• 제목/요약/키워드: X-vector

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A Profile of Glucose-6-Phosphate Dehydrogenase Variants and Deficiency of Multicultural Families in Korea

  • Bahk, Young Yil;Ahn, Seong Kyu;Lee, Jinyoung;Im, Jae Hyoung;Yeom, Joon-Sup;Park, Sookkyung;Kwon, Jeongran;Kan, Hyesu;Kim, Miyoung;Jang, Woori;Kim, Tong-Soo
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제59권5호
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    • pp.447-455
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    • 2021
  • Vivax malaria incidence in Korea is now decreased and showing a low plateau. Nowadays, vivax malaria in Korea is expected to be successfully eliminated with anti-malaria chemotherapy, primaquine, and vector control. The glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) deficiency is associated with potential hemolytic anemia after primaquine administration. This inborn disorder has a pivotal polymorphism with genetic variants and is the most prevalent X-chromosome-linked disorder. The prevalence of G6PD deficiency was previously reported negligible in Korea. As the population of multicultural families pertaining marriage immigrants and their adolescents increases, it is necessary to check G6PD deficiency for them prior to primaquine treatment for vivax malaria. The prevalence of G6PD variants and G6PD deficiency in multicultural families was performed in 7 counties and 2 cities of Jeollanam-do (Province), Gyeonggi-do, and Gangwon-do. A total of 733 blood samples of multicultural family participants were subjected to test the phenotypic and genetic G6PD deficiency status using G6PD enzyme activity quantitation kit and PCR-based G6PD genotyping kit. The G6PD phenotypic deficiency was observed in 7.8% of male adolescent participants and 3.2% of materfamilias population. Based on the PCR-based genotyping, we observed total 35 participants carrying the mutated alleles. It is proposed that primaquine prescription should seriously be considered prior to malaria treatment.

Free vibrations of a two-cable network inter-supported by cross-links extended to ground

  • Zhou, H.J.;Wu, Y.H.;Li, L.X.;Sun, L.M.;Xing, F.
    • Smart Structures and Systems
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    • 제23권6호
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    • pp.653-667
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    • 2019
  • Using cross-ties to connect cables together when forming a cable network is regarded as an efficient method of mitigating cable vibrations. Cross-ties have been extended and fixed on bridge decks or towers in some engineering applications. However, the dynamics of this kind of system need to be further studied, and the effects of extending cross-links to bridge decks/towers on the modal response of the system should be assessed in detail. In this paper, a system of two cables connected by an inter-supported cross-link with another lower cross-link extended to the ground is proposed and analyzed. The characteristic equation of the system is derived, and some limiting solutions in closed form of the system are derived. Roots of cable system with special configurations are also discussed, attention being given to the case when the two cables are identical. A predictable mode behavior was found when the stiffness of inter-connection cross-link and the cross-link extended to the ground were the same. The vector of mode energy distribution and the degree of mode localization index are proposed so as to distinguish global and local modes. The change of mode behaviors is further discussed in the case when the two cables are not identical. Effects of cross-link stiffness, cross-link location, mass-tension ratio, cable length ratio and frequency ratio on $1^{st}$ mode frequency and mode shape are addressed.

Characterization of Phytophthora capsici effector genes and their functional repertoire

  • Arif, Saima;Lim, Gi Taek;Kim, Sun Ha;Oh, Sang-Keun
    • 농업과학연구
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    • 제48권3호
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    • pp.643-654
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    • 2021
  • Phytophthora capsici is one of the most destructive hemibiotrophic pathogens; it can cause blight in chili peppers, and secrete various effector proteins to infect the plants. These effectors contain an N-terminal conserved RXLR motif. Here, we generated full-length RXLR effector coding genes using primer pairs, and cloned them into the pGR106 vector for in planta expression. Two of these genes, PcREK6 and PcREK41 (P. capsici RXLR effector from the Korea isolate), were further characterized. PcREK6 and PcREK41 genes showed that they encode effector proteins with a general modular structure, including the N-terminal conserved RXLR-DEER motif and signal peptide sequences. PcREK6 and PcREK41 expressions were strongly induced when the chili pepper plants (Capsicum annuum) were challenged with P. capsici. These results provide molecular evidence to elucidate the virulence or avirulence factors in chili pepper. Our results also showed that two effectors induce hypersensitive response (HR) cell death when expressed in chili leaves. Cell death suppression assays in Nicotiana benthamiana revealed that most effectors could not suppress programmed cell death (PCD) triggered by Bcl-associated X (BAX) or Phytophthora infestans elicitin (INF1). However, PcREK6 fully suppressed PCD triggered by BAX, while PcREK41 partially suppressed PCD triggered by INF1 elicitin. These results suggest that PcREK effectors from P. capsici interact with putative resistance (R) proteins in planta, and different effectors may target different pathways in a plant cell to suppress pattern-triggered immunity (PTI) or effector-triggered immunity (ETI).

