A rod-shaped virus was isolated from pepper showing mild mosic during the winter growing seasons of 2001 and 2002 in Korea. Based on its biological reactions, serological relationships, reverse transcription-poly-merase chain reaction (RT-PCR) using specific primers, and nucleotide sequence analysis of coat protein (CP) gene, the isolated virus was identified as Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV) and designated as Korean pepper isolate (TMGMV-KP). Crude sap from infected tissue was mechanically transmitted to various indicator plants, which produced characteristic symptoms of tobamovirus infection. However, no symptom was observed in Gomphorena globosa. In RT-PCR assays with specific primers toy respective detection of TMGMV, Tobacco mosaic virus (TMV), Pepper mild mottle virue (PMMoV), and Tomato mosaic virus (ToMV), a single strong band of about 500 bp in length was produced from the sample used only with TMGMV primers. The amplified DNA was cloned and the nucleotide sequence was determined. Sequence comparisons with the CP gene of other tobamoviruses indicated that TMGMV-KP shared 99.3% identity with TMGMV Japanese isolate and only 59.1, 58.6, and 58.1% identity with TMV, PMMoV and ToMV, respectively. This is the first report of TMGMV in Korea.
Kim, Min-Jea;Choi, Seung-Kook;Yoon, Ju-Yeon;Choi, Jang-Kyung;Ryu, Ki-Hyun
The Plant Pathology Journal
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v.21
no.2
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pp.142-148
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2005
Whereas most of isolates of Cucumber mosaic virus(CMV) can induce green mosaic systemic symptoms on zucchini squash, foliar symptoms of a pepper isolate of CMV (Pf-CMV)-infected zucchini squash revealed systemic chlorotic spots. To assess this biological property, infectious full-length cDNA clones of Pf-CMV were constructed using long-template RT-PCR. The complete nucleotide sequences of RNA2 and RNA3 of Pf-CMV were determined from the infectious fulllength cDNA clones, respectively. RNA 2 and RNA3 of Pf-CMV contain 3,070 nucleotides and 2,213 nucleotides, respectively. Overall sequence homology of two RNAs revealed high similarity (90%) between CMV strains, and 60% similarity to those of Tomato aspermy virus and Peanut stunt virus strains. By sequence analysis with known representative strains of CMV, Pf- CMV belongs to a typical member of CMV subgroup IA. The virus has high evolutionary relationship with Fny-CMV, but the pathology of Pf-CMV in zucchini squash was quite different from that of Fny-CMV. The pesudorecombinant virus, F1P2P3, induced chlorotic spot leaf symptom and timing of systemic symptom in squash plants, similar to the plants infected by Pf-CMV. No systemic symptoms were observed when Pf-CMVinoculated cotyledons were removed at 5 days postinoculation (dpi) while Fny-CMV showed systemic symptom at 2 dpi. These results suggest that the pepper isolate of CMV possesses unique pathological properties distinguishable to other isolates of CMVs in zucchini squash.
Kil, HyungBae;Kang, Minji;Choi, Won-Seok;Kim, Joong-Il;Phan, Mi Sa Vo;Im, JiHui;Kim, MeeKyoung;Park, Mi-Ri
Research in Plant Disease
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v.24
no.2
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pp.145-152
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2018
During 2015-2017, we surveyed the incidence of viral infections of tomato and paprika growing in greenhouses in Cherwon province, Korea. In 2015 and 2016, we collected leaves and fruits from tomato and paprika plants growing in greenhouses. We detected viruses in the samples collected using specific primer sets for Broad bean wilt virus 2 (BBWV2), Cucumber mosaic virus (CMV), Pepper mild mottle virus (PMMoV), Pepper mottle mosaic virus (PepMoV), and Tomato spotted wilt virus (TSWV). We detected PMMoV, CMV, and TSWV in the samples, and CMV and TSWV were the most prevalent. For the prevention of future viral diseases, we then surveyed the routes of infection by these viruses in tomato and paprika plants growing in greenhouses in Cherwon province in 2017. Leaf and fruit samples were collected from seedlings and crops two and four months after transplanting into greenhouses. As a result, we found that TSWV was transferred from seedlings to plants, and outbreaks of the virus occurred at the early stage of cultivation. On the other hand, we found that CMV was a virus indigenous to the soil of some towns in Cherwon province, and thus outbreaks of this virus occurred at the middle stage of cultivation.
