Park, Seung-Won;Kweon, Hae-Yong;Goo, Tae-Won;Kim, Seong-Ryul;Jo, You-Young;Choi, Gwang-Ho
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제25권1호
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pp.75-79
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2012
Low-melting-temperature agarose gel solution, as a novel porogen was combined with a silk fibroin solution to generate interconnected porous networks. The porosity of the resultant silk fibroin-agarose scaffolds was greater than that of the scaffolds generated with agarose and deionized water. The porosities of silk fibroin scaffolds containing agarose gel at 0.5%, 1.0%, 1.5%, 2.0% [w/v] were 110.9%, 111.7%, 120.9%, and 123.0%, respectively. Lastly, the internal space generated in scaffolds after dissolution of the agarose gel provides a good environment for cell growth and movement within the scaffold.
박테리아 패터닝을 위한 혼성 아가로즈젤 마이크로 스탬프는 PDMS 몰드를 이용한 replica moding 공정을 이용하여 제작하였다. 완성된 스탬프를 박테리아를 잉크로 사용한 후, $50{\mu}m$ 원 모양을 가지는 2차원 박테리아 어레이를 구현할 수 있었다. 또한, 상기 방법을 통하여 실험 목적에 적합한 다양한 모양을 가지는 패턴을 쉽게 만들 수 있다. 패터닝된 박테리아의 형광 세기는 스팟과 주변간에 매우 높은 대조비를 이루며, 각각의 스팟 및 스팟간의 형광 세기가 매우 균일함을 보여 프린팅 시 매우 균일한 패턴을 얻을 수 있었다. 박테리아 패터닝을 할 경우 큰 문제점인 낮은 젖음성과 미끄럽고 작은 아가로즈젤 마이크로 스탬프를 취급의 어려움을 본 연구에서 제안한 혼성 아가로즈젤 마이크로 스탬프를 이용하여 해결할 수 있었다. 상기 방법의 가장 큰 장점은 세포를 이용한 패터닝의 경우 세포의 활성을 유지시키는 것인데 다량의 수분을 포함하는 아가로즈젤을 사용할 경우 세포의 활성을 유지시키면서 패턴을 구현할 수 있으므로 매우 중요한 기술로 생각된다. 본 연구에서 제안된 방법은 매우 재현성이 높으며, 편리하고, 빠르게 구현할 수 있어서 미생물 생태학, 세포와 표면간의 상호작용 그리고 세포를 바탕으로 하는 스크리닝 시스템에 활용 되어 질것으로 기대된다.
The introduction of molecular biology methodologies to plant improvement programs offers an invaluable opportunity for extensive germplasm characterization. We have applied the developed technique of random amplification of polymorphic DNA(RAPD)to the analysis of evaluating genetic diversity among Korean wild Codonopsis lanceolata. A total of 340 polymorpic hands were gernerated on agarose- and polyacrylamide-gel by 19 primers of abitrary sequence. grouped by cluster analysis using sample matching coefficients of similarity. Among of the samples. the minimum genetic distance value was obtained between sample no. 1(Girisan) and no. 2(Girisan), and the largest value between sample no. 11(Sulaksan) and no. 17(Sulaksan).In separate cluster dendrograms based on agareose - and polyacryamide-gel. some differences were observed; In the case of agarose gel,41 samples could be devided into 7 groups at below about 0.44 level of distance. However they were divided into 6 gourps at below about 0.40 level of distance in the case of polyacrylamide gel. These results showed that polymophic data in agrose were not grouped to wild plant selected from each mountainous district except for wild plants selected from Sulaksan and Chiaksan. We believe that polyacrylamide-RAPD is a superior method for detecting DNA polymorphism compared to agarose-RAPD method.
Effects of staining, buffer washing and denaturing agents on the transferrability of RNA fractionated on a methylmercury hydroxide-agarose gel to a nitrocellulose membrane were studied. Ethidium bromide staining and ammonium acetate buffer washing inhibited RNA transfer, while 3% HCHO and 0.5 M NaOH treatments stimulated transfer which was negated in the ammonium acetate buffer. Accordingly, maintenance of primary structure of RNA was proved to be essential for transferring RNA from the methylmercury hydroxideagarose gel to the nitrocellulose membrane.
Plasma devices such as jets, pencils, and torches have been developed as new tools that help penetration of target agents and applied to plasma medicine. However, these devices cannot be used in a large area. Therefore, we introduced a flexible plasma device, which can be treated of large area and designed as bendable plasma. In additional, in vitro model based on agarose gel was prepared that can be show effectiveness in the depth of penetration. Plasma treatment conditions such as power, time and distance can be optimized on the agarose gel wound model. The chemical structure of changed polysaccharides was predicted due to reactive excited atoms and molecules, UV photons, charged particles and reactive oxygen and nitrogen species (RONS).
