• 제목/요약/키워드: URA3

검색결과 51건 처리시간 0.029초

분열형 효모에서 유전자 결실에 의해 알킬화제와 3-AMINOBENZAMIDE에 저항성을 나타내는 새로운 유전자의 특성 분석 (Characterization of a New Gene Resistant to Alkylating Agents and 3-Aminobenzamide When Knocked Out in Fission Yeast)

  • 박종군;차재영;황성진;박세근;김미영;백성민;최인순;이정섭
    • 생명과학회지
    • /
    • 제12권2호
    • /
    • pp.219-225
    • /
    • 2002
  • 진핵세포의 염색체는 전사, 복제, 회복 등의 과정에서 관여하는 단백질의 기능으로 구조가 변하게 된다. 이때 관여하는 단백질은 DNA-단백질의 상호작용에 의해서 이루어지게 되는데, 이때 단백질의 일부분은 일정한 상동성이 존재하게 된다. 이러한 부분은 motif나 domain으로 구성되는데, 예를 들면, SAP domain등을 들 수 있다. S. pombe genomic DNA 데이터베이스를 검색하여 Arabidopsis PARP 과 KU70과 상동성을 보이는 새로운 유전자를 찾았다. 이를 SAPuvs (SAP UV Sensitive)라 명명하였으며, Ura4를 선별표지로 이용하여 S. pombe SAPuvs 유전자 결실세포를 구성하였다. SAPuvs 유전자 결실세포는 자외선 조사 실험에서 정상의 세포에 비해 현저하게 죽었다. 그러나, MMS 또는 MMS와 3AB의 처리 실험에서는 저항성을 보였다. 이러한 결과로 SAPuvs는 DNA 상해회복에서 염색사구조 형성에 연관되어 있음을 확인하였다.

Cloning된 효모의 RNAI 유전자의 특성에 관하여 (Characterization of the cloned RNA1 gene of Saccharomyces cerevisiae)

  • 송영환;김대영;김진경
    • 한국어병학회지
    • /
    • 제6권2호
    • /
    • pp.93-101
    • /
    • 1993
  • 효모의 RNAI유전자는 RNA processing에 관여 하는지 혹은 RNA transport에 관여 하는지 아직까지 유전자의 기능이 정확히 알려져 있지 않은 실정이다. 효모의 RNAI 유전자의 기능을 파악하기 위한 방법으로 본 연구에서는 rna1-1 mutant gene을 cloning하여 이에 대한 DNA sequence를 조사함으로써 RNAI 유전자와 rna1-1 유전자의 차이점을 이해하고자 하였다. rna1-1 marker를 갖는 yeast strain(R49)로 부터 genomic DNA를 추출하여 이를 BglII로 절단하여 genomic southern blotting을 행한 결과 wild type의 경우와 동일하게 3.4 kb에서 hybridization되는 signal을 얻었으며, RNAl 및 rna1-1이 yeast genome내에 single site로 존재함을 보여 주는 결과를 얻었다. mutant strain으로 부터 얻은 3.4 kb의 BglI fragment를 pUC19의 BamHI site에 subcloning하여 transformant들을 얻었고, wild type RNAl 유전자를 probe로 하여 rna1-1 mutant 유전자를 cloning할 수 있었다. pUC19에 cloning된 RNA1유전자 및 rna1-1유전자로부터 다양한 Ba131유도체를 얻어 이들에 대한 염기 서열을 비교한 결과 transcription initation site에서부터 down stream쪽으로 17 아미노산위치에 TCC가 TTC로 대치되어 있었으며 그 결과 serine이 phenylalanine으로 변환되는 결과를 얻었다. Wild type RNAI gene의 5'-region에는 3군데의 TATA-like sequence가 true TATA box인지 확인하기 위하여 Bal3I deletion에 의해 -103nt까지 deletion된 유도체를 얻었으며 ${\Delta}RNAI$, rna1-1, 81-2-6 clone이 rna1-1 allele와 complementation한지 확인하였으나 ${\Delta}RNAI$은 TS-complementation을 하지 못하였다. 따라서 현재까지 TATA-box라고 알려진 부분은 promoter로 작용하지 못함을 확인하였다.

  • PDF

Saccharomyces cerevisae에서 한국산 겨우살이 유래 lectin A 및 B 유전자의 발현 (Expression of Recombinant Korean Mistletoe(KM) Lectin and B genes in Saccharomyces cerevisiae)

