• Title/Summary/Keyword: biomedical information

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The Portable Monitoring Device Development for Measuring Biosignal of Airport Terminal Users (공항터미널 이용자의 생체신호 측정을 위한 휴대용 모니터링 장치 개발)

  • Yang, Heui-Kyung;Lee, Jung-Whan;Lee, Young-Jae;Lee, Jae-Ho;Lim, Min-Gyu;Park, Hee-Jung;Kang, Sung-Jin;Kim, Kyung-Nam;Park, Jung-Wook
    • Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference
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    • 2014.01a
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    • pp.407-408
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    • 2014
  • 본 논문에서는 이동환경 및 이동부하를 측정하여 그 특성을 조사하기 위하여 간편하게 측정할 수 있는 휴대용 모니터링 장비를 개발하였다. 온습도 및 가속도, 생체신호를 동시에 측정할 수 있다. 본 장비의 현장적용실험을 위해 공항터미널 이용 시의 상태변화를 측정하였다. 그 결과, 이동환경에서 사용하는데 있어 간편성을 가지는 반면 추후 동잡음 제거, 피험자 편의성 등이 보완 되어야 할 것이다.

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Classifying Biomedical Literature Providing Protein Function Evidence

  • Lim, Joon-Ho;Lee, Kyu-Chul
    • ETRI Journal
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    • v.37 no.4
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    • pp.813-823
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    • 2015
  • Because protein is a primary element responsible for biological or biochemical roles in living bodies, protein function is the core and basis information for biomedical studies. However, recent advances in bio technologies have created an explosive increase in the amount of published literature; therefore, biomedical researchers have a hard time finding needed protein function information. In this paper, a classification system for biomedical literature providing protein function evidence is proposed. Note that, despite our best efforts, we have been unable to find previous studies on the proposed issue. To classify papers based on protein function evidence, we should consider whether the main claim of a paper is to assert a protein function. We, therefore, propose two novel features - protein and assertion. Our experimental results show a classification performance with 71.89% precision, 90.0% recall, and a 79.94% F-measure. In addition, to verify the usefulness of the proposed classification system, two case study applications are investigated - information retrieval for protein function and automatic summarization for protein function text. It is shown that the proposed classification system can be successfully applied to these applications.

Design and Development of a Multimodal Biomedical Information Retrieval System

  • Demner-Fushman, Dina;Antani, Sameer;Simpson, Matthew;Thoma, George R.
    • Journal of Computing Science and Engineering
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    • v.6 no.2
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    • pp.168-177
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    • 2012
  • The search for relevant and actionable information is a key to achieving clinical and research goals in biomedicine. Biomedical information exists in different forms: as text and illustrations in journal articles and other documents, in images stored in databases, and as patients' cases in electronic health records. This paper presents ways to move beyond conventional text-based searching of these resources, by combining text and visual features in search queries and document representation. A combination of techniques and tools from the fields of natural language processing, information retrieval, and content-based image retrieval allows the development of building blocks for advanced information services. Such services enable searching by textual as well as visual queries, and retrieving documents enriched by relevant images, charts, and other illustrations from the journal literature, patient records and image databases.

Hybrid Affine Registration Using Intensity Similarity and Feature Similarity for Pathology Detection

  • June-Sik Kim;Ho-Sung Kim;Jong-Min Lee;Jae-Seok Kim;In-Young Kim;Sun I. Kim
    • Journal of Biomedical Engineering Research
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    • v.23 no.1
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    • pp.39-47
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    • 2002
  • The objective of this study is to provide a Precise form of spatial normalization with affine transformation. The quantitative comparison of the brain architecture across different subjects requires a common coordinate system. For the common coordinate system, not only global brain but also a local region of interest should be spatially normalized. Registration using mutual information generally matches the whose brain well. However. a region of interest may not be normalized compared to the feature-based methods with the landmarks. The hybrid method of this Paper utilizes feature information of the local region as well as intensity similarity. Central gray nuclei of a brain including copus callosum, which is used for feature in Schizophrenia detection, is appropriately normalized by the hybrid method. In the results section. our method is compared with mutual information only method and Talairach mapping with schizophrenia Patients. and is shown how it accurately normalizes feature .

