탄 N. D.${\~}$0.009ppb, 다이메틸다이설파이드 N. D.${\~}$0.002ppb가 측정되었다. 악취물질별로 돈사 내 및 부지경계 기준악취물질 발생농도를 비교한 결과 악취물질 발생농도는 다이메틸설파이드 가장 낮게 검출되었으며 그 다음 황화수소, 암모니아, 메틸머캅탄, 다이메틸다이설파이드 순으로 검출되었다. 금후 돈사 내 악취물질 발생 및 그 원인에 대하여는 돈사 내$\cdot$외 환경 여건 변화에 따라 다양하므로 좀더 많은 연구가 필요한 것으로 판단된다.

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Thyrogen 투여 후 측정된 Thyroglobulin 농도변화 (The Variation of Serum Thyroglobulin Measured after Thyrogen Administration)

  • 김지나;안재석;원우재
    • 핵의학기술
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    • 제22권1호
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    • pp.80-83
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    • 2018
  • Purpose Assessment of Serum Thyroglobulin (sTg) value in total thyroidectomy patients having an ablation dose of radioactive iodine indicates remaining cancer or metastasis. Especially, sTg in patients on withdrawal thyroxine or thyrogen administration for radioiodine ablation is an important indicator to determine the direction of further treatment and prognosis. Current guidelines suggest measurement of sTg is performed at 72 hours after the last injection of thyrogen. and assumes that sTg reaches maximum serum levels at that time. The purpose of this study is to evaluate the variation of sTg measured after thyrogen administration. Materials and Methods We compared with sTg performed at 24hours(D0) and 72hours(D2) after the last injection of thyrogen. We reviewed D0 and D2 from 276 patients were divided them into three groups according to ablation dose of radioactive iodine, 5mCi(A group), 30~80mCi(B group) and 100~200mCi(C group). We used T-test for comparison between D0 and D2. sTg was measured in serum using immunoradiometric assay (Tg-plus RIA; BRAHMS, Berlin, Germany). Results There is no critical variation between D0 and D2 in A group(n=100)(P=0.32), The case of increase(D2>D0) is 45, no change(D2=D0) is 23, decrease(D2D0 is 91, D2=D0 is 28, D2D0 is 19, D2=D0 is 2. The biggest increase is 143.6 ng/mL from 98.4 to 242. Conclusion There was a significant difference in the group over 30mCi. and the case of D2>D0 is 45%, 58.7%, 90.5% for each group. therefore, D2 increased as the dose of radioactive iodine increased. Furthermore, the most sTg values of D0 and D2 are variation under 2.0 ng/mL, so reproducibility as well as sensitivity of sTg will be important at values below 2ng/mL.

포디프레임(4D-Frame)을 활용한 수학활동이 유아의 수학적 능력과 수학적 태도에 미치는 영향 (The Effects of Mathematical Activities using 4D-Frame on Young Children's Mathematical Ability and Attitude towards Mathematics)

  • 양효숙;박영숙;조광현
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제19권8호
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    • pp.146-159
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    • 2018
  • 본 연구는 4D프레임 교구를 활용한 유아수학활동이 만 5세 유아의 수학적 능력과 태도에 미치는 영향을 알아보기 위해 수행되었다. 이를 위해 S시에 위치한 E, K, Y유치원의 만 5세 유아 56명을 실험집단(I: n=14, II: n=14)과 비교집단(III, n=14, IV, n=14)으로 나눈 후 8주 동안 실험집단에서 4D프레임 교구를 활용한 유아수학활동을 실시하였고 비교집단은 각각 누리과정에서 제시하는 수학활동과 수 과학 통합프로그램을 실시하였다. 실험집단(I, II)과 비교집단(III, IV)의 사전검사 점수를 공변인으로 하여 공변량분석(ANCOVA)을 실시한 결과, 4D프레임 교구를 활용한 유아수학활동이 실험집단과 비교집단 간 통계적으로 유의미한 차이가 있는 것으로 나타났고 이는 4D프레임 교구를 활용한 유아수학활동이 유아의 수학적 능력과 수학적 태도의 향상에 긍정적인 영향을 준 것으로 해석할 수 있다. 본 연구를 통해 유아교육 현장에서 4D프레임 교구를 활용한 유아수학활동의 효율성을 이해함으로써 유아들의 수학적 능력 및 태도의 향상을 위한 현장 적용 가능한 교육적 방안을 위한 기초자료를 제공하고자 한다.

개화 후 비료의 농도가 Ornamental Pepper의 생장과 착과에 미치는 영향 (Fertilizer Concentration after Flowering Affects Growth and Fruit Setting of Ornamental Pepper)

  • 진영욱;정순주;이범선;강종구
    • 생물환경조절학회지
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    • 제12권2호
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    • pp.95-100
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    • 2003
  • Ornamental pepper의 생장과 착과에 미치는 개화 후 비료 농도의 영향을 구명하기 위하여 정식 후부터 개화시까지 $100\;mg{\cdot}L^{-1}\;(EC=0.8\;dS{\cdot}m^{-1})$의 N농도로 재배하였고 그 후부터 0, 100, 200, $300\;mg{\cdot}L^{-1}$의 N 농도(EC=0.15, 0.8, 1.45, $2.1\;dS{\cdot}m^{-1}$)로 처리하여 수확시까지 재배하였다. $200 \;mg{\cdot}L^{-1}$의 N 농도 처리에서 최대 엽면적과 건물을 수확했으며 식물체당 전체 과일 무게도 가장 무거웠다. 100, 200, $300\;mg{\cdot}L^{-1}$의 N농도에서는 식물체당 과일 수에서 차이가 없었으며, $0\;mg{\cdot}L^{-1}$의 N농도에서 과일수가 현저히 감소하였으나 과일의 착색비율은 높았다. 100, 200, $300\;mg{\cdot}L^{-1}$의 N 농도로 화분에 관비했을 때 화분내 배지의 EC는 각각 0.8에서 $1.2dS{\cdot}m^{-1}$, 2.0에서 $3.0dS{\cdot}m^{-1}$, 3.0에서 $4.5dS{\cdot}m^{-1}$ 수준을 나타냈다. 200과 $300\;mg{\cdot}L^{-1}$의 N농도 처리구에서 배지의 pH가 낮았는데 특히 생육후기에는 4.9정도까지 낮아졌다. 식물체내 무기성분 함량은 대부분 개화 후 비료의 농도에 의해 영향 받지 않았으나 오직 aluminum은 비료의 농도가 증가함에 따라 직선적으로 감소하였다. 이 실험에서 ornamental pepper의 상업적 생산을 위해서는 개화 후 질소의 농도를 100에서 $200\;mg{\cdot}L^{-1}$ 농도로 하는 것이 좋으며, 이 때 배지의 EC는 0.8에서 $3\;dS{\cdot}m^{-1}$로 비교적 넓은 범위를 보였다.