• 제목/요약/키워드: TOF-MS

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LC/MS법 및 LC/UVD(EPA-631)를 이용한 수계 중 Benomyl의 분석법 평가 (Evaluation of LC/MS and LC/UVD(EPA-631) Methods in Determination of Benomyl Concentration in Water Samples)

  • 김기동;최원규;서용찬;박병황;최혜경
    • 대한화학회지
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    • 제45권1호
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    • pp.40-44
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    • 2001
  • 내분비계 장애물질 중의 하나인 농약 benomyl의 환경잔류실태를 조사하기 위해 수질중의 benomyl 농도를 정량 하였다. 일반적으로 benomyl은 가수분해하여 carbendazim으로 변하며 본 분석법은 carbendazim을 정량 하는 간접법이다. 수질중의 잔여 benomyl은 가수분??후 적절한 용매로 추출하여 농축, 정제되었다. 농축된 시료의 carbendazim 농도를 LC/MS (TOF)로 분석하였으며 그 결과 방해물질에 의해 발생할 수 있는 오차를 제거할 수 있었다. 검출한계는 LC/UVD법(EPA-631)에 비하여 약 1,600배 낮았으며 spike의 회수율도 약 80~118%로 양호하였다.

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Proteomics 기법을 이용한 복제태반 분석

  • 김홍래;이혜란;강재구;윤종택;성한우;정진관;조민래;박창식;진동일
    • 한국동물번식학회:학술대회논문집
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    • 한국동물번식학회 2004년도 춘계학술발표대회
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    • pp.238-238
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    • 2004
  • 세포 내에서 발현되고 있는 protein들의 양상을 분석하기 위한 기법으로 최근 proteomics에 기초하여 2차 전기영동과 MALDI-TOF MS에 의한 protein 분석방법이 개발되었는데, 특정 조직에 또는 특정 발생시기에 특이적으로 발현되는 protein의 발현양과 발현양상을 비교ㆍ분석하는데 매우 효과적으로 이용될 수 있다. 최근 체세포 핵이 식기술을 이용하여 동물의 복제가 성공하고 있지만, 임신 중이나 분만시 유사산이 많이 나타나 전반적인 효율이 크게 낮아 실용화에 지장을 초래하고 있다. (중략)

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Characterization of Synthetic Polyamides by MALDI-TOF Mass Spectrometry

  • Choi, Hae-Young;Choe, Eun-Kyung;Yang, Eun-Kyung;Jang, Sung-Woo;Park, Chan-Ryang
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제28권12호
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    • pp.2354-2358
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    • 2007
  • MALDI-TOF-MS technique was applied to obtain structural and compositional information of synthetic polyamides, Nylon6 and Nylon66. Mass spectra of both the original and the hydrolyzed polyamide samples were analyzed using the self calibration method as well as the internal calibration method with the standard materials of known masses. The MALDI-TOF mass spectra of Nylon6 samples showed the presence of protonated, sodiated, and potassiated ions that were assigned to cyclic and NH2/COOH terminated linear oligomers. From the MALDI-TOF mass spectra of Nylon66 samples, the potassiated linear oligomers with three different end groups are identified as well as the cyclic oligomers, i.e., NH2/COOH terminated oligomers, NH2/NH2 terminated oligomers, and COOH/COOH terminated oligomers. Full characterization of the molecular species and end groups present in the polyamide samples has been achieved, and also the changes in mass spectral patterns after the hydrolysis of the samples are presented.

LC/ESI/MS와 GC/TOF-MS를 이용한 인체뇨시료에서의 Prostanozol 대사체 검출 (Determination of metabolites of prostanozol in human urine by LC/ESI/MS and GC/TOF-MS)