A biometric information collecting system for biomedical big data analysis (생체 의학 빅 데이터 분석을 위한 생체 정보 수집 시스템)

  • Lim, Damsub;Hong, Sunhag;Ku, Mino;Min, Dugki
    • Proceedings of the Korean Institute of Information and Commucation Sciences Conference
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    • 2013.10a
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    • pp.513-516
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    • 2013
  • In this paper, we present an information collecting system in medical information management domain. Our proposed system performs a systemized process, consisting of collection, transmission, and management, to develop intelligent medical information system and medical big data processing system. Our information collecting system consists of low-power biomedical sensors, biomedical information collecting devices, and storage systems. Currently, almost biomedical information of patients is collected manually by employees like nurses and medical doctors. Therefore, collected biometric data can be error-pronoun data. Since there is a lack to make big data of medical information, it is difficult to enhance the quality of medical services and researches. Accordingly, through our proposed system, we can overcome the problems like error-pronoun biometric data. In addition, we can extremely extend the area of collectable biometric data. Furthermore, using this system, we are able to make a real-time biomedical analysis system, like a real-time patient diagnosis system, and establish a strategy to against future medical markets changing rapidly.

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Digitize color reaction using the optical method (광학적 방법을 이용한 정색반응의 수치화)

  • Kim, A-Hee;Kim, Ji-Sun;Jung, Gu-In;Choi, Ju-Hyeon;Lee, Tae-Hee;Park, Sung-Joon;Jun, Jae-Hoon
    • Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference
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    • 2013.01a
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    • pp.277-279
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    • 2013
  • 본 논문에서는 광학적 방법을 이용하여 정색반응을 정량적으로 측정할 수 있는 방법을 제시한다. 정색반응은 발색, 변색의 현상을 일으키는 화학 변화로 시료 용액에 시약을 더하여 특수한 빛을 나타내게 하여, 물질을 정성적으로 검출하는데 이용된다. 하지만 정색반응 결과로 나타난 색상은 사람마다 색구별이 다르므로 정확한 양을 알 수는 없다. 본 연구에서는 시료의 양에 따라 색상 변화의 미세한 차이를 PICkit Serial Analyzer를 사용하여 색상을 수치화하여 시료의 양에 따른 색의 변화를 정량적으로 측정하였다.

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Development of Intergrated Ring-Type System for Measurement Signal of Electrodermal Activity Based on Dynamic State (동적 상태의 신경변화 자극에 따른 피부전도도 신호 검출을 위한 반지형 통합 측정 시스템 개발)

  • Lim, Min-Gyu;Lee, Young-Jae;Lee, Jae-Ho;Park, Hee-Jung;Kang, Seung-Jin;Kim, Kyung-Nam;Lee, Jeong-Whan
    • Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference
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    • 2013.07a
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    • pp.359-360
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    • 2013
  • 본 연구에서는 외부 자극과 내적인 교감신경의 변화에 따라 나타나는 땀 반응으로 얻어진 생체신호를 다루었다. 즉, 땀 반응을 지칭하는 피부전도도를 측정할 수 있는 시스템과, 더불어 차량 운전시 혹은 운동 등의 동적 자극에 의한 영향을 최소화하여 교감신경에 의한 피부전도도의 신뢰도를 높일 수 있는 방안을 강구하였다. 기존의 두 개의 전극 간 리지스턴스(Resistance)를 측정하는 방식을 내부에서 분리된 한 개의 전극을 사용하여 신체적 움직임의 제한점을 해소하고 피부전도도로 나타난 생체신호가 외적인 움직임에 따른 영향인지 내적인 신경의 변화에 따른 영향인지를 추정할 수 있는 모듈을 개발하였다. 20명의 건강한 청년을 대상으로 피실험하여 기존의 생체신호 측정 장비인 MP-150의 EDA모듈과 동시 측정한 결과, 두 데이터가 약 88% 일치하는 것으로 확인하였다.

