납, 아연, 카드뮴에 의한 미생물 생장 저해를 변형된 Tris minimal medium을 사용하여 측정하였다. Escherichia coli 균주에 대한 독성의 세기는 아연 > 카드뮴 > 납 순으로 나타났고 Streptomyces coelicolor A3(2)의 철 함유 superoxide dismutase 2를 과발현하는 E. coli 균주는 중금속 저항성이 증가되었음을 알 수 있었다.
The pellets from a culture of Streptomyces coelicolor A3(2) that were submerged shaken were disintegrated into numerous hyphal fragments by DNase treatment. The pellets were increasingly dispersed by hyaluronidase treatment, and mycelial fragments were easily detached from the pellets. The submerged mycelium grew by forming complexes with calcium phosphate precipitates or kaolin, a soil particle. Therefore, the pellet formation of Streptomyces coelicolor A3(2) can be considered a biofilm formation, including the participation of adhesive extracellular polymers and the insoluble substrates.
AfsR2 is a global regulatory protein that stimulates antibiotic biosynthesis in both Streptomyces lividans and S. coelicolor. Previously, various afsR2-dependent genes including a putative abaA-like regulatory gene, SCO4677, were identified through comparative DNA microarray analysis. To further identify the putative SCO4677-dependent proteins, the comparative proteomics-driven approach was applied to the SCO4677-overexpressing strains of S. lividans and S. coelicolor along with the wild-type strains. The 2D gel electrophoresis gave approximately 277 protein spots for S. lividans and 207 protein spots for S. coelicolor, showing different protein expression patterns between the SCO4677-overexpressing strains and the wild-type strains. Further MALDI-TOF analysis revealed that only 18 proteins exhibited similar expression patterns in both S. lividans and S. coelicolor, suggesting that the SCO4677 could encode an abaA-like regulator that controls a few cross-species common proteins as well as many species-specific proteins in Streptomyces species.
Streptomyces coelicolor A3(2) 배양액의 lipase(EC 3.1.1.3)는 ${\alpha}$-naphthyl-butyrate에 대하여 활성을 나타내어 ${\alpha}$-naphthyl-acetate에 활성을 나타내는 esterase와 구분할 수 있었다. Streptomyces coelicolor A3(2) 세포외 lipase를 Sephadex G-100, DEAE-Cellulose 그리고 Phenyl-Sepharose CL4B 크로마토그래피의 과정을 통해 16% 수율로 15배 분리정제 하였다. SDS-폴리아크릴아마이드 겔 전기영동에서는 34.7 kDa정도의 분자량을 갖는 것으로 나타났다. Tributyrin를 기질로 사용하였을 때 이 lipase의 최적활성조건은 pH 8에서 9 그리고 $37^{\circ}C$였다. 기질로서 triacylglycerol의 지방산 길이가 증가할수록 활성은 감소하였다. A-factor에 의해 lipase활성이 억제되므로 배양초기의 낮은 lipase활성과 관련될 것으로 보인다.
Kim Kwang-Pyo;Shin Choon-Shik;Lee Soo-Jae;Kim Ji-Hye;Young Jung-Mo;Lee Yu-Kyung;Ahn Joong-Hoon;Suh Joo-Won;Lim Yoong-Ho
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제16권5호
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pp.799-803
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2006
It was reported that an accumulation of Sadenosyl-L-methionine increases production of actinorhodin in Streptomyces lividans and induces antibiotic biosynthetic genes. We also obtained the same result in Streptomyces coelicolor A3(2). Therefore, in order to identify proteins changed by the addition of S-adenosyl-L-methionine in S. coelicolor A3(2), LC/MS/MS analyses were carried out. Thirteen proteins that were not observed in the control were found.
streptomyces coelicolor A3(2)의 acetyl xylan esterase 유전자를 Escherichia coli께 클로닝하여 그 발현양상을 조사하였다. 이를 위하여 유전자 전체 DNA를 PCR증폭을 통하여 제조하였다. PCR산물의 염기서열을 분석한 결과 1,008개의 nucleotide로 구성된 하나의 open reading frame이 존재함을 확인하였고, 이것은 335개의 아미노산으로 이루어진 약 38 kDa의 단백질을 생성할 것으로 예측할 수 있었다. 이 유전자의 염기 서열은 streptomyces lividans의 acetyl xylan esterase와 98%의 상동성을 가졌다. 그런데 Escherichia coli (pLacl)에서 IPTG유도에 의해 두가지의 acetyl xylan esterase가 발현되었으며 각각의 분자량은 38 kDa과 34 kDa이었다. 이중에서 38 kDa의 단백질은 N-말단의 signal peptide를 포함한 전체 단백질이고,34 kDa의 단백질은 41번과 42번의 두 알라닌 잔기사이의 펩티드 결합이 끊어져 생산된 것으로 추정되었다.
