• 제목/요약/키워드: conformation analysis

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저온에서의 싸이클로옥타논에 대한 고유동위원소 효과 (INTRINSIC NMR ISOTOPE SHIFTS OF CYCLOOCTANONE AT LOW TEMPERATURE)

  • 정미원
    • 분석과학
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    • 제7권2호
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    • pp.213-224
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    • 1994
  • 선택적으로 중수소를 치환시킨 싸이클로옥타논의 여러 동위원소 이성질체들을 합성하였다. 고유동위원소 효과에 의해 영향을 받는 $^{13}C$ NMR 화학적 이동값들을 각 이성질체에 대해 저온에서 계통적으로 관찰하였다. 특히 싸이클로옥타논이 선호하는 안정한 형태 이성질체인 클 boat-chair 형과 연관시켜 이 효과들을 논의하였다.

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X-ray Crystal Structure of Hetaryl Leuco-TAM Dyes, (2Z,2'E)-2,2'-(2-Phenyl Propane-1,3-diylidene) Bis(1,3,3-trimethyl indoline) Derivatives

  • Keum, Sam-Rok;Roh, Se-Jung;Kim, Young-Nan;Im, Do-Hyuck;Ma, So-Young
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제30권11호
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    • pp.2608-2612
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    • 2009
  • The unequivocal solid-state structure and stereochemistry of the hetaryl leuco-TAM dye, 2,2’-(2-phenyl propane- 1,3-diylidene) bis(1,3,3- trimethylindoline) derivatives were established using X-ray single crystal analysis. The X-ray crystal analysis showed that the (Z, E)-isomers only formed stereoselectively, with a so-called “threebladed propeller” conformation, from the reaction of a Fischer base and benzaldehyde derivatives. These isomers were stacked in a juxtaposition to form a dimer or a double dimer, adopting either a triclinic, with P-1, or monoclinic crystal system with a space group P21/n in the unit cell of the crystal.

1,6-Anhydropyranose의 분자구조의 역학적응용 (Application of Molecular Mechanics to the Structure of 1,6-Anhydropyranoses)

  • ;박영자
    • 대한화학회지
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    • 제23권4호
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    • pp.206-209
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    • 1979
  • Empirical force-field method를 단결정 회절방법으로 구조가 연구된 여덟개의 1,6-anhydropyranose 분자구조$^{13{\sim}21}$에 적용하였다. 이론적 계산에서도 분자들간의 pyranose고리 conformation의 $^1C_4$$E_0$ 사이간의 차이는 실험치와 비슷하게 얻어졌다. Five-membered anhydro 고리의 분자들간의 작은 conformation 차이는 잘 예측되지 않았다. C-C결합 길이의 계산치는 실험치와 0.012${\AA}$내에서, C-O결합 길이는 0.027${\AA}$내에서, non-hydrogen atom의 결합각은 1.9$^{\circ}$이내에서 일치되고 있다

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고준위 펄스방사선에 의한 전자소자 Latchup의 발생시험 및 분석 (An Experimental Analysis for a High Pulse Radiation Induced Latchup Conformation)

  • 이남호;황영관;정상훈;김종열
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제18권12호
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    • pp.3079-3084
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    • 2014
  • 펄스 방사선에 의해 전자소자가 받는 영향으로는 Upset, Latchup, Burnout 등이 있다. 이 가운데 Latchup은 대상 소자에 회복 불가능한 영구손상(Permanent Damage)을 가져오게 되며 Burnout으로도 이어져 장비전체에 치명적 기능마비를 유발하기도 한다. 본 연구에서는 전자소자의 내부 공정설계 및 구조정보 활용이 불가능한 상황에서 실험을 통해서 펄스 방사선에 의한 Latchup 발생을 분석하고자 시도하였다. 소자를 전자빔변환 고준위 펄스 감마선 조사한 직후 수행한 전원제공 회로의 차단, 적외선 카메라의 열원측정, 그리고 손상발생 소자의 내부 회로분석의 세 단계별 확인과정은 펄스 방사선에 의해 유발된 Latchup임을 검증하는 효율적 방안으로 여겨진다.

