Communications for Statistical Applications and Methods
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제26권6호
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pp.575-582
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2019
The problem of selecting variables in the presence of outliers is considered. Variable selection and outlier detection are not separable problems because each observation affects the fitted regression equation differently and has a different influence on each variable. We suggest a simultaneous method for variable selection and outlier detection in a linear regression model. The suggested procedure uses a sequential method to detect outliers and uses all possible subset regressions for model selections. A simplified version of the procedure is also proposed to reduce the computational burden. The procedures are compared to other variable selection methods using real data sets known to contain outliers. Examples show that the proposed procedures are effective and superior to robust algorithms in selecting the best model.
The value of statistics used for variable selection criteria can be reduced remarkably by excluding only a few influential cases. Furthermore, different subsets of regressors change leverage and influence patterns for the same response variable. Based on these motivations, this paper suggests a procedure which considers variable selection and detection of influential cases simultaneously.
Communications for Statistical Applications and Methods
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제30권6호
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pp.577-587
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2023
Conventional categorical data imputation techniques, such as mode imputation, often encounter issues related to overestimation. If the variable has too many categories, multinomial logistic regression imputation method may be impossible due to computational limitations. To rectify these limitations, we propose a two-stage imputation method. During the first stage, we utilize the Boruta variable selection method on the complete dataset to identify significant variables for the target categorical variable. Then, in the second stage, we use the important variables for the target categorical variable for logistic regression to impute missing data in binary variables, polytomous regression to impute missing data in categorical variables, and predictive mean matching to impute missing data in quantitative variables. Through analysis of both asymmetric and non-normal simulated and real data, we demonstrate that the two-stage imputation method outperforms imputation methods lacking variable selection, as evidenced by accuracy measures. During the analysis of real survey data, we also demonstrate that our suggested two-stage imputation method surpasses the current imputation approach in terms of accuracy.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
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제27권6호
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pp.1653-1660
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2016
Smoothly clipped absolute deviation (SCAD) penalty is known to satisfy the desirable properties for penalty functions like as unbiasedness, sparsity and continuity. In this paper, we deal with the regression function estimation and variable selection based on SCAD penalized censored regression model. We use the local linear approximation and the iteratively reweighted least squares algorithm to solve SCAD penalized log likelihood function. The proposed method provides an efficient method for variable selection and regression function estimation. The generalized cross validation function is presented for the model selection. Applications of the proposed method are illustrated through the simulated and a real example.
Communications for Statistical Applications and Methods
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제7권2호
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pp.617-631
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2000
This paper is concerned with suggesting a Bayesian method for variable selection in generalized logit model. It is based on Laplace-Metropolis algorithm intended to propose a simple method for estimating the marginal likelihood of the model. The algorithm then leads to a criterion for the selection of variables. The criterion is to find a subset of variables that maximizes the marginal likelihood of the model and it is seen to be a Bayes rule in a sense that it minimizes the risk of the variable selection under 0-1 loss function. Based upon two examples, the suggested method is illustrated and compared with existing frequentist methods.
A classification task requires an exponentially growing amount of computation time and number of observations as the variable dimensionality increases. Thus, reducing the dimensionality of the data is essential when the number of observations is limited. Often, dimensionality reduction or feature selection leads to better classification performance than using the whole number of features. In this paper, we study the possibility of utilizing the Markov blanket discovery algorithm as a new feature selection method. The Markov blanket of a target variable is the minimal variable set for explaining the target variable on the basis of conditional independence of all the variables to be connected in a Bayesian network. We apply several Markov blanket discovery algorithms to some high-dimensional categorical and continuous data sets, and compare their classification performance with other feature selection methods using well-known classifiers.
This paper proposes a variable break that can offset prediction error as well as a pre-selection methods, based on the variable break, for enhanced unit selection. In Japanese, a sentence consists of several APs (Accentual phrases) and MPs (Major phrases), and the breaks between these phrases must predicted to realize text-to-speech systems. An MP also consists of several APs and plays a decisive role in making synthetic speech natural and understandable because short pauses appear at its boundary. The variable break is defined as a break that is able to change easily from an AP to an MP boundary, or from an MP to an AP boundary. Using CART (Classification and Regression Trees), the variable break is modeled stochastically, and then we pre-select candidate units in the unit-selection process. As the experimental results show, it was possible to complement a break prediction error and improve the naturalness of synthetic speech.
Mild cognitive impairment (MCI) is a clinical syndrome characterized by the onset and evolution of cognitive impairments, often considered a transitional stage to Alzheimer's disease (AD). The genetic traits of MCI patients who experience a rapid progression to AD can enhance early diagnosis capabilities and facilitate drug discovery for AD. While a genome-wide association study (GWAS) is a standard tool for identifying single nucleotide polymorphisms (SNPs) related to a disease, it fails to detect SNPs with small effect sizes due to stringent control for multiple testing. Additionally, the method does not consider the group structures of SNPs, such as genes or linkage disequilibrium blocks, which can provide valuable insights into the genetic architecture. To address the limitations, we propose a Bayesian bi-level variable selection method that detects SNPs associated with time of conversion from MCI to AD. Our approach integrates group inclusion indicators into an accelerated failure time model to identify important SNP groups. Additionally, we employ data augmentation techniques to impute censored time values using a predictive posterior. We adapt Dirichlet-Laplace shrinkage priors to incorporate the group structure for SNP-level variable selection. In the simulation study, our method outperformed other competing methods regarding variable selection. The analysis of Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) data revealed several genes directly or indirectly related to AD, whereas a classical GWAS did not identify any significant SNPs.
Communications for Statistical Applications and Methods
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제14권1호
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pp.215-227
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2007
Variable selection algorithm for Sliced Inverse Regression using penalty function is proposed. We noted SIR models can be expressed as generalized eigenvalue decompositions and incorporated penalty functions on them. We found from small simulation that the HARD penalty function seems to be the best in preserving original directions compared with other well-known penalty functions. Also it turned out to be effective in forcing coefficient estimates zero for irrelevant predictors in regression analysis. Results from illustrative examples of simulated and real data sets will be provided.
Communications for Statistical Applications and Methods
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제10권3호
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pp.627-635
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2003
In this short communication we discuss the bias problem of C4.5 in split variable selection and suggest a method to reduce the variable selection bias among categorical predictor variables. A penalty proportional to the number of categories is applied to the splitting criterion gain of C4.5. The results of empirical comparisons show that the proposed modification of C4.5 reduces the size of classification trees.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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