Antibiotics used to be supplemented to animal feeds as growth promoter and as an effective strategy to reduce the burden of pathogenic bacteria present in the gastro-intestinal tract. However, in-feed antibiotics also kill bacteria that may be beneficial to the animal. Secondly, unrestricted use of antibiotics enhanced the antibiotic resistance in pathogenic bacteria. To overcome above problems, scientists are taking a great deal of measures to develop alternatives of antibiotics. There is convincing evidence that probiotics could replace in-feed antibiotics in poultry production. Because they have beneficial effects on growth performance, meat quality, bone health and eggshell quality in poultry. Better immune responses, healthier intestinal microflora and morphology which help the birds to resist against disease attack were also identified with the supplementation of probiotics. Probiotics establish cross-feeding between different bacterial strains of gut ecosystem and reduce the blood cholesterol level via bile salt hydrolase activity. The action mode of probiotics was also updated according to recently published literatures, i.e antimicrobial substances generation or toxin reduction. This comprehensive review of probiotics is aimed to highlight the beneficial effects of probiotics as a potential alternative strategy to replace the antibiotics in poultry.
Transposable elements (TEs) account for approximately 45% of the human genome. TEs have proliferated randomly and integrated into functional genes during hominoid radiation. They appear as right-handed B-DNA double helices and slightly elongated left-handed Z-DNAs. Human endogenous retrovirus (HERV) families are widely distributed in human chromosomes at a ratio of 8%. They contain a 5'-long terminal repeat (LTR)-gag-pol-env-3'-LTR structure. LTRs contain the U3 enhancer and promoter region, transcribed R region, and U5 region. LTRs can influence host gene expression by acting as regulatory elements. In this review, we describe the alternative promoters derived from LTR elements that overlap Z-DNA by comparing Z-hunt and DeepZ data for human functional genes. We also present evidence showing the regulatory activity of LTR elements containing Z-DNA in GSDML. Taken together, the regulatory activity of LTR elements with Z-DNA allows us to understand gene function in relation to various human diseases.
Muhammad Umer Zahid;Anjum Khalique;Shafqat Nawaz Qaisrani;Muhammad Ashraf;Ali Ahmad Sheikh;Muhammad Umar Yaqoob
Animal Bioscience
/
제36권7호
/
pp.1059-1066
/
2023
Objective: Present study was designed to evaluate the efficacy of Acacia nilotica bark extract as an alternative to antibiotic growth promoters in broilers. Methods: Six hundred, day-old broiler chicks were randomly divided into six groups (NC, without any supplementation; AB, NC+Zinc Bacitracin; PB, NC+Safmannan; ANBE1, NC+A. nilotica bark extract 0.1%; ANBE3, NC+A. nilotica bark extract 0.3%; ANBE5, NC+A. nilotica bark extract 0.5%), with ten replicates per group (10 chicks/replicate) and feeding trial was lasted for 35 days. Results: Results showed that weight gain (1,296.63 g) and feed conversion ratio (FCR, 1.59) of AB was better than NC, during the finisher phase. Overall FCR of AB (1.53), PB (1.54), and ANBE5 (1.54) was significantly (p<0.05) better than NC. From carcass parameters relative weight of wing and heart were highest in ANBE3 (2.5% and 1.51%, respectively). Significantly (p<0.05) highest blood glucose level was observed in NC (264.5 mg/dL) and highest albumin concentration was found in AB (1.46 mg/dL). In addition, antibody titer levels against ND and IBD were higher in ANBE5 than NC, while higher relative weight of bursa was observed in ANBE3 than NC. The villus height to crypt depth ratio in all experimental groups was better than NC. Conclusion: Acacia nilotica bark extract could be a suitable alternative to antibiotic growth promoters to support the growth in broilers.
한국생물정보시스템생물학회 2000년도 International Symposium on Bioinformatics
/
pp.69-70
/
2000
The completion of sequencing human genome would motivate us to map millions of human cDNAs onto the unique ruler "genome sequence", in order to identify the exact address of each cDNA together with its exons, its promoter region, and its alternative splicing patterns. The expression patterns of some cDNAs could therefore be associated with these precise gene addresses, which further accelerate studies on mining correlations between motifs of promoters and expressions of genes in tissues. Towards the realization of this goal, we have developed a time-and-space efficient software named SQUALL that is able to map one cDNA sequence of length a few thousand onto a long genome sequence of length thirty million in a couple of minutes on average. Using SQUALL, we have mapped twenty thousand of our Bodymap (http://bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp) cDNAs onto the genome sequences of Chr.21st and 22nd. In this talk, I will report the status of this ongoing project.
