Song, Minyu;Kim, Hyaekang;Kwak, Woori;Park, Won Seo;Yoo, Jayeon;Kang, Han Byul;Kim, Jin-Hyoung;Kang, Sun-Moon;Van Ba, Hoa;Kim, Bu-Min;Oh, Mi-Hwa;Kim, Heebal;Ham, Jun-Sang
한국축산식품학회지
/
제39권4호
/
pp.601-609
/
2019
Bifidobacterium longum KACC 91563 secretes family 5 extracellular solute-binding protein via extracellular vesicle. In our previous work, it was demonstrated that the protein effectively alleviated food allergy symptoms via mast cell specific apoptosis, and it has revealed a therapeutic potential of this protein in allergy treatment. In the present study, we cloned the gene encoding extracellular solute-binding protein of the strain into the histidine-tagged pET-28a(+) vector and transformed the resulting plasmid into the Escherichia coli strain BL21 (DE3). The histidine-tagged extracellular solute-binding protein expressed in the transformed cells was purified using Ni-NTA affinity column. To enhance the efficiency of the protein purification, three parameters were optimized; the host bacterial strain, the culturing and induction temperature, and the purification protocol. After the process, two liters of transformed culture produced 7.15 mg of the recombinant proteins. This is the first study describing the production of extracellular solute-binding protein of probiotic bacteria. Establishment of large-scale production strategy for the protein will further contribute to the development of functional foods and potential alternative treatments for allergies.
Objective: With the rapid development of proteomics sequencing and RNA sequencing technology, multi-omics analysis has become a current research hotspot. Our previous study indicated that Xinjiang brown cattle have better meat quality than Kazakh cattle. In this study, Xinjiang brown cattle and Kazakh cattle were used as the research objects. Methods: Proteome sequencing and RNA sequencing technology were used to analyze the proteome and transcriptome of the longissimus dorsi muscle of the two breeds of adult steers (n = 3). Results: In this project, 22,677 transcripts and 1,874 proteins were identified through quantitative analysis of the transcriptome and proteome. By comparing the identified transcriptome and proteome, we found that 1,737 genes were identified at both the transcriptome and proteome levels. The results of the study revealed 12 differentially expressed genes and proteins: troponin I1, crystallin alpha B, cysteine, and glycine rich protein 3, phosphotriesterase-related, myosin-binding protein H, glutathione s-transferase mu 3, myosin light chain 3, nidogen 2, dihydropyrimidinase like 2, glutamate-oxaloacetic transaminase 1, receptor accessory protein 5, and aspartoacylase. We performed functional enrichment of these differentially expressed genes and proteins. The Kyoto encyclopedia of genes and genomes results showed that these differentially expressed genes and proteins are enriched in the fatty acid degradation and histidine metabolism signaling pathways. We performed parallel reaction monitoring (PRM) verification of the differentially expressed proteins, and the PRM results were consistent with the sequencing results. Conclusion: Our study provided and identified the differentially expressed genes and proteins. In addition, identifying functional genes and proteins with important breeding value will provide genetic resources and technical support for the breeding and industrialization of new genetically modified beef cattle breeds.
Kim, Eunju;Kim, Seong Bum;Baek, Youl Chang;Kim, Min Seok;Choe, Changyong;Yoo, Jae Gyu;Jung, Younghun;Cho, Ara;Kim, Suhee;Do, Yoon Jung
한국동물위생학회지
/
제41권4호
/
pp.221-228
/
2018
Rumen cannulation is used for nutritional and microbiological research, clinical diagnosis, and rumen component transfaunation. However, the cannulation procedure can affect parameters such as complete blood count findings, serum chemistry, and rumen fluid pH. The objective of this study was to evaluate the health risks related to the rumen cannulation procedure over a 1-month period. We did not identify significant differences in red blood cell numbers or morphologies between pre- and postoperative timepoints. Moreover, no inflammation or infection was detected. Despite the absence of apparent clinical signs after surgery, serum chemistry results revealed changes in blood urea nitrogen levels and the activities of liver enzymes, including aspartate transaminase, lactate dehydrogenase, and creatinine kinase, from postoperative days 1 to 14. Rumen fluid pH, as measured from samples collected via an orogastric tube, was slightly increased after a preoperative fasting period and on postoperative day 1 but decreased thereafter from postoperative day 4, indicating a minor influence of cannulation surgery on ruminal fluid pH. This is the first study to evaluate hematological parameters and rumen pH before and after rumen cannulation surgery in Hanwoo cattle. Further research is required to better elucidate the potential effects of rumen cannulation surgery on animal health.