  • 최윤혁;김종배;양웅석;황철원
    • 생명과학회지
    • /
    • 제14권5호
    • /
    • pp.840-846
    • /
    • 2004
  • 본 연구는 한국산 겨우살이 lectin유전자 (A 및 B chain) 을 효모 (Saccharmyces cerevisiae) 에 형질 전환시키는 시스템을 사용한 것으로, 효모내 효과적인 lectin유전자 발현을 위하여 유전자 상에 Kozak translation initiation sequence를 PCR을 이용 삽입, 변형시켜 재 클로닝 하였다. 변형된 lectin A 및 B 유전자를 포함하는 재조합 플라스미드는 S. cerevisiae INVSc (MATa, his3 $\Delta$l, leu2, trpl-289, ura3-52) 에 형질전환 되었다. 형질전환된 효모는 ABI 3700 system을 이용한 DNA 염기서열 분석을 통해 확인되었고 재조합 한국산겨우살이 lectin 발현을 위해 2% galactose를 사용하여 유도발현되었다. 재조합 lectin A 및 B 단백질은 SDS-PACE 및 western blotting 분석을 수행한 결과 약 29kDa 크기로 확인되었다. 재조합 lectin은 세포내 가용성 단백질 1mg중 1.24∼l.75 $\mu\textrm{g}$ 수준으로 발현되어짐을 ELISA 분석을 통해 확인하였다. 한편 lectin 유전자는 galartose 유도발현 후 36시간이 되 었을 때 발현량이 최대가 되었으며 lectin A 유전자의 경우 48 시간 이후에는 발현이 억제되었다.

삼나무의 엽형분류(葉型分類) 및 생장특성(生長特性)에 관(關)한 연구(硏究) -제주도(濟州道)를 중심(中心)으로- (Classification of Needle Type and Growth Characteristics of Cryptomeria japonica Planted in Cheju Province)

  • 진현오;전상근
    • 한국산림과학회지
    • /
    • 제76권4호
    • /
    • pp.410-417
    • /
    • 1987
  • 제주도(濟州道)에 식재(植載)된 삼나무에 대(對)한 엽형(葉型)을 분류(分類)하고 생장특성(生長特性)을 조사(調査)함과 동시에 일본각지(日本各地)의 천연생(天然生) 삼나무와의 유사성(類似性)에 대(對)하여 비교검토(比較檢討)하였다. 제주도(濟州道) 삼나무의 엽형(葉型)은 총(總) 9개형(個型)으로 대별(大別)할 수 있으며, 각조사구(各調査區)에서 6개형(個型) 이상(以上)의 엽형출현(葉型出現)으로, 여러 계통(系統)이 혼재(混在)하고 있음을 알 수 있었다. 일본(日本)의 Ura(이(裏)) 계통(系統) 삼나무의 형태(形態)를 한 엽형(葉型), 즉 침엽각도(針葉角度) 중용이하(中庸以下), 만곡도(灣曲度), 침엽장(針葉長)이 작은 형(型)(각각(各各) $28^{\circ}$ 미만(未滿), 3.2~8.9, 7.3~12.8 mm)의 개체(個體)가 수고생장(樹高生長)에서 우세(優勢)함을 나타내었다. 이러한 개체(個體)를 지위(地位)가 좋은 곳에 조림육성(造林育成)할 경우 임지생산력(林地生産力)의 증대(增大)를 기대(期待)할 수 있다고 추찰(推察)되었다.

  • PDF

3차원 콘포멀 어레이에서의 인터폴레이션 기술의 적용 (Interpolation Technique for 3-D Conformal Array)

  • 강경목;설경은;전정환;고진환
    • 한국통신학회논문지
    • /
    • 제41권12호
    • /
    • pp.1748-1751
    • /
    • 2016
  • 본 논문에서는 휘어지거나 굴곡진 array인 3차원 conformal array의 beam pattern을 보정하고자 interpolation technique을 3차원으로 확장하여 3-D uniform rectangular array(3-D URA)에 적용하는 방법을 연구하였다. 시뮬레이션 결과는 2차원 interpolation 결과보다 매우 우수한 특성을 보여준다.

3차원 interpolation technoque과 compressive sensing을 이용한 비 균일한 3차원 array의 beam pattern 복구 (3-D interpolation technique and compressive sensing for 3-D conformal array)

  • 강경목;설경은;시저웨슬리;정상배;고진환
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국정보처리학회 2017년도 춘계학술발표대회
    • /
    • pp.106-108
    • /
    • 2017
  • 본 논문에서는 휘어지거나 굴곡진 array인 3차원 conformal array의 beam pattern을 보정하고자 기존의 2차원에서 3차원으로 확장한 interpolation technique과 compressive sensing을 이용하여 3-D uniform rectangular array(3-D URA)에 적용하는 방법을 연구하였다. 시뮬레이션 결과는 compressive sensing이 interpolation technique보다 우수한 특성을 보여준다.

A Pyrenyl-Appended Triazole-Based Calix[4]arene as a Fluorescent Sensor for Iodide Ion

  • Kim, Jong-Seung;Park, Sun-Young;Kim, Sang-Hoon;Thuery, Pierre;Souane, Rachid;Matthews, Susan E.;Vicens, Jacques
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
    • /
    • 제31권3호
    • /
    • pp.624-629
    • /
    • 2010
  • The synthesis and evaluation of a novel calix[4]arene-based fluorescent chemosensor 1 for the detection of I. is described. The fluorescent changes observed upon addition of various anions show that 1 is selective for I. over other anions. Addition of I. results in ratiometric measurements with 1 : 1 complex ratio.

