• 제목/요약/키워드: batch assay

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Selection of Well Labelled Insulin Fractions for Radioimmunoassay Use

  • Awh, Ok-Doo;Kim, Jae-Rok
    • Nuclear Engineering and Technology
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    • 제12권2호
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    • pp.121-126
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    • 1980
  • 효과적인 저농도 인슈린 방사면역 측정법 확립 및 표지인슈린의 면역학적 환성과 탄소분말에 대한 흡착력의 상관관계를 밝히기 위하여 이들 두 다른 기준에 기초를 둔 두가지의 최적표지 인슈린선정방법을 비교한결과 탄소분말흡착에 의한 방법은 부적당함을 알 수 있었다. 일반적으로 표지인슈린의 방사능, 항체결합능, 탄소분말흡착능등은 서로 일치하지 않았다. 따라서 측정신뢰도를 높이기 위해서는 매 표지때마다 항체결합능으로 최적표지 인슈린을 선정해야 하며 탄소분말 흡착력으로 선정하면 안된다고 본다. 항체결합능에 따라 선정된 표지 인슈린을 써서 대조혈청중의 인슈린량이 정화히 측정되었으며 정온유지시간을 96시간으로 연장함으로써 5 $\mu$U/ml 하의 표준 인슈린투여 량에 대해서도 매우 예리한 응답곡선을 얻을 수 있었다.

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Quantitative Polymerase Chain Reaction for Microbial Growth Kinetics of Mixed Culture System

  • Cotto, Ada;Looper, Jessica K.;Mota, Linda C.;Son, Ahjeong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제25권11호
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    • pp.1928-1935
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    • 2015
  • Microbial growth kinetics is often used to optimize environmental processes owing to its relation to the breakdown of substrate (contaminants). However, the quantification of bacterial populations in the environment is difficult owing to the challenges of monitoring a specific bacterial population within a diverse microbial community. Conventional methods are unable to detect and quantify the growth of individual strains separately in the mixed culture reactor. This work describes a novel quantitative PCR (qPCR)-based genomic approach to quantify each species in mixed culture and interpret its growth kinetics in the mixed system. Batch experiments were performed for both single and dual cultures of Pseudomonas putida and Escherichia coli K12 to obtain Monod kinetic parameters (μmax and Ks). The growth curves and kinetics obtained by conventional methods (i.e., dry weight measurement and absorbance reading) were compared with that obtained by qPCR assay. We anticipate that the adoption of this qPCR-based genomic assay can contribute significantly to traditional microbial kinetics, modeling practice, and the operation of bioreactors, where handling of complex mixed cultures is required.

Biosurfactant Production from Novel Air Isolate NITT6L: Screening, Characterization and Optimization of Media

  • Vanavil, B.;Perumalsamy, M.;Rao, A. Seshagiri
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제23권9호
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    • pp.1229-1243
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    • 2013
  • In this paper, an air isolate (NITT6L) has been screened based on hemolytic activity, emulsification activity, drop collapsing test, and oil displacement test, as well as lipase activity. It was found that strain NITT6L was able to reduce the surface tension of the medium from 61.5 to 39.83 mN/m and could form stable emulsions with tested vegetable oils. Morphological, biochemical, 16S rRNA sequencing analyses, and fatty acid methyl ester analysis using gas chromatography confirmed that the air isolate under study was Pseudomonas aeruginosa. Characterization of the biosurfactant using agar double diffusion assay revealed that the biosurfactant was anionic in nature, and CTAB-methylene blue assay and Molisch test revealed its glycolipid nature. The FT-IR spectrum confirmed that the crude biosurfactant was a rhamnolipid. Using unoptimized medium containing sucrose as the carbon source, the isolate was found to produce 0.3 mg/ml of rhamnolipid in batch cultivation (shake flask) at $37^{\circ}C$ and pH 7. Optimization of the medium components was carried out using design of experiments and the yield of rhamnolipid has been enhanced to 4.6 mg/ml in 72 h of fermentation.