As host for the production of eucaryotic heterologous proteins, methylotrophic yeast Pichia pastoris and Hansenula polymorpha are the most highly developed of a small group of alternative yeast species chosen for their perceived advantages. This paper describes the method to enhance the recombinant protein productivity with P. pastoris and H. Plymorpha. In these experiments, the effects of methanol induction timing, induction method, pH, culture temperature and kinds of nitrogen sources on foreign protein production were tested with P. pastoris and compared with H. polymorpha.. In addition, optimum methanol concentration as inducer and the effects of carbon sources on AOX1 or MOX promoter repression and secretion efficiency were also studied in both cases.
Sheyhidin, Ilyar;Hasim, Ayshamgul;Zheng, Feng;Ma, Hong
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
제15권23호
/
pp.10299-10306
/
2015
The esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is thought to develop through a multi-stage process. Epigenetic gene silencing constitutes an alternative or complementary mechanism to mutational events in tumorigenesis. Posttranscriptional regulation of human leukocyte antigen class I (HLA-I) and antigen processing machinery (APM) proteins expression may be associated with novel epigenetic modifications in cancer development. In the present study, we determined the expression levels of HLA-I antigen and APM components by immunohistochemistry. Then by a bisulfite-sequencing PCR (BSP) approach, we identified target CpG islands methylated at the gene promoter region of APM family genes in a ESCC cell line (ECa109), and further quantitative analysis of CpG site specific methylation of these genes in cases of Kazakh primary ESCCs with corresponding non-cancerous esophageal tissues using the Sequenom MassARRAY platform. Here we showed that the development of ESCCs was accompanied by partial or total loss of protein expression of HLA-B, TAP2, LMP7, tapasin and ERp57. The results demonstrated that although no statistical significance was found of global target CpG fragment methylation level sof HLA-B, TAP2, tapasin and ERp57 genes between ESCC and corresponding non-cancerous esophageal tissues, there was significant differences in the methylation level of several single sites between the two groups. Of thesse only the global methylation level of LMP7 gene target fragments was statistically higher ($0.0517{\pm}0.0357$) in Kazakh esophageal cancer than in neighboring normal tissues ($0.0380{\pm}0.0214$, p<0.05). Our results suggest that multiple CpG sites, but not methylation of every site leads to down regulation or deletion of gene expression. Only some of them result in genetic transcription, and silencing of HLA-B, ERp57, and LMP7 expression through hypermethylation of the promoters or other mechanisms may contribute to mechanisms of tumor escape from immune surveillance in Kazakh esophageal carcinogenesis.
Oh, Young Taek;Lee, Kang-Mu;Bari, Wasimul;Kim, Hwa Young;Kim, Hye Jin;Yoon, Sang Sun
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제26권3호
/
pp.627-636
/
2016
The causative agent of pandemic cholera, Vibrio cholerae, infects the anaerobic environment of the human intestine. Production of cholera toxin (CT), a major virulence factor of V. cholerae, is highly induced during anaerobic respiration with trimethylamine N-oxide (TMAO) as an alternative electron acceptor. However, the molecular mechanism of TMAO-stimulated CT production is not fully understood. Herein, we reveal that CT production during anaerobic TMAO respiration is affected by glucose fermentation. When the seventh pandemic V. cholerae O1 strain N16961 was grown with TMAO and additional glucose, CT production was markedly reduced. Furthermore, an N16961 Δcrp mutant, devoid of cyclic AMP receptor protein (CRP), was defective in CT production during growth by anaerobic TMAO respiration, further suggesting a role of glucose metabolism in regulating TMAO-mediated CT production. TMAO reductase activity was noticeably decreased when grown together with glucose or by mutation of the crp gene. A CRP binding region was identified in the promoter region of the torD gene, which encodes a structural subunit of the TMAO reductase. Gel shift assays further confirmed the binding of purified CRP to the torD promoter sequence. Together, our results suggest that the bacterial ability to respire using TMAO is controlled by CRP, whose activity is dependent on glucose availability. Our results reveal a novel mechanism for the regulation of major virulence factor production by V. cholerae under anaerobic growth conditions.
Johannah, NM;Ashil, Joseph;Balu, Maliakel;Krishnakumar, IM
Journal of Animal Science and Technology
/
제60권5호
/
pp.8.1-8.9
/
2018
Background: Indiscriminate use of antibiotics in livestock and poultry farming has caused emergence of new pathogenic strains. The situation has warrented the development of safe and alternative growth promoters and immunity enhancers in livestock. Herbal additives in animal and bird feed is a centuries-old practice. Thus, the present study investigated the efficacy of a standardized formulation of lipophilic turmeric extract containing curcumin and turmerones, (TF-36), as a natural growth promoter poultry feed additive. Methods: The study was designed on 180 one-day old chicks, assigned into three groups. Control group ($T_0$) kept on basal diet and supplemented groups $T_{0.5}$ and $T_1$ fed with 0.5% and 1% TF-36 fortified basal diet for 42 days. Each dietary group consisted of six replicates of ten birds. Body weight, food intake, food conversion ratio, skin colour, blood biochemical analysis and antioxidant status of serum were investigated. Results: Body weight improved significantly in $T_1$ with a 10% decrease in FCR as compared to the control. TF-36 supplementation in $T_1$ enhanced the antioxidant enzyme activity significantly (p < 0.05) with a decrease (p < 0.05) in lipid peroxidation. It also caused a slight yellow skin pigmentation without any change in meat color, indicating the bioavailability of curcumin from TF-36. However, no significant change in the concentration of serum creatinine, total protein and liver enzyme activities were observed, indicating the safety. Conclusion: In summary, we concluded that TF-36 can be a natural feed additive to improve growth performance in poultry, probably due to the better antioxidant activity and antimicrobial effects contributed by the better bioavailability of curcuminoids and turmerones. Besides, curcuminoids and turmerones were also known to be gastroprotective and anti-inflammatory agents.
