In this study, we propose a new fast algorithm for calculating short range forces in molecular dynamics, This algorithm uses a new hierarchical tree data structure which has a high adaptiveness to the particle distribution. It can divide a parent cell into k daughter cells and the tree structure is independent of the coordinate system and particle distribution. We investigated the characteristics and the performance of the tree structure according to k. For parallel computation, we used orthogonal recursive bisection method for domain decomposition to distribute particles to each processor, and the numerical experiments were performed on a 32-node Linux cluster. We compared the performance of the oct-tree and developed new algorithm according to the particle distributions, problem sizes and the number of processors. The comparison was performed sing tree-independent method and the results are independent of computing platform, parallelization, or programming language. It was found that the new algorithm can reduce computing cost for a large problem which has a short search range compared to the computational domain. But there are only small differences in wall-clock time because the proposed algorithm requires much time to construct tree structure than the oct-tree and he performance gain is small compared to the time for single time step calculation.
The general octree structure is common for various applications including computer graphics, geometry information analysis and query. Unfortunately, the general octree approach causes duplicated sample data and discrepancy between sampling and representation positions when applied to sample continuous spatial information, for example, signed distance fields. To address these issues, some researchers introduced the dual octree. In this paper, the weakness of the dual octree approach will be illustrated by focusing on the fact that the dual octree cannot access some specific continuous zones asymptotically. This paper shows that the primal tree presented by Lefebvre and Hoppe can solve all the problems above. Also, this paper presents a three-dimensional primal tree traversal algorithm based the Morton codes which will help to parallelize the primal tree method.
Communications for Statistical Applications and Methods
/
v.19
no.2
/
pp.293-301
/
2012
Quantile regression proposed by Koenker and Bassett (1978) is a statistical technique that estimates conditional quantiles. The advantage of using quantile regression is the robustness in response to large outliers compared to ordinary least squares(OLS) regression. A regression tree approach has been applied to OLS problems to fit flexible models. Loh (2002) proposed the GUIDE algorithm that has a negligible selection bias and relatively low computational cost. Quantile regression can be regarded as an analogue of OLS, therefore it can also be applied to GUIDE regression tree method. Chaudhuri and Loh (2002) proposed a nonparametric quantile regression method that blends key features of piecewise polynomial quantile regression and tree-structured regression based on adaptive recursive partitioning. Lee and Lee (2006) investigated wage determinants in the Korean labor market using the Korean Labor and Income Panel Study(KLIPS). Following Lee and Lee, we fit three kinds of quantile regression tree models to KLIPS data with respect to the quantiles, 0.05, 0.2, 0.5, 0.8, and 0.95. Among the three models, multiple linear piecewise quantile regression model forms the shortest tree structure, while the piecewise constant quantile regression model has a deeper tree structure with more terminal nodes in general. Age, gender, marriage status, and education seem to be the determinants of the wage level throughout the quantiles; in addition, education experience appears as the important determinant of the wage level in the highly paid group.
The Journal of the Institute of Internet, Broadcasting and Communication
/
v.13
no.4
/
pp.9-15
/
2013
Most of recent studies on data center networks are based on the assumption of symmetrical multi-rooted tree topologies such as a Fat-Tree. While packet scatter schemes are very effective for such a network topology, it is known that various failures can result in an asymmetric topology which degrades TCP performance. In this paper, we reexamine the effects of link failures on packet scatter schemes in Fat-Trees. Our simulation results show that in case of a single link failure in a large-scale Fat-Tree, packet reordering does not occur enough to degrade TCP performance. This implies that we do not necessarily need a complex scheme to make packet schemes robust to link failures.
Lim, Jong Hwan;Chun, Jung Hwa;Park, Ko Eun;Shin, Man Yong
Journal of Korean Society of Forest Science
/
v.105
no.3
/
pp.351-359
/
2016
This study was conducted to analyze the effect of climate change on the tree-ring growth of Pinus koraiensis in Korea. Annual tree-ring growth data of P. koraiensis collected by the $5^{th}$ National Forest Inventory were first organized to analyze yearly growth patterns of the species. When tree-ring growth data were analyzed through cluster analysis based on similarity of climatic conditions, five clusters were identified. Yearly growing degree days and standard precipitation index based on daily mean temperature and precipitation data from 1951 to 2010 were calculated by cluster. Using the information, yearly temperature effect index(TEI) and precipitation effect index(PEI) by cluster were estimated to analyze the effect of climatic conditions on the growth of the species. Tree-ring growth estimation equations by cluster were developed by using the product of yearly TEI and PEI as independent variable. The tree-ring growth estimation equations were applied to the climate change scenarios of RCP 4.5 and RCP 8.5 for predicting the changes in tree-ring growth by cluster of P. koraiensis from 2011 to 2100. The results of this study are expected to provide valuable information necessary for estimating local growth characteristics of P. koraiensis and for predicting changes in tree-ring growth patterns caused by climate change.