Conformational Analysis of Trimannoside and Bisected Trimannoside Using Aqueous Molecular Dynamics Simulations

  • Kim, Hyun-Myung;Choi, Young-Jin;Lee, Jong-Hyun;Jeong, Karp-Joo;Jung, Seun-Ho
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제30권11호
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    • pp.2723-2728
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    • 2009
  • The conformational properties of oligosaccharides are important to understand carbohydrate-protein interactions. A trimannoside, methyl 3,6-di-O-($\alpha$-D-Man)-$\alpha$-D-Man (TRIMAN) is a basic unit of N-linked oligosaccharides. This TRIMAN moiety was further modified by GlcNAc (BISECT), which is important to biological activity of N-glycan. To characterize the trimannoside and its bisecting one we performed a molecular dynamics simulation in water. The resulting models show the conformational transition with two major and minor conformations. The major conformational transition results from the $\omega$ angle transition; another minor transition is due to the $\psi$ angle transition of $\alpha$ (1 $\rightarrow$ 6) linkage. The introduction of bisecting GlcNAc on TRIMAN made the different population of the major and minor conformations of the TRIMAN moiety. Omega ($\omega$) angle distribution is largely changed and the population of gt conformation is increased in BISECT oligosaccharide. The inter-residue hydrogen bonds and water bridges via bisecting GlcNAc residue make alterations on the local and overall conformation of TRIMAN moiety. These changes of conformational distribution for TRIMAN moiety can affect the overall conformation of N-glycan and the biological activity of glycoprotein.

Variation of Meat Quality Parameters Due to Conformation and Fat Class in Limousin Bulls Slaughtered at 25 to 27 Months of Age

  • Guzek, Dominika;Glabska, Dominika;Pogorzelski, Grzegorz;Kozan, Karolina;Pietras, Jacek;Konarska, Malgorzata;Sakowska, Anna;Glabski, Krzysztof;Pogorzelska, Ewelina;Barszczewski, Jerzy;Wierzbicka, Agnieszka
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제26권5호
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    • pp.716-722
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    • 2013
  • The aim of the present study was to determine the influence of age of animal, hot carcass weight, pH, conformation and fat class on basic beef quality attributes (tenderness, sarcomere length, basic chemical composition, marbling and colour) in a group of purebred animals. The object of the study was beef of Limousin bulls (25 to 27 months, hot carcass weight - $432{\pm}31$ kg, "U" conformation class, "2"-"3" fat class). Analysed cuts were Infraspinatus muscle from the blade and Longissimus dorsi muscle from the cube roll and the striploin. Tenderness was analysed with universal testing machine, colour - chromometer analysis, sarcomere length - microscopic method, basic chemical composition - near-infrared spectroscopy and marbling - computer image analysis. No differences in tenderness and sarcomere length were observed within the age groups of Limousin bulls (age of 25, 26, 27 months) (p>0.05). Moisture (p = 0.0123) and fat (p = 0.0250) content were significantly different for meat of animals slaughtered at the age of 25 and 27 months. No influence of pH value on tenderness was observed, but at the same time, influence on sarcomere length (p = 0.039) and $b^*$ component of colour (0.045) was found. For "U" conformation class, in subclasses, as well as for fat classes "2"-"3", there were no differences in tenderness, sarcomere length and colour components. Higher fat content was observed in the higher fat class, rather than in lower, however this feature was not associated with marbling.

Single Stranded Conformation Polymorphism 분석에 의한 돼지 Duroc 품종의 미토콘드리아 DNA 유전적 변이 (Genetic Variation of Mitochondrial DNA in Duroc (Sus Scrofa) Using Single Stranded Conformation Polymorphism Analysis)

  • 조인철;정용환;정진관;성필남;김병우;이정규;전진태
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제45권6호
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    • pp.911-916
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    • 2003
  • 돼지 Duroc 품종의 mitochondria DNA D-loop전체 유전자를 증폭하기 위하여 많은 동물에서 고도로 상동성이 높은 tRNA-Pro와 tRNA-Phe 염기서열 일부를 이용하여 oligonucleotide primer를 제작하였다. 그 결과 Duroc 품종의 D-loop 전체 유전자는 1,145 base pairs 였으며, 그 중간위치에 10bp의 Sus Scrofa-specific sequence (TACACGTGCG)가 10개 존재하고 있었다. 돌연변이 검출을 위하여 가장 변이가 심한 지역을 primer 제작하여 345 bp의 DNA 단편을 증폭하였으며, Single Stranded Conformation Polymorphism(SSCP) 분석은 8% polyacrylamide gel에서 200 V, 16시간 전기영동하여 ethidium bromide (EtBr)로 10분간 염색하여 UV image analyzer로 관찰하였다. 그 결과 두 개의 서로 다른 밴드유형을 관찰하였으며, 21개 부위에서 염기서열 변이가 관찰되었다. 이러한 결과는 유전적 다양성 변이를 검출하는데 SSCP 분석이 유용한 도구라고 사료된다.

