• 제목/요약/키워드: cell dimension

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점진적 주성분 분석을 이용한 시계열 유전자 발현 데이터의 효율적인 차원 축소 (Dimension Reduction in Time-series Gene Expression Data using incremental PCA)

  • 김선희;김만선;양형정
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2007년도 추계학술발표대회
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    • pp.733-736
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    • 2007
  • 최근 생명 공학 기술의 발달로 마이크로 단위의 실험이 가능해지고 하나의 칩상에 수 만개의 유전자들의 발현 양상을 보다 쉽게 관찰할 수 있게 되었다. DNA 칩 기술에 의해 얻어지는 마이크로어레이(microarray) 데이터는 세포나 조직 내의 유전자 발현도(expression level)를 측정한 것으로 질병 진단이나 유전자 기능 예측 등에 이용되고 있다. 본 논문에서는 대량의 시계열 마이크로어레이 데이터 분석을 위해 효율적으로 데이터의 차원을 판단하는 점진적 주성분 분석을 이용하여 데이터의 차원을 축소 한다. 제안된 방법은 실제 시계열 마이크로어레이 데이터인 yeast cell cycle 데이터에 적용되었고, 데이터 차원 축소에 대한 효율성을 검증하기 위해 클러스터링을 수행하였다. 그 결과 데이터를 축소하여 클러스터링을 수행한 경우 학습 성능이 향상 된 결과를 보였다.

고위험군 유방암 환자의 치료과정에 따른 삶의 질의 변화 (Patients with High Risk Breast Cancer)

  • 박은영;이은옥
    • 종양간호연구
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    • 제1권1호
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    • pp.32-43
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    • 2001
  • High risk breast cancer patients receive aggressive treatments such as APBSCT in order to prevent the recurrence. These treatments take a long time and decrease the quality of life of patients as a result. The purpose of this study is to examine when the changes of quality of life are dramatic in general and in specific dimension. This is a time series study of two types of treatment groups, in which 15 patients were treated by chemotherapy only and nine patients by auto-peripheral blood stem cell transplantation. Subjects were in this study were stage III and above of breast cancer. Data were collected from April 1999 to April 2000 with the 3 month-interval starting after 3rd cycle of chemotherapy. Data were collected 3 times ; treatment period, treatment finishing period and 3 months later after the treatment. Ferrell's QOL instrument was used which had been developed for the breast cancer patients in 1989. Repeated Measure ANOVA was used to examine differences of quality of life at 3 points of time respectively. As a result, average age was 43.29 years (4.38yrs) and the number of married person was 22(91.7%). Scores of quality of life were 5.45 at 1st period after 3rd cycle of chemotherapy, 5.17 after treatment, 5.10 at 3 months later after treatment and difference of quality of life was decreased according to period of treatment (P=.085). Only the psychological dimension of the quality of life showed the significant difference (P=.045). Two different treatment groups showed a difference of quality of life at 3 month later after treatment. In conclusions, high risk breast cancer patients showed the decreased quality of life related to treatment up to 3 months later of treatment. Subjects who received APBSCT returned to the normal quality of life more rapidly than those who received chemotherapy. Psychological nursing intervention was needed during the whole period of treatment.

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유한 대용량 안테나 시스템에서 송수신기 설계 방법 (Transceiver Design Method for Finitely Large Numbers of Antenna Systems)

  • 신준우
    • Journal of Advanced Marine Engineering and Technology
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    • 제39권3호
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    • pp.280-285
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    • 2015
  • 대용량 다중 송신 다중 수신 안테나 환경에서 정합 필터 송신기는 다중 사용자 하향 링크 전송 용량(capacity)을 달성하는 방법으로 알려져 있다. 그러나 기지국이 유한 개수의 대용량 안테나를 장착한 경우 정합 필터는 다중 사용자 하향링크 전송 용량을 제공할 수 없다. 본 논문에서는 유한 대용량 안테나를 갖춘 기지국이 낮은 신호 대 잡음비의 다수의 셀 경계 영역 사용자를 지원할 경우, 효율적 연산 복잡도로 전송 용량을 최대화하는 두 단계 선형 송수신기 설계 방법을 제안한다. 정합 필터로 구성된 첫째 단계 프리코더는 유효 채널 dimension 을 줄이면서 동시에 빔포밍 이득을 통해 수신 신호 대 잡음 비를 개선한다. 그리고 평균 자승 오류율 최소화 기법을 통해 전송 용량을 최대화하는 둘째 단계 선형 송수신기를 구한다. 시뮬레이션과 분석을 통해 전송 용량과 연산 복잡도 면에서 제안하는 방법이 우수함을 보인다.