With the prevalence of multi-dimensional data such as images, content-based retrieval of data is becoming increasingly important. To handle multi-dimensional data, multi-dimensional index structures such as the R-tree, Rr-tree, TV-tree, and MVP-tree have been proposed. Numerous research results on how to effectively manipulate these structures have been presented during the last decade. Query processing strategies, which is important for reducing the processing time, is one such area of research. In this paper, we propose query processing algorithms for R-tree based structures. The novel aspect of these algorithms is that they make use of the notion of VP filtering, a concept borrowed from the MVP-tree. The filtering notion allows for delaying of computational overhead until absolutely necessary. By so doing, we attain considerable performance benefits while paying insignificant overhead during the construction of the index structure. We implemented our algorithms and carried out experiments to demonstrate the capability and usefulness of our method. Both for range query and incremental query, for all dimensional index trees, the response time using VP filtering was always shorter than without VP filtering. We quantitatively showed that VP filtering is closely related with the response time of the query.
R-trees are widely used in various areas such as geographical information systems, CAD systems and spatial databases in order to efficiently index multi-dimensional data. As data sets used in these areas grow in size and complexity, however, range query operations on R-tree are needed to be further faster to meet the area-specific constraints. To address this problem, there have been various research efforts to develop strategies for acceleration query processing on R-tree by using the buffer mechanism or parallelizing the query processing on R-tree through multiple disks and processors. As a part of the strategies, approaches which parallelize query processing on R-tree through Graphics Processor Units(GPUs) have been explored. The use of GPUs may guarantee improved performances resulting from faster calculations and reduced disk accesses but may cause additional overhead costs caused by high memory access latencies and low data exchange rate between GPUs and the CPU. In this paper, to address the overhead problems and to adapt GPUs efficiently, we propose a novel approach which uses a GPU as a buffer to parallelize query processing on R-tree. The use of buffer algorithm can give improved performance by reducing the number of disk access and maximizing coalesced memory access resulting in minimizing GPU memory access latencies. Through the extensive performance studies, we observed that the proposed approach achieved up to 5 times higher query performance than the original CPU-based R-trees.
In wireless sensor network, many sensor nodes are distributed in the field. They communicate the sensing data each other and forward it to sink. Routing protocols, which define the delivery methods of sending data, affect to the lifetime of sensor network. This paper proposes RTAF that is a routing-tree construction algorithm of sensor nodes by a single flooding process in wireless sensor network. A routing tree is constructed by selecting a parent node using the forward-direction flooding packet and gathering children nodes using the reverse-direction flooding packet. In this process, a node with much energy becomes the parent node. And the routing tree is periodically reconstructed in order to distribute the loads of parent nodes. The proposed algorithm compared performance with Modified-LEACH using NS2 network simulation tool. The simulation result shows that the proposed algorithm constructs a routing-tree faster and reduced 40-80% in routing-tree construction packet.
Journal of the Korean Society of Surveying, Geodesy, Photogrammetry and Cartography
/
v.17
no.2
/
pp.117-128
/
1999
A Simple tree-structured line simplification method, which exactly follows the Douglas-Peucker algorithm, has a strength for its simplification index to be involved into the hierarchical data structures. However, the hierarchy of simplification index, which is the core in a simple tree method, may not be always guaranteed. It is validated that the local property of line features in such global approaches as Douglas-Peucker algorithm is apt to be neglected and the construction of hierarchy with no thought of locality may entangle the hierarchy. This study designed a new approach, CALS(Convex hull Applied Line Simplification), a) to search critical points of line feature with convex hull search technique, b) to construct the hierarchical data structure based on these critical points, c) to simplify the line feature using multiple trees. CALS improved the spatial accuracy as compared with a simple tree method. Especially CALS was excellent in case of line features having the great extent of sinuosity.
Pederson, Neil;Jacoby, Gordon C.;D′Arrigo, Rosanne.;Frank, David;Buckley, Brendan;Nachin, Baatarbileg;Chultem, Dugarjav;Renchin, Mijiddorj
The Korean Journal of Quaternary Research
/
v.17
no.2
/
pp.157-159
/
2003
Much of northern Asia is lacking in high-resolution palaeoclimatic data coverage. This vast region thus represents a sizeable gap in data sets used to reconstruct hemispheric-scale temperature trends for the past millennium. To improve coverage, we present a regional-scale composite of four tree-ring width records of Siberian pine and Siberian larch from temperature-sensitive alpine timber-line sites in Mongolia. The chronologies load closely in principal components analysis (PCA) with the first eigenvector accounting for over 53% of the variance from ad 1450 to 1998. The 20-year interval from 1974 to 1993 is the highest such growth period in this composite record, and 17 of the 20 highest growth years have occurred since 1946. Thus these trees, unlike those recently described at some northern sites, do not appear to have lost their temperature sensitivity, and suggest that recent decades have been some of the warmest in the past 500 years for this region. There are, however, comparable periods of inferred, local warmth for individual sites, e.g., in 1520-1580 and 1760-1790. The percent common variance between chronologies has increased through time and is highest (66.1%) in the present century. Although there are obvious differences among the individual chronologies, this result suggests a coherent signal which we consider to be related to temperature. The PCA scores show trends which strongly resemble those seen in recent temperature reconstructions for the Northern Hemisphere, very few of which included representation from Eurasia east of the Ural Mountains. The Mongolia series therefore provides independent corroboration for these reconstructions and their indications of unusual wanning during the twentieth century.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.