Solid-Phase Extraction of L-Muscone from Aqueous Samples with Amberlite XAD-4 for Gas Chromatographic Assay

  • Paik, Man-Jeong;Kim, Kyoung-Rae
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제27권5호
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    • pp.539-543
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    • 2004
  • An efficient analytical method was devised for the accurate L-muscone assay in aqueous samples. It involves solid-phase extraction of L-muscone in adsorption mode using XAD-4 as the sorbent and dichloromethane modified with 10% (v/v) methanol as the eluting solvent. The gas chromatographic analysis of the eluate residue dissolved in toluene on a DB-5MS capillary column provided complete resolution of L-muscone from the co-extracted interferences. The overall method showed excellent linearity ($r^2{\geq}$ 0.9994) in the range of 0.1 to 2.0 $\mu\textrm{g}$/mL with good intra- and inter-day precisions (% RSD = 2.5~7.3) and with high extraction recovery rates ($\geq$ 98.1 %). When the present method was applied to a L-muscone herbal drink product, the within-batch RE (%) in the labeled concentration (1.5 $\mu\textrm{g}$/mL) for the three randomly chosen bottles were -2.4, -1.3 and -3.3 with high precision (% RSD $\leq$ 3.1). The present method is considered to be suitable for quality control evaluation on liquid drinks and other complex formulations fortified with L-muscone.

Saccharomyces cerevisiae에서 합성된 Human Lysozyme 유전자의 발현증대 (Increased Expression of a Chemically Synthesized Human Lysozyme Gene in Saccharomyces cerevisiae)

  • 김기운;최선욱;이승철;백현동;황용일
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.34-39
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    • 1998
  • 본 연구에서는 안정성이 보장된 효모를 숙주로 하여 이미 lysozyme 생산능이 확인된 저 copy수의 YCp type인 pHK101의 생산능을 높이기 위해 고발현 벡터인 다 copy 수의 YEp type인 pHK501을 구축하였다. pHK501과 pHK101형질전환체의 M. luteus를 기질로 한 lysoplate assay 비교에서 확실한 생산량의 증가를 생육저지환을 통해 확인하였다. 또한 E. coli에서 peptidoglycan만을 추출하여 기질로 사용한 lysoplate assay에서도 pHK501형질전환체의 배양액 중에는 정상적 인 HLY의 생산을 직접 확인할 수 있었다. 플라스크 배양에서 배양시간에 따른 HLY의 최대 생산량은 81시간만에 pHK501형질전환체가 55 units/$m\ell$에 도달됨으로써 pHK101(7 units/$m\ell$)에 비해 약 8배 증가됐다. 발효조규모에서의 HLY 생산은 24시간만에 26.8 units/$m\ell$(1.12 units/$m\ell$/h)에 도달하였고 전체 생산성은 플라스크배양(0.625 units/$m\ell$/h)에 비해 약 1.8배 정도 증가되었다.

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The Application of ParalluxTM System for Multi-Detection of (Fluoro)quinolone Class Antibiotics Residues in Raw Bovine Milk

  • Park, Hong-Je;Kim, Gyung-Dong;Han, Kyu-Ho;Lee, Chi-Ho
    • 한국축산식품학회지
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    • 제33권2호
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    • pp.198-204
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    • 2013
  • This study aimed to apply the Parallux system to detect (fluoro)quinone antibiotics residues in raw bovine milk. The immunogen enabled the generation of a specific antiserum with a titer of 1/40,000. The $Parallax^{TM}$ kit using the antibody displayed $IC_{50}$ value of 10 to 150 ppb for (fluoro)quinolone antibiotics. $Parallax^{TM}$ kit was also sensitive for the detection of incurred (fluoro)quinolone at Korean Maximum Residual Levels in raw bovine milk as the result of dose response test. Cross reactivities of the antibody with the common (fluoro)quinolones were determined to be norfloxacin, 100%; enrofloxacin, 100%; ciprofloxacin, 100%; danofloxacin, 100%; nalidixic acid, 40%. Lower detection limit (LOD) values of the $Parallax^{TM}$ kit in raw bovine milk were determined to be norfloxacin, 4 ppb; enrofloxacin, 5 ppb; danofloxacin, 5 ppb; ciprofloxacin, 5 ppb and nalidixic acid, 10 ppb. The $Parallax^{TM}$ kit was run 8 times with five different concentrations of norfloxacin to determine the coefficient of variation (CV, %) of intra-assay, which was between 2.7% and 11.8%. To confirm the precision among kit batches for the inter-assay, five different batch kits were tested with 2 different concentration of norfloxacin. The CVs of the inter assay were 4.2% at 50 ppb, and 7.2% at 10 ppb norfloxacin, respectively.