NOMA 시스템에서 SINR 정보 피드백을 이용한 딥러닝 기반 송신 전력 제어의 성능 분석 (Performance Analysis of Deep Learning Based Transmit Power Control Using SINR Information Feedback in NOMA Systems)

  • 김동현;이인호
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제25권5호
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    • pp.685-690
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    • 2021
  • 본 논문에서는 하향링크 비직교 다중 접속 시스템에서 최소 데이터 전송률을 만족하며 데이터 전송률의 총합을 최대화 할 수 있는 딥러닝 기반의 송신 전력 제어 기법을 제안한다. 하향링크 비직교 다중 접속 시스템에서 사용자가 위치한 셀 이외의 기지국으로부터 발생할 수 있는 동일 채널 간섭을 고려하고, 시스템 피드백 오버헤드를 줄이기 위하여 사용자는 채널 상태 정보 대신에 신호 대 간섭 및 잡음비 정보를 피드백 한다. 따라서 기지국은 신호 대 간섭 및 잡음비 정보만을 이용하여 송신 전력을 제어한다. 함축적 신호 대 간섭 및 잡음비 정보의 이용은 정보 차원을 감소시키는 장점은 있지만 데이터 전송률을 감소시킬 수 있는 단점이 있다. 본 논문에서는 딥러닝 기반의 학습 방식으로 이 문제를 해결하고, 딥러닝 입력의 차원을 효과적으로 축소할 경우 학습의 성능을 향상시킬 수 있음을 보여준다. 시뮬레이션을 통해서 제안된 딥러닝 기반의 송신 전력 제어 기법이 최소 데이터 전송률을 만족하며 데이터 전송률의 총합을 향상시킬 수 있음을 입증한다.

A STUDY ON OSTEOBLAST-LIKE CELL RESPONSES TO SURFACE-MODIFIED TITANIUM

  • Hong Min-Ah;Kim Yung-Soo;Kim Chang-Whe;Jang Kyung-Su;Lee Jae-Il
    • 대한치과보철학회지
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    • 제41권3호
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    • pp.300-318
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    • 2003
  • Statement of problem: The success of implants depends on intimate and direct contact of implant material on bone tissue and on functional relationship with soft tissue contact. Creation and maintenance of osseointegration depend on the understanding of the tissue's healing, repairing, and remodeling capacity and these capacities rely on cellular behavior. Altering the surface properties can modify cellular responses such as cell adhesion, cell motility, bone deposition, Therefore, various implant surface treatment methods are being developed for the improved bone cell responses. Purpose: The purpose of this study was to evaluate the responses of osteoblast-like cells to surface-modified titanium. Materials and Methods: The experiment was composed of four groups. Group 1 represented the electropolished surface. Group 2 surfaces were machined surface. Group 3 and Group 4 were anodized surfaces. Group 3 had low roughness and Group 4 had high roughness. Physicochemical properties and microstructures of the discs were examined and the responses of osteoblast-like cells to the discs were investigated. The microtopography was observed by SEM. The roughness was measured by three-dimension roughness measuring system. The microstructure was analyzed by XRD, AES. To evaluate cell responses to modified titanium surfaces, osteoblasts isolated from calvaria of neonatal rat were cultured. Cell count, morphology, total protein measurement and alkaline phosphatase activities of the cultures were examined. Results and Conclusion: The results were as follows 1. The four groups showed specific microtopography respectively. Anodized group showed grain structure with micropores. 2. Surface roughness values were, from the lowest to the highest, electropolished group, machined group, low roughness anodized group, and high roughness anodized group. 3. Highly roughened anodized group was found to have increased surface oxide thickness and surface crystallinity. 4. The morphology of cells, flattened or spherical, were different from each other. In the electropolished group and machined group, the cells were almost flattened. In two anodized groups, some cells were spherical and other cells were flattened. And the 14 day culture cells of all of the groups were nearly flattened due to confluency. 5. The number of attached cells was highest in low roughness anodized group. And the machined group had significantly lower cell count than any other groups(P<.05). 6. Total protein contents showed no difference among groups. 7. The level of alkaline phosphatase activities was higher in the anodized groups than electropolished and machined groups(P<.05).