In vitro Biodegradability and Surface Properties of Block Copoly(ester-ether)s Consisting of Poly(L-lactide) and Polyether

  • Lee, Chan-Woo;Kim, Yoshiharu ura
    • Macromolecular Research
    • /
    • 제11권1호
    • /
    • pp.42-46
    • /
    • 2003
  • Cell attachment and proliferation on the polymer films of triblock copolymer(ester-ether)s comprising po1y (L-1actide) (PLLA) and poly (oxyethylene-co-oxypropylene)(PN) were investigated using 3T3 fibroblasts. It was found that on the tissue culture polystyrene(TCPS) and the PLLA control film the cells could spread well while on the copolymer films the cells showed a rounded morphology without spreading and proliferated weakly. Especially, little cells proliferated on the films of copolymer having a LN composition of 20 wt%. While the water absorption of the copolymer films increased with increasing PN content, the contact angle against water of copolymer films immersed in aqueous medium was almost identical, being slightly lower than that of the PLLA film. These properties were compatible with the results of cell attachment. The in vitro hydrolysis of the films of triblock and multiblock type copolymers was faster with increasing PN content. The increased hydrolyzability, the flexibility and the decreased cell attachment suggested that these copolymers may have high potential as biodegradable materials for medical use.

미꾸라지로부터의 복제원점 클로닝 및 그 특성에 관한 연구 (Cloning and Characterization of Replication Origins from Misgurnus mizolepis)

  • 임학섭;김무상;이형호
    • 한국양식학회지
    • /
    • 제8권3호
    • /
    • pp.209-220
    • /
    • 1995
  • 미꾸라지의 간으로부터 핵을 분리하여, 저농도 염추출 및 제한효소 처리로 핵기질(nuclear matrix)을 분리하였다. 분리된 핵기질을 Proteinase K로 분해한 후, phenol-chloroform 추출로 크기가 약 0.3kb-15kb의 분포를 나타내는 핵기질 부착 DNA (nuclear matrix attachment regions : MARs)를 얻었다. 효모 URA 3 유전자를 가진 2.13 kb Eco47 III 단편을 제한효소 Ssp I 으로 절단된 pUC19 플라즈미드 벡타에 결합시켜, ARS (autonomously replication sequence) 클로닝을 위한 pURY19 플라즈미드 벡타를 만들었다. 이 pURY19 벡타는 Saccharomyces cerevisiae내에서 독립적으로 복제할 수 없기 때문에, 물고기의 효율적인 발현 벡타 개발을 위해, 이 system을 이용하여, S. cerevisiae내에서 독립적으로 복제 가능한 미꾸라지의 ARS를 클로닝하고자 하였다. 분리 된 MARs를 pURY19 벡타에 결합시 킨 다음, E. coli $DH5\alpha$에 형질전환시켜 $pURY19N_{l-62}$를 얻었다. MAR Libraries $(pURY19N_{1-62})$를 각각 $Ura^-\;S.\;cerevisiae$에 형질전환시켜, S. cerevisiae내에서 독립적으로 복제 가능한 M. mizolepis 유래의 복제원점들 (ARSs)을 분리하여, Sanger's dideoxy-chain termination method로 염기서열을 분석하였다. 염기서열 분석결과 모든 clones들은 AT-rich하였으며, 특히 $pURY19N_6$에는 ARS concensus sequence, Topoisomerase II consensus, near A-box, 그리고 T-box들이 존재하였다.

  • PDF

Multi-locus sequence typing을 이용한 한국에서 분리한 Candida glabrata 임상균주의 유전자 유형 분석 (Genetic Variations of Candida glabrata Clinical Isolates from Korea using Multi-locus Sequence Typing)

  • 강민지;이경은;진현우
    • 생명과학회지
    • /
    • 제30권2호
    • /
    • pp.122-128
    • /
    • 2020
  • Candida albicans가 칸디다 혈증의 주요 원인 균으로 알려져 있지만, 최근에는 non-albicans Candida (NAC)에 의한 심각한 감염이 증가하고 있다. NAC 중에서 C. glabrata는 두 번째로 병원성을 나타내는 원인 균이지만 C. glabrata의 구조, 역학 등의 기본적인 연구는 거의 없는 실정이다. 따라서 본 연구에서는 다양한 유형의 임상 표본으로부터 분리된 총 102개의 C. glabrata균주로 multi-locus sequence typing (MLST)을 수행하였다. FKS, LEU2, NMT1, TRP1, UGP1 및 URA3을 포함한 6개의 하우스키핑 유전자를 증폭하여 염기서열을 분석하였다. 총 3,345개의 DNA 염기서열 중 49개의 가변 염기서열 부위가 발견되었으며, 그 결과 102개의 균주에서 총 12개의 상이한 서열 유형을 확인하였고, 알려지지 않은 서열 유형(USTs) 중 UST1이 가장 많이 나타났다. 이 연구의 결과는 국내 C. glabrata 항생제 처방에 도움이 될 것으로 사료되며, 한국에서 유행하는 C. glabrata에 대한 추가 연구를 위한 기본 역학자료로 사용될 것으로 기대한다.