Mapping Poverty Distribution of Urban Area using VIIRS Nighttime Light Satellite Imageries in D.I Yogyakarta, Indonesia

  • KHAIRUNNISAH;Arie Wahyu WIJAYANTO;Setia, PRAMANA
    • Asian Journal of Business Environment
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    • 제13권2호
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    • pp.9-20
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    • 2023
  • Purpose: This study aims to map the spatial distribution of poverty using nighttime light satellite images as a proxy indicator of economic activities and infrastructure distribution in D.I Yogyakarta, Indonesia. Research design, data, and methodology: This study uses official poverty statistics (National Socio-economic Survey (SUSENAS) and Poverty Database 2015) to compare satellite imagery's ability to identify poor urban areas in D.I Yogyakarta. National Socioeconomic Survey (SUSENAS), as poverty statistics at the macro level, uses expenditure to determine the poor in a region. Poverty Database 2015 (BDT 2015), as poverty statistics at the micro-level, uses asset ownership to determine the poor population in an area. Pearson correlation is used to identify the correlation among variables and construct a Support Vector Regression (SVR) model to estimate the poverty level at a granular level of 1 km x 1 km. Results: It is found that macro poverty level and moderate annual nighttime light intensity have a Pearson correlation of 74 percent. It is more significant than micro poverty, with the Pearson correlation being 49 percent in 2015. The SVR prediction model can achieve the root mean squared error (RMSE) of up to 8.48 percent on SUSENAS 2020 poverty data.Conclusion: Nighttime light satellite imagery data has potential benefits as alternative data to support regional poverty mapping, especially in urban areas. Using satellite imagery data is better at predicting regional poverty based on expenditure than asset ownership at the micro-level. Light intensity at night can better describe the use of electricity consumption for economic activities at night, which is captured in spending on electricity financing compared to asset ownership.

작물의 유전자 재조합을 위한 세포주의 개발 연구 (Development of Cell Lines for Application of Recombinant DNA Techniques in Crops)

  • 채영암;최규환
    • 한국작물학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.195-200
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    • 1985
  • 유전자 재조합 기술을 통하여 유용한 유전자를 세포내로 이전시키거나 세포 수준에서 육종선발을 하기 위한 기술로서 원형질체를 나출, 배양하고 재분화시키는 과정과 세포주를 확보하기 위하여 실험한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 원형질체 나출을 위한 잎의 표면 소독은 sodium hypochloride 2 %에서 3분간 침지하는 것이 소독율이 높았다. 2. 원형질체 나출 최적 효소농도는 cellulase 2 %와 macerozyme 0.5 %의 혼용이다. 3. 원형질체의 배양밀도는 1.4 - 2.0 $\times$ $10^4$/$m\ell$에서 치상효율이 높았다. 4. 배양배지는 배지 1에서 제일 양호하였다. 5. 배양 2 일 후에는 세포격이 완전히 재생되고 배양 4 일 후에는 세포분열이 시작되었다. 배양 2주 후에는 세포 덩어리를 형성하고 3주 후에는 육안으로 볼 수 있는 colony를 형성하였다. 6. Shoot 분화 배지에 치상한 calli는 치상후 25 일에 bud가 나타나기 시작하였다. Shoot분화에는 BA 1 -2 mg/$\ell$로 첨가한 경우 shoot분화율이 높았다. 7. 발근은 홀몬이 첨가되지 않은 MS 배지에서 양호하였고 현재 100여 개의 세포주에서 종자를 수확하였으며 차후 세포주의 특성과 변이성등을 조사할 계획이다.

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Prevalence and molecular analysis of glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency in Chin State, Myanmar

  • Ja Moon Aung;Zin Moon;Dorene VanBik;Sylvatrie-Danne Dinzouna-Boutamba;Sanghyun Lee;Zau Ring;Dong-Il Chung;Yeonchul Hong;Youn-Kyoung Goo
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제61권2호
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    • pp.154-162
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    • 2023
  • Glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) deficiency is caused by X-linked recessive disorderliness. It induces severe anemia when a patient with G6PD deficiency is exposed to oxidative stress that occurs with administration of an antimalarial drug, primaquine. The distribution of G6PD deficiency remains unknown while primaquine has been used for malaria treatment in Myanmar. This study aimed to investigate the prevalence of G6PD deficiency and its variants in Chin State, Myanmar. Among 322 participants, 18 (11 males and 7 females) demonstrated a G6PD deficiency. Orissa variant was dominant in the molecular analysis. This would be related to neighboring Indian and Bangladeshi population, in which Orissa variant was also reported as the main mutation type. The screening test for G6PD deficiency before primaquine treatment appears to be important in Myanmar.