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Air Bubble Detecting and Impurity Classification by permittivity change (유전율 변화를 이용한 수액 기포 검출 및 성분 분류)

  • Kang, Seung-Jin;Kim, Kyung-Nam;Lee, Young-Jae;Lim, Min-Gyu;Lee, Jae-Ho;Park, Hee-Jung;Lee, Jeong-Whan
    • Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference
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    • 2013.07a
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    • pp.357-358
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    • 2013
  • 본 논문에서는 커패시턴스를 이용해 수액 내에 있는 공기방울을 검출하고 수액의 성분을 구분 할 수 있는 측정기의 원리에 대해 제시해보려 한다. 이 측정기의 원리는 유전율의 변화를 감지하여 수액의 종류를 판단하고, 수액 내부의 기포를 검출해내는 등 의원성 사고를 근본적으로 막는 데에 그 의의가 있다. 실험결과 본 연구에서 제작한 측정기로 수액에 따른 값의 차이를 확인하였고, 발생한 기포에 대한 출력 결과를 확인할 수 있었다. 본 연구를 통해 커패시턴스 차폐의 정도가 결과의 신뢰도 측면에 중요한 요인으로 작용하고 있음을 확인 할 수 있었다. 향후 외부 간섭에 따른 노이즈에 대한 추가적인 커패시턴스 차폐 연구가 필요한 것으로 판단된다.

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Compensation of PPG signal distortion due to pressure using FSR sensors (FSR센서를 이용한 압력에 따른 PPG 신호 왜곡 보상)

  • Lee, Jae-Ho;Lee, Young-Jae;Lim, MinGyu;Park, HiJung;Lee, JeongWhan
    • Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference
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    • 2013.01a
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    • pp.281-282
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    • 2013
  • 맥박을 측정하는 방법 중 하나인 PPG(photoplethysmography) 센서는 설계가 비교적 간편하며 사용이 편한 장점이 있지만, 움직임으로 인한 동잡음에 취약하다는 단점이 있다. 본 논문에서는 동잡음으로 인한 센서와 손가락 사이의 밀착되는 압력의 변화를 측정하여 왜곡된 신호를 보상하였다. PPG센서와 손가락 사이의 압력을 측정하기 위하여 FSR(force sensing resistor)센서를 이용하여 측정하였으며, 측정된 압력과 왜곡된 PPG 신호 비교를 통해 왜곡된 PPG신호와 FSR센서에서 얻은 압력 사이의 연관성을 확인하였고, 신호처리를 통하여 왜곡된 신호를 보상 시켰다. 이와 같은 방법으로 PPG신호를 보상하게 된다면 웨어러블한 환경에서의 적용뿐만 아니라 헬스케어로 응용이 가능할 것으로 보인다.

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Signal Processing and Data Management in SiMACS (SiMACS에서의 생체신호처리 및 데이터관리)

  • Suh, J.J.;Kim, J.J.;Lee, S.B.;Park, S.H.;Woo, E.J.
    • Proceedings of the KOSOMBE Conference
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    • v.1994 no.05
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    • pp.57-59
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    • 1994
  • In this paper, we present the software part of the intelligent data processing unit (IDPU), which plays an important role in SiMACS. The software system processes ECG, EEG, EMG, blood pressure, respiration, temperature signals, and extracts some information about patient conditions. It displays the patient condition information and the signal data synchronously, and manages them together with other patient personal data in a network-based client/server environment. The software system is designed in an object-oriented paradigm, and implemented in C++ as a window-based application program.

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