세균의 RNA 중합효소에서 여러 ${\sigma}$ 인자들 간에 보존된 아미노산 서열중 2.3 부위와 4.2 부위의 아미노산 서열로부터 유 n하여 두가지의 PCR primer를 제작하였다. 이들을 이용하여 PCR을 수행하였을 때, E. coli와 Streptomyces coelicolor의 DNA로부터 예상되었던 480 bp 정도의 DNA가 증폭되는 것을 관찰하였다. E. coli DNA에서 증폭된 DNA를 클로닝하여 염기서열을 결정한 결과 E. coli의 rpoS 유전자로부터 유래하였음을 알았다. 이를 탐침으로 S. coelicolor에서 genomic DNA hybridization을 수행하였을 때, PvuII 절편 두가지 (3.5 kb, 2.0 kb) 와 SalI 절편 두가지(3.4kb, 1.5 kb)에 탐침이 결합하는 것을 관찰하였다. 3.5 kb의 pvuII 절편을 sublibrary로부터 클로닝하고, 탐침이 결합하는 1.0kb의 BamHI/HincII 절편의 염기서열을 분석하였다. 부분적으로 결정된 염기서열을 BLAST 프로그램을 이용하여 GenBank와 EMBL, PDB 등의 data library의 유전자들과 비교하여 본 결과Streptomyces속의 ${\sigma}$인자들을 비롯한 Synechococcus종, Anabaena종, Pseudomonas aeruginosa, Stigmatella aurantica 등의 주된 ${\sigma}$ 인자와 높은 유사성을 보였다. 현재까지 1.2 부위와 4 부위에 해당하는 부분의 염기서열을 결정하였는데, 이 부분은 S. coelicolor에서 알려진 다섯가지의 ${\sigma}$ 인자 유전자 중 hrdA와 가장 높은 유사성을 보이며, 아미노산의 유사성이 1.2부위에서는 88%, 4 부위에서는 75%인 것으로 나타났다.
S. coelicolor A3(2)로부터 항산화 저분자 thiol분자인 MSH를 HPLC 및 monobromobimane 형광 검출 방법으로 분리${\cdot}$정제하여 그 존재를 확인하였다. 표준물질인 MSH-bimane과 동일하게 용출되는 MSH 분획을 확인하였으며 여러 thiol 분획 중 MSH 분획이 가장 많은 것으로 보아 MSH가 S. coelicolor의 주된 thiol 화합물로 판단되었다. MSH 생합성에 관여하는 효소 중 I-1-Pase의 유전자의 기능을 알아보기 위하여 이 유전자를 방선균에서 분리한 후 대장균에 클로닝하여 과도발현시켰다. 발현된 I-1-Pase를 Ni-NTA column을 사용하여 정제하였다. 정제된 I-1-Pase는 soluble protein으로 281개 아미노산으로 구성되어 있으며 분자량은 32 kDa이었다. 인간 및 대장균의 I-1-Pase와 각각 24와 $25\%$의 sequence homology를 보였으며, 기존의 I-1-Pase가 가지고 있는 공통의 I-1-Pase motif A와 motif B를 S. coelicolor A3(2)도 가지고 있는 것으로 확인되었다.
Streptomyces coelicolor A3(2)의 acetyl xylan esterase (AxeA)가 Escherichia coli의 과산화수소 저항성에 미치는 영향을 알아보고자 하였다. AxeA 발현은 isopropyl-$\beta$-thiogalactoside로 유도되었고 생산된 AxeA는 SDS-polyacrylamide gel electrophoresis방법으로 확인하였다. AxeA 발현에 따른 과산화수소 저항성의 변화를 E. coli의 생장곡선과 생존율을 통하여 조사하였다. AxeA가 발현되지 않으면 모든 처리 농도 (1 mM, 2.5mM, 5mM)에서 균의 사멸이 일어났다. AxeA가 발현되는 조건에서는 5mM을 제외한 과산화수소 1mM와 2.5mM에서 E. coli의 사멸이 저지되었다. 또한 1.5mM의 과산화수소에 대한생존율이 59%에서 74%로 높다졌다. 동시에 E. coli의 최고생장온도에서에 근접한 $45^{\circ}C$에서의 생존율도 증가되는 결과를 얻었다. 그러므로 AxeA 단백질은 산화적 스트레스와 온도스트레스에 대해 교차 저항성을 나타내는 역할을 한다고 결론지었다.
Protein kinase C (PKC) is a family of kinases involved in the transduction of cellular signals that promote lipid hydrolysis. PKC plays a pivotal role in mediating cellular responses to extracellular stimuli involved in proliferation, differentiation and apoptosis. Comparative analysis of the PKC-${\alpha},{\beta},{\varepsilon}$ isozymes of 200 recently sequenced microbial genomes was carried out using variety of bioinformatics tools. Diversity and evolution of PKC was determined by sequence alignment. The ser/thr protein kinases of Streptomyces coelicolor A3 (2), is the only bacteria to show sequence alignment score greater than 30% with all the three PKC isotypes in the sequence alignment. S.coelicolor is the subject of our interest because it is notable for the production of pharmaceutically useful compounds including anti-tumor agents, immunosupressants and over two-thirds of all natural antibiotics currently available. The comparative analysis of three human isotypes of PKC and Serine/threonine protein kinase of S.coelicolor was carried out and possible mechanism of action of PKC was derived. Our analysis indicates that Serine/ threonine protein kinase from S. coelicolor can be a good candidate for potent anti-tumor agent. The presence of three representative isotypes of the PKC super family in this organism helps us to understand the mechanism of PKC from evolutionary perspective.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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