혈장분획제제 제조공정에서 크로마토그래피 세척 검증을 위한 모델바이러스로서의 Porcine Parvovirus 정량 (Quantitative Real-Time PCR of Porcine Parvovirus as a Model Virus for Cleaning Validation of Chromatography during Manufacture of Plasma Derivatives)

  • 길태건;김원중;이동혁;강용;성학모;유시형;박순희;김인섭
    • 미생물학회지
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    • 제41권3호
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    • pp.216-224
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    • 2005
  • 혈장분획제제 중 혈액응공인자제제와 일부 면역글로불린제제는 혈장에 존재하는 다양한 단백질로부터 유효한 단백성분만을 선택적으로 분리 정제하기 위해 크로마토그래피 방법을 사용하여 생산된다. 효율적인 세척(cleaning) 공정이 이루어지지 않는다면 크로마토그래피는 다양한 종류의 불순물뿐만 아니라 혈액 중 내재 또는 오염 가능성이 있는 위해인자가 오염될 가능성이 있다. 본 연구에서는 혈장분획제제 제조공정에 사용되는 크로마토그래피의 세척 공정에서 혈장유래 바이러스의 제거 및 불활화 공정의 검토 강화로 혈장분획제제의 안전성을 확보하기 위해 크로마토그래피 세척 검증 시스템을 구축하고자 하였다. 크로마토그래피 세척 공정 중 바이러스 제거 검증을 위해 혈장유래 바이러스 중 물리${\cdot}$화학적 처리에 가장 큰 저항성을 갖는 human parvovirus B19의 모델 바이러스의 porcine parvovirus(PPV)를 대상으로 real-time PCR 정량법을 확립하였다. PPV에 특이적인 primer를 선별하였으며 형광염료 SYBR Green I을 사용하여 PPV DNA를 정량하였다. 세포배양법에 의한 감염 역가와 비교한 결과 PCR 민감도는 1.5 $TCID_{50}/ml$이었다. 확립된 검증법의 신뢰성(reliability)을 보증하기 위해 실험법의 특이성(specificity), 재현성(reproducibility) 등을 검증하였다. 구축된 검증시스템을 thrombin 분리${\cdot}$정제를 위한 SP-Sepharose 양이온 크로마토그래피 공정과 factor VIII 분리${\cdot}$정제를 위한 Q-Sepharose 음이온 크로마토그래피 공정에 적용하여 크로마토그래피 세척 검증을 실시하고, 세척 검증 시스템의 적합성을 확인하였다.

Marsh와 Pond 형태의 Microcosm 습지 시스템을 이용한 TNT(2,4,6-trinitrotoluene)의 분해 연구 (A Study on the Removal of TNT(2,4,6-trinitrotoluene) using Marsh and Pond Type Microcosm Wetland Systems)

  • 최종규;김세경;강호정;조경덕
    • 대한환경공학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.198-205
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    • 2005
  • 본 연구에서는 marsh와 pond의 조합으로 구성된 회분식과 연속식 습지 반응조를 이용하여 화약물질인 TNT(2,4,6-trinitrotoluene)를 처리하는 실험을 수행하였다. 회분식 실험결과 10 mg/L의 TNT가 20일 이내에 marsh와 pond 반응조 내에서 모두 제거되었다. TNT의 분해에 따른 주요 분해 부산물들은 2,4-diamino-6-nitrotoluene(2,4-DANT), 2,6-diamino-4-nitrotoluene(2,6-DANT), 4-diamino-2,6-nitrotoluene(4-ADNT), 그리고 2-diamino-4,6-nitrotoluene(2-ADNT)이었으며 시간이 경과하면서 이들 부산물도 점차 감소하는 경향을 보였다. 다음으로 Marsh와 pond의 조합으로 이루어진 연속식 반응조를 이용하여 TNT를 처리한 결과 회분식 반응조와 비슷한 경향을 보였으며, 2일 이내에 수중에서 거의 모든 TNT가 제거되었다. 주요 부산물은 marsh와 pond 단일조합 반응조에서는 ADNT(mono amino-dinitrotoluene)계열의 부산물이었던 반면, marsh-pond, pond-marsh 연속식 반응조에서는 분해가 된 DANT(diamino-mononitrotoluene)가 주된 부산물로 관찰되어 혐기성과 호기성 조건을 동시에 가지는 연속식 조합 습지 시스템이 TNT의 분해에 더 효과적임을 알 수 있었다. 또한 습지의 유입수와 처리수의 독성을 평가하기 위해 Microtox Assay를 통하여 분석한 결과, marsh와 pond의 연속식 복합 반응조의 처리수는 $EC_{50}$를 계산할 수 없을 정도로 독성이 감소됨을 알 수 있었다. 이들 실험결과를 통하여 marsh와 pond의 조합으로 혐기성과 호기성을 동시에 마련한 인공습지 시스템을 이용하여 수중에 존재하는 TNT를 안정적으로 처리할 수 있었다.

