• 제목/요약/키워드: Yellow-head virus

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자연산 대하(Fenneropenaeus chinensis)에서 검출된 노랑머리 바이러스 Genotype 8의 계통분류학적 특성 (Phylogenetic Characteristics of Yellow Head Virus (YHV) Genotype 8 Isolated from Fenneropenaeus chinensis in Korea)

  • 장광일;김보성;오윤경;황지연;권문경;김수미
    • 한국수산과학회지
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    • 제54권5호
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    • pp.698-702
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    • 2021
  • Yellow head virus (YHV) is a rod-shaped positive-sense single-stranded RNA virus, classified into the genus Okavirus, family Roniviridae, and order Nidovirales. In this study, 200 fleshy prawns (Fenneropenaeus chinensis) collected from the vicinity of Narodo in Goheung-gun, Korea, were screened for the presence of yellow head complex viruses and related genotype such as YHV genotype 8. The detection rate of YHV genotype 8 among the 200 fleshy prawns, determined using nested RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reation), was 39.0%. Phylogenetic analysis of the ORF1b gene of YHV showed that eight distinct genetic lineages were detected. The four strains of YHV genotype 8 obtained in this study formed a robust clade with the YHV genotype 8 group that was first isolated from fleshy prawns in China suspected to have acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND).

2018-2019년 양식산 흰다리새우의 바이러스 (IHHNV, TSV, IMNV, YHV, CMNV) 모니터링 (Monitoring of viruses (IHHNV, TSV, IMNV, YHV, and CMNV) in cultured whiteleg shrimp (Litopenaeus vannamei) between 2018 and 2019)

  • 샴 코카뚜니발띨;김위식
    • 한국어병학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.71-75
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    • 2020
  • A survey was conducted to investigate viral infections in 184 whiteleg shrimp (Litopenaeus vannamei) collected from nine farms and one wholesale fish vendor during 2018 and 2019. Gill and abdominal muscle of shrimp were tested for the presence of five viruses, viz. infectious hypodermal and haematopoietic necrosis virus, taura syndrome virus, infectious myonecrosis virus, yellow head virus genotype 1, and covert mortality nodavirus by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and PCR. These viruses were not detected in any of 184 samples, screened under the study.

국내 양식 흰다리새우에서 검출된 노랑머리바이러스(YHV-8)의 유전학적 특성 (Detection and genetic characteristic of Yellow-head virus genotype 8 (YHV-8) Cultured Litopanaeus vanamei, in Korea)

  • 김석렬;;;신기욱
    • 한국어병학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.77-81
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    • 2020
  • This study was performed for screening yellow head virus(YHV) complex in 252 including 235 white leg shrimps (Litopenaeus vannamei) and 17 oriental shrimp (Fenneropenaeus chinensis) collected from 18 farms located in southwestern province of Korea. The virus complex was detected by nested reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) assay. In the assay, amplicons were resulted in RNAs exracted from 38 shrimps (21 white leg shrimps and 17 oriental shrimps) obtained from 7 farms. In phylogenetic analysis using sequences of ORF1b gene, all 38 sequences obtained in this study formed an independent lineage with YHV-8 genotype firstly isolated in China, belonged to an YHV-8 clade.

Differentially expressed genes in Penaeus monodon hemocytes following infection with yellow head virus

  • Pongsomboon, Siriporn;Tang, Sureerat;Boonda, Suleeporn;Aoki, Takashi;Hirono, Ikuo;Yasuike, Motoshige;Tassanakajon, Anchalee
    • BMB Reports
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    • 제41권9호
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    • pp.670-677
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    • 2008
  • A cDNA microarray composed of 2,028 different ESTs from two shrimp species, Penaeus monodon and Masupenaeus japonicus, was employed to identify yellow head virus (YHV)-responsive genes in hemocytes of P. monodon. A total of 105 differentially expressed genes were identified and grouped into five different clusters according to their expression patterns. One of these clusters, which comprised five genes including cathepsin L-like cysteine peptidase, hypothetical proteins and unknown genes, was of particular interest because the transcripts increased rapidly ($\leq$ 0.25 hours) and reached high expression levels in response to YHV injection. Microarray data were validated by realtime RT-PCR analyses of selected differentially expressed transcripts. In addition, comparative analysis of the hemocyte transcription levels of three of these genes between surviving and non-surviving shrimp revealed significantly higher expression levels in surviving shrimp.