Tobacco (Nicotiana tabacum) cultivars including NC 82 and KF 114, and Datura stramonium, Physalis floridana, Gomphrena globosa, and Chenopodium spp. were added to the previous host plants tested for the further examination on the biological characteristics of tobacco mosaic virus (TMV) strains isolated from tobacco (TMV-Common), tomato (TMV-Tomato), and pepper (TMV-Pepper), In TMV-Tomato and TMV-Pepper, different symptoms were noted in P. floridana (no symptom development), and NC 82 (local lesion production on the inoculated leaves) from TMV-Common with which systemic mosaic symptoms were developed. Local lesions were developed in KF 114, D. stramonium, G. globosa, and Chenopodium spp by TMV-Common and TVM-Tomato, while no symptom was observed in KF114 and G. globosa. Also the number and size of local lesions were smaller in KF 114 than Xanthi-nc tobacco (local lesion host) infected with TMV-Tomato. Systemic necrosis was induced in Xanthi-nc and KF 114 when infected with TMV-C at high temperature, but not with the other strains.
Among the plant specimens requested from agricultural actual places of farmers, Agency of agricultural extension services and so forth for the diagnosis of plant virus diseases in 2009, the rate of crop types was 87.5% for vegetables, 4.0% for upland crops and 3.5% for orchids. In vegetables, the crops damaged severely by viral diseases were red pepper and tomato by the infection rate of 51.6% and 26.5%, orderly. Virus species occurring vegetables were 19 and the economically important viruses were Cucumber mosaic virus (CMV), Tomato spotted wilt virus (TSWV), Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), Pepper mild mottle virus (PMMoV) with the infection rate of 33.2%, 16.9%, 16.1% and 7.4%, respectively. Rice stripe virus (RSV) occurred at the whole areas of west coast in Korea in 2009, and its incidence was 14.2% mainly on the susceptible cultivars and yield loss was estimated up to 50%. TYLCV was spread at 34 areas of Si and/or Gun, 22 areas in 2009 and 12 in 2008. Distribution of TSWV was expanded newly in 6 areas of Si and/or Gun including Gangryung, Gangwondo in 2009, and its occurrence areas were 23 Si and/or Gun after first incidence at Anyang area in 2004. Tomato bushy stunt virus (TBSV) was incited newly at Gimcheon area in 2009 with the infection rate of 65.2%, and its soil transmission rate was 55.0% in average.
The complete genome sequence of a Slovak SL-1 isolate of Tomato mosaic virus (ToMV) was determined from the next generation sequencing (NGS) data, further confirming a limited sequence divergence in this tobamovirus species. Tomato genotypes Monalbo, Mobaci and Moperou, respectively carrying the susceptible tm-2 allele or the Tm-1 and Tm-2 resistant alleles, were tested for their susceptibility to ToMV SL-1. Although the three tomato genotypes accumulated ToMV SL-1 to similar amounts as judged by semiquantitative DAS-ELISA, they showed variations in the rate of infection and symptomatology. Possible differences in the intra-isolate variability and polymorphism between viral populations propagating in these tomato genotypes were evaluated by analysis of the capsid protein (CP) encoding region. Irrespective of genotype infected, the intra-isolate haplotype structure showed the presence of the same highly dominant CP sequence and the low level of population diversity (0.08-0.19%). Our results suggest that ToMV CP encoding sequence is relatively stable in the viral population during its replication in vivo and provides further demonstration that RNA viruses may show high sequence stability, probably as a result of purifying selection.
Tobacco mosaic virus (TMV) tomato strain was isolated from tomato "Seo-Kwang" in Korea. The virion was purified by density gradient centrifugation, and total viral RNA was isolated from the purified particles. Coat protein (CP) cDNA of the virus was synthesized by RT-PCR, and the purified cDNA fragment was subcloned to pBluescript II SK-. The analysis of nucleotide sequence showed that this cDNA was 693 nucleotides long from the insert of clone p1571 and p1572 which contain complete codons of the viral coat protein gene (474 nucleotides) and 3' untranslated region. The nucleotides of coat protein encoding cDNA of the strain were 6 nucleotides less than that of TMV common strain isolated from tobacco plant in Korea. The CP gene showed 70% maximum homology with that of the common strain in the nucleotide level and 86% maximum homology in amino acid level.cid level.
