• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제23권10호
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• pp.1454-1459
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• 2013

The changes in prodiginines productions caused by pH shock culture of Streptomyces coelicolor strains were estimated. In Streptomyces coelicolor M511, undecylprodiginine and streptorubin B productions increased 1.8-fold (37.22 mg/g) and 2.5-fold (18.61 mg/g), respectively, by pH shock (from 7.2 to 4.0). In contrast, this resulted in the significantly decreased prodigignines production in the redP deletion mutant SJM1; 3.7-fold for undecylprodiginine, 4.4-fold for streptorubin B, 5.2-fold for methylundecylprodiginine, and 6.4-fold for methyldodecylundecylprodiginine, respectively. RT-PCR analyses showed that, during pH shock, expression of redD, the transcription activator gene, was increased while the expression of fabH, the decarboxylative condensation enzyme gene in fatty acid biosynthesis, was decreased in both strains. The enhanced redD expression was in good accordance with the increased total prodiginines production of M511. However, for SJM1 mutant, the decrease of fabH expression occurred more strikingly, such that it became almost completely turned off during acidic pH shock culture. Therefore, a down-regulation of fabH was considered to be the cause of decreased amount of total prodiginines produced, although redD expression was high in SJM1 mutant.

• Journal of Microbiology
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• 제44권1호
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• pp.121-125
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• 2006

Mycothiol is a low molecular weight thiol compound produced by a number of actinomycetes, and has been suggested to serve both anti-oxidative and detoxifying roles. To investigate the metabolism and the role of mycothiol in Streptomyces coelicolor, the biosynthetic genes (mshA, B, C, and D) were predicted based on sequence homology with the mycobacterial genes and confirmed experimentally. Disruption of the mshA, C, and D genes by PCR targeting mutagenesis resulted in no synthesis of mycothiol, whereas the mshB mutation reduced its level to about $10\%$ of the wild type. The results indicate that the mshA, C, and D genes encode non-redundant biosynthetic enzymes, whereas the enzymatic activity of MshB (acetylase) is shared by at least one other gene product, most likely the mca gene product (amidase).

• 미생물학회지
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• 제40권2호
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• pp.81-86
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• 2004

Streptomyces coelicolor의 전 유전체 청보를 분석한 결과(7), 유전자 ID1103135가 코드 하는 open reading frame SCO7697이 phytase[myo-inositol hexakisphosphate phosphohydrolase상동성 (3-6,8,23)]에 유의하게 유사한 것으로 판단되었다. S. coelicolor A3(2)M의 염색체 DNA를 주형으로 PCR 방법으로 SCO7697 전체를 포함하는 DNA 단편을 클로닝하였다. 두 가지의 서로 다른 길이를 갖는 클로닝 된 ID1103135 DNA 단편을 E. coli 발현용 벡터pET728a(+)에 삽입하여,두 종의 재조합 벡터 pET28-SP와 pET28-LP를 얻었다. pET28-SP 와 pET28-LP를 각각 E. coli BL2l에 도입하여, IPTG로 발현 유도된 단백질을 SDS-polyacrylamide 전기영동으로 확인한 결과, 발현은 성공적으로 이루어 졌으나 대부분불용체를 형성하고 분자량은 예상보다 약간 큰 것으로 나타났다. 불용체 형성은 단백질의 불활성화를 수반 함으로서, 배양 온도를 $37^{\circ}C$에서 $30^{\circ}C$로 변화시켜 배양하는 방법으로 발현된 단백질을 가용화 시켰다. 발현된 단백질을 추출하여 조추출물 또는 정제한 상태로 phytase활성을 측청하였으나 효소활성은 관찰할 수 없었다. 대장균 시스템에서의 발현이 효소 활성의 소실을 초래했을 가능성이 있으므로, ID1103135 유전자를 자신의 promoter를 함유하도록 PCR 클로닝하여, E. coli - Streptomyces의 shuttle vector인 pWHM3에 삽입하고, 이를 방선균 호스트인 S. lividans에 도입하였다. 형질 전환체의 세포조추출액 및 세포배양액의 phytase 활성을 측청하였으나, 역시 활성을 확인할수 없었다. 이와 같은 결과는 SCO7697이 아주 높은 확률(E value; $6e^{-89}$)로 phytase일 것으로 annotation 되었으나, 실제는 이와는 다른 기능을 함유하고 있음을 시사하고 있다.