Effects of Substrate to Inoculum Ratio on the Biochemical Methane Potential of Piggery Slaughterhouse Wastes

  • Yoon, Young-Man;Kim, Seung-Hwan;Shin, Kook-Sik;Kim, Chang-Hyun
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제27권4호
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    • pp.600-607
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    • 2014
  • The aim of this study was to assess the effect of substrate to inoculum ratio (S/I ratio) on the biochemical methane potential (BMP) and anaerobic biodegradability ($D_{deg}$) of different piggery slaughterhouse wastes, such as piggery blood, intestine residue, and digestive tract content. These wastes were sampled from a piggery slaughterhouse located in Kimje, South Korea. Cumulative methane production curves for the wastes were obtained from the anaerobic batch fermentation having different S/I ratios of 0.1, 0.5, 1.0, and 1.5. BMP and anaerobic biodegradabilities ($D_{deg}$) of the wastes were calculated from cumulative methane production data for the tested conditions. At the lowest S/I ration of 0.1, BMPs of piggery blood, intestine residue, and digestive tract content were determined to be 0.799, 0.848, and $1.076Nm^3kg^{-1}-VS_{added}$, respectively, which were above the theoretical methane potentials of 0.539, 0.644, and $0.517Nm^3kg^{-1}-VS_{added}$ for blood, intestine residue, and digestive tract content, respectively. However, BMPs obtained from the higher S/I ratios of 0.5, 1.0, and 1.5 were within the theoretical range for all three types of waste and were not significantly different for the different S/I ratios tested. Anaerobic biodegradabilities calculated from BMP data showed a similar tendency. These results imply that, for BMP assay in an anaerobic reactor, the S/I ratio of anaerobic reactor should be above 0.1 and the inoculum should be sufficiently stabilized to avoid further degradation during the assay.

혼합 메탄균과 반추위 섬유소 분해균 첨가가 메탄발생에 미치는 영향 (Effects of Supplementation of Mixed Methanogens and Rumen Cellulolytic Bacteria on Biochemical Methane Potential)

  • 김지애;윤영만;김창현
    • 한국토양비료학회지
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    • 제45권4호
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    • pp.515-523
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    • 2012
  • 본 연구는 메탄생성에 직접적으로 관여하는 혼합 메탄균과 셀롤로스 등의 고분자 물질의 가수분해 반응에 활성이 뛰어난 반추위 내 혐기성 섬유소분해균 중에서 대표적인 Fibrobacter succinogenes, Ruminococcus flavefaciens 및 Ruminococcus albus를 biochemical methane potential (BMP) 시험에 첨가하였을 때 메탄 발생에 미치는 영향을 조사하고자 수행되었다. BMP시험은 멸균증류수를 첨가한 control과 각각의 미생물 배양액을 첨가한 혼합 메탄균 첨가구 (M), F. succinogenes 첨가구 (FS) R. flavefaciens 첨가구 (RF), R. albus 첨가구 (RA) 및 RA+FS 혼합첨가구와 M+RA+FS 혼합 첨가구로 총 7개 처리구로 각 처리구별 3반복으로 진행되었다. 미생물 배양액의 첨가량은 식종액과 기초혐기배지 (anaerobic basic medium) 혼합액 50 mL에 1% (0.5 mL), 3% (1.5 mL) 및 5% (2.5 mL) 씩 첨가 하였고 배양을 위한 기질로는 cellulose ($2.0g\;VS\;L^{-1}$)이 이용되었다. BMP 시험을 위해 40일간 배양이 지속되었고 중온소화를 위해 $38^{\circ}C$의 배양기에서 수행되었다. 실험의 결과 총 바이오가스 및 메탄 발생량은 5% FS에서 다른 처리구와 비교하여 각각 10.4~22.7% 및 17.4~27.5% 높았다 (p<0.05). 총고형물 (TS) 분해율도 가스발생 결과와 유사하였는데, 전반적으로 FS가 높게 나타났으며, 5% FS에서 64.2%로 가장 높았다. 휘발성 고형물 (VS) 분해율은 5% FS와 5% RF가 각각 68.4 및 71.0%로 가장 높았다. BMP 종료시 배양액내 pH는 모든 처리구가 6.4이상으로 메탄발효에 큰 영향을 주지 않았음을 알 수 있었다. 결론적으로 본 실험의 결과 혐기소화에 대한 회분식 배양에서는 메탄생성단계보다는 가수분해단계에서 특히, F. succinogenes 배양액의 첨가량이 증가할수록 메탄의 생성량을 증가시킴을 알 수 있었다.