Direct colony hybridization on agarose gel plate was established for the identification of recombinant plasmids. The hybridization of the probe to nucleic acids on dried gel without transferring to solid supports was more effective and simpler than hybridization of such probes to materials immobilized on filters such as nitrocellulose or nylon. D-cycloserine in overlaying agamse was essential for releasing the nucleic acids from colony.
The respiratory burst oxidase of neutrophils is a multicomponent enzyme, domant in resting cells, that catalyzes the reduction of oxygen to $O_{2}^{-}$ at the expense of NADPH. In the resting neutrophil, some of the components of the oxidase, including proteins p47 and p67, are in the cytosol, while the rest are in the plasma membrane. Recent evidence has suggested that at least some of the cytosolic oxidase components exist as a complex. The cytosolic complex with a molecular weight of ~240 kDa was found to bind to blue-agarose and 2',5'-ADP-agarose, which recognize nucleotide requiring enzymes. In order to identify the nucleotide binding component of the cytosolic complex we purified recombinant p47 and p67 fusion proteins using the pGEX system. Pure recombinant p47 was retained completely on 2',5'-ADP-agarose, whereas pure recombinant p67 did not bind to these affinity beads. On the basis of these results, we infer that p47 may contain the nucleotide binding site.
An artificial photolysis system of water or aqueous alcohol is studied. Upon irradiation of agarose gel system containing colloidal CdS or TiO$_2$ particles with Rh catalyst, hydrogen and oxygen are produced from water. When an alcohol is used as an electron donor in the agarose system, hydrogen and oxidized form of alcohol, the corresponding an aldehyde, is produced. The photolysis mechanism of water or alcohol in the agarose system is proposed.
The need for natural cosmetic ingredients has been increasing over the world nowadays. Agarose, a natural polymer from red seaweeds, has high hydrophilic character and a function of scaffolder. As skin moisturizer, agarose is adequate for percutaneous absorption. While, blueberry fruits extract possesses rich procyanidins and anthocyanins which show health benefits, anti-oxidant effect, anti-aging and anti-melanogenesis. Stability, sensory preference, skin trouble of the emulsion formula are important for cosmetic product development. In this study, we manufactured an emulsion formula for skin moisturizers using the two ingredients and tested emulsion stability and skin trouble. Total phenolic contents of the blueberry fruits extract were evaluated as well as tyrosinase inhibitory and collagenase inhibitory activities. $IC_{50}$ values of blueberry fruits extract for anti-tyrosinase and anti-collagenase activities were 168 and $112{\mu}g/mL$, respectively using gallic acid as a control ($64.8{\mu}g/mL$). The stability (pH and viscosity) of the formula containing 2% blueberry fruits extracts and 0.1% agarose was measured at five different temperatures (room temp., $25^{\circ}C$, $55^{\circ}C$, $45^{\circ}C$, $55^{\circ}C$) under the sun light at 2 day intervals for 12 days. There has been little pH change at the different temperatures. According to the sensory evaluation, there was no significant flavor, discoloration and physical changes of the formula at $25-65^{\circ}C$. These results suggest that emulsion formula containing blueberry extract and agarose could be used as a candidate for lotion and essence products.
박테리아 패터닝을 위한 혼성 아가로즈젤 마이크로 스탬프는 PDMS 몰드를 이용한 replica moding 공정을 이용하여 제작하였다. 완성된 스탬프를 박테리아를 잉크로 사용한 후, $50{\mu}m$ 원 모양을 가지는 2차원 박테리아 어레이를 구현할 수 있었다. 또한, 상기 방법을 통하여 실험 목적에 적합한 다양한 모양을 가지는 패턴을 쉽게 만들 수 있다. 패터닝된 박테리아의 형광 세기는 스팟과 주변간에 매우 높은 대조비를 이루며, 각각의 스팟 및 스팟간의 형광 세기가 매우 균일함을 보여 프린팅 시 매우 균일한 패턴을 얻을 수 있었다. 박테리아 패터닝을 할 경우 큰 문제점인 낮은 젖음성과 미끄럽고 작은 아가로즈젤 마이크로 스탬프를 취급의 어려움을 본 연구에서 제안한 혼성 아가로즈젤 마이크로 스탬프를 이용하여 해결할 수 있었다. 상기 방법의 가장 큰 장점은 세포를 이용한 패터닝의 경우 세포의 활성을 유지시키는 것인데 다량의 수분을 포함하는 아가로즈젤을 사용할 경우 세포의 활성을 유지시키면서 패턴을 구현할 수 있으므로 매우 중요한 기술로 생각된다. 본 연구에서 제안된 방법은 매우 재현성이 높으며, 편리하고, 빠르게 구현할 수 있어서 미생물 생태학, 세포와 표면간의 상호작용 그리고 세포를 바탕으로 하는 스크리닝 시스템에 활용 되어 질것으로 기대된다.