  • 염태우;팽기정;김연제
    • 분석과학
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    • 제24권3호
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    • pp.173-182
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    • 2011
  • 약물(Prostanozol)을 복용한 여성을 대상으로 한 뇨시료 중에 함유된 Prostanozol 및 그 대사체들을 검출하기 위해 LC/ESI/MS와 GC/TOF-MS를 이용하여 효과적으로 분리 및 검출하였고, LC/ESI/MS의 질량스펙트럼으로부터는 각각의 분자량을 추정하였으며 GC/TOF-MS로는 이들을 확인하였다. M1은 Prostanozol의 17번 탄소가 케톤기로 치환된 17-keto-Prostanozol, M2는 M1에서 pyrazole nucleus 와 Aring에 한 개의 히드록시기가 치환된 hydroxy-17-keto-Prostanozol, M3는 B-ring 또는 C-ring에 한 개의 히드록시기가 치환된 hydroxy-17-keto-Prostanozol, M4는 한 개의 히드록시기가 D-ring에 치환된 hydroxy-17-keto-Prostsnozol로 확인되었으며 M5는 17번 탄소 위치에 히드록시기를 갖고 B-ring 또는 C-ring에서 하나의 히드록시기가 치환된 hydroxy-17-hydroxy-Prostanozol로 추정되며 M6은 17번 탄소 위치에 케톤기를 갖고 pyrazole nucleus 혹은 A-ring에 하나의 히드록시기를 또한 B-ring 또는 C-ring에 또 하나의 히드록시기가 치환된 dihydroxy-17-keto-Prostanozol, M7은 M6와 같이 17번 탄소에 케톤기를 갖으며 pyrazole nucleus 혹은 A-ring에 하나의 히드록시기를, 또한 D-ring에 또 하나의 히드록시기를 가진 dihydroxy-17-keto-Prostanozol로 확인되었다. 마지막으로 M8은 pyrazole nucleus 혹은 A-ring에 하나의 히드록시기를 갖고 그 외의 ring에 또 다른 히드록시기가 치환된 dihydroxy-17-hydroxy-Prostanozol임을 확인할 수 있었다. 이중 M5, M7, 그리고 M8은 지금까지 밝혀지지 않았던 새로운 대사체였다. 체내에서의 포합반응 여부를 확인한 결과 Prostanozol과 8종의 모든 대사체가 글루쿠론산 포합체를 형성하였고, 8종의 대사체 중 일부는 포합체를 형성하지 않고도 배출되며 특히 M6과 M7은 황산 포합체로도 배설되는 것을 확인할 수 있었다.

MALDI-TOF MS를 이용한 효모에서의 황화수소 생성 단백질의 동정 (The MALDI-TOF MS determination of yeast proteins producing $H_2S$)

  • 조현남;판루안;유동찬;양선아;이인선;김재형;백효현;지광환
    • KSBB Journal
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    • 제23권5호
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    • pp.425-430
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    • 2008
  • 생체에서의 황화수소는 의약 분야와 발효 산업에 있어서 중요한 역할을 하고 있다. 본 연구에서는 Saccharomyces cerevisiae을 이용하여 기질인 L-cysteine과 $\beta$-mercaptoethanol로부터 $\beta$-replacement 반응에 인한 황화수소를 발생시킬 수 있는 효소를 간편하고 신속하게 동정하는 방법의 확립을 목적으로 하였다. 효소에 의해 발생된 황화수소와 Pb-acetate의 반응으로 생성된 Pb-S를 gel상에서 간편하게 확인한 후, 확인된 단백질들을 이온교환컬럼를 수행한 후 gel에서 추출하는 방법으로 MALDI-TOFMS의 시료를 간단히 얻을 수 있었다. PMF 방법과 MS/MS ion search 분석을 통해 간편하게 효모에서 황화수소를 형성할 가능성이 있는 세가지 단백질의 동정에 성공하였다. 이 세 가지 단백질은 CYS3, CYS4, MET17 유전자의 단백질로서 cystathionine $\gamma$-lyase, CBS, OASS 임이 밝혀졌다. 그리고 이 세 단백질들은 L-cysteine과 $\beta$-mercaptoethanol의 존재하에서 황화수소를 실제로 생성함을 확인하였다. 본 연구에서 표적의 물질을 생산하는 단백질들을 젤상에서의 활성측정과 MALDI-TOF MS를 이용하여 간단히 그리고 정확하게 동정하는 방법을 확립하였다.