Human cytotoxic T-lymphocyte antigen 4-immunoglobulin (hCTLA4Ig), an immunosuppressive agent, was expressed in transgenic rice cells using RAmy3D promoter and RAmy1A signal peptide for the inducible production and secretion into culture media by sugar depletion. In this study, sodium butyrate was used as a small molecular enhancer (SME) to enhance the production of hCTLA4Ig in transgenic rice cell suspension cultures. When 1 mM sodium butyrate was added in sugar-free media, relative viability was not reduced, while the productivity was improved 1.3-fold. In addition, by supplementing 87 mM sodium pyruvate as an alternative energy source during the production phase, death rate of the cells was decreased. When sodium pyruvate was not added, most cells became dead at day 6. However, by adding sodium pyruvate, 18% of viability can be maintained until day 10 and the production of hCTLA4Ig was enhanced 1.4-fold. When the combination of sodium pyruvate and sodium butyrate at optimum concentrations was added, the highest viability and hCTLA4Ig production could be obtained. The highest level of hCTLA4Ig reached up to 35 mg/L at day 10.
B. thuringiensis subsp. kurstaki HD1 살충성 결정체 단백질 icp 유전자를 클로닝하여 두개의 클론 pHLNl-80(+) 및 pHLN2-80(-)을 제조하였으며, pHLNl-80(+) 클론에는 icp 유전자의 전사개시부위가 정방향으로 클론이 되었고, 유전자 프로모터의 일부인 -80 bp를 가지고 있고, pHLN2-80(-) 클론은 핀자의 전사개시부위가 역방향으로 클로닝이 되었다. 상기 두 클론을 대장균에서 발현을 조사한 결과 icp 유전자가 역으로 삽입된 pHLN2-80(-) 클론은 pHLNl-80(+)클론보다 ICP발현량이 현격히 증가하는 것을 확인하였다. pHLN2-80(-) 플라스미드에서의 -80 bp 프로모터에서 SD서열(-14 bp sequences) 상류부위를 제거한 후 동일한 살충성 결정체 단백질 icp 유전자의 과다발현 현상이 일어나는지 조사하기 위해 icp 유전자가 역방향으로 클로닝된 pHLRBSl-14와 icp 유전자가 정방향으로 클로닝된 pHLRBS2-14 클론을 제조하였다. 또한 상이한 클로닝 운반체에서도 과다 발현이 일어나는지를 보기위하여 pHLNl-80(+)과 pHLN2-80(-) 플라스미드에서와 동일한 구조가 되도록 icp 유전자를 pUC18과 pUC19플라스미드에 각각 클로닝하여 pHLNUCl-80과 pHLNUC2-80 클론을 제조하였다. pHLRBSl-14과 pHLRBS2-14클론을 대장균에서 발현을 시킨 후에 파쇄하여 SDS-PAGE와 Western blot으로 분석을 한 결과는 클론 pHLRBSl-14는 클론 pHLRBS2-14보다 많은 양의 ICP를 생산하였고, pHLRBSl-14는 pHLN2-80(-) 클론 보다는 적게 ICP를 생산하였다. 이러한 발현 현상은 -80 bp promoter 에서 결실된 SD서열의 상류부위가 발현에 직접적인 영향을 주고 있다는 것을 의미한다. pHLNUC1-80이 역방향으로 클로닝된 pHLNUC2-80 클론보다 적게 ICP 의 발현을 하였다. 이 결과는 상기 클론이 icp 유전자 과다발현이 특정 클로닝 운반체에만 국한되어 일어나는 것이 아니며 유전자와 프로모터 간의 구조적 배열에 의하거나 프로모터에 있는 transcription-supressing regions이 교란되어서 일어난 것임을 시사한다. 그러나 왜 전사개기부위가 역삽입의 경우에 과다발현이 되는지 아직은 판단하기 어려우며 앞으로 더욱 연구를 계속하여야 할 과제로 남아있다.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.