Charge Transport Characteristics of Dye-Sensitized TiO2 Nanorods with Different Aspect Ratios

  • Kim, Eun-Yi;Lee, Wan-In;Whang, Chin Myung
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제32권8호
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    • pp.2671-2676
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    • 2011
  • Nanocrystalline $TiO_2$ spherical particle (NP) with a dimension of 5 ${\times}$ 5.5 nm and several nanorods (NR) with different aspect ratios (diameter ${\times}$ length: 5 ${\times}$ 8.5, 4 ${\times}$ 15, 4 ${\times}$ 18 and 3.5 ${\times}$ 22 nm) were selectively synthesized by a solvothermal process combined with non-hydrolytic sol-gel reaction. With varying the molar ratio of TTIP to oleic acid from 1:1 to 1:16, the NRs in the pure anatase phase were elongated to the c-axis direction. The prepared NP and NRs were applied for the formation of nanoporous $TiO_2$ layers in dye-sensitized solar cell (DSSC). Among them, NR2 ($TiO_2$ nanorod with 4 ${\times}$ 15 nm) exhibited the highest cell performance: Its photovoltaic conversion efficiency (${\eta}$) of 6.07%, with $J_{sc}$ of 13.473 mA/$cm^2$, $V_{oc}$ of 0.640 V, and FF of 70.32%, was 1.44 times that of NP with a size of 5 ${\times}$ 5.5 nm. It was observed from the transient photoelectron spectroscopy and the incident photon to current conversion efficiency (IPCE) spectra that the $TiO_2$ films derived from NR2 demonstrate the longest electron diffusion length ($L_e$) and the highest external quantum efficiency (EQE).

고 Gb/Chip을 위한 Pole이 추가된 MRAM의 최적 설계에 관한 연구 (Research of Optimal MRAM Adding Pole for High Gb/Chip)

  • 김동석;원혁;박관수
    • 한국자기학회지
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    • 제18권3호
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    • pp.103-108
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    • 2008
  • 비휘발성 메모리 분야에서 MRAM이 큰 주목을 받지 못하는 이유는 일반적인 비휘발성 메모리에 비해 기록용량이 작다는 문제를 안고 있기 때문이다. 이러한 문제는 MRAM의 일반적인 구조가 자기 효율이 떨어지는 구조를 가지고 있기 때문이다. MRAM이 고용량화 되기 위해선 한 셀의 구조가 작아져야 하는데 두 전류라인만을 이용하는 일반적인 구조에선 큰 기록 필드를 발생시킬 수 없기에 셀의 구조를 작게하는 것은 불가능하다. 본 논문에서는 MRAM의 기록층 양단에 큰 투자율을 가진 Pole을 추가한 형태의 새로운 MRAM을 제안하고 있다. 새로이 고안된 MRAM은 일반적인 MRAM에 비해 자기효율이 크게 향상 되기 때문에 큰 기록 필드를 발생시킬 수 있기 때문에 보자력이 큰 기록 층을 사용할 수 있고 이로 인해 한 셀의 사이즈를 줄일 수 있게 된다. 본 연구는 3차원 유한요소법을 사용하여 진행 되었다.

Capillary Flow in Different Cells of Thuja orientalis, Gmelina arborea, Phellodendron amurense

  • Chun, Su Kyoung
    • 한국가구학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.248-258
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    • 2017
  • A study was carried out to observe the 1% aqueous safranine solution flow speed in longitudinal and radial directions of softwood Thuja orientalis L., diffuse-porous wood Gmelina arborea Roxb., and ring-porous wood Phellodendron amurense Rupr., Longitudinal flow was considered from bottom to top while the radial flow was considered from bark to pith directions. In radial direction, ray cells and in longitudinal direction tracheids, vessel and wood fiber were considered for the measurement of liquid penetration speed at less than 12% moisture contents(MC). The variation of penetration speed for different species was observed and the reasons behind for this variation were explored. The highest radial penetration depth was found in ray parenchyma of T. orientalis but the lowest one was found in ray parenchyma of P. amurense. The average liquid penetration depth in longitudinal trachied of T. orientalis was found the highest among all the other cells. The penetration depth in fiber of G. arborea was found the lowest among the other longitudinal cells. It was found that cell dimension and also meniscus angle of safranine solution with cell walls were the prime factors for the variation of liquid flow speed in wood. Vessel was found to facilitate prime role in longitudinal penetration for hardwood species. The penetration depth in vessel of G. arborea was found highest among all vessels. Anatomical features like ray parenchyma cell length and diameter, end-wall pits number were found also responsible fluid flow differences. Initially liquid penetration speed was high and the nit gradually decreased in an uneven rate. Liquid flow was captured via video and the penetration depths in those cells were measured. It was found that even in presence of abundant rays in hardwood species, penetration depth of liquid in radial direction of softwood species was found high. Herein the ray length, lumen area, end wall pit diameter determined the radial permeability. On the other hand, vessel and fiber structure affected the longitudinal flow of liquids. Following a go-stop-go cycle, the penetration speed of a liquid decreased over time.