The objectives of this study were to confirm a location of the calpastatin (CAST) gene in chromosome 2 and to detect associations of genetic variations with economic traits in the porcine CAST gene as a candidate gene for growth and meat quality traits in pigs. Calpastatin is a specific endogenous inhibitor of calpains. The calpain protease system is ubiquitous, and is involved in numerous growth and metabolic processes. Three single nucleotide variations were identified within a 1.6 kb fragment of the porcine CAST gene and these polymorphisms were used for genetic linkage mapping. Linkage and QTL mapping were performed with the National Livestock Research Institute (NLRI) reference families using eight microsatellites and SNP makers in the CAST gene. The porcine CAST gene was mapped adjacent to the markers, SW395 and SW1695 on SSC2 with LOD scores of 15.32 and 8.50, respectively. According to the QTL mapping, a significant association was detected at 82 cM between SW395 and CAST-Hinf I for weight at the age of 30 weeks. In addition, an association study was performed with the $F_2$ animals of NLRI reference families for Hinf I, Msp I and Rsa I polymorphisms in the CAST gene. Two polymorphisms, CAST-Rsa I and CAST-Hinf I, showed significant correlation for growth traits at p<0.01 and p<0.05, respectively.
Wang, Shu;Ma, Yi Jia;Li, Yong Shi;Ge, Xu Sheng;Lu, Chang;Cai, Chun Bo;Yang, Yang;Zhao, Yan;Liang, Guo Ming;Guo, Xiao Hong;Cao, Guo Qing;Li, Bu Gao;Gao, Peng Fei
Animal Bioscience
/
제35권7호
/
pp.975-988
/
2022
Objective: In this study, we aimed to identify long non-coding RNAs (lncRNAs) that play important roles in starvation stress, analyze their functions, and discover potential molecular targets to alleviate starvation stress to provide a theoretical reference for subsequent in-depth research. Methods: We generated a piglet starvation stress animal model. Nine Yorkshire weaned piglets were randomly divided into a long-term starvation stress group (starved for 72 h), short-term starvation stress group (starved for 48 h), and the control group. LncRNA libraries were constructed using high-throughput sequencing of piglet ileums. Results: We obtained 11,792 lncRNAs, among which, 2,500 lncRNAs were novel. In total, 509 differentially expressed (DE)lncRNAs were identified in this study. Target genes of DElncRNAs were predicted via cis and trans interactions, and functional and pathway analyses were performed. Gene ontology functions and Kyoto encyclopedia of genes and genomes analysis revealed that lncRNA-targeted genes mainly participated in metabolic pathways, cellular processes, immune system processes, digestive systems, and transport activities. To reveal the mechanism underlying starvation stress, the interaction network between lncRNAs and their targets was constructed based on 26 DElncRNAs and 72 DEmRNAs. We performed an interaction network analysis of 121 DElncRNA-DEmRNA pairs with a Pearson correlation coefficient greater than 0.99. Conclusion: We found that MSTRG.19894.13, MSTRG.16726.3, and MSTRG.12176.1 might play important roles in starvation stress. This study not only generated a library of enriched lncRNAs in piglets, but its outcomes also provide a strong foundation to screen key lncRNAs involved in starvation stress and a reference for subsequent in-depth research.
PET allows non-invasive, quantitative and repetitive imaging of biological function in living animals. Small animal PET imaging with $[^{18}F]$FDG has been successfully applied to investigation of metabolism, receptor-ligand interactions, gene expression, adoptive cell therapy and somatic gene therapy. Experimental condition of animal handling impacts on the biodistribution of $[^{18}F]$FDG in small animal study. The small animal PET and CT images were registered using the hardware fiducial markers and small animal contour point. Tumor imaging in small animal with small animal $[^{18}F]$FDG PET should be considered fasting, warming, and isoflurane anesthesia level. Registered imaging with small animal PET and CT image could be useful for the detection of tumor. Small animal experimental condition of animal handling and registration method will be of most importance for small lesion detection of metastases tumor model.