Inulinase의 효율적인 재사용을 위하여 vinylsulfone activated agarose에 endo- 및 exoinulinase를 고정화시켰다. Gram gel당 exoinulinase는 400U, endoinulinase는 80U까지 고정화시킬 수가 있었고 열안정성은 exoinulinase 에서 증가되었다. 두 고정화 효소의 혼합비율에 따른 synergistic effect는 endo/exo가 0.5-0.1일 대 가장 컸으며, synergistic effect는 혼합되지 않은 상태의 고정화 효소에 비해 그 활성이 약 1.7배 증가하였다. 두 고정화 효소의 최적 pH는 4.4-5.0 범위이었으며 operational stability는 batch reactor에서 20번 반복된 실험결과 어떠한 효소활성의 감소도 보이지 않았다.
Lactobacillus reuteri는 사람과 동물의 장관 내에 존재하는 유산균의 일종으로서 혐기적 조건에서 glycerol을 대사하여 항균 물질인 루테린을 생산한다. 본 연구의 목적은 고정화된 L. reuteri를 이용하여 회분식 또는 연속식 생산 공정을 이용하여 루테린 생산의 반응 조건을 조사하는데 있었다. Agarose를 사용하여 고정화된 L. reuteri는 250mM glycerol과 반응시켜 루테린을 생산하였다. Agarose 농도를 0.5%로 조정한 회분식 생산 공정에서는 약 36시간 동안 루테린 생산이 지속되었고 시간 경과에 따라 루테린의 생산이 점차 감소하였다. 연속식 공정에서는 고정화 균이 현탁세포에 비하여 루테린 생산 시간이 약 2배 정도 연장되었으며 총 루테린의 생산 또한 502mM로 현탁 세포에 비하여 약 1.5배 증가하였다. 본 연구의 결과는 고정화 세포를 이용한 루테린 생산의 증가 가능성을 제시하였다.
본 연구에서는 페놀 화합물들을 현장에서 검출하기 위해 간단하고 간편한 일회용 재조합 박테리아 바이오센서 시스템을 개발하였다. 플라즈미드 pLZCapR을 함유하는 E. coli 세포를 ${\beta}$-galactosidase 기질인 CPRG와 함께 96-well plate의 wells에 agarose로 고정하였다. 이 바이오센서는 현장에서 발색을 위한 별도의 기질을 추가하거나 불편한 기기 사용 또는 시료의 전 처리를 필요로 하지 않는다. 시료의 측정은 간단히 적은 부피(<100 ${\mu}l$)의 현장 시료를 바이오센서를 포함하는 wells에 넣고 발색을 관찰하여 측정하였다. 또한 6% DMF, 0.1% SDS 그리고 10 mM $CaCl_2$를 첨가하여 agarose 고정에 의한 화합물의 세포내 확산 제한을 감소시켜 보다 더 나은 발색을 얻을 수 있었다. 따라서 이 고정된 미생물 유래 재조합 바이오센서 시스템은 현장에서 환경오염물질들을 간단하게 확인하고 정량 하는 유용한 접근 방법이 될 것으로 사료된다.
본 연구는 아가로스 겔을 이용하여 금속성과 반도체성 단일벽 탄소나노튜브의 분리실험을 수행하였다. 아가로스의 농도, 분산제인 SDS (sodium dodecyl sulfate)의 농도, 아가로스 용액의 pH에 따른 단일벽 탄소나노튜브의 분리에 대한 영향을 고찰하였다. UV-vis-NIR 분광 분석으로부터 용액상의 아가로스 농도가 증가함에 따라 원심분리에 의해 추출된 상층부에서 금속성 탄소나노튜브의 비율이 증가하였지만, 분리된 탄소나노튜브의 전체적인 농도는 감소하였다. 분산제인 SDS 농도가 증가할수록 금속성 탄소나노튜브와 SDS와의 화학적 친화성으로 인해 상층부에서 금속성 탄소나노튜브의 비율이 증가하였으며, 아가로스 용액의 pH가 8.2일 때 금속성 탄소나노튜브의 비율이 최대 58.4%까지 증가하였다.
Objective: Animal-free scaffolds have emerged as a potential foundation for consistent, chemically defined, and low-cost materials. Because of its good potential for high biocompatibility with reproductive tissues and well-characterized scaffold design, we investigated whether polyglycolic acid (PGA) could be used as an animal-free scaffold instead of natural fibrin-agarose, which has been used successfully for three-dimensional human endometrial cell culture. Methods: Isolated primary endometrial cells was cultured on fibrin-agarose and PGA polymers and evaluated various design parameters, such as scaffold porosity and mean fiber diameter. Cytotoxicity, scanning electron microscopy (SEM), and immunostaining experiments were conducted to examine cell activity on fabricated scaffolds. Results: The MTT (3-[4,5-dimethylthiazol-2-yl]-2,5 diphenyl tetrazolium bromide) assay and SEM results showed that endometrial cells grew and proliferated on both scaffolds. Immunostaining showed cytokeratin and vimentin expression in seeded cells after 7 days of culture. On both scaffolds, an epithelial arrangement of cultured cells was found on the top layer and stromal arrangement matrix on the bottom layer of the scaffolds. Therefore, fibrin-agarose and PGA scaffolds successfully mimicked the human endometrium in a way suitable for in vitro analysis. Conclusion: Both fibrin-agarose and PGA scaffolds could be used to simulate endometrial structures. However, because of environmental and ethical concerns and the low cost of synthetic polymers, we recommend using PGA as a synthetic polymer for scaffolding in research instead of natural biomaterials.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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