Rapid Identification of Vibrio Species Isolated from the Southern Coastal Regions of Korea by MALDI-TOF Mass Spectrometry and Comparison of MALDI Sample Preparation Methods

  • Cho, Youngjae;Kim, Eiseul;Han, Sun-Kyung;Yang, Seung-Min;Kim, Mi-ju;Kim, Hyun-Joong;Kim, Chang-Gyeom;Choo, Dong-Won;Kim, Young-Rok;Kim, Hae-Yeong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제27권9호
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    • pp.1593-1601
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    • 2017
  • Vibrio species are generally recognized as pathogens predominant in seafood along coastal areas. The food industry has sought to develop efficient microbial detection methods. Owing to the limits of conventional methods, this study aimed to establish a rapid identification method for Vibrio isolated from Korea, based on matrix-assisted laser-desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). Four different preparation procedures were compared to determine the appropriate means to pretreat Vibrio species, using 17 isolates and five reference strains. Extended direct transfer and full formic acid extraction methods using bacterial colonies on agar plates revealed very low identification rates. Formic acid and trifluoroacetic acid (TFA) extractions using bacterial broth cultures were also performed. All Vibrio isolates and reference strains prepared by TFA extraction were successfully identified to the species level (17/22, 77.3%) and to the genus level (5/22, 22.7%). Thus, TFA extraction was considered the most appropriate method to pretreat Vibrio species for MALDI-TOF MS. The remaining 33 isolates and two reference strains were prepared by TFA extraction and analyzed by MALDI-TOF MS. Overall, 50 isolates were identified to the species level (40/50, 80%) and to the genus level (10/50, 20%). All isolates were identified as 43 V. alginolyticus, six V. parahaemolyticus, and one V. vulnificus species. V. alginolyticus and V. parahaemolyticus were isolated from fish offal (87.5% and 12.5%, respectively), seawater (91.3%, 8.7%), and shellfish (62.5%, 37.5%), whereas V. alginolyticus and V. vulnificus were isolated from sediment (90.9% and 9.1%, respectively). This study established a reliable system of MALDI-TOF MS preparation and analysis for Vibrio identification.

질량분석 시스템을 이용한 극지 토양 유래 신규 미생물의 지질 A 화학적 구조 분석 (Determination of Lipid A Profile of Gram-Negative Bacteria from Arctic Soils Using Mass Spectrometric Approaches)

  • 황철환;박한규;김윤곤
    • KSBB Journal
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    • 제31권4호
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    • pp.263-269
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    • 2016
  • For decades, the microorganisms in arctic soils have been newly discovered according to the climate change and global warming. In this study, the chemical structure of a lipid A molecule from Pseudomonas sp. strain PAMC 28615 which was newly discovered from arctic soils was characterized by mass spectrometric approaches such as matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) and MALDI multi-stage tandem mass spectrometry (MS). First, lipopolysaccharide (LPS) from Pseudomonas sp. strain PAMC 28615 was extracted and subsequently hydrolyzed to obtain the lipid A. The parent ion peak at m/z 1632 was determined by MALDI-TOF MS, which also can validate our lipid A purification method. For detailed structural determination, we performed the multiple-stage tandem mass analysis ($MS^4$) of the parent ion, and subsequently the abundant fragment ions in each MS stage are tested. The fragment ions in each MS stage were produced from the loss of phosphate groups and fatty acyl groups, which could be used to confirm the composition or the position of the lipid A components. Consequently, the mass spectrometry-based lipid A profiling method could provide the detail chemical structure of lipid A from the Pseudomonas sp. strain PAMC 28615 as an arctic bacterium from the frozen arctic soil.

Comparative Proteome Analysis of Celastrol-Treated Helicobacter pylori

  • Kim, Sa-Hyun
    • 대한의생명과학회지
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    • 제23권4호
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    • pp.395-401
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    • 2017
  • Various preclinical and clinical trials have been conducted the efficacy of celastrol. In data presented in the current manuscript is the first trial to inhibit Helicobacter pylori with celastrol. In this study, the quantitative change of various H. pylori proteins including CagA and VacA by the anti-bacterial effect of celastrol was determined. The anti-H. pylori effects of celastrol was investigated by performing 2-dimensional electrophoresis and additional supporting experiments. After 2-dimensional electrophoresis analysis, spot intensities were analyzed and then each spot was identified using matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) or peptide sequencing using Finnigan LCQ ion trap mass spectrometer (LC-MS/MS). The results show that celastrol has multiple effects on protein expression in H. pylori.