Kang, Kwon;Seo, Dong-Won;Lee, Jae-Bong;Jung, Eun-Ji;Park, Hee-Bok;Cho, In-Cheol;Lim, Hyun-Tae;Lee, Jun Heon
Journal of Animal Science and Technology
/
제55권4호
/
pp.231-235
/
2013
Carcass weight (CW) is one of the most important economic traits in pigs, directly affecting the income of farmers. In this study, a genome wide association study was performed to detect significant single nucleotide polymorphisms (SNPs) affecting CW in pigs derived from a $F_2$ intercross between Landrace and Korean native pig (KNP). Using high-density porcine SNP chips, highly significant SNPs were identified on SSC12. Two candidate genes, LOC100523510 and LOC100621652, were subsequently selected within this region and further investigated. Within these candidate genes, five SNPs were identified and genotyped using the VeraCode GoldenGate assay. The results revealed that one SNP in the LOC100621652 gene and four SNPs in the LOC100523510 gene are highly associated with CW. These SNP markers can thus have significant applications for improving CW in KNP. However, the functions of these candidate genes are not fully understood and require further study.
반려인 들이 늘어나고 반려동물 시장이 크게 증가하고 있으나, 반려동물의 장례 관련 연구는 미비하다. 반려동물 장례의 성장가능성을 타진하고자 반려동물 장례에 대한 인식을 설문을 통하여 조사하였다. 조사 결과 긍정적 인식에 영향을 미치는 요인으로 반려동물 유무, 연령, 종교, 결혼 유무 등이 있었다. 인식조사 결과에서 반려동물 장례에 대한 인식은 긍정적이었으나, 현재 이를 수용할 반려동물 장례에 대한 준비는 미흡하다. 본 연구를 통해 국내 반려동물 장례의 증가가 예상됨에 따라 반려동물의 장례와 사체처리를 동물보호법 상으로 통합하고, 반려동물 장례관련 대책마련과 체계화된 반려동물 전문 장례인력 육성에 힘써야 할 것이다.
This study was carried out to set up the effective development strategy for resources industry of Chungnam Province. Data were gathered from relevant organizations and several times of brain storming was conducted by specialists in the field of animal science. The results obtained were as follows; 1) It was found by SWOT analysis that pig, cow, poultry, pets and selected fishes were desirable items as promising animal resources(Table 9). 2) According to the road map of animal resources industry for Chungnam Province, the principles and strategies were needed for the implementation of the industry(Fig. 3). 3) It was recommended that each city and county should develop their major animal resources industry(Fig. 4). 4) For synergy effect of development strategy as animal resources industry, networking among universities, industries, and government organizations, etc. is needed.
Objective: A genomic region associated with a particular phenotype is called quantitative trait loci (QTL). To detect the optimal F2 population size associated with QTLs in native chicken, we performed a simulation study on F2 population derived from crosses between two different breeds. Methods: A total of 15 males and 150 females were randomly selected from the last generation of each F1 population which was composed of different breed to create two different F2 populations. The progenies produced from these selected individuals were simulated for six more generations. Their marker genotypes were simulated with a density of 50K at three different heritability levels for the traits such as 0.1, 0.3, and 0.5. Our study compared 100, 500, 1,000 reference population (RP) groups to each other with three different heritability levels. And a total of 35 QTLs were used, and their locations were randomly created. Results: With a RP size of 100, no QTL was detected to satisfy Bonferroni value at three different heritability levels. In a RP size of 500, two QTLs were detected when the heritability was 0.5. With a RP size of 1,000, 0.1 heritability was detected only one QTL, and 0.5 heritability detected five QTLs. To sum up, RP size and heritability play a key role in detecting QTLs in a QTL study. The larger RP size and greater heritability value, the higher the probability of detection of QTLs. Conclusion: Our study suggests that the use of a large RP and heritability can improve QTL detection in an F2 chicken population.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.