지뢰탐지를 위한 GPR 시스템의 개발 (GPR Development for Landmine Detection)

  • Sato, Motoyuki;Fujiwara, Jun;Feng, Xuan;Zhou, Zheng-Shu;Kobayashi, Takao
    • 지구물리와물리탐사
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    • 제8권4호
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    • pp.270-279
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    • 2005
  • 일본 문부과학성의 연구 지원하에 지뢰 탐지를 위한 GPR 시스템 개발에 관한 연구를 수행하였다. 2005 년도까지 두 종류의 새로운 지뢰탈지 GPR 시스템 원형의 개발을 완성하였으며 이를 ALIS (Advanced Landmine Imaging System)와 SAR-GPR (Synthetic Aperture Radar-Ground Penetrating Radar)이라고 명명하였다. ALIS는 금속탐지기와 GPR을 결합한 새로운 형태의 휴대용 지뢰탐지 시스템이다. 센서의 위치를 실시간으로 추적하는 시스템을 장착하여 센서에 감지된 신호를 실시간으로 영상화할 수 있도록 하였으며, 센서 위치의 추적은 센서의 손잡이에 장착한 CCD 카메라만을 이용하여 가능하도록 고안하였다. 그리고 GPR과 금속탐지기 신호를 CCD 카메라에 포착된 영상에 중첩하여 동시에 영상화하도록 설계하였기 때문에 매설된 탐지 목적물을 용이하게 그리고 신뢰할 만한 수준으로 탐지하고 구별할 수 있다. 2004년 12월에 아프가니스탄에서 ALIS의 현장 검증 실험을 수행하였으며, 이를 통해 이 연구에서 개발한 시스템을 이용하여 매설된 대인지뢰를 탐지할 수 있을 뿐만 아니라 대인지뢰와 금속 파편의 구분 또한 가능함을 보였다. SAR-GPR은 이동 로보트에 장착한 지뢰탐지 시스템으로 GPR과 금속탐지기 센서로 구성된다. 다수의 송, 수신 안테나로 구성된 안테나 배열을 채택하여 개선된 신호처리 기법의 적용을 가능하며, 이를 통해 좀 더 나은 지하 영상의 획득이 가능하다. SAR-GPR에 합성개구 레이다 알고리듬을 채용함으로써 원하지 않는 클러터(clutter)신호를 억제하고 불균질도가 높은 매질 내부에 매설된 목적물을 영상화할 수 있다. SAR-GPR은 새로이 개발한 휴대용 벡터 네트워크 분석기를 이용한 스텝 주파수 레이다 시스템(stepped frequency radar system)으로 6 개의 Vivaldi 안테나와 3 개의 벡터 네트워크 분석기로 구성된다. SAR-GPR의 크기는 $30cm{\times}30cm{\times}30cm$, 중량은 17 kg 정도이며 소형 무인 차량의 로보트 팔에 장착된다. 이 시스템의 현장 적용 실험은 2005 년 3 월 일본에서 성공적으로 실시된 바 있다.

콘빔CT (CBCT)를 이용한 온라인 영상유도방사선치료 (On-line Image Guided Radiation Therapy) (On-line Image Guided Radiation Therapy using Cone-Beam CT (CBCT))

  • 박진호;정경근;금기창;박석원
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제24권4호
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    • pp.294-299
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    • 2006
  • 목 적: 방사선치료에서 콘빔CT (cone beam computerized tomography, CBCT)를 이용하여 방사선치료 시 환자의 위치를 모의치료 시 위치와 비교하고 보정함으로서, 온라인 영상유도방사선치료(on-line image guided radiation therapy, on-line IGRT)를 수행할 수 있다. 이러한 과정을 통하여 기존의 모의치료, 치료계획 후 환자의 피부에 표시된 표시점에 가속기를 조준하여 방사선 치료를 수행하는 과정에 비해 개선되는 점을 보고하고자 하였다. 대상 및 방법: 2006년 8월부터 2006년 10월까지 중앙대학교 의과대학 방사선종양학교실에서 방사선치료를 받은 환자 3명을 대상으로 하였다. 기존의 방사선 치료와 마찬가지로 모의치료, 치료계획 후 방사선치료를 위해 치료 테이블 위에 환자를 셋업한다. 이때 환자 피부에 표시된 표시점에 치료실의 레이저에 일치시킨 후, 콘빔CT를 이용한 영상을 얻는다. 콘빔CT (CBCT) 영상과 모의치료(simulation) 시 얻은 CT 영상을 이미지 퓨전을 이용한 비교를 통하여, 치료실에서 현재 환자의 위치와 모의치료 및 치료계획 시 환자의 위치에 대한 변위 벡터(displacement vector)를 산출한다. 이때 산출된 변위벡터만큼 환자의 테이블을 이동한 후, 방사선 치료를 수행한다. 수정된 위치에서 치료 후 KV X-ray (OBI 시스템)를 이용하여 위치를 확인한다. 결 과: 콘빔CT에 의해 셋업 오차로 주어진 변위 벡터의 방향 크기는 두경부 환자인 Pt. A와 Pt. B에서 평균은 각각 0.19 cm, 0.18 cm이며, 표준편차는 각각 0.15 cm, 0.21 cm이다. 반면 골반부 환자인 Pt. C에서 평균과 표준편차는 0.37 cm와 0.1 cm였다. 결 론: 콘빔CT를 이용한 온라인 영상유도방사선치료(on-line IGRT)를 통하여, 기존의 방사선치료 과정에 존재할 수 있는 셋업 오차를 보정할 수 있었다. 온라인 영상유도방사선치료에 의해 향상된 정확도는 단순한 대항조사야 치료뿐 아니라, 복잡한 모양의 표적 용적(target volume)과 급격한 선량 변화를 갖는 3차원 입체조형치료 및 세기조절방사선 치료에서 더욱 중요할 것으로 생각된다.