• 한국생물물리학회:학술대회논문집
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• 한국생물물리학회 2002년도 제9회 학술 발표회 프로그램과 논문초록
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• pp.55-55
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• 2002

An alternative sigma factor as encoded by the $\sigma$$\^$B/ gene in Streptomyces coelicolor A3(2) was known to be involved in the differentiation and osmotic stress response. Protein expression profiles of wild-type and a $\sigma$$\^$B/ mutant strain of S coelicolor A3(2), which is impaired in defense against osmotic stress, were compared in the absence and presence of osmotic stress, using 2-dimentional gel electrophoresis.(omitted)

• Journal of Microbiology
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• 제42권2호
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• pp.147-151
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• 2004

$\sigma^{B}$ plays an important role in both osmoprotection and proper differentiation in Streptomyces coelicolor A3(2). We searched for candidate members of the $\sigma^{B}$ regulon from the genome database, using the consensus promoter sequence (GNNTN$_{14-16}$GGGTAC/T). The list consists of l15 genes, and includes all the known $\sigma^{B}$ target genes and many other genes whose functions are related to stress protection and dif-ferentiation.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제31권5호
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• pp.756-763
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• 2021

Agarose is a linear polysaccharide composed of ᴅ-galactose and 3,6-anhydro-ʟ-galactose (AHG). It is a major component of the red algal cell wall and is gaining attention as an abundant marine biomass. However, the inability to ferment AHG is considered an obstacle in the large-scale use of agarose and could be addressed by understanding AHG catabolism in agarolytic microorganisms. Since AHG catabolism was uniquely confirmed in Vibrio sp. EJY3, a gram-negative marine bacterial species, we investigated AHG metabolism in Streptomyces coelicolor A3(2), an agarolytic gram-positive soil bacterium. Based on genomic data, the SCO3486 protein (492 amino acids) and the SCO3480 protein (361 amino acids) of S. coelicolor A3(2) showed identity with H2IFE7.1 (40% identity) encoding AHG dehydrogenase and H2IFX0.1 (42% identity) encoding 3,6-anhydro-ʟ-galactonate cycloisomerase, respectively, which are involved in the initial catabolism of AHG in Vibrio sp. EJY3. Thin layer chromatography and mass spectrometry of the bioconversion products catalyzed by recombinant SCO3486 and SCO3480 proteins, revealed that SCO3486 is an AHG dehydrogenase that oxidizes AHG to 3,6-anhydro-ʟ-galactonate, and SCO3480 is a 3,6-anhydro-ʟ-galactonate cycloisomerase that converts 3,6-anhydro-ʟ-galactonate to 2-keto-3-deoxygalactonate. SCO3486 showed maximum activity at pH 6.0 at 50℃, increased activity in the presence of iron ions, and activity against various aldehyde substrates, which is quite distinct from AHG-specific H2IFE7.1 in Vibrio sp. EJY3. Therefore, the catabolic pathway of AHG seems to be similar in most agar-degrading microorganisms, but the enzymes involved appear to be very diverse.

• 미생물학회지
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• 제33권1호
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• pp.7-14
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• 1997

성장인자가 포함되지 않은 무기염 액체배지(ISP-4)에서 Streptomyces coelicolor A3(2)의 포자가 발아할 때, 성장인자의 주기적인 요구성이(양 등,1993_ 단백질과 RNA 합성과 어떤 관계를 가지고 있는지를 규명하고자 하ㅣ였다. 발아는 10시간 정도 걸렸으며 이때 성장인자의 요구성이 2시간 주기로 반복되는 것을 재입증하였다. 포자의 크기는 시간에 따라 증가하였으나, 포자수는 표준 평판계수법에서 감소하였다. 포자 집단은 생리적으로 살아있거나, 휴면 중인 포자와 죽은 포자로 구분될 수 있었다. 이러한 발아과정에서 포자를 acridine orange(AO)와 iodonitrotetrazolium chloride(INT)로 염색하여 형광현미경으로 관찰하였을 때 RNA와 단백질도 일정한 주기를 갖고 합성되었으며, 이 주기성은 성장인자의 요구 주기와 거의 일치하였다. 이로써 발아 초기에 포자 집단은 성장인자 중에서 특히 단백질 합성과 관련된 물질인 아미노산이 주기적으로 요구되고 있음을 토론하였다.

• 미생물학회지
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• 제52권3호
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• pp.243-248
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• 2016

RNase E는 대장균(Escherichia coli)에서 수많은 RNA의 가공 및 분해에 관여하는 필수적인 효소이다. RNase E의 효소 활성은 RraA와 RraB에 의해 조절된다. 그람양성균인 Streptomyces coelicolor는 RNase ES, RraAS1, RraAS2라고 명명되는 RNase E와 RraA의 동족체를 가지고 있다. 이 연구에서는 S. coelicolor 유래의 RraAS1이 E. coli에서 RNase E의 효소활성을 저해하는지 연구하였다. 대장균에서 RraAS1의 발현은 RNase E의 과발현에 의해 감소된 세포생장을 더욱 저하시켰으며, RNase E의 기질인 rpsO, ftsZ, rnhB mRNA의 양을 감소시키는 것을 확인 하였다. 이러한 RraAS1의 효과는 공동면역침전실험을 수행한 결과에서 유추할 수 있듯이, Rne 단백질과 RraAS1의 결합으로 유도되는 것으로 보인다. 이러한 결과는 RraAS1이 대장균에서 RNase E의 리보핵산 가수분해 활성을 유도함을 시사한다.

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1995년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.295.2-295
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• 1995

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1995년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.294.2-294
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• 1995

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