Despite a simple preparation of manganese oxide (MnO2) nanowires by electrodeposition, the improvement in specific capacitance (Csp) and voltammetric response of the MnO2 nanowire-based electrodes has been quite limited. This is attributed to the poor electrical conductivity of MnO2 and its dense bulk morphology due to the aggregation of the nanowires. This study investigated the capacitive performance of MnO2 nanowires electrodeposited on agarose thin films. The good ionic conductivity and porous network of the agarose film provided favorable growth conditions for the MnO2 nanowires with suppressed aggregation. A maximum Csp value of 686 F/g measured at a scan rate of 10 mV/s was obtained, which was significantly larger than that of 314 F/g for the agarose-free MnO2 electrode at the same scan rate. The rate capability was also improved. The Csp measured at a high scan rate of 100 mV/s retained 74.0% of the value measured at 10 mV/s, superior to the retention of 71.1% for the agarose-free MnO2 electrode.
An artificial photolysis system of water or aqueous alcohol is studied. Upon irradiation of agarose gel system containing colloidal CdS or TiO$_2$ particles with Rh catalyst, hydrogen and oxygen are produced from water. When an alcohol is used as an electron donor in the agarose system, hydrogen and oxidized form of alcohol, the corresponding an aldehyde, is produced. The photolysis mechanism of water or alcohol in the agarose system is proposed.
재배되고 있는 22 페칸종간의 RAPD분석을 한 결과, Agarose gel상에서 primer당 평균 6개의 DNA단편이 증폭되었다. 증폭된 DNA 단편의 크기 는 100bp에서 1500bp의 범위에 위치하였다. 페칸종간의 유연 관계를 분석하기에 적합한 primer를 선발한 결과 OPA-02, OPA-10, OPA-12, OPB-01이 최적이었다. 4종의 primer를 이용하여 증폭한 PCR산물을 1.5% Agarose gel상에 분획하여 단편의 종류를 분석한 결과 22의 페칸종은 5개의 그룹으로 구분 할 수 있었다. 40종 primer로부터 증폭된 466 DNA단편을 기초로하여 유전적 근연계수를 계산하였던 결과 유사도 값이 가장큰 것은 C. flacra와 Black walnut로 0.90를 나타났으며, Kiowa와 Red hickory, C. tomentosa, C. flacra, Black walnut간에는 유사도 값이 0.31로 가장 작았다. 선발된 4종의 primer를 이용하여 증폭시킨 PCR산물을 Polyacrylamide gel상에 분획한 후 검출된 DNA단편을 분석하였다. 유사도 값이 가장 큰 것은 그룹 V의 Red hickory, C. tomentosa, C. flacra, Black walnut간으로 1.0이었고, Farley와 Pawnee간과 Sturya와 Clarke간은 공히 0.98를 나타내었다. Polyacrylamide gel분획 후 은염색하여 단편을 검출하는 것은 Agarose gel에 비하여 시간, 기술, 경비가 요구되지만 보다 정확한 유전적 배경을 설명할 수 있다고 생각되었다. 또한 Agarose gel 분석, Polyacrylamide gel 분석 및 주성분 분석법에서 Farley, C. tomentosa, C. flacra, Black walnut, C. corpiformis만이 동일 그룹에서 이탈되지 않았다.
본 연구에서는 페놀 화합물들을 현장에서 검출하기 위해 간단하고 간편한 일회용 재조합 박테리아 바이오센서 시스템을 개발하였다. 플라즈미드 pLZCapR을 함유하는 E. coli 세포를 ${\beta}$-galactosidase 기질인 CPRG와 함께 96-well plate의 wells에 agarose로 고정하였다. 이 바이오센서는 현장에서 발색을 위한 별도의 기질을 추가하거나 불편한 기기 사용 또는 시료의 전 처리를 필요로 하지 않는다. 시료의 측정은 간단히 적은 부피(<100 ${\mu}l$)의 현장 시료를 바이오센서를 포함하는 wells에 넣고 발색을 관찰하여 측정하였다. 또한 6% DMF, 0.1% SDS 그리고 10 mM $CaCl_2$를 첨가하여 agarose 고정에 의한 화합물의 세포내 확산 제한을 감소시켜 보다 더 나은 발색을 얻을 수 있었다. 따라서 이 고정된 미생물 유래 재조합 바이오센서 시스템은 현장에서 환경오염물질들을 간단하게 확인하고 정량 하는 유용한 접근 방법이 될 것으로 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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