용매 증발 과정 중 마이크로웨이브 처리가 PVDF 복합재료 필름의 결정화 형태에 미치는 영향 (Effect of Microwave Irradiation on Conformation of Crystalline of PVDF Nano-composite Film in the Solvent Evaporation Process)

  • 홍현수;김성수
    • Composites Research
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    • 제33권1호
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    • pp.19-24
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    • 2020
  • 본 연구에서는 Poly(vinylidene fluoride) (PVDF) 필름 제작 과정 중 마이크로웨이브 처리 과정을 도입하여 β 결정성 향상에 어떠한 영향을 미치는지 분석하였다. 또한, 나노 입자 보강제로써 금속산화물인 TiO2를 혼합하여 PVDF 복합재료 필름을 만들어, 전기적 음성도 차이로 인한 반데르발스 힘을 통해 β 결정 형성을 추가적으로 향상시키려고하였다. FTIR과 XRD 분석을통하여해당필름시편들에대해결정화도(Crystallinity) 및결정성(Crystalline)을 분석하였다. 이러한 분석 결과를 바탕으로, 용매 증발 과정 중 마이크로웨이브 처리 과정이 PVDF 필름의 결정화도를 높여주는 것을 확인하였고, 추가적인 연신(Stretching) 공정을 통해 α 결정에서 β 결정 변화(Crystalline phase change)가 발생함으로써 결과적으로 더 많은 β 결정성을 나타내었다. 그리고 금속산화물을 넣은 PVDF 복합재료 필름이 Neat PVDF 필름보다 상대적으로 더 높은 β 결정성을 나타내는 것을 확인하였다.

SSCP와 DHPLC에 의한 β2-교감신경수용체 유전자의 돌연변이 분석 (Mutation Analysis in β2-Adrenergic Receptor Gene by Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) and Denaturing High Performance Liquid Chromatography (DHPLC))

  • 박상범;한상만;남윤형;장원철
    • 분석과학
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    • 제17권1호
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    • pp.53-59
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    • 2004
  • 현재 일반적으로 많이 사용되는 single strand conformation polymorphism (SSCP)나 denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)같은 돌연변이 검출법은 많은 시간과 비용, 그리고 노동력이 소모된다는 단점과 실험자의 실험에 대한 숙련도에 의해 실험 결과가 달라지는 한계점을 가지고 있다. 이런 단점들을 보완하기 위하여 ion-pair reversed phase chromatography (IP-RPC)방식을 이용한 denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC)방법을 사용하여 기관지 천식 (bronchial asthma)을 조절하는 베타2-교감신경수용체 유전자의 돌연변이를 검출하였다. 80명의 천식 환자의 혈액에서 genomic DNA를 추출하여 중합효소연쇄반응 (polymerase chain reaction)을 이용해 증폭하고, 그 산물을 SSCP와 DHPLC로 분석하였다. 그 결과, 베타2-교감신경수용체 유전자에서 SSCP는 80명의 sample 가운데 19개 (23.75%)의 돌연변이를 검출하였고, DHPLC는 25개 (31.25%)의 변이를 검출하였다. 돌연변이 검출법으로 DHPLC 분석법이 SSCP보다 더 빠르고 효과적인 방법임을 확인하였다.

Construction of 19F-13C Solid-State NMR Probe for 400MHz Wide-Bore Magnet

  • Jeong, Ji-Ho;Park, Yu-Geun;Choi, Sung-Sub;Kim, Yongae
    • 한국자기공명학회논문지
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    • 제17권2호
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    • pp.81-85
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    • 2013
  • Various fluorine-containing materials are used in electronic devices like LCD display panels and Li-ion batteries. The structural conformation of fluorine in fluorinated materials is an important contributing factor that influences the chemical and physical properties. The conformation can be changed by heat and stress during manufacture or use. Understanding the conformational changes is critical for understanding the performance and durability of electronic devices. Solid-state NMR spectroscopy could be widely used for the analysis of various fluorine-containing materials for electronic devices. However, conventional CPMAS probes cannot be used for in-situ analysis of fluorine-containing electronic devices like LCD panels and Li-ion batteries. In this paper, we show the design, construction, and optimization of a $^{19}F-^{13}C$ double-resonance solid-state NMR probe for a 400MHz wide-bore magnet with a flat square coil for in-situ analysis of fluorine-containing electronic devices without observing fluorine background signals. This custom-built probe does not show any fluorine background signals, and can have higher efficiency for lossy samples.