수입 냉동새우에서 검출된 YHV3와 IHHNV의 계통학 및 병원성 분석 (Phylogenetic and pathogenic traits of YHV3 and IHHNV detected from imported frozen shrimp)

  • 백은진;정예진;정민아;박지연;김광일
    • 한국어병학회지
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    • 제35권1호
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    • pp.27-40
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    • 2022
  • 2019년부터 2020년도까지 국내로 수입 및 유통되고 있는 냉동 새우에 대하여 갑각류 전염병인 전염성피하및조혈기괴사증(infectious hypodermal andhematopoietic necrosis, IHHN), 노란머리병(yellow head disease, YHD), 타우라증후군(taura syndrome, TS), 전염성근괴사증(infectious myonecrosis, IMN)의 병원체 유전자 검출 여부를 조사하였다. Polymerase chain reaction (PCR) 분석을 수행한 결과 5개 국가에서 수입된 총 10개 그룹의 시료에서 YHV (1/10), IHHNV (2/10)가 검출되었으며 TSV와 IMNV는 검출되지 않았다. 또한, 검출된 IHHNV의 경우 type A IHHNV related gene을 증폭시킬 수 있는 MG831F/R primer를 이용한 PCR 결과에서도 양성으로 확인되었다. 유전자가 검출된 시료에 대해 염기서열 및 계통학적 분석 결과 YHV는 genotype 3 (YHV3)로 분류되었으며 IHHNV는 infectious IHHNV type 2 로 분류되었다. PCR 양성 조직 시료를 마쇄 후 흰다리새우에 인위 감염 실험을 수행한 결과, 폐사는 나타나지 않았으나 접종한 바이러스 유전자는 검출되었다. 이러한 결과는 YHV3와 IHHNV가 냉동 새우의 수입 과정에서 국내로 유입되고 있음을 시사한다. 본 연구에서 검출된 YHV3와 IHHNV는 병원성이 없는 유전형 또는 수입 및 유통 과정에서 불활화에 따라 흰다리새우에 폐사를 유발하기에는 감염성이 낮은 수준의 형태로 존재하고 있을 것으로 사료된다.

맥류의 토양 전염성 Bymovirus의 감염이 국내 육성 맥주보리의 생육 및 수량에 미치는 영향 (Effects on Growth and Yield of Korean Malting Barley Cultivars by Soil-borne Bymovirus Infection)

  • 박종철;김미정;이은숙;박철수;강천식;현종내;이정준;김태수;김기종
    • 식물병연구
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    • 제16권1호
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    • pp.21-26
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    • 2010
  • 우리나라에서 가장 우점하는 BaYMV(Barley yellow mosaic virus)에 의한 국내 육성 맥주보리의 품종의 저항성 정도에 따룬 생육 및 수량 피해를 조사하였다. 바이러스 감염 검정에서 두산 29호는 BaYMV와 BaMMV(Barley mild mosaic virus)에 감염되어 있었으나 진양보리와 호훔보리는 BaYMV에 만 감염된 것으로 나타났다. 월동후 초장과 수확기 간징의 생육을 조사한 결과 폼종별 저항성 정도에 따라 8~29%의 신장 억제율을 보였다. 생육 후기의 간장 단축률은 9~12%로 낮아지는 결과를 보였다. 월동후 경수는 호품에서는 발병포장와 건전포장에서 차이가 없었으나, 감수성인 두산 29호와 진양에서는 10~14%감소되었다. 그러나 수확기경 수수는 BaYMV 감염에 의해 26~33%까지 감소하는 결과를 보였다. 출수기는 발병 포장에서 1~3일까지 지연되는 경향이었다. 수확후 수량구성요소의 피해정도를 조사하였다. 천립중과 l 중도 품종별 저항성 정도에 따라 피해를 받아 각각 4.0~6.6%와1.0~ 4.2% 감소되는 것으로 조사되었다. BaYMV 감염시 6.0~8.6% 정 도의 비립이 발생하였으나 건정포장에서는 2.9~3.6%로 감소되어 두배 이상 비립발생이 증가하였다. 품종간 종실 수량 피해를 조사한 결과 건전한 포장에서의 품종간 평균 수량은 약 509kg~632kg/10a으로 유의성 있는 차이를 보이지 않았다. 발병 포장에서는 품종별 저항성 정도에 따라 유의성 있는 차이를 보였다. 중저항성인 호품의 경우 약 467kg/10a, 중약과 감수성인 진양과 두산29호에서는 각각 390kg과 290kg으로 조사되어 감수성인 두 품종에서는 77~177kg/10a의 수량 감소를 보였다. BaYMV 감염에 의해 수량성은 품종의 저항성 정도에 따라 26~43%의 감소되었다.