A mosaic virus disease of ginger plant was investigated to determine its virus group on the basis of host range, physical and chemical properties, serological behavior and electron-microscopic morphology. The disease gave rise to yellowsih and dark-green mosaic on the leaves in the early stage and stunted all the leaves as well as rhizomes in the late stage. In the field about 43\% of the plants were observed to be diseased The disease was able to be artificially infected to the ginger plants by the sap and transmission as well as to 23 other species of plants which were known to be the CMV susceptible plants by the sap transmission; Chenopodium amaranticolar, Nicotiana tabaccum var. Havana, cow pea, cucumber, tomato,... etc. The dilution end point of the virus ranged $10^{-4}-10^{-5}$ and the thermal inactivation point $65-70^{\circ}C$. Serological test showed a positive reaction by a CMV antiserum. An electron microscopy of the purified virus showed that the virus particles were spherical with a diameter of $28-32m\mu$. Virus particles from the infected tissue were observed to be free or aggregated in the mesophyll tissue of artificially infected tobacco plant. The mosaic disease of ginger plants were conclusively suggested to the CMV group.
Kim, Jeong-Soo;Lee, Su-Heon;Choi, Hong-Soo;Choi, Guk-Sun;Cho, Jeom-Deog;Chung, Bong-Nam
Research in Plant Disease
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v.14
no.1
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pp.1-9
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2008
The severe damage induced by the important viruses of Rice stripe virus (RSV), Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV), Melon necrotic spot virus (MNSV), Tomato spotted wilt virus (TSWV) and Tomato bushy stunt virus (TBSV) was described on major crops in Korea. In 2007, the plot incidence rate of RSV was 100% on the precocious rice cultivars at the Western coastal provinces of Gyeonggido, Chungcheongnamdo, Jellabugdo and Jellanamdo, and Jejudo. RSV occurred in 2,441 ha with incidence rate of 70% over at 5 areas of Seocheon, Seosan, Boryung, Hongsung and Buyou in Chungcheongnamdo. At 4 areas of Buan, Gimje, Gunsan and Gochang in Jellabukdo, RSV occurred in 2.016 ha. CGMMV occurred on watermelon in 4.6 ha at Cheongyang area, and its outbreak was also 890 ha on oriental melon for 120 farmers with the incidence area of 23% against total cultivation areas of Seongju. MNSV was recorded firstly on watermelon in 2006 at Andong and it spread to 3 areas of Hapcheon, Gochang and Yanggu. TSWV occurred firstly at Danggin in Chungcheongnamdo in 2005. TSWV in 2006 spread to 6 areas; Taian, Hongsung and Seosan in Chungcheongnando, Namwon in Jellabukdo, and Sunchon and Kwangju in Jellanamdo. In 2007, TSWV covered 17 areas of western and southern parts; the 5 area including Taian in Chungcheongnamdo, Kwangju in Jellanamdo, Bucheon in Gyunggido, and so forth. TBSV was described firstly on table tomato at Sacheon in Kyungsangnamdo in 2004. TBSV occurred on cherry tomato at Chungju in 2006 and on table tomato at Busan area.
Molecular characterization of Cucumber mosaic virus (CMV) was done by using samples from tomato and cucurbitaceous plants collected from different locations in the northwest region of Iran. After screening by enzyme-linked immunosorbent assay, 91 CMV-infected samples were identified. Biological properties of eight representative isolates were compared with each other revealing two distinct phenotypes on squash and tomato plants. Phylogenetic analyses based on nucleotide sequences of the coat protein (CP), movement protein (MP) and 2b of the new isolates, together with that of previously reported isolates, led to the placement of the Iranian isolates in subgroups IA and IB according to CP and MP genes, but in subgroup IA according to the 2b gene. These data suggest that reassortment may have been a major event in the evolution of CMV in Iran, and that the Iranian isolates are derived from a common recent ancestor that had passed through a bottleneck event.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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