어류 유래 마이오스타틴 프로도메인 단백질에 의한 시마연어(Oncorhychus masou) 성장효과 (Growth Effect of Oncorhychus masou by Recombinant Myostatin Prodomain Proteins Derived from Fish)

  • 김정환;이상범;조미진;안지영;이석근;홍성열;성기백;진형주
    • 생명과학회지
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    • 제21권8호
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    • pp.1149-1155
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    • 2011
  • 성장과 분화를 조절하는 인자인 myostatin은 포유류에서 주로 골격근에 분포하며 근육성장을 억제하는 것으로 알려져 있다. Myostatin은 포유류에서뿐만 아니라 어류에 있어서도 그 기능이 유사하며 본 연구에서는 넙치와 조피볼락 유래 재조합 myostatin 단백질을 생산하여 시마연어에 침지방법을 통해 처리하였다. 처리 결과 시마연어의 무게와 생화학 분석에서는 유의성이 나타날 정도의 증가는 없었지만 근(muscle) 조직학적 분석에서 넙치와 조피볼락 유래 재조합 myostatin prodomain에 의해 12주째에는 세포의 수가 증가하는 hyperplasia가 일어났으며 22주째에는 조피볼락 유래의 재조합 myostatin prodomain을 처리한 군에서만 hypertrophy가 일어났다. 결론적으로 어류 유래 재조합 myostatin prodomain이 시마연어 근육성장 시 hyperplasia와 hypertrophy가 순차적으로 유도되는 것으로 확인되었다.

Herpes simplex virus-thymidine kinase 유전자가 전이된 종양 세포에서 Gancyclovir와 방사선 조사에 의한 항 종양 효과 (Antitunor Effect of Carcinoma cells Ttransduced with Herpes simplex virus-thymidine kinase by Gancyclovir and Radiation)

  • 이재우;오승택;안창혁;임근우;조현일;김금용;김태규
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제1권1호
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    • pp.45-52
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    • 2001
  • Background: Many types of cancer become resistant to current chemotherapeutic and radiotherapeutic intervention. To overcome this situation application of gene therapy by the introduction of suicide genes followed by their prodrugs may be promising. A viral enzyme, Herpes simplex thymidine kinase (HSV-tk), which converts ganciclovir from an inactive prodrug to a cytotoxic agent by phosphorylation, are being actively investigated for use in gene therapy for cancer. The purpose of this study was to determine whether combining prodrug-activating gene therapy and irradiation might result in enhanced antitumor effects. Methods: The HSV-tk gene was cloned into the retroviral vector, pLXSN and established the clones producing retroviruses carrying the HSV-tk gene. The carcinoma cell line, HCT116 and Huh-7 were transduced with high-titer recombinant retroviruses. These cell lines were treated with ganciclovir before or after irradiation for the defining combinational effect of suicide gene therapy and radiotherapy. Results: The titers of cloned PA3 17 amphotropic retroviruses ranged from 4 to 6 X $10^6CFU/ml4$. After selectional periods, the expression of HSV-tk was confirmed by reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR). The growth of cells expressing HSV-tk was inhibited as increase of GCV dose after 48 hr and the growth inhibitory effect of GCV was much higher after 72 hr. When the cells transduced with HSV-tk gene were exposed to radiation, the growth inhibitory effect of GCV was significantly increased, as compared with non-transduced parental cells. Conclusions: The results suggest that the addition of HSV-tk gene therapy to standard radiation therapy may improve the effectiveness of treatment for solid tumors.

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