Effects of Culture Dimensions on Maintenance of Porcine Inner Cell Mass-Derived Cell Self-Renewal

  • Baek, Song;Han, Na Rae;Yun, Jung Im;Hwang, Jae Yeon;Kim, Minseok;Park, Choon Keun;Lee, Eunsong;Lee, Seung Tae
    • Molecules and Cells
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    • 제40권2호
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    • pp.117-122
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    • 2017
  • Despite the fact that porcine embryonic stem cells (ESCs) are a practical study tool, in vitro long-term maintenance of these cells is difficult in a two-dimensional (2D) microenvironment using cellular niche or extracellular matrix proteins. However, a three-dimensional (3D) microenvironment, similar to that enclosing the inner cell mass of the blastocyst, may improve in vitro maintenance of self-renewal. Accordingly, as a first step toward constructing a 3D microenvironment optimized to maintain porcine ESC self-renewal, we investigated different culture dimensions for porcine ICM-derived cells to enhance the maintenance of self-renewal. Porcine ICM-derived cells were cultured in agarose-based 3D hydrogel with self-renewal-friendly mechanics and in 2D culture plates with or without feeder cells. Subsequently, the effects of the 3D microenvironment on maintenance of self-renewal were identified by analyzing colony formation and morphology, alkaline phosphatase (AP) activity, and transcriptional and translational regulation of self-renewal-related genes. The 3D microenvironment using a 1.5% (w/v) agarose-based 3D hydrogel resulted in significantly more colonies with stereoscopic morphology, significantly improved AP activity, and increased protein expression of self-renewal-related genes compared to those in the 2D microenvironment. These results demonstrate that self-renewal of porcine ICM-derived cells can be maintained more effectively in a 3D microenvironment than in a 2D microenvironment. These results will help develop novel culture systems for ICM-derived cells derived from diverse species, which will contribute to stimulating basic and applicable studies related to ESCs.

주기적 편중 분할에 의한 다차원 데이터 디클러스터링 (Declustering of High-dimensional Data by Cyclic Sliced Partitioning)

  • 김학철;김태완;이기준
    • 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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    • 제31권6호
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    • pp.596-608
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    • 2004
  • 디스크 입출력 성능에 의해서 많은 영향을 받는 대용량의 데이타를 저장하고 처리하는 시스템에서 데이타를 다수의 병렬 디스크에 분산 시켜 저장한 후 질의 처리 시 디스크 접근 시간을 감소시키기 위한 노력들이 많이 행해졌다. 대부분의 이전 연구들은 데이타 공간이 정형의 그리드 형태로 분할되어 있다는 가정 하에 각 그리드 셀에 대해서 효과적으로 디스크 번호를 할당하는 알고리즘 연구에 치중하였다. 하지만, 그리드 형태의 분할은 저차원 데이타에 대해서는 효과적이지만 고차원 데이타에 대해서는 우수한 디스크 할당 알고리즘을 적용하더라도 디클러스터링에 의한 성능 향상을 이룰 수가 없다. 그 이유는 그리드 분할 방법은 데이타 분포 비율에 관계없이 전체 데이타 공간을 동일한 비율로 분할하기 때문이다. 고차원 데이타는 대부분 데이타 공간의 표면에 존재한다. 본 논문에서는 이와 같은 현상을 고려하여 데이타 표면으로부터 주기적으로 편중 분할하는 알고리즘을 이용한 새로운 디클러스터링 알고리즘을 제시한다. 다양한 실험 결과에 의하면 표면으로부터 주기적으로 편중 분할하는 방법은 차원이 증가할 수록, 또한 질의 크기가 증가할 수록 그리드 형태의 분할에 비해서 질의를 만족하는 데이타 블록의 수를 현저히 감소시킬 수 있다. 본 논문에서는 분할 결과 데이타 블록들의 배치(layout)를 이용한 디스크 번호 할당 알고리즘들을 제시하였다. 우리는 제시한 알고리즘의 성능을 보이기 위해서 다양한 차원과 디스크 수에 대해서 여러 가지 실험을 하였다. 본 연구에서 제시한 디스크 할당 알고리즘은 절대 최적의 디스크 할당 방법에 비해서 추가적인 디스크 접근 횟수가 10번을 넘지 않는다. 디클러스터링 알고리즘의 응답 시간에 대해서 그리드 분할에 대해서 가장 좋은 성능을 보이는 것으로 알려져 있는 Kronecker sequence을 이용한 디스크 할당 알고리즘과 비교하였으며 차원이 높아짐에 따라 최대 14배까지 성능이 향상된다.